Том 49, № 1 (2004)

С целью выявления подтипов ВИЧ-1, циркулирующих в 1999-2002 гг. в других группах риска, среди лиц, никогда не употреблявших наркотики внутривенно, проведен анализ 52 независимо полученных образцов крови. Анализ проводили методами электрофоретической подвижности гетеродуплексов и определения нуклеотидной последовательности С2-V3 области env. У лиц, заразившихся в результате гетеросексуальных контактов, выявлены вирусы 4 подтипов (А, В, С и G), а также вариант с мозаичной структурой gagAenvB. При этом в данной группе риска доминировали варианты ВИЧ-1 подтипа А, обнаруженные в 22 (73,3%) из 30 исследованных образцов. Анализ нуклеотидных последовательностей указывает на высокую степень гомологии между вирусами, выявленными ранее среди наркоманов, и изолятами, обнаруженными у лиц, заразившихся гетеросексуальным путем. С другой стороны, среди мужчин, инфицированных в результате половых контактов с мужчинами, по-прежнему продолжают распространяться варианты ВИЧ-1 подтипа В, выявленные нами во всех 16 исследованных случаях.

Определяли субтипы HBsAg в образцах крови потребителей инъекционных наркотиков (ПИН) и доноров из 10 городов Западной Сибири с помощью 6 высокоспецифических моноклинальных антител методом ИФА. В образцах крови ПИН Новосибирска выявлено 2 субтипа HBsAg; их относительная встречаемость: 3% ayw2; 97% ayw3 (var А и В). В образцах донорской крови установлено 3 субтипа HBsAg; их относительная встречаемость: 57% ayw2; 42% ayw3 (var А и В); 1% adw2. Полученные данные позволяют разработать первую национальную панель сывороток, содержащую разные субтипы HBsAg ВГВ, характерные для России.

Изучен генетический полиморфизм штаммов вирусов простого герпеса типов 1 (ВПГ-1) и 2 (ВПГ-2). С использованием ПЦР-системы, которая позволяет амплифицировать фрагмент гена ДНК-полимеразы 4 герпесвирусов: ВПГ-1, ВПГ-2, вируса Эпштейна-Барр и цитомегаловируса. Полученные ампликоны анализировали методом полиморфизма размеров рестрикционных фрагментов (ПДРФ) с рестриктазами Rsal, Taql и Hinfl. Четыре штамма ВПГ-1 дали идентичный рестрикционный профиль. Штамм G (ВПГ-2) также демонстрировал ожидаемые рестрикционные профили, однако для штамма ВН (ВПГ-2) были получены противоречивые результаты: рестрикционные профили с рестриктазами Hinfl и Rsal соответствовали ВПГ-2, а рестрикционный профиль с Taql - ВПГ-1. В результате сиквенса соответствующих фрагментов штаммов G и ВН была обнаружена точечная мутация, которая локализуется в сайте рестрикции Taql. Разработанную ПЦР совместно с ПДРФ использовали также для генотипирования 75 у рогенитальных образцов от женщин сгенитальным герпесом из медицинских учреждений Москвы. ВПГ-1 был обнаружен в 18(24%), а ВПГ-2 - в 57 (76%) образцах. Не отмечено изменений рестрикционного профиля для ВПГ-2 среди исследованных образцов, все они демонстрировали рестрикционный профиль, подобный штамму G. Таким образом, генитальный герпес, ассоциированный с ВПГ-2, в московской популяции обладает генетической стабильностью.

Проведенные вирусологические, серологические и молекулярно-биологические исследования позволили установить, что главным этиологическим агентом, вызвавшим основную массу вспышечной энтеровирусной инфекции в Витебске в 2001 г., был вирус Коксаки В4, выделенный из спинно-мозговой жидкости и носоглоточных смывов больных. При осуществлении санитарно-вирусологических исследований в питьевой воде, в том числе в очагах инфекции, были также обнаружены вирусы Коксаки В4 (в 30% проб при использовании культу рального метода и в 76,9% проб при исследовании методом ПЦР). Кроме того, в процессе исследования питьевой воды методом интегрированной с культурой клеток ПЦР в отношении "-"цепи РНК энтеровирусов (ЭВ) были обнаружены инфекционные нецитолитические ЭВ с измененными биологическими свойствами, не выявляемые классическим культуральным методом. Характерные клиникоэпидемиологические особенности вспышечной заболеваемости ("взрывное" начало, многообразие клинических форм, наличие смешанных энтеровирусных инфекций, спад заболеваемости после хлорирования питьевой воды), а также выделение от больных и из воды одного и того же серотипа ЭВ указывают на возможную связь данной вспышки с водным фактором.

Вирус лейкоза крупного рогатого скота (ВЛ КРС), циркулирующий на территории Украины, охарактеризован посредством определения подвидовой принадлежности. Провирусная ДНК ВЛ КРС выделена из лимфоцитов периферической крови животных черно-пестрой породы из неблагополучных в отношении лейкоза хозяйств Харьковской области, природно инфицированных ВЛ КРС. Фрагмент env-гена провирусной ДНК амплифицирован, секвенирован и проанализирован после обработки ампликона тремя ферментами рестрикции - BamHI, Bell, Pvull. Проведенный анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов показал, что украинский изолят ВЛ КРС может быть классифицирован и отнесен к австралийскому подвиду, одному из 3 известных подвидов. Множественное выравнивание и филогенетический анализ фрагмента env-гена изолятов ВЛ КРС из базы данных EMBL продемонстрировали, что эволюционно украинский изолят расположен отдаленно от кластеров изолятов как бельгийского, японского, так и австралийского подвидов, а также имеет наибольшее количество (4) несовпадающих нуклеотидов для проанализированного высококонсервативного локуса env-гена ВЛ КРС длиной 444 пары нуклеотидов