Results of investigation of ticks in Volga river delta (Astrakhan region, 2017) for Crimean-Congo hemorrhagic fever virus ( Nairoviridae ,  Orthonairovirus , CCHFV) and other tick-borne arboviruses

E. V. Vakalova; Вакалова Е. В.; A. M. Butenko; Бутенко А. М.; T. V. Vishnevskaya; Вишневская Т. В.; T. E. Dorofeeva; Дорофеева Т. Е.; A. K. Gitelman; Гительман А. К.; L. N. Kulikova; Куликова Л. Н.; D. K. Lvov; Львов Д. К.; S. V. Alkhovsky; Альховский С. В.

doi:10.36233/0507-4088-2019-64-5-221-228

Results of investigation of ticks in Volga river delta (Astrakhan region, 2017) for Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (Nairoviridae, Orthonairovirus, CCHFV) and other tick-borne arboviruses

Authors: Vakalova E.V.¹^,2^,3, Butenko A.M.⁴, Vishnevskaya T.V.⁴, Dorofeeva T.E.⁴, Gitelman A.K.⁴, Kulikova L.N.⁵, Lvov D.K.⁴, Alkhovsky S.V.⁴
Affiliations:
1. Astrakhan Anti-plague Station
2. Astrakhan State Medical University
3. A.M. Nichogi Regional Infectious Clinical Hospital
4. D.I. Ivanovsky Institute of Virology National Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F.Gamaleya
5. Center of Hygiene and Epidemiology in Astrakhan region
Issue: Vol 64, No 5 (2019)
Pages: 221-228
Section: ORIGINAL RESEARCH
Submitted: 30.12.2019
Accepted: 30.12.2019
Published: 20.10.2019
URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/13
DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-2019-64-5-221-228
ID: 13

Cite item

Full Text

Abstract
About the authors
References
Supplementary files
Statistics

Abstract

Introduction. There are natural foci of Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) that vectored by Hyalomma marginatum ticks in Volga river delta (Astrakhan region, South of Russia). The circulation of Dhori virus (DHOV) (Thogotovirus: Orthomyxoviridae) has been also shown here. We hypothesized that other tick-borne arboviruses are also likely to circulate in the region. In particular, Bhanja virus (Phlebovirus: Phenuiviridae), Wad Medani virus (Orbivirus: Reoviridae), and Tamdy virus (Orthonairovirus: Nairoviridae), which were found to circulate in neighboring regions and are vectored by Haemaphysalis spp., Dermacenter spp., and Hyalomma spp. ticks.

Goals and objectives. The aim of the study was to examine ixodid ticks in Volga river delta for the presence of CCHFV, DHOV, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus.

Material and methods. Ticks were collected in Volga river delta in 2017. We used molecular genetic methods for the detection and analysis of nucleic acids (PCR, sequencing, phylogenetic analysis).

Results. We detect CCHFV and DHOV RNA in H. marginatum ticks. The rate of infected H. marginatum ticks was 1.98% for CCHFV and 0.4% for DHOV. The results of genetic analysis showed that found DHOV strains are almost identical (99- 100% in the M gene) and forms a separate genetic lineage alongside of Batken virus from Central Asia. At the same time, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus were not found in ticks, collected in this region.

Conclusions. DHOV is circulating in the natural foci of CCHF in the Volga river delta. The ratio of infection of H. marginatum with CCHFV and DHOV was determined for the first time.

Keywords

Hyalomma marginatum, Dermacenter marginatus

References

Зимина Ю.В., Куликова Л.Н., Салько В.Н., Ковтунов А.И. Иксодовые клещи в Астраханской области, их роль в формировании природных очагов и передаче арбовирусов человеку. В кн.: Вопросы риккетсиологии и вирусологии (Сбориник научных трудов). Астрахань-Москва; 1996: 58-62.
Зимина Ю.В., Бируля Н.Б., Березин В.В. Материалы зоолого-паразитологической характеристики Крымской геморрагической лихорадки в Астраханской области. В кн.: Труды Института полиомиелита и вирусных энцефалитов. Том 7. М.; 1965: 288-395.
Вакалова Е.В., Волынкина А.С., Котенев Е.С., Куликова Л.Н., Викторова Н.В. Детекция и генетическая характеристика РНК-изолятов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, выделенных из клещей Hyalomma marginatum в Астраханской области (2016 г.). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2017; 22(5): 248-53. Doi: https://doi.org/10.1882/1560-9529-2017-22-5-248-253
Смирнова С.Е., Карань Л.С., Колесникова Н.М., Рыбкин В.С., Платонов А.Е. Распространение вируса Баткен/Дхори в эндемичной по Крымской-Конго геморрагической лихорадке Астраханской области РФ. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2011; (1): 12.
Львов Д.Н., Джаркенов А.Ф., Аристова В.А., Ковтунов А.И., Громашевский В.Л., Вышемирский О.И. и др. Изоляция вирусов Дхори (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) и Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Bunyaviridae, Nairovirus) от зайца (Lepus europaeus) и собранных с него клещей Hyalomma marginatus в средней зоне дельты Волги, Астраханская область, 2001 г. Вопросы вирусологии. 2002; 47(4): 32-6.
Бутенко А.М., Чумаков В.М. Выделение нового для СССР арбовируса «Астра» из клещей H. plumbeum и комаров An. hyrcanus в Астраханской области. В кн.: Вопросы медицинской вирусологии. Часть 2. М.; 1971: 11-112.
Бутенко А.М., Лещинская Е.В., Семашко И.В., Донец М.А., Мартьянова Л.И. Вирус Дхори — возбудитель заболевания человека, пять случаев лабораторной инфекции. Вопросы вирусологии. 1987; 32(6): 724-9.
Shah K.V., Work T.H. Bhanja virus: a new arbovirus from ticks Haemaphysalis intermedia Warburton and Nuttall, 1909, in Orissa, India. Indian J. Med. Res. 1969; 57(5): 793-8.
Verani P., Balducci M., Lopes M.C., Sacca G. Isolation of Bhanja virus from Haemaphysalis ticks in Italy. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1970; 19(1): 103-5. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1970.19.103
Vesenjak-Hirjan J., Calisher C.H., Brudnjak Z., Tovornik D., Skrtic N., Lazuick J.S. Isolation of Bhanja virus from ticks in Yugoslavia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1977; 26(5 Pt. 1): 1003-8. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1977.26.1003
Ungureanu A., Popovici V., Cătănaş F., Ioniţă I., Tutoveanu A., Safta M. Isolation of Bhanja virus in Romania. Arch. Roum. Pathol. Exp. Microbiol. 1990; 49(2): 139-45.
Pavlov P., Rosický B., Hubálek Z., Daniel M., Bárdos V., Minár J., et al. Isolation of Bhanja virus from ticks of the genus Haemaphysalis in southeast Bulgaria and presence of antibodies in pastured sheep. Folia Parasitol. (Praha). 1978; 25(1): 67-73.
Filipe A.R., Alves M.J., Karabatsos N., de Matos A.P., Nuncio M.S., Bacellar F. Palma virus, a new bunyaviridae isolated from ticks in Portugal. Intervirology. 1994; 37(6): 348-51. Doi: https://doi.org/10.1159/000150399
Hubálek Z. Geographic distribution of Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1987; 34(1): 77-86.
Lvov D.K., Gromashevsky V.L., Zakaryan V.A., Skvortsova T.M., Berezina L.K., Gofman Y.P., et al. Razdan virus, a new ungrouped bunyavirus isolated from Dermacentor marginatus ticks in Armenia. Acta Virol. 1978; 22(6): 506-8.
Mádr V., Hubálek Z., Zendulková D. Experimental infection of sheep with Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1984; 31(1): 79-84.
Calisher C.H., Goodpasture H.C. Human infection with Bhanja virus. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1975; 24(6 Pt. 1): 1040-2. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1975.24.1040
Punda V., Ropac D., Vesenjak-Hirjan J. Incidence of hemagglutination-inhibiting antibodies for Bhanja virus in humans along the north-west border of Yugoslavia. Zentralbl. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. A. 1987; 265(1-2): 227-34.
Азарян А.Р., Гришанова А.П., Бутенко А.М., Ларичев В.Ф., Чалов В.В., Инкина Т.Е. и др. Серологическая диагностика арбовирусных инфекций в Астраханской области. В кн.: Бутенко А.М., Баринский И.Ф., Карганова Г.Г., Малеев В.В., Терехин С.А., ред. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции». М.: Гриф и К; 2007: 115-9.
Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К. и др. Генетическая характеристика вируса Вад Медани (WMV - Wad Medani virus) (Reoviridae, Orbivirus), изолированного в Туркмении, Казахстане и Армении из иксодовых клещей Hyalomma asiaticum Schulze et Schlottke, 1930 и в Таджикистане из H. anatolicum Koch, 1844 (Ixodidae: Hyalomminae). Вопросы вирусологии. 2014; 59(4): 25-30.
Lvov D.K., Sidorova G.A., Gromashevsky V.L., Kurbanov M., Skvoztsova L.M., Gofman Y.P., et al. Virus “Tamdy” – a new arbovirus, isolated in the Uzbee S.S.R. and Turkmen S.S.R. from ticks Hyalomma asiaticum asiaticum Schulee et Schlottke, 1929, and Hyalomma plumbeum plumbeum Panzer, 1796. Arch. Virol. 1976; 51(1-2): 15-21. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01317830
Brinkmann A., Dincer E., Polat C., Hekimoglu O., Hacioglu S., Foldes K., et al. A metagenomic survey identifies Tamdy orthonairovirus as well as divergent phlebo-, rhabdo-, chu- and flavi-like viruses in Anatolia, Turkey. Ticks Tick Borne Dis. 2018; 9(5): 1173-83. Doi: https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.04.017
Львов Д.К. Лихорадка Тамды. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 783-5.
Liu X., Zhang X., Wang Z., Dong Z., Xie S., Jiang M., et al. A Tentative Tamdy Orthonairovirus Related to Febrile Illness in Northwestern China. Clin. Infect. Dis. 2019; pii: ciz602. Doi: https://doi.org/10.1093/cid/ciz602
Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anal. Biochem. 1987; 162(1): 156-9. Doi: https://doi.org/10.1006/abio.1987.9999
Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Львов Д.Н. и др. Генетическая характеристика вируса Баткен (BKNV-Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 33-7.
Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Аристова В.А., Гительман А.К. и др. Таксономия ранее негруппированного вируса Тамды (TAMV – Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schülce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) в Средней Азии и Закавказье. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 15-22.
Lvov D.K., Karas F.R., Tsyrkin Y.M., Vargina S.G., Timofeev E.M., Osipova N.Z., et al. Batken virus, a new arbovirus isolated from ticks and mosquitoes in Kirghiz S.S.R. Arch. Gesamte Virusforsch. 1974; 44(1): 70-3. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01242183
Lukashev A.N., Deviatkin A.A. Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia. Infect. Genet. Evol. 2018; 59: 23-7. Doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.01.016

Supplementary files

Supplementary Files

Action

1. JATS XML

Download

Username
Password
Remember me

Forgot password?	Register

Username
Password
Remember me

Forgot password?	Register