Results of investigation of ticks in Volga river delta (Astrakhan region, 2017) for Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (Nairoviridae, Orthonairovirus, CCHFV) and other tick-borne arboviruses

Cover Page


Cite item

Full Text

Abstract

Introduction. There are natural foci of Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) that vectored by Hyalomma marginatum ticks in Volga river delta (Astrakhan region, South of Russia). The circulation of Dhori virus (DHOV) (Thogotovirus: Orthomyxoviridae) has been also shown here. We hypothesized that other tick-borne arboviruses are also likely to circulate in the region. In particular, Bhanja virus (Phlebovirus: Phenuiviridae), Wad Medani virus (Orbivirus: Reoviridae), and Tamdy virus (Orthonairovirus: Nairoviridae), which were found to circulate in neighboring regions and are vectored by Haemaphysalis spp., Dermacenter spp., and Hyalomma spp. ticks.

Goals and objectives. The aim of the study was to examine ixodid ticks in Volga river delta for the presence of CCHFV, DHOV, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus.

Material and methods. Ticks were collected in Volga river delta in 2017. We used molecular genetic methods for the detection and analysis of nucleic acids (PCR, sequencing, phylogenetic analysis).

Results. We detect CCHFV and DHOV RNA in H. marginatum ticks. The rate of infected H. marginatum ticks was 1.98% for CCHFV and 0.4% for DHOV. The results of genetic analysis showed that found DHOV strains are almost identical (99- 100% in the M gene) and forms a separate genetic lineage alongside of Batken virus from Central Asia. At the same time, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus were not found in ticks, collected in this region.

Conclusions. DHOV is circulating in the natural foci of CCHF in the Volga river delta. The ratio of infection of H. marginatum with CCHFV and DHOV was determined for the first time.

About the authors

E. V. Vakalova

Astrakhan Anti-plague Station; Astrakhan State Medical University; A.M. Nichogi Regional Infectious Clinical Hospital

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-6121-5900
Astrakhan, 414024, Russia; Astrakhan, 414011, Russia; Astrakhan, 414011, Russia Russian Federation

A. M. Butenko

D.I. Ivanovsky Institute of Virology National Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F.Gamaleya

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-6152-5685
Moscow, 123098, Russia Russian Federation

T. V. Vishnevskaya

D.I. Ivanovsky Institute of Virology National Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F.Gamaleya

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6963-8681
Moscow, 123098, Russia Russian Federation

T. E. Dorofeeva

D.I. Ivanovsky Institute of Virology National Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F.Gamaleya

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8846-0092
Moscow, 123098, Russia Russian Federation

A. K. Gitelman

D.I. Ivanovsky Institute of Virology National Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F.Gamaleya

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-8410-2332
Moscow, 123098, Russia Russian Federation

L. N. Kulikova

Center of Hygiene and Epidemiology in Astrakhan region

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-3066-3430
Astrakhan, 414057, Russia Russian Federation

D. K. Lvov

D.I. Ivanovsky Institute of Virology National Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F.Gamaleya

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8176-6582
Moscow, 123098, Russia Russian Federation

S. V. Alkhovsky

D.I. Ivanovsky Institute of Virology National Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F.Gamaleya

Author for correspondence.
Email: s_alkhovsky@gamaleya.org
ORCID iD: 0000-0001-6913-5841
Moscow, 123098, Russia Russian Federation

References

  1. Зимина Ю.В., Куликова Л.Н., Салько В.Н., Ковтунов А.И. Иксодовые клещи в Астраханской области, их роль в формировании природных очагов и передаче арбовирусов человеку. В кн.: Вопросы риккетсиологии и вирусологии (Сбориник научных трудов). Астрахань-Москва; 1996: 58-62.
  2. Зимина Ю.В., Бируля Н.Б., Березин В.В. Материалы зоолого-паразитологической характеристики Крымской геморрагической лихорадки в Астраханской области. В кн.: Труды Института полиомиелита и вирусных энцефалитов. Том 7. М.; 1965: 288-395.
  3. Вакалова Е.В., Волынкина А.С., Котенев Е.С., Куликова Л.Н., Викторова Н.В. Детекция и генетическая характеристика РНК-изолятов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, выделенных из клещей Hyalomma marginatum в Астраханской области (2016 г.). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2017; 22(5): 248-53. Doi: https://doi.org/10.1882/1560-9529-2017-22-5-248-253
  4. Смирнова С.Е., Карань Л.С., Колесникова Н.М., Рыбкин В.С., Платонов А.Е. Распространение вируса Баткен/Дхори в эндемичной по Крымской-Конго геморрагической лихорадке Астраханской области РФ. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2011; (1): 12.
  5. Львов Д.Н., Джаркенов А.Ф., Аристова В.А., Ковтунов А.И., Громашевский В.Л., Вышемирский О.И. и др. Изоляция вирусов Дхори (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) и Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Bunyaviridae, Nairovirus) от зайца (Lepus europaeus) и собранных с него клещей Hyalomma marginatus в средней зоне дельты Волги, Астраханская область, 2001 г. Вопросы вирусологии. 2002; 47(4): 32-6.
  6. Бутенко А.М., Чумаков В.М. Выделение нового для СССР арбовируса «Астра» из клещей H. plumbeum и комаров An. hyrcanus в Астраханской области. В кн.: Вопросы медицинской вирусологии. Часть 2. М.; 1971: 11-112.
  7. Бутенко А.М., Лещинская Е.В., Семашко И.В., Донец М.А., Мартьянова Л.И. Вирус Дхори — возбудитель заболевания человека, пять случаев лабораторной инфекции. Вопросы вирусологии. 1987; 32(6): 724-9.
  8. Shah K.V., Work T.H. Bhanja virus: a new arbovirus from ticks Haemaphysalis intermedia Warburton and Nuttall, 1909, in Orissa, India. Indian J. Med. Res. 1969; 57(5): 793-8.
  9. Verani P., Balducci M., Lopes M.C., Sacca G. Isolation of Bhanja virus from Haemaphysalis ticks in Italy. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1970; 19(1): 103-5. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1970.19.103
  10. Vesenjak-Hirjan J., Calisher C.H., Brudnjak Z., Tovornik D., Skrtic N., Lazuick J.S. Isolation of Bhanja virus from ticks in Yugoslavia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1977; 26(5 Pt. 1): 1003-8. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1977.26.1003
  11. Ungureanu A., Popovici V., Cătănaş F., Ioniţă I., Tutoveanu A., Safta M. Isolation of Bhanja virus in Romania. Arch. Roum. Pathol. Exp. Microbiol. 1990; 49(2): 139-45.
  12. Pavlov P., Rosický B., Hubálek Z., Daniel M., Bárdos V., Minár J., et al. Isolation of Bhanja virus from ticks of the genus Haemaphysalis in southeast Bulgaria and presence of antibodies in pastured sheep. Folia Parasitol. (Praha). 1978; 25(1): 67-73.
  13. Filipe A.R., Alves M.J., Karabatsos N., de Matos A.P., Nuncio M.S., Bacellar F. Palma virus, a new bunyaviridae isolated from ticks in Portugal. Intervirology. 1994; 37(6): 348-51. Doi: https://doi.org/10.1159/000150399
  14. Hubálek Z. Geographic distribution of Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1987; 34(1): 77-86.
  15. Lvov D.K., Gromashevsky V.L., Zakaryan V.A., Skvortsova T.M., Berezina L.K., Gofman Y.P., et al. Razdan virus, a new ungrouped bunyavirus isolated from Dermacentor marginatus ticks in Armenia. Acta Virol. 1978; 22(6): 506-8.
  16. Mádr V., Hubálek Z., Zendulková D. Experimental infection of sheep with Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1984; 31(1): 79-84.
  17. Calisher C.H., Goodpasture H.C. Human infection with Bhanja virus. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1975; 24(6 Pt. 1): 1040-2. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1975.24.1040
  18. Punda V., Ropac D., Vesenjak-Hirjan J. Incidence of hemagglutination-inhibiting antibodies for Bhanja virus in humans along the north-west border of Yugoslavia. Zentralbl. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. A. 1987; 265(1-2): 227-34.
  19. Азарян А.Р., Гришанова А.П., Бутенко А.М., Ларичев В.Ф., Чалов В.В., Инкина Т.Е. и др. Серологическая диагностика арбовирусных инфекций в Астраханской области. В кн.: Бутенко А.М., Баринский И.Ф., Карганова Г.Г., Малеев В.В., Терехин С.А., ред. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции». М.: Гриф и К; 2007: 115-9.
  20. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К. и др. Генетическая характеристика вируса Вад Медани (WMV - Wad Medani virus) (Reoviridae, Orbivirus), изолированного в Туркмении, Казахстане и Армении из иксодовых клещей Hyalomma asiaticum Schulze et Schlottke, 1930 и в Таджикистане из H. anatolicum Koch, 1844 (Ixodidae: Hyalomminae). Вопросы вирусологии. 2014; 59(4): 25-30.
  21. Lvov D.K., Sidorova G.A., Gromashevsky V.L., Kurbanov M., Skvoztsova L.M., Gofman Y.P., et al. Virus “Tamdy” – a new arbovirus, isolated in the Uzbee S.S.R. and Turkmen S.S.R. from ticks Hyalomma asiaticum asiaticum Schulee et Schlottke, 1929, and Hyalomma plumbeum plumbeum Panzer, 1796. Arch. Virol. 1976; 51(1-2): 15-21. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01317830
  22. Brinkmann A., Dincer E., Polat C., Hekimoglu O., Hacioglu S., Foldes K., et al. A metagenomic survey identifies Tamdy orthonairovirus as well as divergent phlebo-, rhabdo-, chu- and flavi-like viruses in Anatolia, Turkey. Ticks Tick Borne Dis. 2018; 9(5): 1173-83. Doi: https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.04.017
  23. Львов Д.К. Лихорадка Тамды. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 783-5.
  24. Liu X., Zhang X., Wang Z., Dong Z., Xie S., Jiang M., et al. A Tentative Tamdy Orthonairovirus Related to Febrile Illness in Northwestern China. Clin. Infect. Dis. 2019; pii: ciz602. Doi: https://doi.org/10.1093/cid/ciz602
  25. Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anal. Biochem. 1987; 162(1): 156-9. Doi: https://doi.org/10.1006/abio.1987.9999
  26. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Львов Д.Н. и др. Генетическая характеристика вируса Баткен (BKNV-Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 33-7.
  27. Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Аристова В.А., Гительман А.К. и др. Таксономия ранее негруппированного вируса Тамды (TAMV – Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schülce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) в Средней Азии и Закавказье. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 15-22.
  28. Lvov D.K., Karas F.R., Tsyrkin Y.M., Vargina S.G., Timofeev E.M., Osipova N.Z., et al. Batken virus, a new arbovirus isolated from ticks and mosquitoes in Kirghiz S.S.R. Arch. Gesamte Virusforsch. 1974; 44(1): 70-3. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01242183
  29. Lukashev A.N., Deviatkin A.A. Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia. Infect. Genet. Evol. 2018; 59: 23-7. Doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.01.016

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2019 Vakalova E.V., Butenko A.M., Vishnevskaya T.V., Dorofeeva T.E., Gitelman A.K., Kulikova L.N., Lvov D.K., Alkhovsky S.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies