Molecular and epidemiology studies of HIV-1 prevalence in the Republic of Sakha (Yakutia)


Cite item

Full Text

Abstract

The gag, pol, and env genomic regions of HIV-1 variants currently circulating in the Republic of Sakha (Yakutia) were analyzed. The results of the study indicated that in this area there were HIV-1 variants belonging to two subtypes: A (IDU-A) and B, the former being predominant in this area and in the Russian Federation. The IDU-B-East strain was first isolated from a heterosexually infected patient, which suggests that the strain is outside the risk group of injection drug users. No cases of primary infection with resistant variants were notified during the study.

References

  1. Бобков А. Ф., Казеннова Е. В., Бобкова М. Р. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика ВИЧ-1 на территории России // Вестн. РАМН. - 2002. - № 8. - С. 40-42.
  2. Васильев А. В., Казеннова Е. В., Бобкова М. Р. Предсказание фенотипа R5/X4 для вариантов ВИЧ-1, циркулирующих в России, с использованием компьютерных методов // Вопр. вирусол. - 2009. - № 3. - С. 17-21.
  3. Казеннова Е. В., Бронникова А. В., Кузин С. Н. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, циркулирующих в г. Череповце Вологодской области: второй случай эпидемической вспышки, вызванной рекомбинантом gagAenvB // Вопр. вирусол. - 2008. - № 5. - С. 23-27.
  4. Казеннова Е. В., Васильев А. В., Бобкова М. Р. Прогноз эффективности применения препарата бевиримата для лечения ВИЧ-инфекции в России // Вопр. вирусол. - 2010. - № 3. - С. 37-41.
  5. Кожевников А. А. Особенности эпидемиологии и профилактики ВИЧ-инфекции в экстремальных условиях Республики Саха (Якутия): Автореф. дис. ... канд. мед. наук. - Иркутск, 2006.
  6. Покровский В. В., Юрин О. Г., Кравченко А. В., Потекаев Н. С. Первый случай ВИЧ-инфекции у гражданина СССР // Журн. микробиол. - 1992. - Т. 11, № 12. - С. 19-22.
  7. Суханова А. Л., Рудинский Н. И., Богословская Е. В. и др. Полиморфизм области генома, кодирующий протеазу и обратную транскриптазу, вариантов ВИЧ-1 подтипа А, распространенных на территории СНГ // Молекул. биол. - 2005. - № 6. - С. 1063-1071.
  8. Bobkov A., Cheingsong-Popov R., Selimova L. et al. An HIV type 1 epidemic among injecting drug users in the former Soviet Union caused by a homogeneous subtype A strain // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 1997. - Vol. 13. - P. 1195-1201.
  9. Bobkov A., Kazennova E., Selimova L. et al. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: Identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/ envB recombinants // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 1998. - Vol. 14. - P. 669-676.
  10. Bobkov A. F., Lukashov V. V., Goudsmit J., Weber J. N. Silent mutation in the V3 region characteristic of HIV type 1 env subtype B strains from Injecting Drug Users in the Former Soviet Union // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 2000. - Vol. 16. - P. 291-294.
  11. Bobkova M. R., Kazennova E. V., Selimova L. M. et al. Serological approaches to subtyping of HIV-1 in injecting drug users in Russia: evidence of subtype homogeneity at the main sites of the epidemic // Int. J. STD AIDS. - 2001. - Vol. 12. - P. 34- 40.
  12. Delwart E., Shpaer E. G., Louwagie J. et al. Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay analysis of HIV-1 env genes // Science. - 1993. - Vol. 262. - P. 1257-1261.
  13. Dorr P., Westby M., Dobbs S. et al. Maraviroc (UK-427,857), a potent, orally bioavailable, and selective small-molecule inhibitor of chemokine receptor CCR5 with broad-spectrum anti-human immunodeficiency virus type 1 activity // Antimicrob. Agents Chemother. - 2005. - Vol. 49. - P. 4721-4732.
  14. Heyndrickx L., Janssens W., Zekeng L. et al. Simplified strategy for detection of recombinant human immunodeficiency virus type 1 group M isolates by gag/env heteroduplex mobility assay // J. Virol. - 2000. - Vol. 74. - P. 363-370.
  15. Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequencer // J. Mol. Evol. - 1980. - Vol. 16. - P. 111-120.
  16. Lukashov V. V., Karamov E. V., Eremin V. F. et al. Extreme founder effect in an HIV type 1 subtype A epidemic among drug users in Svetlogorsk, Belarus // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 1998. - Vol. 14. - P. 1299-1303.
  17. Salzwedel K., Martin D. E., Sakalian M. Maturation inhibitors: a new therapeutic class targets the virus structure // AIDS Rev. - 2007. - Vol. 9. - P. 162-172.
  18. Yebra G., Holguin A. The maturation inhibitor bevirimat (PA-457) can be active in patients carrying HIV type-1 non-B subtypes and recombinants // Antivir. Ther. - 2008. - Vol. 13. - P. 1083-1085.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2011 Kazennova E.V., Antonova O.V., Kuzin S.N., Serkina T.P., Sokolova L.S., Vasil'ev A.V., Lapovok I.A., Bobkova M.R., Kazennova E.V., Antonova O.V., Kuzin S.N., Serkina T.P., Sokolova L.S., Vasilyev A.V., Lapovok I.A., Bobkova M.R.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies