Результаты обследования клещей в дельте Волги (Астраханская область, 2017 год) на вирус Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Nairoviridae, Orthonairovirus, CCHFV) и другие клещевые арбовирусы

Обложка
  • Авторы: Вакалова Е.В.1,2,3, Бутенко А.М.4, Вишневская Т.В.4, Дорофеева Т.Е.4, Гительман А.К.4, Куликова Л.Н.5, Львов Д.К.4, Альховский С.В.4
  • Учреждения:
    1. ФКУЗ «Астраханская противочумная станция» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав и благополучия человека Российской Федерации
    2. Научно-исследовательский институт краевой инфекционной патологии, ФГБОУ ВО «Астраханский государственный медицинский университет» Минздрава России
    3. ГБУЗ Астраханской области «Областная инфекционная клиническая больница им. А.М. Ничоги»
    4. Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
    5. ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Астраханской области» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав и благополучия человека Российской Федерации
  • Выпуск: Том 64, № 5 (2019)
  • Страницы: 221-228
  • Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
  • Дата подачи: 30.12.2019
  • Дата принятия к публикации: 30.12.2019
  • Дата публикации: 20.10.2019
  • URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/13
  • DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-2019-64-5-221-228
  • ID: 13


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. В дельте Волги (Астраханская область) расположены активные природные очаги Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ), основным переносчиком которой служат клещи Hyalomma marginatum. Также здесь выявлена активная циркуляция вируса Дхори (Thogotovirus: Orthomyxoviridae). Вместе с тем, можно предположить, что в дельте Волги возможна циркуляция и других клещевых арбовирусов. В частности тех, которые циркулируют в соседних регионах и переносятся клещами Hyalomma spp. и Dermacenter spp., таких как вирусы Бханджа (Phlebovirus: Phenuiviridae), Вад Медани (Orbivirus: Reoviridae) и Тамды (Orthonairovirus: Nairoviridae).

Цель работы – исследование иксодовых клещей, распространённых в дельте Волги, на наличие клещевых арбовирусов, включая вирус ККГЛ и малоизученные вирусы Дхори, Бханджа, Вад Медани, и Тамды.

Материал и методы. Использовали молекулярно-генетические методы выявления и анализа нуклеиновых кислот (ПЦР, секвенирование, филогенетический анализ).

Результаты и обсуждение. В 2017 г. заражённость клещей H. marginatum вирусами ККГЛ и Дхори в дельте Волги составила 1,98 и 0,4% соответственно. Результаты генетического анализа показали, что циркулирующая здесь популяция вируса Дхори гомогенна (99–100% по гену М) и формирует отдельный генетический кластер, для которого вирус Баткен (антигенный вариант вируса Дхори) из Средней Азии является ближайшей внешней группой. В то же время вирусов Бханджа, Вад Медани и Тамды в клещах H. marginatum и D. marginatus, распространённых в данном регионе, не выявлено.

Заключение. Вирус Дхори активно циркулирует в природных очагах ККГЛ в дельте Волги. Впервые получены количественные показатели соотношения заражённости вирусами ККГЛ и Дхори клещей H. marginatum.

Об авторах

Е. В. Вакалова

ФКУЗ «Астраханская противочумная станция» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав и благополучия человека Российской Федерации; Научно-исследовательский институт краевой инфекционной патологии, ФГБОУ ВО «Астраханский государственный медицинский университет» Минздрава России; ГБУЗ Астраханской области «Областная инфекционная клиническая больница им. А.М. Ничоги»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-6121-5900
414024, г. Астрахань, Россия; 414011, г. Астрахань, Россия; 414011, г. Астрахань, Россия Россия

А. М. Бутенко

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-6152-5685
123098, г. Москва, Россия Россия

Т. В. Вишневская

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6963-8681
123098, г. Москва, Россия Россия

Т. Е. Дорофеева

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8846-0092
123098, г. Москва, Россия Россия

А. К. Гительман

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-8410-2332
123098, г. Москва, Россия Россия

Л. Н. Куликова

ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Астраханской области» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав и благополучия человека Российской Федерации

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-3066-3430
414057, г. Астрахань, Россия Россия

Д. К. Львов

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8176-6582
123098, г. Москва, Россия Россия

С. В. Альховский

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: s_alkhovsky@gamaleya.org
ORCID iD: 0000-0001-6913-5841
Альховский Сергей Владимирович, д-р биол. наук, руководитель лаборатории биотехнологии, 123098, г. Москва, Россия; salkh@ya.ru Россия

Список литературы

  1. Зимина Ю.В., Куликова Л.Н., Салько В.Н., Ковтунов А.И. Иксодовые клещи в Астраханской области, их роль в формировании природных очагов и передаче арбовирусов человеку. В кн.: Вопросы риккетсиологии и вирусологии (Сбориник научных трудов). Астрахань-Москва; 1996: 58-62.
  2. Зимина Ю.В., Бируля Н.Б., Березин В.В. Материалы зоолого-паразитологической характеристики Крымской геморрагической лихорадки в Астраханской области. В кн.: Труды Института полиомиелита и вирусных энцефалитов. Том 7. М.; 1965: 288-395.
  3. Вакалова Е.В., Волынкина А.С., Котенев Е.С., Куликова Л.Н., Викторова Н.В. Детекция и генетическая характеристика РНК-изолятов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, выделенных из клещей Hyalomma marginatum в Астраханской области (2016 г.). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2017; 22(5): 248-53. Doi: https://doi.org/10.1882/1560-9529-2017-22-5-248-253
  4. Смирнова С.Е., Карань Л.С., Колесникова Н.М., Рыбкин В.С., Платонов А.Е. Распространение вируса Баткен/Дхори в эндемичной по Крымской-Конго геморрагической лихорадке Астраханской области РФ. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2011; (1): 12.
  5. Львов Д.Н., Джаркенов А.Ф., Аристова В.А., Ковтунов А.И., Громашевский В.Л., Вышемирский О.И. и др. Изоляция вирусов Дхори (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) и Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Bunyaviridae, Nairovirus) от зайца (Lepus europaeus) и собранных с него клещей Hyalomma marginatus в средней зоне дельты Волги, Астраханская область, 2001 г. Вопросы вирусологии. 2002; 47(4): 32-6.
  6. Бутенко А.М., Чумаков В.М. Выделение нового для СССР арбовируса «Астра» из клещей H. plumbeum и комаров An. hyrcanus в Астраханской области. В кн.: Вопросы медицинской вирусологии. Часть 2. М.; 1971: 11-112.
  7. Бутенко А.М., Лещинская Е.В., Семашко И.В., Донец М.А., Мартьянова Л.И. Вирус Дхори — возбудитель заболевания человека, пять случаев лабораторной инфекции. Вопросы вирусологии. 1987; 32(6): 724-9.
  8. Shah K.V., Work T.H. Bhanja virus: a new arbovirus from ticks Haemaphysalis intermedia Warburton and Nuttall, 1909, in Orissa, India. Indian J. Med. Res. 1969; 57(5): 793-8.
  9. Verani P., Balducci M., Lopes M.C., Sacca G. Isolation of Bhanja virus from Haemaphysalis ticks in Italy. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1970; 19(1): 103-5. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1970.19.103
  10. Vesenjak-Hirjan J., Calisher C.H., Brudnjak Z., Tovornik D., Skrtic N., Lazuick J.S. Isolation of Bhanja virus from ticks in Yugoslavia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1977; 26(5 Pt. 1): 1003-8. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1977.26.1003
  11. Ungureanu A., Popovici V., Cătănaş F., Ioniţă I., Tutoveanu A., Safta M. Isolation of Bhanja virus in Romania. Arch. Roum. Pathol. Exp. Microbiol. 1990; 49(2): 139-45.
  12. Pavlov P., Rosický B., Hubálek Z., Daniel M., Bárdos V., Minár J., et al. Isolation of Bhanja virus from ticks of the genus Haemaphysalis in southeast Bulgaria and presence of antibodies in pastured sheep. Folia Parasitol. (Praha). 1978; 25(1): 67-73.
  13. Filipe A.R., Alves M.J., Karabatsos N., de Matos A.P., Nuncio M.S., Bacellar F. Palma virus, a new bunyaviridae isolated from ticks in Portugal. Intervirology. 1994; 37(6): 348-51. Doi: https://doi.org/10.1159/000150399
  14. Hubálek Z. Geographic distribution of Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1987; 34(1): 77-86.
  15. Lvov D.K., Gromashevsky V.L., Zakaryan V.A., Skvortsova T.M., Berezina L.K., Gofman Y.P., et al. Razdan virus, a new ungrouped bunyavirus isolated from Dermacentor marginatus ticks in Armenia. Acta Virol. 1978; 22(6): 506-8.
  16. Mádr V., Hubálek Z., Zendulková D. Experimental infection of sheep with Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1984; 31(1): 79-84.
  17. Calisher C.H., Goodpasture H.C. Human infection with Bhanja virus. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1975; 24(6 Pt. 1): 1040-2. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1975.24.1040
  18. Punda V., Ropac D., Vesenjak-Hirjan J. Incidence of hemagglutination-inhibiting antibodies for Bhanja virus in humans along the north-west border of Yugoslavia. Zentralbl. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. A. 1987; 265(1-2): 227-34.
  19. Азарян А.Р., Гришанова А.П., Бутенко А.М., Ларичев В.Ф., Чалов В.В., Инкина Т.Е. и др. Серологическая диагностика арбовирусных инфекций в Астраханской области. В кн.: Бутенко А.М., Баринский И.Ф., Карганова Г.Г., Малеев В.В., Терехин С.А., ред. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции». М.: Гриф и К; 2007: 115-9.
  20. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К. и др. Генетическая характеристика вируса Вад Медани (WMV - Wad Medani virus) (Reoviridae, Orbivirus), изолированного в Туркмении, Казахстане и Армении из иксодовых клещей Hyalomma asiaticum Schulze et Schlottke, 1930 и в Таджикистане из H. anatolicum Koch, 1844 (Ixodidae: Hyalomminae). Вопросы вирусологии. 2014; 59(4): 25-30.
  21. Lvov D.K., Sidorova G.A., Gromashevsky V.L., Kurbanov M., Skvoztsova L.M., Gofman Y.P., et al. Virus “Tamdy” – a new arbovirus, isolated in the Uzbee S.S.R. and Turkmen S.S.R. from ticks Hyalomma asiaticum asiaticum Schulee et Schlottke, 1929, and Hyalomma plumbeum plumbeum Panzer, 1796. Arch. Virol. 1976; 51(1-2): 15-21. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01317830
  22. Brinkmann A., Dincer E., Polat C., Hekimoglu O., Hacioglu S., Foldes K., et al. A metagenomic survey identifies Tamdy orthonairovirus as well as divergent phlebo-, rhabdo-, chu- and flavi-like viruses in Anatolia, Turkey. Ticks Tick Borne Dis. 2018; 9(5): 1173-83. Doi: https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.04.017
  23. Львов Д.К. Лихорадка Тамды. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 783-5.
  24. Liu X., Zhang X., Wang Z., Dong Z., Xie S., Jiang M., et al. A Tentative Tamdy Orthonairovirus Related to Febrile Illness in Northwestern China. Clin. Infect. Dis. 2019; pii: ciz602. Doi: https://doi.org/10.1093/cid/ciz602
  25. Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anal. Biochem. 1987; 162(1): 156-9. Doi: https://doi.org/10.1006/abio.1987.9999
  26. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Львов Д.Н. и др. Генетическая характеристика вируса Баткен (BKNV-Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 33-7.
  27. Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Аристова В.А., Гительман А.К. и др. Таксономия ранее негруппированного вируса Тамды (TAMV – Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schülce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) в Средней Азии и Закавказье. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 15-22.
  28. Lvov D.K., Karas F.R., Tsyrkin Y.M., Vargina S.G., Timofeev E.M., Osipova N.Z., et al. Batken virus, a new arbovirus isolated from ticks and mosquitoes in Kirghiz S.S.R. Arch. Gesamte Virusforsch. 1974; 44(1): 70-3. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01242183
  29. Lukashev A.N., Deviatkin A.A. Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia. Infect. Genet. Evol. 2018; 59: 23-7. Doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.01.016

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Вакалова Е.В., Бутенко А.М., Вишневская Т.В., Дорофеева Т.Е., Гительман А.К., Куликова Л.Н., Львов Д.К., Альховский С.В., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах