Генетическая характеристика возбудителя клещевого энцефалита в Монголии


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В 2008 г. в Монголии умер больной с диагнозом "менингоэнцефалит" и укусом клеща в анамнезе. Целью данной работы было охарактеризовать вирус, вызвавший гибель заболевшего человека. Вирус идентифицировали, применив филогенетический анализ фрагмента генома вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) длиной 520 нуклеотидных оснований, который кодирует фрагмент белка E ВКЭ между аминокислотами 52-223. РНК ВКЭ обнаружена в образцах продолговатого мозга, коры головного мозга и мягкой оболочки головного мозга и не выявлена в тканях мозжечка. По генетической структуре исследованного фрагмента вирус наиболее близок к представителям дальневосточного субтипа. Ближайшим родственником оказался вирус 740-84 (GenBank EU878282), изолированный в Бурятии от красно-серой полевки и существенно отличающийся от дальневосточного вируса Sofjin. В пределах изученного фрагмента белка E обнаружены 2 аминокислотные замены - H86R и V167A. В работе впервые описан возбудитель клещевого энцефалита на территории Монголии и обсуждаются вопросы эволюции и патогенности ВКЭ.

Список литературы

  1. Абмэд Д., Нимадава П., Андреев В. П. и др. Исследование по арбовирусным инфекциям в МНР. Сообщение II. Изоляция вируса клещевого энцефалита в Селенгинском аймаке // Мон тезисд, Улаанбаатар, стр. 22.
  2. Абмэд Д. Результаты исследования по распространению арбовирусов в Монголии: Автореф. дис. ... д-ра биол. наук. - Улаанбаатар, 2006.
  3. Верхозина М. М., Злобин В. И., Козлова И. В. и др. Эколого-генетический анализ региональной популяции вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 53-59.
  4. Данчинова Г. А., Хаснатинов М. А., Злобин В. И. и др. Современная ситуация по клещевому энцефалиту в Монголии // Материалы расширенного пленума проблемной комиссии "Клещевой энцефалит и другие вирусные энцефалиты". М., 2003. - С. 36-37.
  5. Демина Т. В., Джиоев Ю. П., Верхозина М. М. и др. Генетическая вариабельность и генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью дезоксирибонуклеотидных зондов // Вопр. вирусол. - 2009. - Т. 54, № 3. - С. 33-42.
  6. Злобин В. И., Демина Т. В., Беликов С. И. и др. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента гена белка оболочки E. // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. - С. 16-21.
  7. Карань Л. С., Маленко Г. В., Бочкова Н. Г. и др. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). - С. 34-40.
  8. Gritsun T. S., Frolova T. V., Zhankov A. I. et al. Characterization of a siberian virus isolated from a patient with progressive chronic tick-borne encephalitis // J. Virol. - 2003. - Vol. 77, N 1. - P. 25-36.
  9. Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucl. Acids Symp. Ser. - 1999. - Vol. 41. - P. 95-98.
  10. Hayasaka D., Ivanov L., Leonova G. et al. Distribution and characterization of tick-borne encephalitis viruses from Siberia and far-eastern Asia // J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82. - P. 1319-1328.
  11. Hopp T. P., Woods K. R. Prediction of protein antigenic determinants from amino acid sequences // Proc. Natl. Acad Sci. USA. - 1981. - Vol. 78. - P. 3824-3828.
  12. Khasnatinov M. A., Danchinova G. A., Unursaikhan U. et al. Characterization of tick-borne encephalitis virus that caused the lethal meningoencephalitis in human in Mongolia // The International conference "Zoonotic infectious diseases and tourism": Reports. 30 March 2009. Ulaanbaatar, 2009. - P. 88-94.
  13. Kunz C., Heinz F. X. Tick-borne encephalitis // Vaccine. - 2003. - Vol. 21. - P. 1-2.
  14. Labuda M., Jiang W. R., Kaluzova M. et al. Change in phenotype of tick-borne encephalitis virus following passage in Ixodes ricinus ticks and associated amino acid substitution in the envelope protein // Virus Res. - 1994. - Vol. 31. - P. 305-315.
  15. Lars Lindquist, Olli Vapalahti. Tick-borne encephalitis // Lancet. - 2008. - Vol. 371. - P. 1861-1871.
  16. Mandl C. W., Guikhoo F., Holzmann H. et al. Antigenic structure of the flavivirus envelope protein E at the molecular level, using tick-borne encephalitis virus as a model // J. Virol. - 1989. - Vol. 63. - P. 564-571.
  17. Mandl C. W., Kroschewski H., Allison S. L. et al. Adaptation of tick-borne encephalitis virus to BHK-21 cells results in the formation of multiple heparan sulfate binding sites in the envelope protein and attenuation in vivo // J. Virol. - 2001. - Vol. 75. - P. 5627-5637.
  18. Rey F. A., Heinz F. X., Mandl C. et al. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2A resolution. // Nature. - 1995. - Vol. 375. - P. 291-298.
  19. Rice C. Flaviviridae: the viruses and their replication // Fields virology / Eds. B. Frields, M. D. Knipe. - Philadelphia; New York, 1996. - P. 931-960.
  20. Romanova L., Gmyl A. P., Dzhivanian T. I. et al. Microevolution of tick-borne encephalitis virus in course of host alternation // Virology. - 2007. - Vol. 362. - P. 75-84.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Хаснатинов М.А., Данчинова Г.А., Кулакова Н.В., Tungalag K., Арбатская Е.В., Миронова Л.В., Tserennorov D., Bolormaa G., Otgonbaatar D., Злобин В.И., Khasnatinov M.A., Danchinova G.A., Kulakova N.V., Tungalag K., Arbatskaya E.V., Mironova L.V., Tserennorov D., Bolormaa G., Otgonbaatar D., Zlobin V.I., 2010

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах