Genetic characteristics of the causative agent of tick-borne encephalitis in Mongolia


Cite item

Full Text

Abstract

A patient with diagnosed meningoencephalitis and a history of tick bite died in Mongolia in 2008. The purpose of this paper is to characterize the virus causing the ill person's death. The virus was identified using the phylogenetic analysis of the 520-bp fragment of the tick-borne encephalitis virus (TBEV) genome, which codes the fragment of TBEV protein E between 52-223 amino acids. TBEV RNA was detected in the samples of medulla oblongata, cerebral cortex, and pia mater of brain, but not in the cerebellar tissue. The study virus fragment was genetically closest to the representatives of the Far East subtype. Its closest relative was virus 740-84 (GenBank EU878282) isolated from large-toothed redback voles (Clethrionomys glareolus) in Buryatia and greatly differed from the Far East virus Soffin. Two amino acid substitutions (H86R and V17A) were detected within the study protein E fragment. The paper is the first to describe the causative agent of tick-borne encephalitis on the territory of Mongolia and to discuss the evolution and pathogenicity of TBEV.

References

  1. Абмэд Д., Нимадава П., Андреев В. П. и др. Исследование по арбовирусным инфекциям в МНР. Сообщение II. Изоляция вируса клещевого энцефалита в Селенгинском аймаке // Мон тезисд, Улаанбаатар, стр. 22.
  2. Абмэд Д. Результаты исследования по распространению арбовирусов в Монголии: Автореф. дис. ... д-ра биол. наук. - Улаанбаатар, 2006.
  3. Верхозина М. М., Злобин В. И., Козлова И. В. и др. Эколого-генетический анализ региональной популяции вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 53-59.
  4. Данчинова Г. А., Хаснатинов М. А., Злобин В. И. и др. Современная ситуация по клещевому энцефалиту в Монголии // Материалы расширенного пленума проблемной комиссии "Клещевой энцефалит и другие вирусные энцефалиты". М., 2003. - С. 36-37.
  5. Демина Т. В., Джиоев Ю. П., Верхозина М. М. и др. Генетическая вариабельность и генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью дезоксирибонуклеотидных зондов // Вопр. вирусол. - 2009. - Т. 54, № 3. - С. 33-42.
  6. Злобин В. И., Демина Т. В., Беликов С. И. и др. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента гена белка оболочки E. // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. - С. 16-21.
  7. Карань Л. С., Маленко Г. В., Бочкова Н. Г. и др. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). - С. 34-40.
  8. Gritsun T. S., Frolova T. V., Zhankov A. I. et al. Characterization of a siberian virus isolated from a patient with progressive chronic tick-borne encephalitis // J. Virol. - 2003. - Vol. 77, N 1. - P. 25-36.
  9. Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucl. Acids Symp. Ser. - 1999. - Vol. 41. - P. 95-98.
  10. Hayasaka D., Ivanov L., Leonova G. et al. Distribution and characterization of tick-borne encephalitis viruses from Siberia and far-eastern Asia // J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82. - P. 1319-1328.
  11. Hopp T. P., Woods K. R. Prediction of protein antigenic determinants from amino acid sequences // Proc. Natl. Acad Sci. USA. - 1981. - Vol. 78. - P. 3824-3828.
  12. Khasnatinov M. A., Danchinova G. A., Unursaikhan U. et al. Characterization of tick-borne encephalitis virus that caused the lethal meningoencephalitis in human in Mongolia // The International conference "Zoonotic infectious diseases and tourism": Reports. 30 March 2009. Ulaanbaatar, 2009. - P. 88-94.
  13. Kunz C., Heinz F. X. Tick-borne encephalitis // Vaccine. - 2003. - Vol. 21. - P. 1-2.
  14. Labuda M., Jiang W. R., Kaluzova M. et al. Change in phenotype of tick-borne encephalitis virus following passage in Ixodes ricinus ticks and associated amino acid substitution in the envelope protein // Virus Res. - 1994. - Vol. 31. - P. 305-315.
  15. Lars Lindquist, Olli Vapalahti. Tick-borne encephalitis // Lancet. - 2008. - Vol. 371. - P. 1861-1871.
  16. Mandl C. W., Guikhoo F., Holzmann H. et al. Antigenic structure of the flavivirus envelope protein E at the molecular level, using tick-borne encephalitis virus as a model // J. Virol. - 1989. - Vol. 63. - P. 564-571.
  17. Mandl C. W., Kroschewski H., Allison S. L. et al. Adaptation of tick-borne encephalitis virus to BHK-21 cells results in the formation of multiple heparan sulfate binding sites in the envelope protein and attenuation in vivo // J. Virol. - 2001. - Vol. 75. - P. 5627-5637.
  18. Rey F. A., Heinz F. X., Mandl C. et al. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2A resolution. // Nature. - 1995. - Vol. 375. - P. 291-298.
  19. Rice C. Flaviviridae: the viruses and their replication // Fields virology / Eds. B. Frields, M. D. Knipe. - Philadelphia; New York, 1996. - P. 931-960.
  20. Romanova L., Gmyl A. P., Dzhivanian T. I. et al. Microevolution of tick-borne encephalitis virus in course of host alternation // Virology. - 2007. - Vol. 362. - P. 75-84.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2010 Khasnatinov M.A., Danchinova G.A., Kulakova N.V., Tungalag K., Arbatskaya E.V., Mironova L.V., Tserennorov D., Bolormaa G., Otgonbaatar D., Zlobin V.I., Khasnatinov M.A., Danchinova G.A., Kulakova N.V., Tungalag K., Arbatskaya E.V., Mironova L.V., Tserennorov D., Bolormaa G., Otgonbaatar D., Zlobin V.I.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies