Comparative molecular and genetic characterization of rabies viruses (Rabies lyssavirus, Lyssavirus, Rhabdoviridae) circulated in the Russian Federation in 1985–2016

Cover Page


Cite item

Full Text

Abstract

Introduction. Rabies caused by the neurotropic virus of the genus Lyssavirus, Rhabdoviridae family, which infects all warm-blooded vertebrates including human beings. The homology level of the amino acid sequences for Lyssaviruses nucleoprotein reaches 78–93%.

Aim – study the genetic diversity and molecular epidemiology of Lyssaviruses circulated in the Russian Federation in 1985–2016.

Material and methods. 54 isolates of rabies virus isolated from animals, and 2 isolates from humans, 4 vaccine strains of rabies virus: RV-97, ERA, Shchelkovo 51, ERAG333 used in phylogenetic study. Phylogenetic analysis was performed using Genbank data on genome fragments of 73 rabies virus isolates and 9 EBLV-1 isolates. DNASTAR V.3.12, Bio Edit 7.0.4.1 and MEGA v.10.0.5, Primer Premier 5 programs have been used.

Results. Comparative molecular genetic analysis of genomes fragments of 130 Lissaviruses, isolated on the territory of the RF, Ukraine in 1985-2016, vaccine strains of rabies virus, showed their distribution by geographical feature. Comparison of the nucleoprotein fragments of the rabies virus isolates with vaccine strains revealed 4 marker mutations: V56I (Eurasian group), L/V95W (Central group), D101N/S/T, and N/G106D. Phylogenetic analysis of the isolate «Juli», isolated from a human bitten by a bat proved his belonging to the European Bat lyssavirus-1a.

Discussion. Study of the molecular epidemiology of rabies within the Russian Federation allows for the genotyping of the viruses and helps to study the hidden mechanisms of rabies infection in animal and human populations, and to characterize vaccine strains, including during oral vaccination.

Conclusion. Further study of the molecular epidemiology of rabies within the Russian Federation and the countries bordering it is important.

Full Text

Введение

Бешенство – одна из древнейших инфекций, возбудителем которой является нейротропный вирус рода Lyssavirus, семейства Rhabdoviridae. Вирус классического бешенства (Rabies virus) поражает всех теплокровных позвоночных. Геном вируса бешенства представлен молекулой РНК отрицательной полярности и имеет 5 открытых рамок считывания, располагающихся в геноме в следующем порядке: 3’-N-P-M-G-L-5’ [1][2][3].

По данным Международного комитета по таксономии вирусов, род Lyssavirus в настоящее время насчитывает 16 видов, переносчиками для 13 видов могут являться рукокрылые млекопитающие, 7 видов лиссавирусов были обнаружены у людей (Rabies virus, European bat lyssavirus-1, European bat lyssavirus-2, Irkut lyssavirus, Duvenhage lyssavirus, Australian bat lyssavirus, Mokola lyssavirus). Уровень гомологии последовательностей аминокислот нуклеопротеина среди лиссавирусов достигает 78–93%, что имеет важное значение при генотипировании [4][5][6][7].

Изучая изоляты вируса бешенства, выделенные на территории бывшего СССР, И.В Кузьмин и соавт. разделили их на несколько групп: A, B, C, D, UG. Позднее С.А. Чупин и соавт. предложили описать группы как Евразийскую, Северную Европейскую, Центральную Российскую и Кавказскую. Топология филогенетических дендрограмм предложенных классификаций совпадает [7][8][9][10].

Так, при исследовании фрагментов геномов изолятов из Республики Саха (Якутия), Аляски (США), Республики Коми в работе С.А. Чупина и соавт. было установлено, что эти изоляты относятся к Арктической группе, подгруппе Арктическая-2. За 20 лет на данном участке генома эта линия вируса, предком которой, предположительно, является штамм SG23, выделенный от песца в 1988 г., не претерпела изменений. В дальнейшем при более тщательных исследованиях молекулярной структуры гена N этого штамма установлена скорость фиксации замен: 1,4×10-4 заменна сайт в год [7].

Бешенство широко распространено в мире, за исключением островных государств, осуществляющих строгие карантинные и профилактические мероприятия. Резервуаром и источником инфекции в природных очагах являются преимущественно дикие плотоядные, а в антропургических очагах – обычно собаки и кошки. В свою очередь, бешенство собак является источником 99% случаев заражения человека и представляет потенциальную угрозу более чем для 3,3 млрд человек. В последнее время возросла роль кошки как потенциального звена в передаче вируса бешенства. В мире ежегодно от бешенства умирают 59 тыс. человек в более чем 150 странах. Наиболее распространено бешенство в странах Азии и Африки (95%) [11][12][13][14].

Основу профилактики распространения бешенства составляют оральная иммунизация диких плотоядных, вакцинация домашних и бродячих животных. Известно, что штаммы вируса бешенства, используемые для создания оральных вакцин, могут быть остаточно вирулентными по отношению к некоторым видам животных, поэтому важным этапом контроля антирабических мероприятий должен быть сравнительный молекулярно-генетический анализ штаммов вируса бешенства, используемых при создании оральных вакцин, и изолятов, выделенных на территориях, где проводят оральную иммунизацию [15][16][17][18][19].

Изучение молекулярной эпидемиологии бешенства позволяет охарактеризовать популяции вируса, циркулирующие на территории РФ [20].

Цель данного исследования – изучение генетического разнообразия и молекулярной эпидемиологии лиссавирусов, циркулирующих на территории РФ с 1985 по 2016 г.

Материал и методы

Исследуемые образцы. Было исследовано 54 изолята вируса бешенства, выделенных от животных:

  • отстрелянных после проведения программы по оральной вакцинации в Брянской и Кировской областях, в том числе 13 изолятов, выделенных от лис, и два – от енота и енотовидной собаки соответственно;
  • 39 изолятов, предоставленных лабораторией ФГБУ «ВНИИЗЖ» (г. Владимир, Россия) при поддержке лаборатории эпизоотологии ФГБНУ ФНЦ ВИЭВ РАН, выделенных в Центральном и Приволжском федеральных округах от енотовидной собаки (n = 7), собаки (n = 9), кошки (n = 1), лисы (n = 18) и КРС (n = 4).

Два изолята: «Shuv» (2002 г., Центральная часть России) и «Juli» (1985 г., Белгород, Россия), выделенных
от людей, были получены из коллекции НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского. Ранее они были описаны
в работе С.В. Грибенча и соавт. [6] и в обзоре А.Д. Ботвинкина со ссылкой на исследования М.А. Селимова [8].

Для выравнивания нуклеотидных последовательностей и построения филогенетических деревьев использовали первичную структуру фрагментов геномов 73 лиссавирусов, содержащихся в базе данных GenBank (43 изолята выделены от лис, четыре – от собак, один – от енотовидной собаки, восемь – от крупного рогатого скота, четыре – от кошки, один – от барсука, пять – от волка, три – от человека, один – от верблюда, два – от песца, один – от лошади), а также 9 изолятов EBLV-1.

Для молекулярно-генетического анализа также использовали первичную структуру фрагментов геномов вакцинных штаммов: RV-97, ERA, Щёлково 51, ERA G333.

Контроли при проведении МФА и ОТ-ПЦР использовали в соответствии с методикой [21] и ГОСТ 26075-2013.

Специфические олигонуклеотиды. Нуклеотидные последовательности праймеров, фланкирующих фрагмент гена N, были взяты из работы P. Heaton и соавт., 1997 г. [22], или разработаны в лаборатории (см. таблицу).

Приготовление препаратов. Для подтверждения наличия вируса бешенства в нативных образцах использовали МФА, согласно ГОСТ 26075-2013. Окрашенные препараты просматривали в поле зрения люминесцентного инвертированного микроскопа «Olympus CKX41» (Япония) при увеличении ×20.

Выделение РНК. РНК выделяли из 200 мкл 10% суспензии мозга с применением коммерческого препарата TRI Reagent® (Sigma Aldrich, США) по методике, рекомендованной производителем.

Проведение ОТ-ПЦР. Первым этапом было получение кДНК из РНК, затем проводили ПЦР. Объём реакционной смеси в нашей модификации составил 40 мкл, вносили 10 мкл кДНК. Учёт реакции проводили методом горизонтального электрофореза в 1% агарозном геле.

Секвенирование ПЦР-фрагментов. Образцы очищали из агарозного геля с помощью набора Silica Bead DNA Gel Extraction Kit (Fermentas, США) согласно инструкции производителя и секвенировали. Реакцию проводили на амплификаторе Mastercycler Gradient (Eppendorf, Германия) с применением BigDye® Terminator v 3.1 Ready Reaction kit (Applied Biosystems, США), затем продукты амплификации переосаждали для последующего секвенирования с использованием автоматического секвенатора Applied Biosystems® 3130 Genetic Analyzer (США).

Компьютерный анализ. Для выравнивания нуклеотидных последовательностей и построения филогенетических деревьев применяли пакет программ DNASTAR V.3.12 (Lasergen Inc., США) и программы Bio Edit 7.0.4.1 [23], MEGA v.10.0.5 [24]; для подбора специфических олигонуклеотидов пользовались программным обеспечением Primer Premier 5 (Premier Biosoft int., США) [25].

Олигонуклеотиды, фланкирующие фрагмент гена N вируса бешенства, используемые в исследовании
The nucleotide sequences of the primers flanking the N gene fragment of the Rabies virus using in this study

Результаты

Проверка изолятов, выделенных от животных и человека, методами МФА и ПЦР выявила вирус бешенства и фрагменты его генома.

Далее сравнивали нуклеотидные и аминокислотные последовательности полученных фрагментов с использованием ранее полученных данных [26–28] и базы данных GenBank.

Сравнение полученных фрагментов нуклеопротеина изолятов вируса бешенства, циркулирующих на территории РФ и Украины, с вакцинными штаммами выявило 4 маркёрных позиции: V56I, L/V95W, D101N/S/T, N/G106D. Размер исследуемого участка фрагмента гена N составил 439 нуклеотидных остатков (н.о., положение в гене 100–538 н.о.), кодирующих порядка 146 аминокислот.

Так, абсолютное большинство изолятов из республик Алтай, Хакасия, из Красноярска. Омска, республик Тыва и Бурятия имеют в 56-й позиции аминокислоту изолейцин вместо валина. Изоляты из Центральной части России (Центральной группы вирусов), а именно из Московской, Нижегородской, Владимирской, Тверской и Ярославской областей, в 95-й позиции содержат аминокислоту триптофан, как и изолят «Shuv».

Филогенетический анализ изолятов вируса бешенства, циркулировавших на территории РФ (рис. 1), показал, что «Shuv» относится к Центральной группе вирусов бешенства и по молекулярной структуре близок к изолятам из г. Владимир, Собинского района Владимирской области и Москвы. Все изоляты Центральной группы в 95-й позиции имеют аминокислоту триптофан. Изолят из Украины Rvu 09-06 по молекулярной структуре ближе к изолятам Евразийской группы.

Изоляты Центральной группы вирусов в позиции 101 имеют аспарагиновую аминокислоту, в то время как изоляты Евразийской группы вирусов в данной позиции могут содержать различные аминокислоты и подразделяются на 2 группы. Первую группу образуют изоляты из республик Алтай и Хакасия, из Красноярска, Омска, Республики Тыва, из Тулы и Кировской области. В 101-й позиции они содержат аминокислоту аспарагин либо серин. К 2-й группе относятся изоляты из Белгорода, Брянской и Нижегородской областей, а также один украинской изолят 09-06_Ukraine, содержащие в 101-й позиции аминокислоту треонин.

Изоляты Центральной группы в 106-й позиции имеют аминокислоту глицин, остальные изоляты, в том числе 4 изолята из Тверской и Владимирской областей, в данной позиции содержат аспарагиновую кислоту.

Изоляты Евразийской группы из республик Алтай и Хакасия, из Красноярска, Омска, республик Тыва и Бурятия образуют на филогенетической дендрограмме несколько подгрупп: Омская, группа Красноярск– Хакасия–Алтай, куда входит один изолят из Республики Бурятия и один из Омска, и группа Тыва–Бурятия (см. рис. 1). В целом внутри каждой группы по молекулярной структуре данного фрагмента генома изоляты между собой различаются примерно на 0–2%.

При исследовании изолята «Juli» было установлено, что он относится к европейскому лиссавирусу летучих мышей 1 (EBLV-1). Размер исследуемого фрагмента гена N составил 486 н.о. (положение в гене 100–585), кодирующих 161 аминокислоту. Филогенетический анализ (рис. 2) изолята «Juli» и 9 изолятов EBLV-1 показал, что данный изолят, вероятно, можно отнести к подгруппе EBLV-1a. По молекулярной структуре на заданном участке генома он отличается от других представителей этой подгруппы в 158-й позиции, где содержит аминокислоту лизин вместо аргинина. При этом изоляты подгруппы EBLV-1b имеют 2 маркёрных позиции: R8K и H102N, отличающие их от представителей EBLV-1a.

Филогенетический анализ указывает на то, что выделенный в 1968 г. изолят NC 009527 может быть общим предком изолята «Juli» и изолятов, выделенных во Франции в 2003–2008 гг., относящихся к подгруппе EBLV-1a.

Рис. 1. Филогенетическая дендрограмма, построенная на основании данных о первичной структуре гена N с помощью MegAlign 7.1.0.
Fig. 1. Phylogenetic tree obtained from the primary structure of thebased on partial sequences of N gene fragment of rabies virus isolates with MegAlign 7.1.0

Рис. 2. Филогенетическая дендрограмма изолятов EBLV-1, полученная на основании данных о фрагменте гена N с помощью MEGA v. 10.0.5, и сравнение фрагментов нуклеопротеина EBLV-1.
Fig. 2. Phylogenetic tree obtained from the primary structure of the N gene fragment of EBLV-1 isolates with MEGA v. 10.0.5 and fragment comparison of nucleoprotein of EBLV-1

Обсуждение

Сравнительно низкая скорость изменчивости молекулярной структуры нуклеопротеина позволяет типировать лиссавирусы и вирус бешенства по географическим группам в частности, изучать не только скрытые механизмы распространения бешенства в популяциях животных и человека, но и возможности реверсии вакцинных штаммов, используемых в живых оральных вакцинах для диких плотоядных, к вирулентному варианту [26][27][28][29][30][31][32][33].

В ходе исследования нами проанализировано 130 фрагментов геномов лиссавирусов в сравнении с вакцинными штаммами. Молекулярный анализ изолята «Juli», выделенного от человека, показал его принадлежность к подгруппе EBLV-1a, распространённой в странах Европы, где практически удалось элиминировать Rabies virus, но большую угрозу на сегодняшний день представляют лиссавирусы летучих мышей. Изолят был выделен в 1985 году от человека, укушенного летучей мышью, и описан С.В. Грибенча, а также А.Д. Ботвинкиным [6][8][34].

Согласно данным обзора А.Д. Ботвинкина (2011 г.) со ссылкой на М.А. Селимова (1989 г.), вирус «Juli» был выделен от девочки 11 лет, жительницы Украины, гостившей в Белгороде и укушенной летучей мышью в губу в 1985 г. Она заболела и умерла через 1 мес с типичной клинической картиной бешенства. После описания этого случая стало ясно, что rabies-like (rabies-related) вирусы, как их тогда называли, не только циркулируют среди летучих мышей в Европе, но и представляют опасность для людей. Ранее был известен только один такой случай в Африке [8]. Интересно, что изучаемый нами изолят «Juli» попадает в одни и те же временные рамки с изолятами 9397RUS (1985 г.) и 9443UKR (1987 г.), которые описаны в работе C. Troupin и соавт. (2017 г.) [35].

Однако при изучении молекулярной структуры фрагментов нуклеопротеина выявлена одна аминокислотная замена, отличающая изолят «Juli» от других представителей EBLV-1. Наличие замены на сравнительно коротком участке (161 а.о.) может свидетельствовать либо о том, что ранее охарактеризованный изолят 9397RUS (1985 г.) или 9443UKR (1987 г.) претерпел изменения в серии пассажей через мозг белых мышей, либо о том, что молекулярная структура фрагмента генома вируса «Juli» описана нами впервые в рамках данной работы.

Ранее неоднократно было показано распределение вирусов бешенства, циркулирующих на территории РФ и сопредельных стран, на 6 групп [7][30][31]:

А. Арктическая: север Красноярского края, север Республики Саха (Якутия), Республика Коми, Земля Франца-Иосифа, Аляска, северная часть Канады, Гренландия.

B. Арктически-подобная: Хабаровский край, Читинская область, Приморский край, Маньчжурия (Китайская Народная Республика, КНР).

C. Степная (Евразийская): Белгородская, Тульская, Волгоградская, Оренбургская, Пензенская, Воронежская, Липецкая, Нижегородская, Новосибирская, Астраханская, Омская области, республики Тыва, Дагестан и Башкортостан, Алтайский, Краснодарский и Красноярский края, Украина, Республика Казахстан, Монголия, провинция КНР Внутренняя Монголия и Синьцзян-Уйгурский автономный район КНР.

D. Центральная (Центрально-российская): Московская, Владимирская, Тверская, Тульская, Рязанская, Нижегородская области, Венгрия.

E. Северо-восточно-европейская: Псковская, Новгородская, Брянская, Ленинградская области, Эстония, Финляндия, Литва, Словакия, Польша, Германия, Украина.

F. Кавказская: Республика Дагестан, Краснодарский край, Грузия, Азербайджанская Республика, Ирак, Иран.

Было отмечено, что эпизоотии бешенства цикличны, носят сезонный характер и связаны с ареалом обитания и миграциями основных переносчиков возбудителя. Из представленной классификации видно, что некоторые области повторяются в разных группах, это можно проследить и при молекулярном анализе изолятов, выделенных в различных регионах. Так, ранее было показано, что изоляты из Московской, Тверской, Владимирской и Нижегородской областей образуют кластер и их молекулярная структура соответствует Центральной группе вирусов [28].

Изоляты из республик Тыва и Бурятия образуют подгруппу; вероятно, это объясняется тем, что данные регионы граничат друг с другом. Так же можно объяснить образование подгруппы Красноярск–Алтай–Хакасия, в которую, кроме того, попали изолят из Республики Бурятия и изолят из Омска. Однако большинство представленных изолятов из Омска образовали подгруппу, своим расположением указывая в направлении изолятов Центральной части России, входящих в Степную (Евразийскую) группу вирусов на дендрограмме.

Евразийская (Степная) группа – наиболее широко представленная группа вирусов, она имеет несколько ответвлений на филогенетической дендрограмме. Подобное наблюдение филогенетического и территориального распределения вирусов, особенности молекулярной структуры гена N лиссавирусов даёт нам право предположить, что эпизоотия бешенства движется с северо- и юго-востока на запад и юго-запад, концентрируясь в центральной части РФ. А с ростом городов и с увеличением числа бродячих невакцинированных животных эпизоотии природного типа переходят в городскую среду.

Следует отметить, что один изолят из Украины (Rvu 09-06), выделенный от кошки, по молекулярной структуре близок к Степной группе вирусов бешенства, а другой (Rvu 10-33) ранее был отнесён к Северо-восточно-европейской группе [32]. Необходимо отметить, что пусковым механизмом распространения рабической инфекции являются не только миграции природных резервуарных хозяев вируса бешенства, немаловажную роль может играть и увеличение в последнее время трансграничных передвижений людей со своими животными. Таким образом, необходим не только тщательный контроль со стороны ветеринарных служб, но и ответственный подход самих хозяев, выезжающих со своими питомцами за границу.

Заключение

Бешенство – это природно-очаговый зооантропоноз, и для борьбы со смертельной инфекцией необходимы координация ветеринарных и медицинских служб, исследования в области эпидемиологии, мониторинг антирабических антител после вакцинации против бешенства, просветительская работа с населением, контроль программ по оральной иммунизации диких плотоядных.

Результаты проведённых исследований говорят о необходимости дальнейшего мониторинга случаев бешенства на территории РФ методами молекулярного анализа.

×

About the authors

O. N. Zaykova

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after honorary academician N.F. Gamaleya; Peoples’ Friendship University of Russia

Author for correspondence.
Email: zaykova_o_n@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4708-2069

Olga N. Zaykova, Researcher at the Laboratory of Molecular Diagnostics.

Moscow, 123098
Moscow, 117198

Russian Federation

T. V. Grebennikova

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after honorary academician N.F. Gamaleya; Peoples’ Friendship University of Russia

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6141-9361
Moscow, 123098
Moscow, 117198 Russian Federation

M. A. Losich

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after honorary academician N.F. Gamaleya

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-5618-1918
Moscow, 123098 Russian Federation

A. L. Elakov

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after honorary academician N.F. Gamaleya

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-5798-6518
Moscow, 123098 Russian Federation

A. M. Gulyukin

All-Russian Scientific and Research Institute of Experimental Veterinary Medicine named after K.I. Scriabin and Ya.R. Kovalenko of the Russian Academy of Sciences

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-2160-4770
Moscow, 109428 Russian Federation

A. E. Metlin

All-Russian State Center for Quality and Standardization of Medicines for Animals and Feed

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-4283-0171
Moscow, 123022 Russian Federation

References

  1. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013.
  2. Васильев Д.А., Луговцев В.Ю., ред. Вирусы, вызывающие болезни общие для многих видов сельскохозяйственных животных. Курс лекций по вирусологии. Часть вторая. Ульяновск; 2004.
  3. Cai L., Tao X., Liu Y., Zhang H., Gao L., Hu S., et al. Molecular characteristics and phylogenetic analysis of N gene of human derived rabies virus. Biomed. Environ. Sci. 2011; 24(4): 431-7. http://doi.org/10.3967/0895-3988.2011.04.015.
  4. International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV. Available at: http://www.ictvonline.org/
  5. Hayman D.T., Fooks A.R., Marston D.A., Garcia-R J.C. The global phylogeography of lyssaviruses – challenging the ‘out of Africa’ hypothesis. PLoS Negl. Trop. Dis. 2016; 10(12): e0005266. http://doi.org/10.1371/journal.pntd.0005266
  6. Грибенча С.В., Козлов А.Ю., Костина Л.В., Елаков А.Л., Лосич М.А., Цибезов В.В. и др. Получение моноклональных антител к нуклеопротеину вируса бешенства. Вопросы вирусологии. 2013; 58(5): 38-43.
  7. Чупин С.А., Чернышова Е.В., Метлин А.Е. Генетическая характеристика полевых изолятов вируса бешенства, выявленных на территории Российской Федерации в период 2008-2011 гг. Вопросы вирусологии. 2013; 58(4): 44-9.
  8. Ботвинкин А.Д. Смертельные случаи заболевания людей бешенством в Евразии после контактов с рукокрылыми. (Обзор литературы). Plecotus et al. 2011; (14): 75-86.
  9. Kuzmin I.V., Orciari L.A., Arai Y.T., Smith J.S., Hanlon C.A., Kameoka Y., et al. Bat lyssaviruses (Aravan and Khujand) from Central Asia: phylogenetic relationships according to N, P and G gene sequences. Virus Res. 2003; 97(2): 65-79. http://doi.org/10.1016/s0168-1702(03)00217-x
  10. Botvinkin A.D., Poleschuk E.M., Kuzmin I.V., Borisova T.I., Gazaryan S.V., Yager P., et al. Novel lyssaviruses isolated from bats in Russia. Emerg. Infect. Dis. 2003; 9(12): 1623-5. http://doi.org/10.3201/eid0912.030374
  11. Всемирная организация здравоохранения. Available at: http://www.who.int/ru
  12. Shulpin M.I., Nazarov N.A., Chupin S.A., Korennoy F.I., Metlin A.Y., Mischenko A.V. Rabies surveillance in the Russian Federation. Rev. Sci. Tech. 2018; 37(2): 483-95. http://doi.org/10.20506/rst.37.2.2817
  13. Hampson K., Coudeville L., limbo T., Sambo M., Kieffer A., Attlan M., et al. Estimating the global burden of endemic canine rabies. PLos Negi. Trop. Dis. 2015; 9(4): e0003709. http://doi.org/10.1371/journal.pntd.0003709
  14. Шабейкин А.А., Гулюкин А.М., Зайкова О.Н. Обзор эпизоотической ситуации по бешенству в Российской Федерации за период с 1991 по 2015 годы. Ветеринария Кубани. 2016; (4): 4-6.
  15. Fehlner-Gardiner C., Nardine-Davis S., Armstrong J., Muldoon F., Bachmann P., Wandeler A. ERA vaccine-derived cases of rabies in wildlife and domestic animals in Ontario, Canada, 1989 – 2004. J. Wildl. Dis. 2008; 44(1): 71-85. http://doi.org/10.7589/0090-3558-44.1.71
  16. Müller T., Bätza H.J., Beckert A., Bunzenthal C., Cox J.H., Freuling C.M., et al. Analysis of vaccine-virus-associated rabies cases in red foxes (Vulpes vulpes) after oral rabies vaccination campaigns in Germany and Austria. Arch. Virol. 2009; 154(7): 1081-91. http://doi.org/10.1007/s00705-009-0408-7
  17. Forró B., Marton S., Kecskeméti S., Hornyák Á., Bányai K. Vaccineassociated rabies in red fox, Hungary. Vaccine. 2019; 37(27): 3535-3538. http://doi.org/10.1016/j.vaccine.2019.05.014
  18. Елаков А.Л., Уласов В.И., Баньковский Д.О., Сафонов Г.А. Изучение биологических свойств штамма ERA G333 вируса бешенства. Ветеринария. 2011; (2): 22-4.
  19. Metlin A., Paulin L., Suomalainen S., Neuvonen E., Rybakov S., Mikhalishin V., et al. Characterization of Russian rabies virus vaccine strain RV-97. Virus Res. 2008; 132(1-2): 242-7. http://doi.org/10.1016/j.virusres.2007.11.016
  20. Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Нашатырева Д.Н., Градобоева Е.А., Пакскина Н.Д., Попова И.В. Бешенство в Российской Федерации: информационно-аналитический бюллетень. Омск: КАН; 2019.
  21. OIE Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals (mammals, birds and bees). Available at: https://www.oie.int/standard-setting/terrestrial-manual/access-online/
  22. Heaton P.R., Johnstone P., McElhinney L.M., Cowley R., O’Sullivan E., Whitby J.E. Heminested PCR assay for detection of six genotypes of rabies and rabies-related viruses. J. Clin. Microbiol. 1997; 35(11): 2762-6.
  23. Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucl. Acids. Symp. 1999; (41): 95-8.
  24. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evol. 2018; 35(6): 1547-9. http://doi.org/10.1093/molbev/msy096
  25. Hall B.G. Building Phylogenetic trees from molecular data with MEGA. Mol. Biol. Evol. 2013; 30(5): 1229-35. http://doi.org/10.1093/molbev/mst012
  26. Елаков А.Л., Зайкова О.Н., Кочергин-Никитский К.С., Гребенникова Т.В., Алипер Т.И. Мониторинг бешенства у диких животных в Брянской области. Ветеринария. 2015; (1): 11-4.
  27. Зайкова О.Н., Гребенникова Т.В., Елаков А.Л., Кочергин-Никитский К.С., Алипер Т.И., Чучалин С.Ф. и др. Молекулярногенетическая характеристика геномов полевых изолятов вируса бешенства, циркулирующих на территории Кировской области. Вопросы вирусологии. 2016; 61(4): 186-92. http://doi.org/10.18821/0507-4088-2016-61-4-186-192
  28. Зайкова О.Н., Гребенникова Т.В., Гулюкин А.М., Шабейкин А.А., Полякова И.В., Метлин А.Е. Молекулярно-генетическая характеристика полевых изолятов вируса бешенства, выявленных на территории Владимирской, Московской, Тверской, Нижегородской и Рязанской областей. Вопросы вирусологии. 2017; 62(3): 101-8. http://doi.org/10.18821/0507-4088-2017-62-3-101-108
  29. Гулюкин А.М. Значимость современных методов лабораторной диагностики и идентификации возбудителя бешенства для иммунологического мониторинга данного зооноза. Вопросы вирусологии. 2014; 59(3): 5-10.
  30. Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Грибенча С.В. Итоги изучения антигенного и генетического разнообразия вируса бешенства в популяциях наземных млекопитающих России. Вопросы вирусологии. 2013; 58(3): 9-16.
  31. Ботвинкин А.Д., Кузьмин И.В., Хисматуллина Н.А. Итоги изучения антигенного разнообразия вируса бешенства на территории бывшего СССР. Ветеринарная патология. 2004; (3): 117-27.
  32. Metlin A.E., Rybakov S., Gruzdev K., Neuvonen E., Huovilainen A. Genetic heterogeneity of Russian, Estonian and Finnish field rabies viruses. Arch. Virol. 2007; 152(9): 1645-54. http://doi.org/10.1007/s00705-007-1001-6
  33. Deviatkin A.A., Lukashev A.N., Poleshchuk E.M., Dedkov V.G., Tkachev S.E., Sidorov G.N., et al. The phylodinamics of the rabies virus in the Russian Federation. PLos One. 2017; 12(2): e0171855. http://doi.org/10.1371/journal.pone.0171855
  34. Picard-Meyer E., Robardet E., Laurent A., Cliquet F., et al. Bat rabies in France: a 24-year retrospective epidemiological study. PLos One. 2014; 9(6): e98622. http://doi.org/10.1371/journal.pone.0098622
  35. Troupin C., Picard-Meyer E., Dellicour S., Casademont I., Kergoat L., Lepelletier A., et al. Host Genetic Variation Does Not Determine Spatio-Temporal Patterns of European Bat 1 Lyssavirus. Genome Biol. Evol. 2017; 9(11): 3202-13. http://doi.org/10.1093/gbe/evx236

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2020 Zaykova O.N., Grebennikova T.V., Losich M.A., Elakov A.L., Gulyukin A.M., Metlin A.E.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies