Том 70, № 2 (2025)

Ротавирусы (РВ) животных играют важную роль в формировании новых вариантов эпидемически значимых штаммов Rotavirus А (РВА) человека. В настоящее время на территории Российской Федерации преобладает реассортантный вариант генотипа G3P[8], происхождение которого связано с РВ лошадей и крупного рогатого скота. Помимо этого, в мире долгое время спорадически выявляются реассортантные варианты РВА генотипов G3P[3], G3P[9], G6P[9], подобные РВ кошек и собак. Учитывая актуальность данной темы, подробное изучение AU-1-подобной геногруппы РВА, представители которой тесно связаны с РВ кошек и собак, представляет научно-практический интерес.

Цель настоящего обзора – анализ опубликованных научных данных о РВ человека, кошек и собак, входящих в состав AU-1-подобной геногруппы и изученных на основе полного генотипа.

Введение. Белок Vif вируса иммунодефицита человека 1-го типа (ВИЧ-1) является фактором вирусной инфекционности и противодействует клеточным дезаминазам семейства APOBEC3, препятствующим репликации вируса. На основе белка Vif ведутся разработки для создания терапевтических средств. Природные замены в белке Vif могут влиять на его функциональность и ассоциироваться с ускоренным переходом ВИЧ-инфекции в стадию СПИДа. Изучение особенностей белка Vif у вариантов ВИЧ-1, циркулирующих в России, ранее не проводилось.

Цель работы: изучить генетическое разнообразие белка Vif вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в Московской области в 2019‒2020 гг.

Материалы и методы. Проанализировано 234 образца цельной крови ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта приема антиретровирусной терапии. Дизайн исследования включал следующие стадии: экстракция провирусной ДНК, амплификация гена vif, секвенирование продуктов амплификации, определение генетических вариантов полученных нуклеотидных последовательностей; затем проводили исследование консенсусных последовательностей белка Vif наиболее распространенных генетических вариантов ВИЧ-1, анализ консервативности и генетического разнообразия белка Vif-А6 (белок Vif вариантов ВИЧ-1 суб-субтипа А6) у пациентов с разными стадиями заболевания, оценку генетического разнобразия белка Vif-А6 в Московской области.

Результаты. Проведена оценка генетического разнообразия ВИЧ-1 в области генома, кодирующего белок Vif, – выявлено большое генетическое разнообразие, включающее в себя ВИЧ-1 чистых субтипов (A6, B и G), а также его рекомбинантных форм (CRF63_02A6). Впервые получены консенсусные последовательности белка Vif генетических вариантов ВИЧ-1 – B и CRF63_02A6, циркулирующих на территории Российской Федерации. Для наиболее распространенных в России вариантов ВИЧ-1 определены характерные замены в консенсусных последовательностях.

Заключение. Ограничением исследования является небольшая выборка последовательностей, принадлежащих генетическим вариантам B и CRF63_02A6 ВИЧ-1. Полученные результаты могут быть интересны и учтены при разработке терапевтических средств на основе белка Vif, а также при изучении вопросов патогенности ВИЧ-1 суб-субтипа А6.

Введение. Культуры клеток клещей широко используются для изучения биологии этих членистоногих и переносимых ими патогенов, в особенности вирусов. Большинство имеющихся в настоящее время культур клеток были получены из эмбриональных клеток клещей и могут быть инфицированы вирусами. Клеточная линия HAE/CTVM8, полученная из клещей Hyalomma anatolicum, часто используется для выделения переносимых клещами внутриклеточных инфекционных агентов.

Цель работы – изучение клеточной линии HAE/CTVM8 с помощью высокопроизводительного секвенирования с целью поиска вирусов в ней.

Материалы и методы. Культуральную жидкость клеток HAE/CTVM8 ультрацентрифугировали. Полученный осадок использовали для высокопроизводительного секвенирования после выделения РНК, реакции обратной транскрипции и синтеза второй цепи. Полученные прочтения фильтровали по длине и качеству в программе Trimmomatic, после чего собирали контиги с помощью программы SPAdes и анализировали их на присутствие вирусных последовательностей. Финальная сборка генома вируса осуществлялась в программе Ugene. Выравнивание последовательностей производили с использованием программы MAFFT. Построение филогенетических деревьев производилось с применением программы IQ-TREE.

Результаты. Выявлена персистенция одного вируса – Liman tick virus (LMTV) – в культуре клеток HAE/CTVM8. Филогенетически LMTV принадлежит новому семейству Chuviridae, состоящему из вирусов, обнаруженных с помощью высокопроизводительного секвенирования, вирусологическая характеристика которых отсутствует.

Заключение. Полученная в настоящем исследовании информация крайне важна для использования культуры клеток HAE/CTVM8 в научных исследованиях и изоляции новых вирусов. Наше исследование показывает, что клеточная линия HAE/CTVM8 с персистирующим в ней LMTV представляет собой готовую систему для изучения репродукции представителей семейства Chuviridae.

Актуальность. Метапневмовирус человека (Human metapneumovirus, hMPV) имеет большое эпидемиологическое значение, являясь доминирующей причиной инфекций нижних дыхательных путей у детей младше 2 лет и лиц старше 65 лет. Возможно многократное инфицирование hMPV в течение жизни человека ввиду антигенной и генетической изменчивости возбудителя. При этом генетическая изменчивость hMPV, циркулирующих в России, остается неизученной.

Цель работы. Апробация протокола полногеномного секвенирования hMPV для оценки генетического разнообразия метапневмовирусов, циркулирующих в отдельных субъектах России.

Материалы и методы. Исследовали назофарингеальные мазки от пациентов разного возраста с острыми респираторными вирусными инфекциями, положительные в полимеразной цепной реакции на hMPV. Из части образцов вирус выделяли на клеточной культуре. На платформе Illumina MiSeq проведено полногеномное секвенирование вирусов hMPV из мазков и изолятов с последующим филогенетическим анализом.

Результаты. Впервые в России проведено полногеномное секвенирование 44 hMPV, циркулировавших в период с 2017 по 2024 г., описана их принадлежность к генетическим группам, показано доминирование клайда A2b2. Подтверждено, что наибольшее разнообразие в генах, кодирующих поверхностные белки вируса, отмечено для гена G, в то время как в гене F в изучаемый период изменения были минимальны.

Заключение. Проведенное исследование дает представление о генетическом разнообразии вирусов hMPV, циркулирующих в отдельных субъектах Российской Федерации. Изучение генетической изменчивости hMPV имеет решающее значение для понимания вирусной эволюции, динамики передачи и механизмов иммунного ускользания, которые влияют на разработку вакцин и противовирусных препаратов.

Введение. Энтеровирусная инфекция, широко распространенная в мире и в России, характеризуется разнообразием клинических форм, одной из которых является серозный менингит. Наиболее частой причиной энтеровирусного менингита у детей является вирус echovirus 30 (E30). Ранее нами получен химерный белок, состоящий из S-домена белка VP1 норовируса (S_N), слитого в одну молекулу с VP1 Е30 (S_N-VP1_E30), который в перспективе может быть использован для разработки вакцины для профилактики энтеровирусного менингита, вызванного вирусом Е30.

Целью настоящей работы явилось изучение иммунологических свойств белка S_N-VP1_E30.

Материалы и методы. Мышей линии Balb/c и морскую свинку иммунизировали белком S_N-VP1_E30. Продукцию антител класса G (IgG) и M (IgM) исследовали методом иммуноферментного анализа. Взаимодействие антител против S_N-VP1_E30 с вирионами энтеровирусов Е30 разных генотипов изучали методом электронной микроскопии. Реакцию нейтрализации Е30 антителами проводили в культуре клеток RD.

Результаты. У мышей, иммунизированных S_N-VP1_E30 без адъюванта, средние титры суммарных антител против VP1 E30 составили 1 : 19 000. Использование адъюванта повышало средний титр антител в 3 раза. Уровень IgM был значительно ниже и составил в среднем 1 : 1500. С помощью иммуноэлектронной микроскопии показано, что антитела морской свинки против химерного S_N-VP1_E30 способны связывать вирионы E30 генотипов h и еС2. Антитела мышей и морской свинки способны нейтрализовать Е30 в культуре клеток RD. У мышей титры нейтрализующих антител варьировали от 20 до 40, у морской свинки составили 40.

Заключение. Иммуногенность S_N-VP1_E30 у двух видов животных и способность антител связывать и нейтрализовать энтеровирус Е30 позволяет предложить его в качестве антигена в составе вакцины для профилактики заболеваний, вызванных E30.