Стремительное распространение циркулирующей рекомбинантной формы CRF02-AG ВИЧ-1 на территории России и сопредельных стран

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Статья посвящена исследованию распространения циркулирующей рекомбинантной формы CRF02-AG ВИЧ-1 по территории стран бывшего СССР на основе частичных и полногеномных сиквенсов. Впервые получен полногеномный сиквенс рекомбинанта CRF02-AG, циркулирующего в России (Московский регион). Построено общемировое филогенетическое дерево полногеномных сиквенсов CRF02-AG. Выявлены 3 четко кластеризующиеся географические группы: СНГ, Южная Корея и Франция, что, по-видимому, свидетельствует о единичном заносе вируса в каждый из регионов. Кластер СНГ характеризуется наименьшим генетическим разнообразием и является сравнительно молодым. Филогенетический анализ в пределах СНГ на основе последовательностей гена env четко дискриминирует 3 ветви: 2 российские и 1 узбекскую. Низкое генетическое разнообразие в двух российских кластерах свидетельствует как минимум о двух недавних независимых заносах рекомбинанта CRF02-AG на территорию России.

Об авторах

Ф. Ф. Москалейчик

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: fedor.mosckaleychick@gmail.com

Москалейчик Федор Феликсович, канд. биол. наук, ст. науч. сотр.

123098, г. Москва

Россия

В. Ю. Лага

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
123098, г. Москва Россия

Е. Дельгадо

Национальный центр микробиологии, Институт Салуда Карлоса III, Махадаонда

Email: fake@neicon.ru
Мадрид Испания

И. Вега

Национальный центр микробиологии, Институт Салуда Карлоса III, Махадаонда

Email: fake@neicon.ru
Мадрид Испания

А. Фернандес-Гарсия

Национальный центр микробиологии, Институт Салуда Карлоса III, Махадаонда

Email: fake@neicon.ru
Мадрид Испания

Л. Перес-Альварес

Национальный центр микробиологии, Институт Салуда Карлоса III, Махадаонда

Email: fake@neicon.ru
Мадрид Испания

Г. В. Корнилаева

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
123098, г. Москва Россия

А. Ю. Пронин

ГУЗ МО «Московский областной центр по профилактике и борьбе со СПИДом и инфекционными заболеваниями»

Email: fake@neicon.ru
129110, г. Москва Россия

Ю. В. Жернов

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
123098, г. Москва Россия

М. М. Томсон

Национальный центр микробиологии, Институт Салуда Карлоса III, Махадаонда

Email: fake@neicon.ru
Мадрид Испания

М. Р. Бобкова

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
123098, г. Москва Россия

Э. В. Карамов

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
123098, г. Москва Россия

Список литературы

  1. Karamov E.V., Yaroslavtseva N.G., Shchelkanov M.Y., Martovitski D., Lukashov V., Kozlov A.P. et al. Antigenic and genetic relations between different HIV-1 subtypes in Russia. Immunol. Infect. Dis. 1996; 6: 15–24.
  2. Lukashov V.V., Cornelissen M.T., Goudsmit J., Papuashvilli M.N., Rytik P.G., Khaitov R.M. et al. Simultaneous introduction of distinct HIV-1 subtypes into different risk groups in Russia, Byelorussia and Lithuania. AIDS. 1995; 9 (5): 435–9.
  3. Hamers F.F. HIV infection in Ukraine (1987–96). Rev. Epidemiol. Sante Publique. 2000; 48 (Suppl. 1): 1S3–15.
  4. Novitsky V.A., Montano M.A., Essex M. Molecular epidemiology of an HIV-1 subtype A subcluster among injection drug users in the Southern Ukraine. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998; 14 (12): 1079–85.
  5. Bobkov A., Cheingsong-Popov R., Selimova L., Ladnaya N., Kazennova E., Kravchenko A. et al. An HIV type 1 epidemic among injecting drug users in the former Soviet Union caused by a homogeneous subtype A strain. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1997; 13 (14): 1195–201.
  6. Lukashov V.V., Karamov E.V., Eremin V.F., Titov L.P., Goudsmit J. Extreme founder effect in an HIV type 1 subtype A epidemic among drug users in Svetlogorsk, Belarus. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998; 14 (14): 1299–303.
  7. Fernandez-Garcia A., Revilla A., Vazquez-de Parga E., Vinogradova A., Rakhmanova A., Karamov E. et al. The analysis of near full-length genome sequences of HIV type 1 subtype A viruses from Russia supports the monophyly of major intrasubtype clusters. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2012; 28 (10): 1340–3.
  8. Nabatov A.A., Kravchenko O.N., Lyulchuk M.G., Shcherbinskaya A.M., Lukashov V.V. Simultaneous introduction of HIV type 1 subtype A and B viruses into injecting drug users in southern Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet Union. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2002; 18 (12): 891–5.
  9. Thomson M.M., de Parga E.V., Vinogradova A., Sierra M., Yakovlev A., Rakhmanova A. et al. New insights into the origin of the HIV type 1 subtype A epidemic in former Soviet Union’s countries derived from sequence analyses of preepidemically transmitted viruses. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2007; 23 (12): 1599–604.
  10. Казеннова Е.В., Васильев А.В., Лаповок И.А., Гришечкин А.Е., Лага В.Ю., Саламов Г.Г. и др. Генетические варианты ВИЧ-1 в азиатской части России. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4): 28–35.
  11. Liitsola K., Holm K., Bobkov A., Pokrovsky V., Smolskaya T., Leinikki P. et al. An AB recombinant and its parental HIV type 1 strains in the area of the former Soviet Union: low requirements for sequence identity in recombination. UNAIDS Virus Isolation Network. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2000; 16 (11): 1047–53.
  12. Liitsola K., Tashkinova I., Laukkanen T., Korovina G., Smolskaja T., Momot O. et al. HIV-1 genetic subtype A/B recombinant strain causing an explosive epidemic in injecting drug users in Kaliningrad. AIDS. 1998; 12 (14): 1907–19.
  13. Карамов Э.В., Гашникова Н.М., Дроздов И.Г., Онищенко Г.Г. Мониторинг ВИЧ-инфекции в Евразии. Атлас вирусов иммунодефицита человека. Новосибирск: ЦЭРИС; 2009.
  14. Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A. et al. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014; 30 (8): 742–52.
  15. Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. Genetic characterization of an isolate of HIV type 1 AG recombinant form circulating in Siberia, Russia. Arch. Virol. 2012; 157 (12): 2335–41.
  16. Гашникова Н.М., Сафронов П.Ф., Никонорова Ю.В., Унагаева Н.В., Лаптева Т.А. Свойства изолятов CRF02_AG ВИЧ-1, циркулирующих на территории Новосибирской области. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2011; 3: 38–43.
  17. Kurbanov F., Kondo M., Tanaka Y., Zalalieva M., Giasova G., Shima T. et al. Human immunodeficiency virus in Uzbekistan: epidemiological and genetic analyses. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2003; 19 (9): 731–8.
  18. Carr J.K., Nadai Y., Eyzaguirre L., Saad M.D., Khakimov M.M.,Yakubov S.K. et al. Outbreak of a West African recombinant of HIV-1 in Tashkent, Uzbekistan. J. Acquir. Immune. Defic. Syndr. 2005; 39 (5): 570–5.
  19. Palm A.A., Esbjornsson J., Mansson F., Kvist A., Isberg P.E., Biague A. et al. Faster progression to AIDS and AIDS-related death among seroincident individuals infected with recombinant HIV-1 A3/ CRF02_AG compared with sub-subtype A3. J. Infect. Dis. 2014; 209 (5): 721–8.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Москалейчик Ф.Ф., Лага В.Ю., Дельгадо Е., Вега И., Фернандес-Гарсия А., Перес-Альварес Л., Корнилаева Г.В., Пронин А.Ю., Жернов Ю.В., Томсон М.М., Бобкова М.Р., Карамов Э.В., 2015

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах