Разработка и апробация набора реагентов для определения РНК классического вируса бешенства методом ОТ-ПЦР в реальном времени

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

С целью повышения эффективности лабораторной диагностики бешенства и оптимизации надзорных мероприятий разработан набор реагентов для выявления РНК вируса бешенства методом обратнотранскриптазной полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флюоресцентной детекцией. Аналитическая чувствительность разработанного набора составила 4*103 копий РНК в 1 мл. Высокая специфичность набора реагентов показана на репрезентативной выборке образцов, содержащих генетический материал родственных вирусов, и на образцах, содержащих мозговую ткань разных видов млекопитающих.

Об авторах

В. Г. Дедков

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора; ФГБНУ «НИИ медицины труда»

Автор, ответственный за переписку.
Email: vgdedkov@yandex.ru
Россия

А. А. Девяткин

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора; ФГБНУ «НИИ медицины труда»; ФГБУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова»

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Е. М. Полещук

ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора

Email: noemail@neicon.ru
Россия

М. В. Сафонова

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора; ФГБУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова»

Email: noemail@neicon.ru
Россия

М. Л. Маркелов

ФГБНУ «НИИ медицины труда»

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Г. А. Шипулин

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Список литературы

  1. King M.Q., Michael A.J., Carstens B.E., Lefkowitz J.E. Virus taxonomy, classification and nomenclature of viruses. In: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam: Elsevier, Academic Press; 2012: 95-111.
  2. Dietzschold B., Faber M., Schnell M.J. New approaches to the prevention and eradication of rabies. Expert. Rev. Vaccines. 2003; 2(3): 399-406.
  3. Информационный бюллетень ВОЗ № 99, сентябрь 2015 года. Available at: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs099/ru/.
  4. Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Березина Е.С. Бешенство в Российской Федерации. Информационно-аналитический бюллетень. Омск: полиграфический центр Кан; 2013.
  5. Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Березина Е.С. Бешенство животных в России в 2007-2011 гг. Российский ветеринарный журнал. Мелкие домашние и дикие животные. 2012; (6): 8-12.
  6. ГОСТ 26075-2013. Животные. Методы лабораторной диагностики бешенства. М.: Стандартинформ; 2013.
  7. Хисматуллина Н.А. Методические указания по лабораторной диагностике бешенства животных. Утверждены Департаментом Ветеренарии Министерства сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации 14 мая 1997 г. М.; 1997.
  8. Дедков В.Г., Бекова М.В., Девяткин А.А., Кулешов К.В., Полещук Е.М., Маркелов М.Л. и др. Ретроспективная диагностика двух случаев бешенства у пациентов из Астраханской области. В кн.: Материалы VIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика - 2014». М.; 2014: 453-4.
  9. WHO. Expert Consultation on Rabies. Second report. WHO Technical Report Series 982. Geneva: WHO Press; 2013.
  10. Delmas O., Holmes E.C., Talbi C., Larrous F., Dacheux L., Bouchier C. et al. Genomic diversity and evolution of the lyssaviruses. PLoS One. 2008; 3(4): e2057.
  11. Tyagi S., Kramer F.R. Molecular beacons: probes that fluoresce upon hybridization. Nat. Biotechnol.1996; 14(3): 303-8.
  12. Van Pelt-Verkuil E., van Belkum A., Hays J.P. Principles and Technical Aspects of PCR Amplification. NY: Springer; 2008.
  13. Yuryev A., ed. Methods in Molecular Biology. Vol. 402: PCR Primer Design. Totowa, New Jersey: Humana Press; 2007.
  14. Kibbe W.A. OligoCalc: an online oligonucleotide properties calculator. Nucleic. Acids Res. 2007; 35(Web Server issue): W43-6.
  15. Maniatis T., Fritsch E.E., Sambrook J. Molecular Cloning. A laboratory Manual. New York: Cold Spring Harbor Laboratory; 2003.
  16. Pasloske B.L., Walkerpeach C.R., Obermoeller R.D., Winkler M., Du Bois D.B. Armored RNA technology for production of ribonuclease-resistant viral RNA controls and standards. J. Clin. Microbiol. 1998; 36(12): 3590-4.
  17. Cheng Y., Niu J., Zhang Y., Huang J., Li Q. Preparation of His-tagged armored RNA phage particles as a control for real-time reverse transcription-PCR detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus. J. Clin. Microbiol. 2006; 44(10): 3557-62.
  18. Reed L.J., Muench H. A simple method of estimation of fifty percent endpoints. Am. J. Hyg. 1938; 27: 493-7.
  19. Dupuis M., Brunt S., Appler K., Davis A., Rudd R. Comparison of Automated qRT-PCR and Direct Fluorescent Antibody Detection for Routine Rabies Diagnosis in the United States. J. Clin. Microbiol. 2015; 53(9): 2983-9.
  20. Appolinário C., Allendorf S.D., Vicente A.F., Ribeiro B.D., Fonseca C.R., Antunes J.M. et al. Fluorescent antibody test, quantitative PCR pattern and clinical aspects of rabies virus strains isolatedfrom main reservoirs in Brazil. Braz. J. Infect. Dis. 2015; 19(5): 479-85.
  21. Fischer M., Wernike K., Freuling C.M., Müller T., Aylan O., Brochier B. et al. A step forward in molecular diagnostics of lyssavirusesresults of a ring trial among European laboratories. PLoS One. 2013; 8(3): e58372.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Дедков В.Г., Девяткин А.А., Полещук Е.М., Сафонова М.В., Маркелов М.Л., Шипулин Г.А., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах