HiV-1 Genetic Variants in the Asian Part of Russia: a Study (2005-2010)

Full Text

ВВЕДЕНИЕ Массовая эпидемия ВИЧ-инфекции в России началась в 1996 г., после того как вирус попал в среду потребителей инъекционных наркотиков (ПИН) с территории Украины. Ограниченное число заносов (если не единственный источник) и скорость, с которой распространялась инфекция, позволили в короткие сроки создать в стране уникальную ситуацию, когда подавляющее большинство ВИЧ-инфицированных составляли ПИН, зараженные однородным в генетическом отношении вирусом, принадлежащим к подтипу А ВИЧ-1 и получившим название IDU-A. Молекулярный мониторинг проводился в течение всех лет эпидемии ВИЧ-инфекции и на начальных этапах, включая «наркотический», был сосредоточен практически полностью на европейской части России, в то время как азиатская ее часть оставалась «белым пятном» на мировой карте эпидемического процесса [1]. Между тем эпидемия ВИЧ-инфекции в восточных регионах страны, в целом начавшись несколько позже, чем в западной ее части, имеет ряд особенностей, которые могут отразиться на молекулярной структуре вирусной популяции. Одной из таких особенностей является значительное присутствие гетеросексуального пути передачи инфекции, характерного для второго этапа эпидемии. В данной работе сделана попытка обобщить данные, полученные в ходе исследований, проведенных в регионах Сибири, Дальнего Востока и Якутии в 2005-2010 гг. несколькими группами ученых. Целью исследований были анализ распространенности и оценка соотношения основных генетических вариантов вируса, охарактеризованных на прежних этапах эпидемии ВИЧ-инфекции в России, в указанных регионах. Материалы и методы Образцы крови были собраны от ВИЧ-инфицированных пациентов в 2005-2009 гг. в Хабаровске. Магадане, Кургане, Красноярске, Ноябрьске (ЯмалоНенецкий автономный округ), Якутии, Алтайском крае и Тыве. Общее число образцов составило 427, среди них 216 от ПИН и 175 от лиц, заразившихся гетеросексуальным путем, остальные случаи связаны с вертикальной передачей и переливанием инфицированной крови (табл. 1, 2). Среди пациентов находились как не получавшие терапию («наивные»), так и леченые. Все коллекции собраны благодаря активно- Таблица 1 Распределение обследованных пациентов по регионам азиатской части России* Регион регистрации случаев ВИЧ-инфекции Годы сбора образцов и исследования Число исследованных образцов Алтайский край 2005 56 2009 13 Красноярский край 2005 32 2009 67 Курганская область 2006 19 Магаданская область 2005 23 Республика Саха (Якутия) 1998-2007 45 Республика Тыва 2006-2007 8 Хабаровский край 2005 34 Ямало-Ненецкий АО 1995-2010 130 Всего... 427 Примечание. Здесь и в табл. 2: представлено кумулятивное количество выявленных в регионе случаев ВИЧ-инфекции по данным на год исследования (http://www.hivrussia.org). му участию сотрудников региональных центров по профилактике и борьбе со СПИДом. Факторы риска, возможные места заражения, а также эпидемиологические связи с другими ВИЧ-инфицированными лицами выявляли в ходе опроса пациентов при сборе эпидемиологического анамнеза. Распределение обследуемых пациентов по основным факторам риска заражения ВИЧ-1 представлено в табл. 2. Кроме того, регистрировали возраст, пол пациента, дату забора клинического материала, дату и географический регион постановки диагноза «ВИЧ-инфекция». Сведения о применении/неприменении пациентом антиретровирусных препаратов получали, руководствуясь записями в амбулаторных картах. Весь полученный клинический материал использовали при информированном согласии пациентов. В качестве объекта исследования были использованы препараты провирусной ДНК, выделенные из мононуклеарных клеток периферической крови (МКПК), либо препараты вирусной РНК, выделенные из плазмы крови, с применением традиционных методов. Значительная часть образцов провирусной ДНК была подвергнута предварительному исследованию методом сравнительного анализа подвижности Таблица 2 Распределение исследованных пациентов по основным факторам риска заражения ВИЧ-1 Регион ПИН Гетеросексуальные контакты Гомосексуальные контакты Вертикальная передача Переливание инфицированной крови Прочие* Всего, % Алтайский край 28 27 0 0 0 1 56 Красноярский край 43 44 4 5 0 13 109 Курганская область 3 16 0 0 0 0 19 Магаданская область 10 13 0 0 0 0 23 Республика Саха (Якутия) 21 19 0 0 1 7 48 Республика Тыва 1 6 0 1 0 0 8 Хабаровский край 34 34 Ямало-Ненецкий АО 76 50 0 3 0 1 Итого... 216 175 4 9 1 22 427 29 Таблица 3 Распределение генетических вариантов ВИЧ-1 среди обследованных пациентов Регион Подтип А Подтип В Рекомбинант А/В Рекомбинант А/Е Другие генетические варианты Всего Алтайский край 69 0 0 0 0 69 Красноярский край 93 6 0 0 0 99 Курганская область 17 0 2 0 0 19 Магаданская область 22 0 1 0 0 23 Республика Саха (Якутия) 42 3 0 0 0 45 Республика Тыва 8 0 0 0 0 8 Хабаровский край 34 0 0 0 0 34 Ямало-Ненецкий АО 118 2 8 2 0 130 Итого... 403 11 11 2 0 427 гетеродуплексов (HMA) по областям генов gag или env [2, 3] и затем секвенирована по области гена env, кодирующей петлю V3 гликопротеина gp120. Часть образцов анализировали только методом прямого сек-венирования генома. Образцы вирусной РНК из плазмы, как правило, исследовали по области гена pol, кодирующей про-теазу и частично - обратную транскриптазу ВИЧ-1 с целью выявления мутаций лекарственной устойчивости в ходе терапии либо эпидемиологического мониторинга. Исследования были проведены в разное время разными группами исследователей, поэтому способы анализа, наборы праймеров для амплификации нуклеотидных последовательностей и соответствующие им области генома различались. Для анализа гена pol ВИЧ-1 в Красноярске и Ноябрьске ЯНАО были использованы коммерческие тест-системы ViroSeq HIV-1 Genotyping System («Abbott Laboratories», США), доступные в диагностических лабораториях центров СПИДа. Остальные образцы исследовали в лаборатории вирусов лейкозов НИИ вирусологии (Москва) с применением in-house-наборов праймеров, описанных ранее [4-7]. В ходе анализа компьютерных текстов поиск последовательностей генома ВИЧ-1 проводили на Интернет-сайте Национальной лаборатории в Лос-Аламосе, США (http://hiv-web.lanl.gov). Генетические дистанции между нуклеотидными последовательностями рассчитывали по двухпараметрическому методу Kimura. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей проводили с помощью метода «ближайших соседей». Оценку подтиповой принадлежности проводили либо методом построения филогенетического древа, либо с применением специализированных Интернет-ресурсов COMET v0.1 (http:// comet.retrovirology.lu/) и REGA v2.0 (http://dbpartners. stanford.edu/RegaSubtyping/). Достоверность установленных филогенетических связей оценивали методом bootstrap при 300-500 независимых построениях каждого филогенетического древа. Все операции осуществляли с использованием программы Mega 4.0.2 (http://www.megasoftware.net). Результаты Алтайский край. Исследования проводили ученые из НИИ вирусологии (2005) и Университета Амстердама (2009) [8]. Результаты анализа нуклеотидной последовательности гена env в НИИ вирусологии показали, что все изученные образцы ВИЧ-1, выделенные на территории Алтайского края, близки к варианту вируса подтипа А (IDU-A), ранее обнаруживаемого в других городах России и других республиках бывшего СССР (Казахстан, Беларусь, Узбекистан) [4, 5, 9-11]. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена env продемонстрировал, что алтайские варианты ВИЧ-1 образуют две общие ветви (кластеры) с ранее опубликованными последовательностями двух близкородственных вариантов ВИЧ-1 подтипа A, выделенных в Казахстане, в Павлодаре и Караганде [6]. Это наводит на мысль о существовании как минимум двух заносов вируса ВИЧ-1 подтипа A на территорию Алтайского края. Эти результаты подтвердились в результате сравнительных исследований гена pol, проведенных в Университете Амстердама: все 13 образцов ВИЧ-1 принадлежали к тому же варианту подтипа А ВИЧ-1 - IDU-A. Таким образом, на территории Алтайского края в указанный период циркулировали преимущественно генетические варианты ВИЧ-1 подтипа А, характерного для других территорий Российской Федерации (табл. 3). Красноярский край. На территории Красноярского края исследования проводили те же группы специалистов. В работе НИИ вирусологии (2005) образцы крови, полученные от 32 пациентов, анализировали с помощью HMA по генам env и gag (HMA/env и HMA/ gag). Результаты анализа обоих генов свидетельствовали о том, что все образцы относятся к подтипу А ВИЧ-1. Полученные данные были подтверждены результатами анализа нуклеотидных последовательностей области гена env, кодирующей участок C2-V3 гликопротеина gp120 (n = 8). Результаты филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей ВИЧ-1 от красноярских пациентов представлены на рис. 1, из которого следует, что нуклеотидные последовательности гена env также образуют кластеры с последовательностями вариантов ВИЧ-1 подтипа A, выделенными в странах СНГ (Казахстан) и на территории РФ (Алтайский край). Таким образом, на территории Красноярского края также циркулируют преимущественно генетические варианты ВИЧ-1 подтипа А, характерного для других территорий Российской Федерации. В ходе анализа красноярских вариантов ВИЧ-1 по гену pol, проведенного несколько позднее - в 2009 г. [8], обнаружено несколько отличная от описанной картина. Исследование было проведено среди пациентов, испытавших неуспех терапии, с целью поиска мутаций ВИЧ-1, ассоциированных с лекарственной устойчивостью, а также среди «наивных» пациентов. По данным филогенетического анализа большинство образцов вируса кластеризовалось с вариантами IDU-A (n = 74), оставшиеся 6 образцов принадлежали к подтипу В. Наиболее интересной находкой оказался тот факт, что 4 из 6 образцов были получены от 30 Рис. 1. Результаты филогенетического анализа фрагментов гена env ВИЧ-1 размером 231 п.н., кодирующих область V3-петли, в составе образцов из Красноярска, Алтая и Казахстана. Включены референс-последовательности подтипов ВИЧ-1 и последовательности вариантов, типичных для стран бывшего СССР. Bootstrep-анализ проведен в 500 повторах, показаны значения > 80%. Сокращенные названия вариантов подтипа А ВИЧ-1: KR - Красноярск, AL - Алтайский Край, KZ - Казахстан. лиц, заразившихся гетеросексуальным путем, и лишь 2 - от мужчин, имеющих секс с мужчинами (группа МСМ), среди которых варианты подтипа В встречались ранее. Курган. Образцы из Кургана и Курганской области были доставлены в количестве 19 и исследованы в 2007 г. (НИИ вирусологии). Результаты анализа 6 из них, полученные при применении стандартного алгоритма исследования (PBIA ^ HMA ^ секвенирование ^ филогенез), были позднее подтверждены данными анализа с применением программ COMET v0.1 и REGA v2.0. Согласно всем полученным данным, у 16 пациентов в Кургане был обнаружен вари ант IDU-A, у трех оставшихся (гетеросексуалов) выявлялся рекомбинант CRF03_AB. Магаданская область. Результаты HMA-анализа генов gag и env (НИИ вирусологии, 2005) показали, что 22 образца относятся к подтипу А, а один является рекомбинантом A/B (у пациента, приехавшего в Магадан из Калининградской области, где рекомбинантная форма CRF03_AB получила наибольшее распространение). Полученные данные были подтверждены результатами анализа нуклеотидных последовательностей области гена env, кодирующей участок C2-V3 гликопротеина gp120 (n = 10). В результате филогенетического анализа установлено, что некоторые нуклеотидные последовательности гена env, выявленные у ВИЧ-инфицированных лиц на территории Магаданской области, образуют общую ветвь (кластер) с нуклеотидными последовательностями вариантов ВИЧ-1 подтипа А, выделенных в Украине, а другие - с выявленными в РФ (Хабаровский край), что позволяет сделать предположение о множественных заносах вируса на территорию области. Таким образом, среди анализированных образцов ВИЧ-1 из Магаданской области, как и с других территорий Восточной Сибири, доминирует вариант ВИЧ-1 генетического подтипа А. Якутия. Коллекция сывороток и/или плазм и ДНК МКПК была собрана на территории Якутии от 48 лиц, зарегистрированных с диагнозом «ВИЧ-инфекция» в период с 1998 по 2007 г., и исследована в Институте вирусологии в 2008 г. В результате анализа методами PBIA, ПЦР с последующим НМА-gag/env в 44 образцах выявлен вариант вируса gagAenvA, в двух - gagВenvB. Филогенетический анализ области гена env, кодирующей V3 петлю (273 п.н.) 10 произвольно выбранных образцов с генотипом envА и 2 образцов с генотипом envB показал, что все нуклеотидные последовательности первой группы образуют общую ветвь с ранее полученными последовательностями той же области вариантов IDU-A, выделенных в других регионах страны в разное время, и референс-штаммами подтипа А1 [12]. Из двух пациентов второй группы один был инфицирован в результате гетеросексуальных контактов, а другой - при употреблении психоактивных препаратов внутривенно. Как следовало из филограммы, первый вариант образовывал субкластер с восточноевропейскими IDU-B-вариантами, выделенными на территории России и Украины [5, 6, 10]. Последовательность ВИЧ-1 второго пациента кластеризовалась с вариантами подтипа В от гомо- и гетеросексуалов, а также ПИН из Западной Европы, что свидетельствовало об ином источнике заражения пациента. Тыва. Из 8 образцов, исследованных в 2006 г., лишь один был получен от мужчины - потребителя наркотиков, один ребенок заразился в результате вертикальной передачи, остальные (женщины) принадлежали к группе гетеросексуалов. Все методы исследования, примененные в отношении этой коллекции в Институте вирусологии, однозначно указывали на присутствие варианта IDU-A во всех образцах, кроме одного - у ПИН, инфицированного вариантом gagAenvB. Хабаровский край. Анализ 34 образцов плазмы крови, полученных из Хабаровского края (НИИ вирусо- 31 логии, 2005), проведенный аналогично описанному в предыдущих разделах, продемонстрировал их высокое сродство с генетическими вариантами подтипа А, циркулирующими в соседних регионах (Иркутск, Красноярск, Алтай, Казахстан), при этом степень их генетической гетерогенности оказалась крайне низкой. Ямало-Ненецкая АО. Исследование мутаций ВИЧ-1, ассоциированных с лекарственной устойчивостью, позволяет параллельно проводить определение подтипа, ориентируясь на последовательность гена pol. Для этого на первых этапах исследования подтип ВИЧ-1 анализировали в программе HIVdb Program: Sequence Analysis (http://hivdb.stanford.edu). Однако позднее выяснилось, что эта программа ошибочно расценивает вариант IDU-A как рекомбинантную форму AE, поэтому в дальнейшем для определения генетического варианта ВИЧ-1 использовали другие программы (REGA HIV-1 Subtyping Tool (версия 2), http://hivdb.stanford.edu и COmEt HIV-1, http://comet. retrovirology.lu/), результаты которых полностью совпадали с данными филогенетического анализа. Подробно эта работа описана в статье [13]. В результате анализа 130 образцов обнаружено, что из них 118 являются представителями подтипа А, по два образца относятся к подтипу В и рекомбинантной форме АВ, а еще два оказались истинными рекомбинантами АЕ, происходящими из Юго-Восточной Азии, что и подтвердилось в ходе тщательного эпидемиологического расследования. Поскольку в данной работе была исследована только область гена pol, анализ генетической дистанции не проводили. Анализ генетической вариабельности варианта подтипа а ВИЧ-1 в области петли V3 Сравнение уровней генетической вариабельности в области петли V3 и прилегающих к ней областей C2 и C3 гена env проводилось между вариантами подтипа А ВИЧ-1, полученными из каждого исследованного региона, за исключением Тывы из-за малого числа данных секвенирования. Результаты этого анализа отражены в табл. 4. Как видно из представленных данных, максимальные значения генетической дистанции (> 6%) были зарегистрированы в Кургане, Магадане и Якутии, а минимальные (< 2%) - в Хабаровском крае. Последний факт имеет простое объяснение: степень генетической гетерогенности, оказавшаяся крайне низкой, по-видимому, обусловлена общностью источников и ограниченным периодом заражения для большинства обследованных - ПИН, находящихся в условиях изоляции в исправительных учреждениях. Что касается Магадана и Якутии - регионов, характеризующихся значительным наплывом временной рабочей силы из всех регионов России и СНГ, сложившаяся здесь ситуация позволяет предположить множественные заносы вируса на территорию области на протяжении эпидемии. В таких условиях уровень генетической вариабельности оказывается предсказуемо высок. Интересно отметить, что все образцы из Кургана принадлежали лицам, заразившимся половым путем, и хотя число секвенированных образцов было ограниченным, возможно, именно способом преимущественного заражения объясняется высокий уровень изменчивости вируса в этом регионе. Таблица 4 Генетическая изменчивость области гена env ВИЧ-1 в образцах, принадлежащих к подтипу А Регион Генетическая дистанция, % Алтайский край Красноярский край Курганская область Магаданская область Республика Саха (Якутия) Республика Тыва Хабаровский край Ямало-Ненецкий АО 2,60±1,89 2,63±1,03 6,72±1,93 6,78±2,72 6,70±4,50 Не определяли 1,59±0,42 Не определяли Обсуждение Полученные результаты позволяют сделать однозначный вывод о доминировании в исследованных регионах азиатской части России того же генетического варианта подтипа А, который прежде вызвал эпидемию ВИЧ-инфекции в европейской части страны. Этот вывод нельзя назвать неожиданным, так как весь предшествующий ход эпидемии предсказывал именно такое развитие событий. В истории эпидемии ВИЧ-инфекции в России можно выделить несколько этапов. Первый этап характеризовался низким числом случаев заражения и относительно высокой гетерогенностью популяции вируса, при этом основным путем передачи вируса были гомосексуальные и гетеросексуальные контакты [14, 15]. В охарактеризованных случаях преобладали подтип В ВИЧ-1 (35%), доминирующий среди мужчин, практикующих секс с мужчинами, и подтип G (35%), связанный с нозокомиальной вспышкой на юге России [4]. Второй этап начался в 1996 г., когда ВИЧ-1 проник в среду российских ПИН с территории Украины. Стремительное распространение вируса среди ПИН быстро привело к формированию уникальной молекулярно-эпидемиологической ситуации, когда подавляющее большинство инфицированных в стране составляли ПИН, при этом на территории всех регионов страны доминировал распространившийся из одного источника вариант подтипа А ВИЧ-1, получивший название IDU-A, и отличающийся крайне высокой гомогенностью структуры генома [4, 5]. Исключение составила изолированная от остальной территории России Калининградская область, где абсолютное большинство случаев ВИЧ-инфекции было связано с вариантом ВИЧ-1, образовавшимся в результате рекомбинации между IDU-A и ВИЧ-1 подтипа B, имеющим генотип gagA/envB и названным впоследствии CRF03_AB (рис. 2). Приблизительно в начале столетия (2001-2003) эпидемия вступила в новый, третий этап, когда в эпидемический процесс все интенсивнее стали вовлекаться лица, у которых основным фактором риска заражения являются гетеросексуальные контакты. К этому моменту массовая эпидемия уже захватила некоторые регионы азиатской части России, в других она только начиналась. Известно, что гетеросексуальная передача вируса от одного лица к другому замедлена по сравнению с передачей любым из гемоконтактных 32 Рис. 2. Основные молекулярные варианты ВИЧ-1 на территории азиатской части России и их происхождение. На карту нанесены города - центры регионов, где проводилось исследование в 2005-2010 гг. А - вариант IDU-A, доминирующий на всей территории страны; АВ - рекомбинантный вариант CRF03_AB, типичный для Калининградской области; AG - рекомбинантный вариант CRF03_AG, выявленный в Новосибирской области [3]. способов, а сам вирус получает возможность в течение периода циркуляции в пределах одного организма испытать на себе воздействие иммунной системы человека в виде клеточного и гуморального иммунного ответа. В этих условиях формировался молекулярный «ландшафт» эпидемии ВИЧ-инфекции в азиатской части страны. Основным источником заражения лиц, проживающих в регионе, стали контакты с российскими ВИЧ-инфицированными пациентами, большинство которых, включая гетеросексуалов, ранее были инфицированы вирусом доминирующего варианта подтипа А, поэтому указанный вариант доминирует и в исследованном регионе. Тем не менее некоторые особенности состава генетических вариантов в регионе обращают на себя внимание. В частности, значительно возросла генетическая вариабельность доминирующего варианта IDU-A (2,6-6,8%) по сравнению с первыми годами эпидемии. Отчасти это объясняется естественной дивергенцией вируса от исходного варианта независимо от пути его передачи, отчасти, вероятно, связано с относительным замедлением распространения инфекции в результате смещения характера передачи в сторону гетеросексуального пути и связанным с ним повышением значения селекции под действием иммунной системы. Другим заметным явлением стали несколько случаев обнаружения вируса подтипа В у гетеросексуалов в Красноярском крае и Якутии; ранее этот вариант встречался практически только в группе МСМ. Фе номен взаимного проникновения вариантов вируса между основными группами риска также можно было прогнозировать; относительная «закрытость» группы МСМ не позволяет пока дать ответ на вопрос, встречается ли в этой группе вариант подтипа А, однако на выяснение этого вопроса будут направлены ближайшие исследования. Начиная с 2006 г. в Новосибирской области все чаще выявляется рекомбинантный вирус CRF02_AG [16], происхождение которого связывают с присутствием в данном регионе заметного числа лиц из Центральной Азии, где этот вариант был выявлен раньше [9] (см. рис. 2). В настоящей работе не было выявлено ни одного случая заражения генетическим вариантом CRF02_AG; возможно, причина этого состоит в том, что данное исследование проводилось в 2005-2010 гг., когда указанный вариант вируса еще не получил широкого распространения в Сибирском регионе и России в целом. Заметим, что в последние годы (2010-2012) единичные случаи обнаружения рекомбинанта CRF02_AG становятся повсеместными. Таким образом, как и предполагалось, основным фактором, определяющим генетическую гетерогенность популяции ВИЧ-1 в азиатской части России, является не географическое положение региона, а сложившиеся экономические и социальные связи, направление миграционных потоков и распространения наркотиков. Вместе с тем в некоторых соседних странах, прежде всего в Китае, наблюдается распространение вариантов ВИЧ-1, отличных от циркулирующих в России и 33 странах СНГ, в частности подтипа В, и циркулирующих рекомбинантных форм CRF07_BC и CRF08_BC вируса в Китае [17] и Японии [18]. Усиливающиеся экономические и социальные связи с этими странами могут наложить свой «генетический отпечаток» и на эпидемию ВИЧ-инфекции, в первую очередь в приграничных районах Сибири и Дальнего Востока. Выяснение вопроса о реализации этой возможности является неотложным как для оценки эффективности используемых диагностических (в основном молекулярных) тестов, так и для формирования стратегии лекарственной терапии. В части работы, касающейся анализа степени изменчивости ВИЧ-1, полученные результаты позволяют уверенно говорить об увеличении генетической дистанции между вариантами ВИЧ-1 в исследованных регионах по сравнению с первыми годами российской эпидемии, когда уровень генетической вариабельности не превышал 1%. По нашему мнению, одной из важнейших причин увеличения данного показателя является накопление значимых мутаций при половом пути передачи на протяжении сравнительно более длительной персистенции возбудителя в организме хозяина. Это предположение находит отклик в работе [19], где было продемонстрировано замедление скорости эволюции ВИЧ-1 (т. е. снижение генетической дистанции между циркулирующими вариантами, имеющими общего предка) в случае ускорения самой эпидемии. Логично предположить, что замедление эпидемии, связанное с ростом полового пути передачи, способно сказаться на изменчивости вируса обратным образом. Этот тезис будет подробнее исследован в будущих работах, в частности проводимых на территориях Сибири и Дальнего Востока страны. Выводы 1. Во всех обследованных в 2005-2010 гг. регионах азиатской части Российской Федерации продолжал доминировать вирус, принадлежащий к генетическому варианту подтипа А, характерному для второго периода эпидемии ВИЧ-инфекции в России. 2. Данный вариант ВИЧ-1 преобладал в обеих основных группах лиц, подверженных риску заражения, - потребителей инъекционных наркотиков и лиц, инфицированных гетеросексуальным путем. 3. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 в целом остается невысоким, однако отмечено его постепенное увеличение за счет взаимного проникновения вариантов вируса между группами риска, а также появления новых генетических вариантов. 4. Ретроспективный анализ области петли V3 и прилегающих к ней областей C2 и C3 продемонстрировал наличие тенденции к росту генетической изменчивости у вариантов подтипа A ВИЧ-1, получивших распространение на территории азиатской части Российской Федерации в 2005-2010 гг. (2,6-6,8%), по сравнению с вариантами, распространенными на европейской части страны в 1996-1999 гг. (1%).

References

Supplementary files