Результаты исследования распространённости и активности циркуляции парвовируса В19 (Parvoviridae, Parvovirinae, Erythroparvovirus, Primate erythroparvovirus 1) среди социально значимых категорий населения
- Авторы: Никишов О.Н.1, Кузин А.А.1, Зобов А.Е.1, Лаврентьева И.Н.2, Антипова А.Ю.2, Останкова Ю.В.2, Хамитова И.В.2, Никишов С.Н.3
-
Учреждения:
- ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Минобороны России
- ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера» Роспотребнадзора
- ФГБОУ ВО «Национальный исследовательский Мордовский государственный университет имени Н.П. Огарёва»
- Выпуск: Том 65, № 3 (2020)
- Страницы: 143-149
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Дата подачи: 21.07.2020
- Дата принятия к публикации: 21.07.2020
- Дата публикации: 21.07.2020
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/387
- DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-3-143-149
- ID: 387
Цитировать
Полный текст
Аннотация
В настоящее время наряду с возрастающей потребностью медицинских организаций в препаратах крови ощущаются и недостатки существующей системы, поскольку не для всех инфекций с гемоконтактным механизмом передачи разработаны алгоритмы лабораторного обследования доноров крови. Примером может служить инфекция, вызываемая парвовирусом В19.
Цель исследования – изучение распространённости носительства маркеров гуморального иммунитета и активности циркуляции возбудителей парвовирусной инфекции среди социально значимых категорий населения.
Материал и методы. Материалами исследования послужили образцы крови от доноров, проживающих в Санкт-Петербурге, а также изоляты парвовируса В19, выделенные из ДНК-положительных образцов плазмы.
Результаты и обсуждение. По результатам лабораторного обследования доноров была установлена высокая доля носителей вирусспецифических антител класса IgG, что свидетельствует о перенесённой ранее парвовирусной инфекции В19 и иллюстрирует её высокую распространённость в данной социально значимой группе. По результатам исследования препаратов крови с помощью метода полимеразной цепной реакции в значительном числе образцов обнаружена ДНК парвовируса В19. Это указывает на остропротекающий инфекционный процесс парвовирусной инфекции у обследованных доноров и обусловливает высокую эпидемическую опасность получаемых от них гемопродуктов. В результате секвенирования и филогенетического анализа фрагмента гена VP1 у исследуемых изолятов выявлена принадлежность к генотипу А1 и его подтипу 1А2, что показывает наибольшее сходство с генотипами парвовируса В19, циркулирующими в странах Евросоюза и Азии. Кроме того, были выделены два неизвестных ранее изолята парвовируса В19, нуклеотидные последовательности которых депонированы в международную базу данных GenBank.
Заключение. По итогам работы обоснована целесообразность включения тестирования проб крови на маркеры парвовирусной инфекции В19 в алгоритмы лабораторного обследования доноров, что позволит обеспечить предупреждение гемоконтактного заражения реципиентов крови парвовирусом В19.
Полный текст
Введение
В настоящее время потребность медицинских организаций в препаратах крови значительно возросла, что связано с совершенствованием оказания медицинской помощи населению, особенно с внедрением специализированных высокотехнологичных методов лечения. При этом принципиально важно использование для этих целей сырья, либо полностью освобождённого от гемоконтактных вирусов, либо имеющего минимальную вирусную нагрузку [1][2]. Данное требование закреплено постановлением Правительства РФ от 22.06.2019 № 797 в Правилах заготовки, хранения, транспортировки и клинического использования донорской крови и её компонентов.
Эпидемическая безопасность гемотрансфузий – один из важных компонентов профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи [2]. Предупреждение гемоконтактной передачи возбудителей вирусной природы (гепатиты В, С, D, ВИЧ-инфекция) является её обязательным элементом. В отношении данных инфекций осуществляется эпидемиологический мониторинг и нормативно закреплены алгоритмы лабораторного обследования лиц, являющихся донорами крови. Вместе с тем известны вирусные инфекции, которые могут распространяться посредством гемоконтактного механизма передачи.
К ним относится парвовирусная инфекция человека (ПВИ) В19, впервые обнаруженная Y. Cossart и соавт. при тестировании пробы плазмы крови от здорового донора на вирусный гепатит В [3]. Наименование возбудителя: парвовирус В19 (далее – PV B19) – связано с обозначением лунки лабораторного планшета, где находился исследуемый биологический материал плазмы крови, из которого был выделен патоген.
Гемоконтактный механизм передачи PV В19 особенно актуален для пациентов гематологического и хирургического профиля, являющихся реципиентами препаратов крови. Поэтому с позиции эпидемиологии весьма важно, что устойчивость PV B19 к традиционным режимам дезинфекции (стерилизации) обусловливает эпидемическую опасность продуктов крови, особенно со значительной вирусной нагрузкой (≥104 копий/мл), как фактора передачи данной инфекции, способного приводить к заражению до 50% реципиентов [4][5]. Кроме того, известно, что при развитии острой ПВИ в крови появляются нейтрализующие антитела, а собственно период вирусемии, несмотря на сравнительно малую продолжительность (не более 3 нед), сопровождается высокой концентрацией ДНК PV B19 в крови (≥1012 копий/мл) [6]. В свою очередь появление специфических антител класса IgМ к PV B19, циркулирующих в крови до 3 мес, сопряжено со снижением уровня вирусной ДНК, а антитела класса IgG к PV B19, обеспечивающие напряжённый иммунитет, появляются в крови начиная с 14–15-го дня от начала заболевания [7][8]. В связи с этим обнаружение в крови доноров антител того или иного класса может свидетельствовать о наличии или отсутствии острой ПВИ и, соответственно, об уровне эпидемической опасности данной кроводачи.
Таким образом, роль серопозитивных к PV B19 доноров крови в развитии эпидемического процесса ПВИ весьма значима, однако их активное выявление в нашей стране, к сожалению, не предусмотрено. При этом в некоторых странах Европы и в США, в отличие от Российской Федерации, внедрены прямые указания на тестирование крови доноров на PV B19 наряду с возбудителями других гемоконтактных инфекций (гепатиты В, С, D и др.).
Цель исследования – изучение распространённости носительства маркеров гуморального иммунитета и активности циркуляции возбудителей ПВИ среди социально значимых категорий населения (на примере результатов обследования доноров крови, проживающих в Санкт-Петербурге).
Материал и методы
500 образцов плазмы крови доноров из Санкт-Петербурга исследовали на маркеры ПВИ – IgG-антитела и ДНК вируса.
Использовали эпидемиологические (эпидемиологический анализ), математико-статистические, молекулярно-генетические (диагностику методом полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование, филогенетический анализ) и серологический (иммуноферментный анализ, ИФА) методы исследования.
Для лабораторной диагностики ПВИ применяли ИФА – стандартный метод определения вирусспецифических антител [9]. Антитела к PV В19 классов IgМ и IgG выявляли с помощью тест-систем «recomWELLParvovirus B19 IgM» и «recomWELLParvovirus B19 IgG» (Microgen GmbH, Германия) в соответствии с инструкцией производителя.
Методом ПЦР с помощью диагностического набора реагентов «АмплиСенс®Parvovirus В19-FL» (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Россия) определяли наличие ДНК PV B19 и вирусную нагрузку положительных образцов плазмы серопозитивных к PV B19 доноров. ДНК для генотипирования выделяли из образцов с наибольшей вирусной нагрузкой.
Выделенную ДНК амплифицировали по методике, описанной ранее [10][11]. Генотипирование проводили по участку (локусу), по которому кодируется фрагмент гена NS1 и область гена VP1 (VP1u) возбудителя, что необходимо для филогенетического анализа изолятов PV B19. Для этого использовали специфические праймеры (ООО «Синтол», Россия), которые подбирали с помощью программы NCBI/PrimerBLAST с учётом данных литературы и в соответствии с общепринятыми рекомендациями.
В работе были использованы праймеры:
ParvoB19 1F CAATTGTCACAGACACCAGTA;
ParvoB19 2F CCCGCGCTCTAGTACGCCCA и ParvoB19 1R ACTTAGCCAGTTGGCTATACCT;
ParvoB19 2R TTGCGGGGGCCCAGCTTGTA.
Секвенирующую реакцию проводили в соответствии с инструкцией к набору реагентов ABI PRISM BigDyeTerminator v3.1 (Applied Biosystems, США) в трёх повторах, на прямых и обратных праймерах. Очищенный осадок денатурировали в формамиде. Продукт секвенирующей реакции анализировали на специальном оборудовании – генетическом анализаторе ABI Prism 3500 (Applied Biosystems, США).
При исследовании генетических элементов использовали программу NCBI Blast с выравниванием последовательностей нуклеотидов посредством программы MEGA 7.0 (алгоритм ClusalW). Полученные результаты сравнивали с международными данными, представленными в GenBank. В филогенетическом анализе методом «присоединения соседей» оценивали расстояние между нуклеотидными последовательностями и строили филогенетическое дерево с учётом критерия сбалансированной эволюции. Кроме того, проведён бутстреп-анализ для 500 доноров, что позволило оценить достоверность построенного филогенетического дерева возбудителя.
Математические расчёты и статистический анализ выполнены с использованием методов, применяемых в медицинских исследованиях. При этом вычисляли частотные показатели и определяли 95% доверительный интервал (ДИ) по методу Вальда–Уилсона.
Результаты
В результате проведённых исследований у 426 (85,2%) обследованных в сыворотках крови были обнаружены вирусспецифические антитела класса IgG. С одной стороны, это свидетельствует о перенесённой ПВИ В19, а с другой – показывает её распространённость в данной социально значимой группе населения (см. таблицу).
IgG-маркеры ПВИ В19 у доноров по гендерным и возрастным признакам, на 100 человек (95% доверительный интервал)
Prevalence of IgG antibodies to parvovirus В19 in donors by gender and age, per 100 people (95% CI)
Как показали результаты исследований, в общей когорте обследованных доноров оказалось 79,4 (95% ДИ 75,6–83,2) мужчин и 5,8 (95% ДИ 3,9–7,7) женщин, серопозитивных к PV В19, на 100 человек. При этом наибольшая частота Ig-маркеров PV В19 выявлена в возрастной группе 18–20 лет: 38,0, особенно среди мужчин (37,0). В то же время среди лиц 40 лет отмечена невысокая распространённость маркеров специфического противовирусного иммунитета: 4,4 у мужчин и 1,8 у женщин на 100 обследованных.
Для определения вирусной нагрузки 426 (85,2%) образцов крови доноров, содержащих IgG-антитела к PV B19, были исследованы методом ПЦР. В результате в 17,4% пробах плазмы крови обнаружена вирусспецифическая ДНК, подтверждающая наличие PV В19 у доноров. При этом отмечена неоднородность вирусной нагрузки: в 13,5% случаев ДНК PV В19 составила 104 копий/мл, в 1,6% – 104 –105 и в 2,4% – более 105. С одной стороны, это свидетельствует об острой ПВИ В19, а с другой – об эпидемической опасности таких гемопродуктов, особенно при значительной вирусной нагрузке. Полученный вывод согласуется с данными как отечественных, так и зарубежных исследователей [4][9][12][13].
Была проанализирована частота встречаемости ДНК РV B19 в зависимости от возраста доноров: 18– 20 лет (1-я группа), 21 год – 30 лет (2-я группа), 31 год – 40 лет (3-я группа), 41 год и старше (4-я группа). Анализ показал, что 67,6% положительных проб ПЦР были получены от доноров 1-й группы. Кроме того, в основном у лиц этой группы были обнаружены образцы плазмы крови с высокой вирусной нагрузкой (104–108 копий/мл ДНК РV B19). Среди доноров 2-й группы (21 год – 30 лет) доля лиц с высокой вирусной нагрузкой в клиническом материале составила 28,4%, в 3-й и 4-й возрастных группах – по 2%.
Из образцов плазмы крови с вирусной нагрузкой 106–107копий/мл ДНК PV B19 были выделены два изолята PV B19 – RUS15.15 и RUS15.15.2, их нуклеотидные последовательности депонированы в международную базу данных GenBank: MG779501 и MG779500 соответственно. Полученные последовательности MG779501 и MG779500 оказались идентичными.
При сравнении с референсным изолятом NC000883 из базы GenBank в изолятах RUS 15.15 и RUS 15.15.2 были отмечены изменения качественного состава аминокислот, связанные с мутациями на генном уровне (VP1, VP1u). Выявлены уникальные значимые мутации в следующих последовательностях аминокислот: E14K, V30L, S98N, D107N. Здесь необходимо отметить, что в структурном белке PV B19 (VP1, VP1u) имеется уникальная область, которая является своеобразной антигенной мишенью, нейтрализуемой специфическими антителами. Поэтому происходящие в этой области мутации могут способствовать распространению новых генотипов PV B19 в популяции людей. Однако требуются дополнительные исследования, результаты которых позволят установить эпидемиологическую значимость таких мутаций.
Для филогенетического анализа полученные в данном исследовании нуклеотидные последовательности группировали с последовательностями наиболее широко распространённого в мире генотипа 1А. Генотип 1А включает два клайда: 1А1 и 1А2. По результатам генотипирования обнаруженные изоляты отнесены к подтипу 1А2. Похожие на RUS15.15 и RUS15.15.2 последовательности PV B19 были выделены и депонированы в GenBank из Российской Федерации, из европейских (Франция, Германия) и азиатских стран (Япония), что подтверждает значительную распространённость инфекции, связанной с PV В19 (см. рисунок).
Результаты сравнительного филогенетические анализа выделенных и депонированных в GenBank изолятов парвовируса В19.
Results of comparative phylogenetic analysis of isolated parvovirus В19 sequences deposited in the GenBank.
Обсуждение
К настоящему времени известно три генотипических варианта PV B19, которые на 10–15% различаются по нуклеотидному составу [14][15][16]. При всём разнообразии на генетическом уровне существует только один серотип этого возбудителя [9][17][18]. Эпидемиологическую значимость представляет исследование, направленное на выявление распространённости PV В19 в группе доноров, так как возбудитель может передаваться посредством гемоконтактного механизма, в частности, при использовании препаратов крови и её продуктов. В ходе исследования проб плазмы крови в 85,2% случаев были обнаружены вирусспецифические IgG-антитела, что свидетельствует о перенесённой ПВИ В19. В 14,8% исследованных образцов обнаружена ДНК возбудителя. Нуклеотидная идентичность выделенных из образцов плазмы крови двух изолятов PV B19: RUS15.15 (MG779500) и RUS15.15.2 (MG779501) – составила 100%, что свидетельствует о циркуляции парвовируса среди обследованных доноров. Изоляты относятся к генотипу G1А2 и имеют уникальные мутации, не представленные ранее в коллекции GenBank.
Как следует из данных литературы, наиболее часто PV B19 инфицируются лица детского и подросткового возраста [19], но, как показывают проведённые исследования, актуальность ПВИ сохраняется и для взрослых лиц, особенно из организованных воинских коллективов.
Заключение
Полученные в исследовании данные показывают необходимость дальнейшей разработки проблемы эпидемической безопасности, связанной с ПВИ В19, в гематологии и трансфузиологии. Одно из её направлений – мониторинг специфической ДНК и вирусной нагрузки (>104 копий/мл) в образцах крови, полученной от доноров. Это позволит своевременно отбраковывать эпидемически опасные гемопродукты, что имеет важное практическое значение в профилактике инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. В связи с этим для предупреждения гемоконтактного заражения пациентов PV В19 целесообразно включить в существующие алгоритмы лабораторного обследования доноров тестирование проб крови на маркеры PV В19 (IgМ- и IgG-антитела, ДНК PV В19 с вирусной нагрузкой).
Об авторах
О. Н. Никишов
ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Минобороны России
Автор, ответственный за переписку.
Email: nikishov.oleg2015@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-3677-1734
Никишов Олег Николаевич, преподаватель кафедры общей и военной эпидемиологии
194044, Санкт-Петербург
РоссияА. А. Кузин
ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Минобороны России
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-9154-7017
194044, Санкт-Петербург Россия
А. Е. Зобов
ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Минобороны России
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-7791-8993
194044, Санкт-Петербург Россия
И. Н. Лаврентьева
ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера» Роспотребнадзора
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-2188-6547
197101, Санкт-Петербург Россия
А. Ю. Антипова
ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера» Роспотребнадзора
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-7763-535X
197101, Санкт-Петербург Россия
Ю. В. Останкова
ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера» Роспотребнадзора
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-2270-8897
197101, Санкт-Петербург Россия
И. В. Хамитова
ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера» Роспотребнадзора
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-1966-7860
197101, Санкт-Петербург Россия
С. Н. Никишов
ФГБОУ ВО «Национальный исследовательский Мордовский государственный университет имени Н.П. Огарёва»
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-1573-6825
430005, Саранск
РоссияСписок литературы
- Попцов А.Л., Парамонов И.В., Фетищева Н.Ю. Верификация методики выявления и количественного определения ДНК парвовируса В19 методом ПЦР в плазме для фракционирования. Вестник службы крови России. 2014; (1): 48-53.
- Элижбаева М.А., Февралева И.С., Глинщикова О.А., Сильвейстрова О.Ю., Шипулина О.Ю., Домонова Э.А. и др. Выявление парвовируса В19 в крови российских доноров. Гематология и трансфузиология. 2011; 56(2): 10-3.
- Cossart Y.E., Field A.M., Cant B., Widdows D. Parvovirus-like particles in human sera. Lancet. 1975; 1(7898): 72-3. DOI: http://doi.org/10.1016/s0140-6736(75)91074-0
- Парамонов И.В., Попцов А.Л., Рылов А.В. Опыт внедрения системы утверждения доноров плазмы для фракционирования. Гематология и трансфузиология. 2016; 61(2): 87-91. DOI: http://doi.org/10.18821/0234-5730-2016-61-2-87-91
- Kleinman S.H., Glynn S.A., Lee T.H., Tobler L., Montalvo L., Todd D., et al. Prevalence and quantitation of parvovirus B19 DNA levels in blood donors with a sensitive polymerase chain reaction screening assay. Transfusion. 2007; 47(10): 1756-64. DOI: http://doi.org/10.1111/j.1537-2995.2007.01341.x
- Филатова Е.В., Новикова Н.А., Зубкова Н.В., Голицына Л.Н., Кузнецов К.В. Определение маркеров парвовируса В19 в образцах крови доноров. Микробиология, эпидемиология и иммунология. 2010; (5): 67-70.
- Mossong J., Hens N., Friederichs V., Davidkin I., Broman M., Litwinska B., et al. Parvovirus B19 infection in the European countries: seroepidemiology, force of infection, and maternal risk of infection. Epidemiol. Infect. 2008; 136(8): 1059-68. DOI: http://doi.org/10.1017/S0950268807009661
- Anderson L.J., Gillespie S.M., Torok T.J., Hurwitz E.S., Tsou C.J., Gary G.W. Risk of infection following exposures to human parvovirus B19. Behring Inst. Mitt. 1990; (85): 60-3.
- Anderson L.J., Tsou C., Parker R.A., Chorba T.L., Wulff H., Tattersall P., et al. Detection of antibodies and antigens of human parvovirus B19 by enzyme-linked immunosorbent assay. J. Clin. Microbiol. 1986; 24(4): 522-6.
- Лаврентьева И.Н., Антипова А.Ю., Семенов А.В., Бичурина М.А. Генотипы изолятов парвовируса В19, циркулирующих на территории Северо-западного федерального округа России. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013; 90(6): 36-43.
- Хамитова И.В., Останкова Ю.В., Антипова А.Ю., Семёнов А.В., Лаврентьева И.Н. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов парвовируса В19, циркулирующих на территории северо-западного федерального округа. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2018; 95(6): 55-61. DOI: http://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-6-55-61
- Candotti D., Etiz N., Parsyan A., Allain J.P. Indentification and сharacterization of persistent human erythrovirus infection in blood donor samples. J. Virol. 2004; 78(22): 12169-78. DOI: http://doi.org/10.1128/JVI.78.22.12169-12178.2004
- Ke L., He M., Li C., Liu Y., Gao L., Yao F., et al. The prevalence of human parvovirus B19 DNA and antibodies in blood donors from four Chinese blood centers. Transfusion. 2011; 51(9): 1909-18. DOI: http://doi.org/10.1111/j.1537-2995.2011.03067.x
- Лаврентьева И.Н., Антипова А.Ю. Парвовирус В19 человека: характеристика возбудителя, распространение и диагностика обусловленной им инфекции. Инфекция и иммунитет. 2013; 3(4): 311-22. DOI: http://doi.org/10.15789/2220-7619-2013-4-311-322
- Baylis S.A. Standardization of nucleic acid amplification technique (NAT)-based assays for different genotypes of parvovirus B19: a meeting summary. Vox Sang. 2008; 94(1): 74-80. DOI: http://doi.org/10.1111/j.1423-0410.2007.00992.x
- Corcoran A., Doyle S. Advances in the biology, diagnosis and host-pathogen interactionsof parvovirus B19. J. Med. Microbiol. 2004; 53(Pt. 6): 459-75. DOI: http://doi.org/10.1099/jmm.0.05485-0
- Blümel J., Eis-Hübinger A.M., Stühler A., Bönsch C., Gessner M., Löwer J. Characterization of Parvovirus B19 genotypes 2 in KU812Ep6 cells. J. Virol. 2005; 79(22): 14197-206. DOI: http://doi.org/10.1128/JVI.79.22.14197-14206.2005
- Lou S., Xu B., Huang Q., Zhi N., Cheng F., Wong S., et al. Molecular сharacterization of the newly identified human parvovirus 4 in the family Parvoviridae. Virology. 2012; 422(1): 59-69. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virol.2011.09.033
- Смеликов Я.А. Парвовирусная (В19) инфекция у детей на современном этапе (обзор). Вестник КГМА им. И.К. Ахунбаева. 2011; (4): 20-4.