Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology11822ArticlesСтатьиDNA polymorphism of herpes simplex virus, types 1 and 2, from laboratory strains and clinical samples of patients with genital herpesПолиморфизм ДНК вируса простого герпеса типов 1 и 2 из лабораторных штаммов и клинического материала от пациентов с генитальным герпесом15022004491NO1 (2004)№1 (2004)232709062023Copyright ©; 2004, Kruglova A.I., Nikolayeva N.P., Nyukhalova Y.V., Barinsky I.F., Alimbarova L.M., Dyomkin V.V.Copyright ©; 2004, Круглова А.И., Николаева Н.П., Нюхалова Ю.В., Баринский И.Ф., Алимбарова Л.М., Демкин В.В.2004Kruglova A.I., Nikolayeva N.P., Nyukhalova Y.V., Barinsky I.F., Alimbarova L.M., Dyomkin V.V.Круглова А.И., Николаева Н.П., Нюхалова Ю.В., Баринский И.Ф., Алимбарова Л.М., Демкин В.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11822

Polymerase chain reaction (PCR), that can amplify a fragment of the DNA-polymerase gene of 4 herpes viruses, i.e. herpes simplex viruses, type 1 (HSV-1), herpes simplex viruses, type 2 (HSV-2), Epstein-Barr virus and cytomegalovirus , was made use of to study the genetic polymorphism of HSV-1 and HSV-2 strains. The obtained amplicons were analyzed by the method of restriction-size fragments' polymorphism (RSFP) with restrictases Rsal, Taql and Hinfl. Four HSV-1 strains had an identical restriction profile. Strain G (HSV-2) also displayed the expected restriction profiles, however, contradictory results were obtained for strain BH (HSV-2): the restriction profiles with restrictases Hinfl and Rsal corresponded to HSV-2, and the restriction profile with Taql corresponded to HSV-1. The sequencing of appropriate fragments of strains G and BH revealed a dot-type mutation localized in Taql restriction site. The thus worked out PCR was used jointly with RSFP in the genoty ping of 75 urogenital samples obtained from women with genital herpes who were treated at Moscow patient-care facilities. HSV-1 and HSV2 were detected in 18 (24%) and 57 (76%) of samples, respectively. No changes were registered in the restriction profile for HSV-2 among the investigated samples and all of them had the restriction profile similar to that of strain G. The conclusion is that genital herpes associated with HSV-2 is genetically stable within its Moscow population.

Изучен генетический полиморфизм штаммов вирусов простого герпеса типов 1 (ВПГ-1) и 2 (ВПГ-2). С использованием ПЦР-системы, которая позволяет амплифицировать фрагмент гена ДНК-полимеразы 4 герпесвирусов: ВПГ-1, ВПГ-2, вируса Эпштейна-Барр и цитомегаловируса. Полученные ампликоны анализировали методом полиморфизма размеров рестрикционных фрагментов (ПДРФ) с рестриктазами Rsal, Taql и Hinfl. Четыре штамма ВПГ-1 дали идентичный рестрикционный профиль. Штамм G (ВПГ-2) также демонстрировал ожидаемые рестрикционные профили, однако для штамма ВН (ВПГ-2) были получены противоречивые результаты: рестрикционные профили с рестриктазами Hinfl и Rsal соответствовали ВПГ-2, а рестрикционный профиль с Taql - ВПГ-1. В результате сиквенса соответствующих фрагментов штаммов G и ВН была обнаружена точечная мутация, которая локализуется в сайте рестрикции Taql. Разработанную ПЦР совместно с ПДРФ использовали также для генотипирования 75 у рогенитальных образцов от женщин сгенитальным герпесом из медицинских учреждений Москвы. ВПГ-1 был обнаружен в 18(24%), а ВПГ-2 - в 57 (76%) образцах. Не отмечено изменений рестрикционного профиля для ВПГ-2 среди исследованных образцов, все они демонстрировали рестрикционный профиль, подобный штамму G. Таким образом, генитальный герпес, ассоциированный с ВПГ-2, в московской популяции обладает генетической стабильностью.

polymerase chain reactionrestriction analysisherpes simplex virus of types 1 and 2genetic polymorphismполимеразная цепная реакциярестржтазный анализвирусы простого герпеса типов 1 и 2генетический полиморфизмБаринский И. Ф., Бакаев В. В., Посевая Т. А. и др. Подбор праймеров и их использование в полимеразкой цепной реакции для диагностики инфекций, вызываемых вирусами простого герпеса и цитомегаловирусом // Вопр. вирусол. - 1994. - № 6. - С. 245-247.Сенкевич Т. Г., Гибадулин Р. А., Угрюмое Е. П. и др. Типирование штаммов вируса простого герпеса методом анализа вирусной ДНК с помощью рестрикционных эндонуклеаз // Там же. - 1982. - № 3. - С. 330-334.Ashley R. L., Wald A. Genital herpes: review of the epidemic and potential use of type-specific serology // Clin. Microbiol. - 1999.-Vol. 12, N l.-P. 1-8.Cheong W. K., Thirumoorthy Т., Doraisingham S., Ling A. E. Clinical and laboratory study of first episode genital herpes in Singapore // Int. J. STD AIDS. - 1990. - Vol. I. - P. 195198.Demkin V. V., Kruglova A. I., Nikolaeva N. P., Yurchenko J. V. Detection and species identification of four human herpesviruses using polymerase chain reaction coupled with restriction endonuclease analysis // J. virol. Meth. - 2002. - Vol. 103. - P. 121-128.Duffy K. E., Quail M. R., Nguyen Т. Т. et al. Assessing the contribution of the herpes simplex virus DNA polymerase to spontaneous mutations // BMC Infect. Dis. - 2002. - Vol. 2. - P. 7.Kinghorn G. R. Epidemiology of genital herpes // J. Int. Med. Res. - 1994. - Vol. 22. - Suppl. l.-P. 14A-23A.Lafferty W. E., Downey L., Celum C., Wald A. Herpes simplex virus type 1 as a cause of genital herpes: impact on surveillance and prevention // J. Infect. Dis. - 2000. - Vol. 181, N 4. - P. 1454-1457.Lowhagen G. В., Jansen E., Nordenfelt E., Lycke E. Epidemiology of genital herpes infections in Sweden // Acta Derm. Venereol. - 1990. - Vol. 70, N 4. - P. 330-334.Marshall D. S., Linfert D. R., Draghi A. et al. Identification of herpes simplex virus genital infection: comparison of a multiplex PCR assay and traditional viral isolation techniques // J. Mod. Pathol. - 2001. - Vol. 4, N 3. - P. 152-156.Sarisky R. Т., Nguyen Т. Т., Duffy К. Е. et al. Difference in incidence of spontaneous mutations distinct between herpes simplex virus types 1 and 2 // Antimicrob. Agents Chemother. - 2000. - Vol. 44. - P. 1524-1529.Wald A., Zeh J., Selke S. et al. Virologic characteristics of subclinical and symptomatic genital herpes infections // N. Engl. J. Med. - 1995. - Vol. 333. - P. 770-775.