Том 59, № 2 (2014)
- Год: 2014
- Дата публикации: 15.04.2014
- Статей: 10
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/issue/view/111
Особенности эпидемии гриппа на отдельных территориях России в эпидемическом сезоне 2012-2013 гг. Доминирование штаммов вируса гриппа A (H1N1) pdm09 в странах Европы
Аннотация
Представлены особенности циркуляции вирусов гриппа с октября 2012 по июнь 2013 г. в 10 городах России, опорных базах Центра экологии и эпидемиологии гриппа при ФГБУ НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского Минздрава России. Подъем уровня заболеваемости, этиологически связанный с вирусами гриппа, регистрировали в январе-марте 2013 г. Максимальные показатели заболеваемости отмечены в период 6-7 нед с последующим снижением до порогового уровня к 14-й неделе 2013 г.. Этиологию эпидемических подъемов уровня заболеваемости определяли штаммы вирусов гриппа A (H1N1) pdm09, A (H3N2) и В, активность которых различалась на разных территориях России. Результаты изучения антигенных и молекулярногенетических свойств штаммов выявили близкое родство большинства из них вакцинным вирусам. При этом отмечены генетическая гетерогенность популяции циркулирующих штаммов и их дрейфовые варианты. Штаммы были чувствительны к озельтамивиру (за исключением одного штамма вируса гриппа A (H1N1) pdm09), занамивиру и арбидолу; сохранили резистентность к ремантадину. Долевое участие возбудителей ОРВИ негриппозной этиологии сравнимо с таковым в предыдущие эпидемические сезоны.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):5-10
5-10
Вакциноподобные вирусы: особенности циркуляции в Южной Америке
Аннотация
Рассмотрены особенности распространения вакциноподобных вирусов, впервые выявленных более 50 лет назад на территории Южной Америки. Эти вирусы вызывают вспышки инфекции у молочного скота и обслуживающего его персонала. Отмена оспопрививания в 1980 г. привела к снижению популяционного иммунитета и повысила риск инфицирования человека. Это обстоятельство делает необходимым активизацию мониторинга за свойствами вакциноподобных вирусов, кругом их носителей и возможным изменением патогенности для человека.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):10-14
10-14
Таксономия ранее негруппирован-ного вируса Тамды (TAMV-Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum SchOlce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) в Средней Азии и Закавказье
Аннотация
Проведено полногеномное секвенирование (GenBank iD: KF801653-KF801655) трех штаммов вируса Тамды (TAMV - Tamdy), прототипный штамм которого LEiV-1308Uz был впервые изолирован из иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schulce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae), собранных в августе 1971 г. с овец в пустынном ландшафте в окрестностях г. Тамдыбулак (41°36' с.ш., 64°39' в.д.) Тамдинского района Бухарской области Узбекистана. Показано, что TAMV является прототипным представителем новой филогенетической группы в составе рода Nairovirus. Гомология TAMV по аминокислотной последовательности RdRp (L-сегмент) составляет менее 40% с вирусами Крымской-Конго геморрагической лихорадки (CCHFV), Хазара (HAZV) и Дугбе (DUGV), которые тоже связаны с иксодовыми клещами. Уровень гомологии TAMV с вирусами Иссык-Куль (isKv) и Каспий (CASV) по RdRp составляет 37,6 и 37,7% соответственно. Эти данные соответствуют низким значениям гомологии структурных белков GnGc (M-сегмент) и белка нуклеокапсида N (S-сегмент). Гомология TAMV с наировирусами по GnGc составляет в среднем 25%; с наировирусами, связанными с иксодовыми клещами (CCHFV, DUGV, HAZV), - 33%; с аргасовыми клещами (iSKV, CASV) - 28%. Штаммы TAMV/LEiV-1308Uz, LEiV-6158Ar и LEiV-10226Az имеют высокий уровень идентичности. TAMV/LEiV-10226, изолированный в Азербайджане, обладает 99% гомологией по нуклеотидной и аминокислотной RdRp-последовательностям с прототипным TAMV/LEiV-1308Uz. Штамм TAMV/LEiV-6158Ar из Армении более дивергентен и имеет с TAMV/ LEiV-1308Uz уровень гомологии 94,2 и 96,3% по нуклеотидной и аминокислотной последовательностям соответственно. Уровень гомологии между TAMV/LEiV-1308Uz и TAMV/LEiV-10226Az по GnGc составляет 93%. Штамм TAMV/LEiV-6158Ar по данному белку имеет менее 90% гомологии с прототипным TAMV/LEiV-1308Uz и 93% с TAMV/LEiV-10226Az. Различия по белку нуклеокапсида между тремя штаммами TAMV составляют 5-7%.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):15-22
15-22
Молекулярно-генетическая характеристика вирусов Охотский (OKHV-Okhotskiy virus) и Анива (ANIV-Aniva virus) (Reoviridae, Orbivirus), изолированных в высоких широтах Северной Евразии из облигатных эктопаразитов чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820) - клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852
Аннотация
Изучены молекулярно-генетические характеристики вирусов Охотский (OKHV - Okhotskiy virus) (iD Gen Bank KF981623-32) и Анива (ANiV - Aniva virus), ареал распространения которых охватывает в высоких широтах шельфовые и островные территории бассейнов Охотского, Берингова и Баренцева морей. Вирусы экологически связаны с гнездовьями чистиковых (Alcidae) птиц и их облигатными паразитами клещами Ixodes uriae (Ixodidae). OKHV и ANiV являются самостоятельными видами в составе группы Грейт-Айленд (GiV - Great island virus) рода Orbivirus сем. Reoviridae. Большинство генов OKHV и ANiV имеют между собой высокий уровень гомологии (VP1 96%; Т2 99%; VP7 (T13) 98%; NS1 94%; NS2 98%; NS3 72%; VP6 93%). Но поверхностные белки, несущие основные видоспецифические антигенные детерминанты (VP2 и VP5), у OKHV и ANiV существенно различаются (62 и 68% гомологии по аминокислотным последовательностям соответственно).
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):22-28
22-28
Таксономический статус вируса Тюлёк (TLKV-Tyulek) (Orthomyxoviridae, Quaranjavirus, группа Кваранфил), изолированного в Киргизии из клещей Argas vulgaris Filippova, 1961 (Argasidae) из норовых биотопов с гнездами птиц
Аннотация
В работе с использованием технологии полногеномного секвенирования (next-generation sequencing) определена полная последовательность генома вируса Тюлёк (TLKV - Tyulek virus) (iD GenBank KJ438647-8), изолированного из клещей Argas vulgaris Filippova, 1961. (Argasidae), собранных в 1978 г. в норовых биотопах с поливидовыми колониями птиц в пойме реки Ак-Су в окрестностях поселка Тюлёк Московского района, в северной части Чуйской долины в Киргизии. По данным предварительного изучения TLKV был отнесен к группе Кваранфил, включающей вирусы Кваранфил (QRFV - Quaranfil virus), Атолл Джонстон (JAV - Johnston Atoll virus) и Озеро Чад (LCV - Lake Chad), которая в настоящее время выделена в самостоятельный род Quaranjavirus в составе сем. Orthomyxoviridae. Гомология TLKV с вирусами QRFV и JAV по белку PB1 составляет 86 и 84% соответственно. По другим белкам полимеразного комплекса (PB2 и PA) TLKV обладает около 70% гомологии с QRFV. По поверхностному гликопротеиду GP гомология между TLKV и QRFV составляет 72 и 80% по нуклеотидной и аминокислотной последовательностям соответственно. На основе проведенного молекулярно-генетического и филогенетического анализа показано, что TLKV является новым вирусом группы Кваранфил рода Quaranjavirus сем. Orthomyxoviridae.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):28-32
28-32
Генетическая характеристика вируса Баткен (BKNV-Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии
Аннотация
Методом полногеномного секвенирования (MiSeq, illumina) определена практически полная нуклеотидная последовательность генома вируса Баткен (BKNV - Batken virus) (iD GenBank KJ396672-4). Прототипный штамм LEiV-K306 BKNV изолирован от иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844, собранных с овец в окрестностях районного центра Баткен в Киргизии в апреле 1970 г. Впоследствии на территории Киргизии BKNV был изолирован из смешанного пула комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889. Ранее было установлено, что BKNV чрезвычайно близок к вирусу Дхори (DHOV - Dhori virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), впервые изолированному от иксодовых клещей Hyalomma dromedarii Koch, 1844 в Индии. В настоящей работе показано, что структурные и неструктурные белки BKNV обладают высоким уровнем гомологии с DHOV - 98% (PB1) и 96% (PB2, PA, NP, M). Уровень гомологии поверхностного гликопротеина HA у BKNV и DHOV составляет 90%, что объясняет антигенные различия между этими близкородственными вирусами. Поскольку гомология остальных структурных и неструктурных белков BKNV и DHOV составляет 96-98%, можно заключить, что BKNV является топотипным вариантом DHOV, характерным для Средней Азии, Закавказья и Северного Прикаспия. Эволюционное расхождение BKNV и DHOV по поверхностному гликопротеину, вероятно, связано с локальными экологическими особенностями ареала BkNv.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):33-37
33-37
Противовирусная активность производных адаманта-на в отношении вируса гриппа A(H1N1)pdm09 на модели in vivo
Аннотация
Впервые in vivo на модели вирусной пневмонии мышей исследована противовирусная активность в отношении вируса гриппа A(H1N1)pdm09 синтетических производных адамантанового ряда, включающих остатки аминокислот и липоевую кислоту. Установлено, что производные адамантана с остатками гистидина, серина и липоевой кислоты способны ингибировать резистентный к ремантадину штамм вируса гриппа A(H1N1)pdm09. В результате продолжительность жизни мышей, зараженных вирусом, увеличилась в 1,6 раза относительно таковой в группе вирусного контроля. Таким образом, показана возможность реанимации противовирусных свойств ремантадина как in vitro, так и in vivo путем введения в его молекулярную структуру новых функционально активных групп.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):37-40
37-40
Сравнительное изучение эффективности использования клеточных линий MDCK и CaCo-2 для выделения вирусов гриппа
Аннотация
Проведено изучение эффективности использования клеточной линии СаСо-2 для выделения вируса гриппа. Показано, что свойства данной клеточной линии могут сильно меняться в зависимости от источника получения и условий культивирования. Инфекционная активность вирусов гриппа на линии СаСо-2 схожа с таковой для линии MDCK. Эффективность изоляции вирусов пандемического гриппа и гриппа В была схожа для обеих линий, но при этом только на СаСо-2 были выделены вирусы гриппа из постмортальных материалов. Сделан вывод о ценности клеточной линии СаСо-2 для вирусологических исследований, в том числе и для выделения вирусов гриппа.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):40-45
40-45
Изучение противогерпетических свойств экстрактов из березового гриба Inonotus obliquus
Аннотация
Разработаны различные схемы получения экстрактов березового гриба - чаги (Inonotus obliquus), обладающего высоким содержанием биологически активных веществ. Установлено, что водные, водноспиртовые и щелочные экстракты мало токсичны для клеток и обладают способностью защищать культуру клеток Vero от цитодеструктивного действия вируса простого герпеса. Изученная более детально фракция iV, полученная методом щелочной экстракции, в концентрации 5,0 мкг/мл полностью защищала клетки при внесении до или в течение часа после инфицирования вирусом простого герпеса, тип 1.
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):45-48
45-48
Н.В. Каверин
Вопросы вирусологии. 2014;59(2):49-49
49-49