Том 59, № 4 (2014)

В работе методом полногеномного секвенирования (next-generation sequencing) определена полная последовательность генома вируса Бурана (Burana virus - BURV) (ID GenBank KF801651). Прототипный штамм BURV LEIV-Krg760 изолирован из клещей Haemaphysalis punctata Canestrini et Fanzago, 1877 (Ixodidae, Haemaphysalinae), собранных с коров в апреле 1971 г. в Токмакском заказнике в восточной части Чуйской долины у подножья Киргизского хребта, в окрестностях пос. Бурана (43°10’ с. ш., 74°40’ в. д.) в Кыргызстане. На основании проведенного молекулярно-генетического и филогентического анализа установлена принадлежность BURV к роду Nairovirus сем. Bunyaviridae. В составе рода Nairovirus BURV филогенетически наиболее близок к вирусу Тамды (TAMV), который так же, как и BURV, экологически связан с иксодовыми клещами пастбищных биоценозов. Ранее показано, что TAMV является прототипным представителем новой филогенетической группы Tamdy в составе рода Nairovirus. Таким образом, в результате проведенной работы BURV классифицирован как новый вирус группы Tamdy рода Nairovirus сем. Bunyaviridae.

Вирус Гиссар (Gissar - GSRV) был изолирован в 1982 г. от аргасовых клещей Argas reflexus, Fabricius, 1794 (так называемых голубиных клещей), собранных в августе 1982 г. в голубятне над жилым помещением в пос. Гиссар в окрестностях г. Душанбе, Таджикистан (38°40’ с. ш., б8°40’ в. д.). По данным электронной микроскопии GSRV отнесен к семейству Bunyaviridae, однако его классификация до рода оказалась невозможной вследствие отсутствия антигенных связей с известными буньявирусами. В настоящей работе методом полногеномного секвенирования fnext-generation sequencing, платформа illumina) определена практически полная последовательность генома GSRV, что позволило провести филогенетический анализ и установить его таксономическое положение. GSRV обладает высоким уровнем гомологий (94% по белку нуклеокапсида, 87,5% по RdRp и 82% по оболочечным белкам GnGc) с вирусом Гранд Арбо (Grand Arbaud - GAV), выделенным так же, как и GSRV, из клещей A. reflexus в голубятне во Франции. Независимо от географии распространения GSRV и GAV занимают узкую экологическую нишу, связанную с клещами A. reflexus и птицами (вероятно, преимущественно голубиными Columbidae). на основании проведенного молекулярно-генетического и филогенетического анализа GsRV классифицирован как среднеазиатский вариант GAV группы Уукуниеми (Uukuniemi) рода Phlebovirus (Bunyaviridae). (ID GenBank KJ425423, KJ425424, KJ425425).

Представлены результаты молекулярно-эпидемиологического анализа вариантов вируса иммунодефецита человека 1-го типа (ВИЧ-1), распространенных в Благовещенске и Хабаровске. Показано, что в Благовещенске, как и по России в целом, доминирует штамм IDU-A подтипа А1 (92,5%). в Хабаровске отмечена гетерогенность циркулирующих вариантов ВИЧ-1. наряду с вариантами IDU-A (66%) распространены вирусы подтипов В (12,6%), С (4,4%) и рекомбинантная форма CRF02_AG (17%). Методом филогенетического анализа не подтверждается версия о проникновении вариантов ВИЧ-1 из Китая и Японии.

При длительном изучении инфекционного процесса у рыжих полевок (Myodes glareolus), экспериментально зараженных штаммом Казань 6С.g хантавируса Puumala (PUUV), выявлены три группы особей, отличающихся по иммунореактивности и интенсивности накопления вирусного антигена в органах. Наличие тесной связи между этими параметрами предполагает существование разных механизмов персистенции вируса и вариантов течения инфекции в организме хозяина.