Том 55, № 2 (2010)

Представлены данные по сравнительному анализу нуклеотидных последовательностей фрагмента гена S3 67 изолятов реовируса кур (РК), выявленных в пробах патологического материала, поступившего на исследование с 1999 по 2007 г. Установлено, что данные изоляты РК по нуклеотидной последовательности гена S3 отличались от вакцинных штаммов. Была рассчитана приблизительная скорость накопления нуклеотидных замен для данного гена, варьирующая от 2,010-3 до 6,010-3 замен на 1 нуклеотид в год.

Выполнен поиск потенциальных ОРТ в концевых вариабельных протяженных районах генома ВНО. Проведен детальный структурно-функциональный анализ этих рамок и их сравнение как между собой, так и с гомологичными ОРТ различных ортопоксвирусов. Выявлены наиболее консервативные и гетерогенные среди изученных ОРТ 70 штаммов ВНО. У штаммов Helder и Mary Российской коллекции впервые открыта уникальная для ВНО ОРТ длиной 111 а. к. Кроме того, только у штамма Helder ОРТ D14L распадается на две отдельные рамки трансляции. Обнаружен ряд неточностей в современных базах данных для ОРТ ВНО. Установлено, что доминирующим типом селекции для анализируемых ОРТ является стабилизирующий отбор. Определено, что ОРТ C3L ВНО находится под адаптивной селекцией в отличие от ортологов, представленных в геноме других поксвирусов. Данный факт свидетельствует о важной роли этого гена при адаптации ВНО к человеку.

В работе представлен анализ NS1/VP1u-фрагмента генома (994 нуклеотида) 84 парвовирусов B19, выявленных в 2006 г. у больных инфекционной эритемой в Беларуси. Все вирусы принадлежали к генотипу 1, согласно классификации A. Servant и соавт., и формировали 2 кластера с четкой географической принадлежностью штаммов. Кластер 1A преимущественно включал вирусы от больных из Минска, где в 2006 г. была зарегистрирована вспышка парвовирусной инфекции. Кластер 1B составляли вирусы от спорадических случаев инфекционной эритемы из разных регионов страны. Вариабельность в пределах кластера 1B (1,1%) была почти вдвое выше вариабельности кластера 1A (0,6%). В сравнении с парвовирусами, представленными в Международном генетическом банке данных (NCBI, Bethesda, США), у белорусских штаммов выявлены 22 уникальные нуклеотидные замены, из которых 18 (81,8%) являлись значимыми. Подавляющее большинство образцов сывороток крови, содержавших IgM-антитела к парвовирусу, оказались позитивными и при исследовании в ПЦР (63 из 67; 94%), что свидетельствует о перспективности использования обоих методов для диагностики инфекции.

На территории Западной Сибири из погибших от полиэдроза гусениц непарного шелкопряда выделены 6 изолятов вируса ядерного полиэдроза (ВЯП). На гусеницах непарного шелкопряда установлена гетерогенность по вирулентности и репродуктивной активности выделенных изолятов. Полученные результаты свидетельствуют о фенотипической изменчивости исследованных изолятов вируса. Не выявлено связи между вирулентностью и репродуктивной активностью всех выделенных изолятов вируса, за исключением изолята Карасукский, высокая вирулентность которого сопряжена с высокой репродуктивной активностью. Для западносибирских штаммов ВЯП Карасукский и Татарский с максимальной и минимальной вирулентностью определены нуклеотидные последовательности продуктов ПЦР с праймерами, специфичными для гена полиэдрина. Выравнивание нуклеотидных последовательностей выявило высокую консервативность исследуемого фрагмента гена полиэдрина между западносибирскими изолятами ВЯП и американскими штаммами ВЯП непарного шелкопряда за исключением двух точечных мутаций. Эти мутации одинаковы для изолятов ВЯП из России, но отличаются от известных структур гена полиэдрина американских штаммов. Только одна из мутаций приводит к аминокислотной замене в белке полиэдрине. Следовательно, структура гена полиэдрина и кодируемого им белка не влияет на вирулентность и репродуктивную активность ВЯП.

При обследовании 281 здорового привитого ребенка из 6 домов ребенка было выделено 37 вакцинных полиовирусов. Частота выделения полиовирусов в тех домах ребенка, где в числе прочих находились дети, рожденные от ВИЧ-инфицированных матерей, была достоверно выше, чем в других. В этих домах ребенка отмечена наиболее длительная экскреция полиовирусов после вакцинации. Анализ профилей RFLP показал, что 40% изученных штаммов являлись межтиповыми рекомбинантами. По результатам секвенирования около 30% штаммов имели небольшое число нуклеотидных замен на участке VP3-VP1 вирусного генома. Установлена корреляция между динамикой экскреции полиовирусов после вакцинации оральной пероральной вакциной и динамикой формирования рекомбинантных штаммов полиовирусов.