Molecular epidemiology of HIV-1 strains in the Moscow Region


Cite item

Full Text

Abstract

The Moscow Region is one of the HIV-1-affected subjects of the Russian Federation; there were 34613 HIV-1-infected subjects as of October 31, 2009. To characterize the molecular epidemiology of HIV-1 in the Moscow Region, the investigators obtained and studied HIV-1 variants from 61 infected subjects of the region, who were major risk groups: intravenous drug users (IDUs) and hetero- and homosexually infected persons. Genetic analysis of HIV-1 variants was carried out by sequencing the gag genes (729 nucleotides in length, including full-length protein p17 and partial p24) and/or env (270 nucleotides in length, V3 region) with further phylogenetic analysis. The findings demonstrated that HIV-1 subtype A variants are dominant in the Moscow Region and detectable in 93.5% of IDUs and 100% of heterosexually infected persons. Phylogenetically (and accordingly epidemiologically) unrelated HIV-1 subtype B strains were revealed in 4 patients, including 2 IDUs.

References

  1. Казеннова Е. В., Бронникова А. В., Кузин С. Н. и др. Молекулярно-генетическая харакетристика вариантов ВИЧ-1, циркулирующих в Череповце Вологодской области: второй случай эпидемической вспышки, вызванной рекомбинантом gagAenvB // Вопр. вирусол. - 2008. - № 5. - С. 23- 27.
  2. Лукашов В. В., Лазовская Н. В., Карамов Э. В. и др. Молекулярная эпидемиология ВИЧ-1 в Беларуси (1996-2004 гг.): доминирование вариантов субтипа А и циркуляция вариантов субтипа В // Вопр. вирусол. - 1996. - № 6. - С. 22-26.
  3. Суханова А. Л., Казеннова Е. B., Бобкова М. Р. и др. Варианты вируса иммунодефицита человека типа 1, обнаруживаемые в России среди инфицированных половым путем // Вопр. вирусол. - 2004. - № 1. - С. 4- 7.
  4. Ханина Т. А., Селимова Л. М., Казеннова Е. В. и др. Биологические свойства вариантов ВИЧ-1, циркулирующих среди наркоманов на территории России // Вопр. вирусол. - 2005. - № 4. - С. 24-28.
  5. Bobkov A., Kazennova E., Selimova L. et al. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: identification of subtype A, subtype B, and novel gaga/ envB recombinants // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 1998. - Vol. 14, N 8. - P. 669-676.
  6. Bobkov A., Kazennova E., Khanina Т. et al. An HIV type 1 subtype A strain of low genetic diversity contuse to spread among injecting drug users in Russia: study of the new local outbreaks in Moscow and Irkutsk // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 2001. - Vol. 17, N 3. - P. 257-261.
  7. Bobkov A. F., Kazennova E. V., Selimova L. M. et al. Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: perdominance of subtype A // J. Med. Virol. - 2004. - Vol. 74, N 2. - P. 191-196.
  8. Boom R., Sol C. J. A., Salimans M. M. M. et al. Rapid and simple method for purification of nucleic acids // J. Clin. Microbiol. - 1990. - Vol. 28. - P. 495-503.
  9. Lazouskaya N. V., Eremin V. F., Adema K. W. et al. The HIV type 1 epidemic in Belarus: Predominance of eastern European subtype A strains and circulation of subtype В viruses // AIDS Res Hum Retrovirusus. - 2005. - Vol. 21, N 9. - P. 830- 833.
  10. Lukashov V. V., Kuiken C. L., Goudsmit J. Intrahost human immunodeficiency virus type 1 evolution is related to length of the immunocompetent period // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 11. - P. 6911-6916.
  11. Lukashov V. V., Karamov E. V., Eremin V. F. et al. Exrteme founder effect in an HIV type 1 subtype A epidemic among drug users in Svetlogorsk, Belarus // AIDS Reso Hum Retroviruses. - 1998. - Vol. 14. - P. 1299-1303.
  12. Rumyantseva O. A., Olkhovskiy I. A., Malysheva M. A. et al. Epidemiological networks and drug resistance of HIV type 1 in Krasnoyarsk region, Russia // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 2009. - Vol. 25, N 9. - P. 931-936.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2010 Gilyazova A.V., Zenin P.V., Pronin A.Y., Serkov I.L., Khametova K.M., Orlova-Morozova E.A., Zhukova E.V., Kornilaeva G.V., Pasternak A.O., Lukashov V.V., Karamov E.V., Gilyazova A.V., Zenin P.V., Pronin A.Y., Serkov I.L., Khametova K.M., Orlova-Morozova E.A., Zhukova E.V., Kornilaeva G.V., Pasternak A.O., Lukashov V.V., Karamov E.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies