HIV-1 serotyping ofV3-mimicking peptides circulating in the Republicof Tajikistan among intravenous drug users


Cite item

Full Text

Abstract

The paper summarizes the results of HIV-1 serotyping by using 56 positive sera collected in the territory of the
Republic of Tajikistan (RT) from intravenous drug users (IVDU). It was made by solid-phase ELISA based on synthetic
peptides, mimicking different variants of the apical epitope of the HIV-1 gp120 V3-loop. Two types of conjugates,
those specific to human IgG and IgA, were used to detect the immune complexes. Serotypes, as determined
according to IgG and IgA-based ELISA, coincided, however, the latter were proven to be more suitable for
serotyping. There is a high level of HIV-1 serotype heterogeneity among IVDU in RT; altogether, 4 serotypes were
identified, i.e. В (10%), B+A/C (18%), A/C (20%) and A/C+B (52%). The modern serotype HIV-1 diversity in RT resembles
the epidemiologic situation in the territory of the former USSR as observed in the late 80-ies - early 90-ies of the last century.

References

  1. Анциферов Л. В. Гашишизм в Средней Азии. - Ташкент, 1934.
  2. Калачев Б. Ф. Суверенизация государств Средней Азии и Казахстана как фактор, способствующий незаконному обороту наркотиков // Ислам и народная культура. - М., 1988. - С. 33-42.
  3. Караганов С. А., Малашенко И. Е., Федоров А. В. Наркомания в России: угроза нации. Аналитический доклад Совета по внешней и оборонной политике РФ. - М., 1998.
  4. Мещерякова Д. В., Андреев С. М., Тарасова С. О. и др. Анализ эпитопной специфичности антител из сывороток HIV- инфицированных лис с использованием функционально значимых фрагментов белков HIV // Иммунология. - 1995. - № 2 . - С . 10-13.
  5. Набатов А. А., Машарский А. Э., Веревочкин С. В. и др. Изучение антигенного разнообразия ВИЧ-1 в различных регионах Украины: разные субтипы в разных городах // Рус. журн. "ВИЧ, СПИД и родственные проблемы". - 1998.-Т. 2, № 1 . - С . 11-18.
  6. Организация эколого-эпидемиологического мониторинга территории Российской Федерации: Метод, рекомендации / Под ред. Д. К. Львова. - М., 1995.
  7. Папуашвшш М. Н. Клинико-иммунологический мониторинг ВИЧ-инфицированных пациентов (иммунный статус и алгоритмы альтернативных схем терапии): Дис. ... д-ра биол. наук. - М., 2002.
  8. Пашкова Т. А., Ярославцева Н. Г., Щелканов М. Ю. и др. Биологические свойства первичных изолятов ВИЧ-1 различных серотипов // Вопр. вирусол. - 1998. - № 6. - С. 319-326.
  9. Порядок учета, хранения, передачи и транспортирования микроорганизмов I-IV групп патогенности. Санитарные правила. 00 СП 1.2.036-95. - М„ 1996.
  10. Ромашкин П. А., Саухат С. Р., Шемшура А. Б. и др. Ретроспективный анализ популяционной изменчивости области V3 gpl20 в когорте ВИЧ-инфицированных, имеющих единый источник заражения // Вопр. вирусол. - 2003. - № 4. - С. 20-26.
  11. Семилетов Ю. А., Ржанинова А. А., Гараев М. М. Синтез и сравнительный анализ антигенной активности пептидов гипервариабельной области V3 поверхностного гликопротеида gpl20 вируса иммунодефицита человека типа 1 // Биоорган, химия. - 1994. - Т. 20. - С. 1070-1079.
  12. Тишкова Ф. X. Особенности распространения вируса гепатита С и его генотипов в Таджикистане: Дис. ... д-ра мед. наук. - М., 2003.
  13. Ханина Т. А. Генетическая изменчивость вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), циркулирующего на территории России в группах лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов: Дис.... канд. биол. наук. - М., 2003.
  14. Щелканов М. Ю., Пашкова Т. А., Сахурия И. Б. и др. Анализ биологических характеристик первичных изолятов ВИЧ-1 с помощью метода главных компонент// Вопр. вирус. - 1998. - № 3. - С. 117-121.
  15. Щелканов М. Ю., Ярославцева Н. Г., Емельянов А. В. и др. Модель функционирования верхушечного эпитопа V3- петли gpl20 ВИЧ-1 в составе комплекса с антителами // Молекул, биол. - 1998. - Т. 32, № 6. - С. 1062-1074.
  16. Щелканов М. Ю., Ярославцева Н. Г., Набатов А. А. и др. Серотипическая стратификация ВИЧ-1 в популяции внутривенных наркоманов на юге/юго-востоке Украины // Вопр. вирусол. - 1998. - Т. 43, № 4. - С. 176-182.
  17. Щелканов М. Ю., Ярославцева Н. Г., Юдин А. Н и др. Анализ иммунологической гетерогенности ВИЧ-1: I. "Аргинин-глутаминовый триггер" в четвертой позиции верхушечного тетрапептида УЗ-петли gpl20 // Молекул, биол. - 1998. - Т. 32, № 4. - С. 717-728.
  18. Щелканов М. Ю., Ярославцева Н. Г., Юдин А. Н. и др. Анализ иммунологической гетерогенности ВИЧ-1: II. Влияние аминокислотных остатков, фланкирующих С-конец верхушечного тетрапептида УЗ-петли gpl20 // Молекул, биол. - 1998. - Т. 32, № 4. - С. 729-734.
  19. Щелканов М. Ю., Ярославцева Н. Г., Юдин А. Н. и др. Серологические свойства изолятов ВИЧ-1 из очага эпидемии в Гомельской области Беларусь (1996) // Вопр. вирусол. - 1998. - Т. 43, № 5. - С. 220-229.
  20. Щелканов М. Ю. Серологические свойства УЗ-петли gpl20 вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории бывшего СССР: Дис. ... канд. биол. наук. - М., 1999.
  21. Щелканов М. Ю., Еремин В. Ф., Сахурия И. Б. и др. Дегидрогеназная активность инфицированных клеток и биологические свойства различных вариантов ВИЧ-1 // Биохимия. - 1999. - Т. 64, № 4. - С. 81-87.
  22. Щелканов М. Ю., Сойнов Л. А., Залунин В. В. и др. Определение дистантности спектров иммунореактивности при серотипировании ВИЧ // Иммунология. - 1999. - № 1. - С. 35-37.
  23. Щелканов М. Ю., Юдин А. Н., Бурунова В. В. и др. Циркуляция вариантов ВИЧ-1 серотипа А/С в популяции наркоманов Твери, применяющих наркотики внутривенно // Иммунология. - 1999. - № 1. - С. 30-35.
  24. Щелканов М. Ю., Юдин А. Н., Бурунова В. В. и др. Применение метода главных компонент для анализа эффективности панелей эпитоп-имитирующих пептидов при серотипировании ВИЧ // Иммунология. - 1999. - № 3. - С. 13-18.
  25. Щелканов М. Ю., Юдин А. Н., Еремин В. Ф. и др. Нарастание серотипической гетерогенности ВИЧ-1 в Светлогорском очаге (1996) через год после начала вспышки эпидемии // Вопр. вирусол. - 1999. - Т. 44, № 4. - С. 174-177.
  26. Щелканов М. Ю., Ярославцева Н. Г., Юдин А. Н. и др. Серотипический профиль эпидемии ВИЧ-1 в Москве // Вопр. вирус. - 1999. - Т. 44, № 5. - С. 224-229.
  27. Щелканов М. Ю., Юдин А. Н., Бурунова В. В. и др. Анализ специфичности иммунных комплексов при серотипировании ВИЧ на основе эпитоп-имитирующих пептидов // Клин. лаб. диагн. - 2001. - № 1. - С. 19-26.
  28. Юдин А. Н. Разработка информационных технологий для серотипирования ВИЧ на основе эпитоп-имитирующих пептидов: Канд. дис. ...физ.-мат. наук. - М., 2001.
  29. Ярославцева Н. Г. Гено- и серотипирование - два подхода к изучению изменчивости ВИЧ-1 // Гематол. и трансфузиол. - 2000. - № 2. - С. 19-25.
  30. Barre-Sinoussi F., Chermann J. С, Rey F., Monlagnier L. Isolation of T-lymphotropic retrovirus from a patient at risk for acquired immune deficiency syndrome (AIDS) // Science. - 1983. - Vol. 220. - P. 868-871.
  31. Bobkov A., Kazennova E., Khanina T. et al. An HIV type 1 A strain of low genetic diversity continues to spread among injecting drug users in Russia: study of the new local outbreaks in Moscow and Irkutsk // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 2001. -Vol. 17, N 3. - P. 257-261.
  32. Burunova V. V., Shchelkanov M. Yu., Yudin A. N. et al. HIV-1 serotypes in Moscow // Abstract Book of 6-th International Conference "AIDS, Cancer and Related Problems". - St.-Petersburg, 1998. - P. 91.
  33. Garaev M., Bobkov A. F., Cheingsong-Popov R. et al. Subtyping of HIV-1 strains on the territory of CIS // Abstract Book of MRC Conference of AIDS, September 19-23, 1995 (Manchester, UK). - Manchester, 1995. - P. 19.
  34. Gondois-Rey F., Grivel J. C., Biancotto A. et al. Segregation of R5 and X4 HIV-1 variants to memory T cell subsets differentially expressing CD62L in ex vivo infected human lymphoid tissue // AIDS. - 2002. - Vol. 14. - P. 1245-1249.
  35. Hoelscher M., Hanker S., Barin F. et al. HIV type 1 V3 serotyping of Tanzanian samples: probable reasons for mismatching with genetic subtyping // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 1998. - Vol. 14. - P. 139-149.
  36. Jamalova M. Tajikistan: STD survey results // Entre Nous (Copenhagen). - 1999- - Vol. 42. - P. 12.
  37. Lukashov V. V., Cornelissen M. Т. E., Goudsmit J. et al. Simultaneous introduction of distinct HIV-1 subtypes into different risk groups in Russia, Byelorussia and Lithuania // AIDS. - 1995. - Vol. 9. - P. 435-439.
  38. Lukashov V. V., Kuiken С. L., Vlahov D. et al. Evidence for HIV type 1 strains of US intravenous drug users as founders of AIDS epidemic among intravenous drug users in northern Europe // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 1996. - Vol. 12. - P. 1179- 1183.
  39. Lukashov V. V., Karamov E. V., Eremin V. F. et al. Extreme founder effect in an HIV type 1 subtype A epidemic among drug users in Svetlogorsk, Belarus // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 1998. - Vol. 14. - P. 1299-1303.
  40. Malkevich N., Womack С., Pandya P. et al. Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) non-B subtypes are similar to HIV-1 subtype В in that coreceptor specificity is a determinant of cytopathicity in human lymphoid tissue infected ex vivo //J. Virol. - 2001. - Vol. 75. - P. 10520-10522.
  41. Nabatov A. A., Kravchenko O. N., Lyulchuk U. G. et al. Simultaneous introduction of HIV type 1 subtype A and В viruses into injecting drug users in southern Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet Union // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 2002. - Vol. 18, N 12. - P. 891-895.
  42. Zwart G., Wolfs T. F. W., Bookelman R. et al. Greater diversity of the HIV-1 V3 neutralization domain in Tanzania compared with The Netherlands: serological and genetic analysis // AIDS. - 1993. - Vol. 7. - P. 467-474.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2004 Burunova V.V., Shchelkanov M.Y., Tishkova F.K., Starikov N.S., Pazilin A.S., Belobrova E.A., Petrenko M.S., Yudin A.N., Samuilov V.D., Garayev M.M., Lvov D.K.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies