Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology11833ArticlesСтатьиTyping of bovine leucosis virus circulating in UkraineТипирование вируса лейкоза крупного рогатого скота, циркулирующего в Украине15022004491NO1 (2004)№1 (2004)394409062023Copyright ©; 2004, Limansky A.P., Geue L., Limanskaya O.Y., Beier D.Copyright ©; 2004, Лиманский А.П., Geue L., Лиманская О.Ю., Beier D.2004Limansky A.P., Geue L., Limanskaya O.Y., Beier D.Лиманский А.П., Geue L., Лиманская О.Ю., Beier D.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11833

Bovine leucosis virus (BLV), circulating in the Ukrainian territory, was characterized through the definition of its subspecies affiliation. The pro-viral BLV DNA was isolated from peripheral-blood lymphocytes of naturally-HIVinfected black-variegate animals taken from leucosis-affected farms in the Kharkov Region. The env-gene fragment of pro-viral DNA was amplified, sequenced and analyzed after the amplicon had been treated by three restriction enzymes, i.e. BamH I, Bel I and Pvu II. According to the analysis of restriction-fragments' length polymorphism, the Ukrainian BLV isolate can be classified as belonging to the Australian subspecies, i.e. to one of the 3 known subspecies. Multiple alignment and phylogenetic analysis of the env-gene fragment of BLV isolates from the EMBL database showed that evolutionally the Ukrainian isolate is distantly located from the isolates' clusters of the Belgian, Japanese and Australian subspecie and has the biggest quantity (4) of non-coinciding nucleotides for the analyzed highly conservative locus of the BLV env-gene with a length of 444 pair of nucleotides.

Вирус лейкоза крупного рогатого скота (ВЛ КРС), циркулирующий на территории Украины, охарактеризован посредством определения подвидовой принадлежности. Провирусная ДНК ВЛ КРС выделена из лимфоцитов периферической крови животных черно-пестрой породы из неблагополучных в отношении лейкоза хозяйств Харьковской области, природно инфицированных ВЛ КРС. Фрагмент env-гена провирусной ДНК амплифицирован, секвенирован и проанализирован после обработки ампликона тремя ферментами рестрикции - BamHI, Bell, Pvull. Проведенный анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов показал, что украинский изолят ВЛ КРС может быть классифицирован и отнесен к австралийскому подвиду, одному из 3 известных подвидов. Множественное выравнивание и филогенетический анализ фрагмента env-гена изолятов ВЛ КРС из базы данных EMBL продемонстрировали, что эволюционно украинский изолят расположен отдаленно от кластеров изолятов как бельгийского, японского, так и австралийского подвидов, а также имеет наибольшее количество (4) несовпадающих нуклеотидов для проанализированного высококонсервативного локуса env-гена ВЛ КРС длиной 444 пары нуклеотидов

bovine leucosis virusUkrainetypingDNApolymerase chain reactionanalysis of restriction-fragments' length polymorphismвирус лейкоза крупного рогатого скотаУкраинатипированиеДНКполимеразная цепная реакцияанализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментовБродский Л. К., Драчев А. Л., Татузов Р. Л., Чумаков К. М. Пакет прикладных программ для анализа последовательностей биополимеров: GeneBee // Биополимеры и клетка. - 1991.-Т. 7. -С. 10-14.Елов А. А., Козлова А. В. Диагностика и мониторинг ВИЧинфекции на генетическом уровне // Успехи соврем, биол. - 1996. -Т. 116. -С. 48-59.Лимфоциты. Методы / Под ред. Дж. Клауса. - М., 1990.Beier D., Blankenstein P., Marquardt O., Kuzmak J. Identification of different BLV provirus isolates by PCR, RELPA and DNA sequencing // Berl. Munch. Tierarztl. Wschr. - 2001. - Bd 114. -S. 252-256.Coulston J., Naif H., Brandon R. et al. Molecular cloning and sequencing of an Australian isolate of proviral bovine leukaemia DNA: comparison with other isolates // J. Gen. Virol. - 1990. -Vol.71. -P. 1737-1747.Dequiedt F., Kettmann R., Burny A., Willems L. Mutations in the p53 tumor-suppressor gene are frequently associated with bovine leukemia virus-induced leukemogenesis in cattle but not in sheep // Virology. - 1995. - Vol. 209. - P. 676-683.Dube S., Bachman S., Spicer T. et al. Degenerate and specific PCR assays for the detection of bovine leukaemia virus and primate T-cell leukaemia/lymphoma virus pol DNA and RNA: phylogenetic comparisons of amplified sequences from cattle and primates from around the world // J. Gen. Virol. - 1997. -Vol. 78.-P. 1389-1398.Hayasaka D., Suzuki Y., Kariwa H. et al. Phylogenetic and virulence analysis of tick-borne encephalitis viruses from Japan and far-eastern Russia // Ibid. - 1999. - Vol. 80. - P. 3127- 3135.Hayasaka D., Ivanov L., Leonova G. et al. Distribution and characterization of tick-borne encephalitis viruses from Siberia and far-eastern Asia // Ibid. - 2001. - Vol. 82. - P. 1319- 1328.Limansky A., Limanskaya O. Comparison of primer sets for detection of bovine leukemia virus by polymerase chain reaction // Bull. Vet. Inst, in Pulawy. - 2002. - Vol. 46. - P. 27-36.Rychlik W., Spencer W. J., Rhoads R. E. Optimization of the annealing temperature for DNA amplification in vitro // Nucl. Acids Res. - 1990. - Vol. 18. - P. 6409-6417.Willems L., Thienpont E., Kerkhops P. Bovine leukemia virus, an animal model for the study of intrastrain variability // J. Virol. - 1993. - Vol. 67. - P. 1086-1089.Willems L., Kerkhofs P., Dequiedt F. Attenuation of bovine leukemia virus by deletion of R3 and G4 open reading frames // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1994. - Vol. 91. P. 11532-11536.Zaghawa A., Beier D., Abd El-Rahim H. et al. An outbreak of enzootic bovine leukosis in Upper Egypt: clinical, laboratory and molecular-epidemiological studies // J. Vet. Med. - 2002. - Vol. B49. - P. 123-129.