Efficiency of the Influenza A and B Viruses Isolation from Nasopharyngeal Swabs Taken in the Test Tubes Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) and Virocult® (M40 Compliant, Virocult) in 2010-2011 Epidemic Season


Cite item

Full Text

Abstract

The goal of this work was to compare the efficiency of the influenza A and B viruses isolated during 2010-2011 epidemic season. The clinical samples were taken in the test tubes with the transport medium on the basis of the medium EMEM and commercial test tubes Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) and Virocult® (M40 Compliant, Virocult). The results of this work demonstrated higher efficiency of influenza A and B viruses isolation from nasopharyngeal swabs of the patients taken in the test tubes Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) and Virocult® (M40 Compliant, Virocult) with the transport medium as compared with the efficiency of influenza strains isolation from nasopharyngeal swabs taken in test tubes with the medium EMEM with respect to all estimated indicators: efficiency of isolation, a passage of isolation and the titer of isolates. The possibility of the long-term storage of a clinical material at room temperature and at 4оС was confirmed, without resorting to freezing, which is significant in the absence of the necessary equipment.

Full Text

Одним из направлений исследований в службе надзора за циркуляцией вирусов гриппа как в России, так и других странах мира является изоляция эпидемических штаммов из клинического материала. Значение изоляции состоит в уточнении этиологии эпидемических подъемов заболеваемости и определении долевого участия вирусов гриппа в структуре ОРВИ; получении новых антигенных вариантов вирусов гриппа А и В, их антигенной характеристики; изучении биологических и молекулярно-генетических свойств; выборе и подготовке кандидатов в вакцинные штаммы и диагностические препараты; определении чувствительности выделенных штаммов к этиотропным препаратам (ремантадин, арбидол, ингибиторы нейраминидазы); оценке эффективности вакцинопрофилактики гриппа путем сопоставления данных по степени родства вакцинных штаммов и их эпидемических вариантов. Эффективность изоляции штаммов зависит от ряда факторов, среди которых особое место занимает взятие материала и его хранение до начала лабораторных исследований. В обычной практике вирусологов нашей страны используют транспортную среду, которую готовят на основе среды Игла МЕМ [4]. Безусловно наиболее удобными как для вирусологов, так и для врачей, берущих анализы, являются коммерческие пробирки с уже готовой транспортной средой, упакованные с тампонами для взятия материала. Их вариантами являются пробирки с транспортной средой Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) и Virocult® (M40 Compliant, Virocult). Одно из достоинств этих пробирок - возможность их хранения при комнатной температуре, а после взятия клинического материала - при 4°С. Целью настоящего исследования было сравнительное изучение эффективности изоляции штаммов вирусов гриппа А и В в период эпидемического подъема 2010-2011 гг. при взятии клинических образцов в пробирки с транспортной средой на основе среды Игла МЕМ и в коммерческие пробирки Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) и Virocult® (M40 Compliant, Virocult). Материалы и методы Пробирки для взятия носоглоточных смывов. Среды Игла МЕМ с добавлением антибиотика (гентами-цин), альбумина и хепес-буфера; Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult, lot 10A06) и Virocult® (M40 Compliant, Virocult, lot 10B10), предоставленные компанией ООО "МК Рустек". Клинический материал. Носоглоточные смывы от больных с диагнозом гриппа отбирали в первые 3 дня заболевания по клиническому диагнозу. Материал от одного пациента дублировали на 2 пробирки. Материал, взятый в среду Игла МЕМ, замораживали при -20°С; материал, взятый в коммерческие пробирки, хранили при 4°С не более 3 сут до использования в исследовании (рекомендации производителя). Молекулярно-генетические методы. Подтверждением наличия вируса гриппа в носоглоточном смыве был положительный результат диагностики с ОТ-ПЦР-РВ с использованием коммерческих наборов АмплиСенс Influenza virus A/B-FL и АмплиСенс Influenza virus A/H1-swine-FL, "Интерлабсервис", Россия [2]. Изоляция вирусов гриппа. Использовали монослой клеток культуры ткани MDCK как наиболее чувствительной линии клеток в отношении вирусов гриппа А и В [10]. Первичное заражение монослоя клеток культуры ткани MDCK проводили по методике H. Davies и соавт. [7]. Индикацию вирусных изолятов, полученных на клетках культуры MDCK, выполняли в реакции гемагглютинации (РГА) [4]. Определение антигенной структуры штаммов. Антигенную структуру выделенных штаммов определяли в реакции торможения гемагглютинации (РТГА) с использованием эталонных штаммов вирусов гриппа A(H1N1)swl и В, A/Калифорния/7/2009(H1N1)swl и В/Брисбен/60/2007 и приготовленных к ним специфических поликлональных сывороток [3, 4]. Эталоны получены из справочного центра ВОЗ по гриппу (CDC&P, США), а также коллекции лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа ФГБУ НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского Минздравсоцразвития России. Определение инфекционной активности вирусов. Инфекционную активность вирусов определяли согласно методике, описанной ранее [6]. Инфекционные титры рассчитывали по методу Рида и Менча [5]. Результаты Настоящее исследование предусматривало 2 этапа работы. На первом этапе проведено сравнительное изучение эффективности культивирования пандемического штамма вируса гриппа A/IIV-Moscow/01/2009 (H1N1)swl при разных режимах хранения материала в пробирках с транспортной средой на основе среды Игла МЕМ и в коммерческих пробирках со средой Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult). Эффек- Контактная информация: Шевченко Елена Сергеевна, канд. мед. наук; e-mail: esshevchenko@yandex.ru 43 тивность культивирования вируса оценивали путем сравнения результатов инфекционной активности вируса гриппа A/IIV-Moscow/01/2009 (H1N1)swl, полученных при хранении вируса, разведенного средой Игла мЕм и Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult), в режимах: при комнатной температуре, 4оС, -20оС в течение 7 и 14 дней. В табл.1 представлены результаты определения инфекционных титров вируса гриппа A/IIVMoscow/01/2009 (H1N1)swl при различных режимах хранения пробирок. Как видно из представленных данных, практически при всех режимах хранения вируса в его разведении транспортной средой Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) инфекционные титры ниже аналогичных показателей для среды Игла МЕМ на 1,0—3,0 lg, что является статистически значимым. Исключение составил режим хранения при 4оС в течение 14 дней, для которого показатели инфекционных титров были сравнимы. Тем не менее предварительные результаты позволили сделать вывод о возможности хранения материала в течение более длительного срока (до 14 дней), не прибегая к замораживанию (результаты сравнимы при хранении при комнатной температуре). При всех режимах вирус сохранял жизнеспособность и мог быть рекультивирован с достаточным инфекционным титром, необходимым для его дальнейшего изучения. На втором этапе проведены исследования, посвященные оценке эффективности изоляции эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В из носоглоточных смывов, взятых в пробирки со средой на основе среды Игла МЕМ, а также Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) и Virocult® (M40 Compliant, Virocult). В эпидемическом сезоне 2010-2011 гг. в России циркулировали штаммы вирусов гриппа A(H1N1)pdm09 и В, что было определено в настоящем исследовании. Штаммы вируса гриппа A(H1N1)pdm09 были антигенно родственны эталону А/Калифорния/7/2009 (H1N1)swl. Штаммы гриппа В были родственны эталонному вирусу В/Брисбен/60/2007 (линия В/Виктория-подобных) [1]. В табл. 2 и табл. 3 в сравнительном плане представлены результаты изоляции эпидемических штаммов из носоглоточных смывов, взятых в пробирки со средой на основе среды Игла МЕМ, Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) и Таблица 1 Инфекционные титры вируса гриппа A/IIV-Moscow/01/2009 (H1N1)swl при разных режимах разведения и хранения Режим хранения пробирок с транспортной средой Инфекционный титр вируса, (lg) разведение вируса в среде Игла МЕМ разведение вируса в среде Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) Исходный титр вируса 6,7 6,45 Через 7 дней t комнатная 3,5 2,5 4oC 4,0 2,5 -20oC 5,5 2,5 Через 14 дней t комнатная 3,5 1,7 4oC 5,5 5,0 -20oC 6,7 1,7 Virocult® (M40 Compliant, Virocult) от пациентов, госпитализированных с предварительным диагнозом “грипп” средней и тяжелой формы. Критерием отбора пациентов был клинический диагноз, в связи с чем не во всех случаях была подтверждена гриппозная инфекция или наличие вирусов гриппа в носоглоточном смыве, выявляемых постановкой ОТ-ПЦР-РВ. Только по клиническим симптомам среди 60 пациентов, включенных в исследование, грипп был подтвержден у 42 положительным результатом на специфическую РНК вируса гриппа А и В методом ОТ-ПЦР-РВ. При этом эффективность изоляции составила 52% (22 пациента), что является достаточно высоким показателем (обычно не более 20%). Эффективность изоляции штаммов вирусов гриппа А и В из носоглоточных смывов больных, взятых в пробирки Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) и Virocult® (M40 Compliant, Virocult) c транспортной средой, в эпидемическом сезоне 2010-2011 гг. была достаточно высокой и сравнимой с эффективностью изоляции штаммов вирусов гриппа из носоглоточных смывов, взятых в пробирки со средой Игла МЕМ, по всем оцениваемым показателям: эффективности выделения, пассажу изоляции, титру изолята, возможности проведения ОТ-ПЦР-РВ, спектру вирусов гриппа А и В. Таблица 2 Изоляция эпидемических штаммов при применении пробирок Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) с транспортной средой Пробирки для взятия носоглоточных смывов Число пациентов с РНК вирусов гриппа, выявленной Число пациентов с выделенным вирусом в клетках культуры MDCK пациен пассаж выделения титр ГА при выделении тов методом ОТ-ПЦР-РВ первичное заражение 1-й пассаж в целом 1/4 1/8 1/16 Со средой Σ-Virocult® 30 26 11 2 13 8 4 1 Со средой Игла МЕМ 12 1 13 4 9 - Таблица 3 Изоляция эпидемических штаммов при применении пробирок Virocult® (M40 Compliant, Virocult) c транспортной средой Пробирки для взятия носоглоточных смывов Число пациентов Число пациентов с РНК вирусов гриппа, выявленной методом ОТ-ПЦР-РВ Число пациентов с выделенным вирусом в клетках культуры MDCK пассаж выделения титр ГА при выделении первичное заражение 1-й пассаж в целом 1/4 1/8 1/16 1/32 9 - 9 3 5 - 1 Со средой Virocult® Со средой Игла МЕМ 44 30 16 7 2 9 5 2 1 1 Обсуждение Таким образом, полученные нами результаты свидетельствуют о достаточно высокой эффективности изоляции штаммов вирусов гриппа А и В из носоглоточных смывов больных, взятых в пробирки Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) и Virocult® (M40 Compliant, Virocult) c транспортной средой, которая была сравнима с эффективностью изоляции штаммов вирусов гриппа из носоглоточных смывов, взятых в пробирки со средой Игла МЕМ по всем оцениваемым показателям. Наши результаты подтверждают многочисленные данные зарубежных исследователей. Данные литературы указывают на высокую эффективность культивирования вирусов гриппа А и B, а также РС-вируса, аденовируса, риновируса, вируса парагриппа, корона-вируса, энтеровируса из смывов, взятых в транспортную среду Virocult®, сравнимую с эффективностью среды Игла МЕМ. Значимым является тот факт, что среда Virocult® совместима со многими молекулярнодиагностическими методами исследования: иммунохроматографией, ИФА, ПЦР и культивированием на разных клеточных линиях [8, 9]. Наше исследование подтвердило сохранение жизнеспособности вирусов гриппа А и В при длительном хранении клинического материала до 14 дней при комнатной температуре и при 4оС без замораживания, что является, безусловно, значимым при отсутствии необходимого оборудования. Презентация проф. A. Rudsdale на последнем клинико-вирусологическом симпозиуме продемон-стри-ровала, что транспортная среда Virocult® поддерживает вирус гриппа в жизнеспособном состоянии, по крайней мере 8 дней при двух температурных режимах: 4оС и комнатной температуре, а также совместима со многими молекулярными методами исследования для обычной и быстрой идентификации известных штаммов. Virocult® соответствует мировому стандарту для транспортных сред, который утвержден и зарегистрирован для использования во всем мире, включая США и Канаду [12]. Другие зарубежные исследования продемонстрировали высокую эффективность изоляции вируса гриппа типа А, а также аденовируса, вируса парагриппа, риновируса и вируса простого герпеса 1-го и 2-го типов из смывов, взятых в пробирки со средой Virocult®, после хранения материала в течение 7 дней при комнатной температуре и при 4оС [11]. Транспортная среда Virocult® использовалась на протяжении многих лет во Франции для отбора проб в рамках эпиднадзора за гриппом. Применяя методы диагностики ЩТ-ПЦР и ИФА, исследователи показали, что среда Σ-Virocult® является надежной и повышает эффективность изоляции вируса гриппа A(H3N2), а также его жизнеспособность при сроке хранения до 4 дней при комнатной температуре и 4оС [13]. Заключение Полученные данные могут быть использованы для решения проблемы взятия и хранения носоглоточных смывов от больных в период эпидемии гриппа в пробирках с транспортными средами Σ-Virocult® (M40 Compliant, Sigma Virocult) и Virocult® (M40 Compliant, Virocult), а также и эффективной изоляции из них штаммов вирусов гриппа А и В. Транспортная среда Virocult® пригодна для идентификации новых вирусов гриппа и других респираторных вирусов, а также для дифференциальной диагностики острых респираторных инфекций.
×

References

  1. Бурцева Е.И., Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Прилипов A.Г., Альховский С.В., Львов Д.К. Анализ результатов надзора, лабораторной диагностики и выделения штаммов вирусов гриппа в базовых лабораториях ЦЭЭГ в период 2009-2011 гг. В кн.: Грипп: эпидемиология, профилактика и лечение: Сборник статей и тезисов. СПб.; 2011: 12-6.
  2. Львов Д.К., Бурцева Е.И., Прилипов А.Г. и др. Изоляция 24.05.2009 г. и депонирование в Государственную коллекцию вирусов (ГКВ N 2452 от 24.05.2009 г.) первого штамма A/IIV-Moscow/01/2009 (H1N1)swl, подобного свиному вирусу A(H1N1) от первого выявленного 21.05.2009 г. больного в г. Москве. Вопросы вирусологии. 2009; 5: 10-4.
  3. Методические указания к работе опорных баз Всесоюзного центра по гриппу и ОРЗ. Л.; 1986: 40-2.
  4. Методыопределенияпоказателейкачестваиммунобиологических препаратов для профилактики и диагностики гриппа. Методические указания МУ 3.3.2.1758-03. М.; 2005.
  5. Сергиенко В.И., Бондарева Н.Б., Маевский Е.И. «Статистическая обработка результатов доклинических испытаний. В кн.: Руководство по экспериментальному (доклиническому) изучению новых фармакологических средствю. М.: «ИИА Ремедиум»; 2000: 360-98.
  6. Шевченко Е.С., Бурцева Е.И., Слепушкин А.Н. и др. «Спектр чувствительности к ремантадину вирусов гриппа А, циркулировавших в эпидемических сезонах 2002-2004 гг. Вопросы вирусологии. 2005; 5: 32-5.
  7. Davies H.W., Appleyard G., Cunnighan P., Pereira M.S. The use of continuous cell line for the isolation of influenza virus. Bull. WHO. 1978; 56: 1991-3.
  8. Lina B., Valette M. Medix biochemica influenza A and B. Actim influenza A and B. In: Test evaluation report. Translation from the French original. March, 2005.
  9. Rezza G., Valdarchi C., Puzelli S., Ciotti M., Farchi F. et al. Respiratory viruses and Influenza-like illness: a survey in the area of Rome, winter 2004-2005. Eurosurveillance. 2006; 11 (10): 251-3.
  10. Richardson J.C.W., Scolera V., Simmonds N.L. Identification of two strains of MDCK cells which resemble separate nephron tubule segments. Biochim. Biophys. Acta. 1981; 673: 26-6.
  11. Rudsdale A. Evaluation of a virology specimen transport device with six viruses using CLSI standard M40-A. In: Poster C-053, ASM 109: General meeting. Philadelphia; 2009.
  12. Rudsdale A., Shedden D. “Investigation of the Suitability of the Virocult® Swab transport device for influenza a specimens which are to be analyzed by cell culture or molecular techniques. In: POSTER M42. Clinical virology symposium. 2009.
  13. Valette M., Bouscambert-Duchamp M., Fanget R., Lambert S., Lina B. Comparison of Virocult® Swab, Σ-Swab TM and Σ-Virocult® for Influenza A viability for cell culture and molecular detection. In: POSTER S84. Clinical virology symposium. 2010.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2013 Shevchenko E.S., Breslav N.V., Lavrischeva V.V., Mukasheva E.A., Siluyanova E.V., Oskerko T.A., Kolobukhina L.V., Merkulova L.N., Dubovaya N.V., Zaplatnikov A.L., Burtseva E.I.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies