Эпидемический сезон 2023–2024 гг.: палитра возбудителей ОРВИ на некоторых территориях РФ и в регионах ВОЗ

Полный текст

Введение

На фоне продолжающейся циркуляции нового коронавируса SARS-CoV-2 активность других респираторных патогенов, в том числе гриппа, в течение последних 3 эпидемических сезонов (2020–2023 гг.) была ниже по сравнению с предпандемическим по COVID-19 периодом [1–4]. Несмотря на это, была отмечена изменчивость популяций вирусов SARS-CoV-2 и гриппа, что не могло не повлиять на особенности эпидемического процесса острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ) в постковидный период¹ [5, 6]. Изучение особенностей изменчивости вирусных патогенов, а также способность к прогнозированию эволюционных связей может повысить уровень контроля над возбудителями ОРВИ и, в первую очередь, вирусами гриппа и SARS-CoV-2, в отношении которых разработаны вакцины [7]. При продолжении ранее проводимых ежегодных исследований определенный интерес представляла оценка особенностей развития эпидемии гриппа 2023–2024 гг. по частоте встречаемости и спектру респираторных патогенов на отдельных территориях РФ, а также в регионах Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ). Очевидной является необходимость анализа результатов изучения эволюционной изменчивости вирусов гриппа птиц и свиней, случаи которых были детектированы у людей в разных странах мира, для оценки рисков преодоления межвидового барьера и возможного формирования нового пандемического варианта².

Цель настоящей работы заключалась в определении особенностей циркуляции возбудителей ОРВИ, в том числе вирусов гриппа и SARS-CoV-2, в период эпидемического сезона 2023–2024 гг. в ряде регионов РФ и ВОЗ.

Материалы и методы

Сбор данных по заболеваемости и лабораторной диагностике возбудителей ОРВИ. В рамках осуществления эпидемиологического надзора за циркуляцией вирусов гриппа и ОРВИ в РФ Центр экологии и эпидемиологии гриппа (ЦЭЭГ) Института вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России в сотрудничестве с 10 опорными базами, представленными территориальными управлениями и ФБУЗ «Центры гигиены и эпидемиологии» Роспотребнадзора в Европейской части (гг. Новгород Великий, Липецк, Владимир, Ярославль, Пенза, Чебоксары), на Урале (г. Оренбург), Сибири (г. Томск) и Дальнем Востоке (гг. Биробиджан и Владивосток), провели анализ показателей заболеваемости и госпитализации в разных возрастных группах населения, а также результатов лабораторной диагностики респираторных патогенов. Период наблюдения ‒ с 40-й недели (октябрь) 2023 г. по 39-ю неделю (сентябрь) 2024 г.

Анализ заболеваемости гриппом и ОРВИ в разных возрастных группах, изоляция вирусов гриппа, постановка полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), реакции торможения гемагглютинации, оценка чувствительности к противогриппозным препаратам, а также статистическая обработка полученных результатов описаны ранее [1, 2]. В рамках традиционного надзора объем исследований с помощью лабораторных методов составил: для вирусов гриппа – 44 719 клинических образцов/изолятов/штаммов, ОРВИ – 40 277 клинических образцов и SARS-CoV-2 – 30 890 клинических образцов.

Полногеномная амплификация вирусов гриппа А и B была проведена по ранее описанной методике [8, 9]. Библиотека комплементарной ДНК была приготовлена с использованием набора SQK-LSK109 (Oxford Nanopore, Великобритания) с последующим секвенированием на приборе MinION (Oxford Nanopore, Великобритания). Биоинформационная обработка данных проведена с использованием пакетов программного обеспечения guppy вер.6.3.8, porechop вер.0.2.4, nanofilt вер.2.3.0, minimap2 вер.2.24, medaka вер.1.7.2 и bcftools вер.1.13.

Этическое утверждение. Исследование проводилось при добровольном информированном согласии пациентов. Протокол исследования одобрен Этическим комитетом ГБУЗ г. Москвы «Инфекционная клиническая больница № 1 Департамента здравоохранения города Москвы» (Протокол № 8 от 28.12.2022).

Результаты

В период с октября 2023 г. (40-я неделя) по сентябрь 2024 г. (39-я неделя) на сотрудничающих с ЦЭЭГ территориях превышение эпидемического порога заболеваемости ОРВИ по отношению к среднему показателю по РФ (72,6 на 10 тыс. населения) регистрировали в периоды 47–52-й недели 2023 г., 2–7-й недели, 9-й и 11-й недели 2024 г. Максимальную заболеваемость по совокупному населению (среднее значение по данным 10 городов РФ) регистрировали на 51-й неделе 2023 г. (135,9) – в те же сроки, что и в предыдущем сезоне, но с более низким показателем (157,0). В этот период частота положительных проб на респираторные патогены составила 34,2%, в том числе вирусы гриппа – 18,9%, SARS-CoV-2 – 5,7%, другие ОРВИ – 9,6%.

Средний показатель заболеваемости ОРВИ за весь сезон был незначительно ниже по сравнению с показателем предыдущего периода (69,1 и 71,6 соответственно); в то же время отмечали незначительный рост показателя у детей 0–2 лет (среднее 303,1 с интервалом 6,9–553,8 и 294,4 (9,2–475,2) соответственно); в других возрастных группах отмечено снижение: у детей 3–6 лет (264 (6,4–409,6) и 273,9 (10,5–425,4) соответственно), школьников (137,6 (5,5–225,6) и 141,4 (9,4–218,3) соответственно) и взрослых (41,6 (29,0–58,3) и 43,6 (19,4–54,3) соответственно).

Динамика частоты положительных находок для вирусов гриппа А и В, SARS-CoV-2 и ОРВИ (в том числе: вирусы парагриппа 1, 2, 3 и 4-го типов (human Parainfluenza virus-1–4, HPIV); аденовирусы групп B, C и E ((human Adenovirus B, C, E, HAdV); респираторно-синцитиальный вирус (human Respiratory Syncytial virus, HRsV); риновирус (human Rhinovirus, HRV); бокавирус (human Bocavirus, HBoV); метапневмовирус человека (human Metapneumovirus, HMPV); коронавирус (human Coronavirus, HCoV)) методом ОТ-ПЦР в период октября 2023 г. – сентября 2024 г. представлена на рис. 1.

 

Рис. 1. Динамика частоты выявления положительных образцов на вирусные респираторные возбудители (%) в клинических материалах методом ОТ-ПЦР в период эпидемического сезона 2023–2024 гг.

Fig. 1. Dynamics of the frequency of detection of positive samples for virus respiratory pathogens (%) in clinical samples by RT-PCR during epidemic season 2023–2024.

 

Эпидемический сезон 2023–2024 гг., как и предыдущий, стартовал с высоких показателей частоты положительных проб на ОРВИ негриппозной этиологии (28,3%). На фоне снижающейся активности патогенов ОРВИ и относительно «невысокой» частоты выявления положительных проб на SARS-CoV-2 (до 9,1%) был отмечен рост активности вирусов гриппа с максимальными показателями числа положительных проб (31,5%) в период 1-й недели 2024 г. Эти данные указывают на высокую эпидемическую активность вирусов гриппа в этот период и коррелируют с показателями заболеваемости ОРВИ.

В период 3–24-й недели 2024 г. регистрировали рост активности других респираторных патогенов с максимальными показателями частоты положительных проб до 26,0%; и вплоть до 27-й недели 2024 г. частота выявления положительных проб была не менее 10,0%. Рост показателей был отмечен также в период 37–39-й недели 2024 г. (до 14,1%).

Наибольшая активность SARS-CoV-2 была прослежена в период 11–16-й недели 2024 г.

Частота положительных находок по результатам ПЦР в период 40-й недели 2023 г. – 26-й недели 2024 г. составила: для гриппа – 7,7% (из 38 070 обследованных), ОРВИ – 17,1% (из 33 869 обследованных) и SARS-CoV-2 – 6,5% (из 26 257 обследованных); в период июня–сентября 2024 г. (27–39-я неделя 2024 г.) показатели были значительно ниже и составили: для ОРВИ – 9,7% (из 6408 обследованных) и SARS-CoV-2 – 4,9% (из 4633 обследованных). При этом их активность различалась в разных городах РФ (табл. 1).

 

Таблица 1. Результаты ПЦР-диагностики гриппа, SARS-CoV-2 и некоторых ОРВИ в период октября 2023 г. – сентября 2024 г. в ЦЭЭГ НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи и на сотрудничающих с ним территориях РФ

Table 1. The results of PCR diagnostics of influenza, SARS-CoV-2 and some acute respiratory infections in the period October 2023 – September 2024 at the Centre of Ecology and Epidemiology of Influenza (CEEI) in National Research Centre of N.F. Gamaleya and in the territories of the Russian Federation cooperating with it

Центры гигиены и эпидемиологии городов, областей, республик Canters of Hygiene and Epidemiology of cities, regions, republics	Число образцов, изученных на наличие респираторных патогенов методом ОТ-ПЦР The number of samples examined for the presence of respiratory pathogens by RT-PCR
	грипп influenza viruses		ОРВИ, сезонные acute respiratory infections, seasonal								SARS-CoV-2
	число образцов number of samples	% «+»	число образцов number of samples	HPIV % «+»	HAdV % «+»	HRsV % «+»	HRV % «+»	HCoV % «+»	HBoV % «+»	HMPV % «+»	число образцов number of samples	% «+»
ЦЭЭГ, Москва CEEI, Moscow	1404	13,8	595	1,5	3,4	2,7	12,9	3,7	0,2	2,0	1404	13,6
Вел. Новгород Vel. Novgorod	1222	1,8	1024	0,7	0	2,3	0	0	0	0	0	0
Липецк Lipetsk	4117	1,5	4117	0,5	0,3	0,3	0,5		0,4	0,6	4117	0,8
Владимир Vladimir	2330	5,7	1663	2,4	1,3	5,5	6,8	2,1	2,4	2,2	2234	3,2
Ярославль Yaroslavl	6196	8,5	4159	1,7	2,3	2,7	8,3	3,9	1,0	4,1	4587	8,2
Пенза Penza	4058	4,2	3549	1,1	1,6	2,3	5,0	1,1	0,4	0,5	3549	1,3
Чебоксары Cheboksary	3348	6,2	3348	0,7	0,6	0,9	0,03	1,6	0	0	3422	10,0
Оренбург Orenburg	10 817	1,7	10 817	1,5	1,0	2,1	4,6	1,5	0,8	2,6	0	0
Томск Tomsk	3265	12,9	3254	1,32	1,5	2,9	8,8	2,1	0,8	1,2	3265	6,3
Владивосток Vladivostok	5345	13,1	5345	1,9	1,8	4,7	10,5	4,0	1,0	3,1	5345	8,3
Биробиджан Birobidzhan	2617	12,7	2406	2,9	2,5	1,1	12,6	4,2	0,9	2,5	2967	8,0
Всего Total	44 719	6,6	40 277	1,5	1,3	2,4	5,9	2,1	0,8	2,0	30 890	6,3

 

Наиболее высокая частота выявления положительных проб на грипп была отмечена в гг. Москве, Владивостоке, Томске и Биробиджане; SARS-CoV-2 – в гг. Москве, Чебоксарах, Владивостоке и Ярославле. Тройку «лидеров» в структуре сезонных ОРВИ составили HRV (5,9%), HRsV (2,4%) и HCoV (2,1%), при этом более высокие показатели положительных проб на HPIV выявляли в гг. Биробиджане, Владимире и Ярославле; на HAdV – в гг. Москве, Биробиджане и Ярославле; HRV – в гг. Москве, Биробиджане и Владивостоке; HCoV – в гг. Ярославле, Москве и Владимире; HBoV – в гг. Владимире, Владивостоке и Биробиджане; HMPV – в гг. Ярославле, Оренбурге и Биробиджане.

В то же время регионы России не различались по долевому участию типов/подтипов вирусов гриппа (рис. 2). Вирус гриппа A доминировал в сезоне 2023–2024 гг. на всех территориях, сотрудничающих с ЦЭЭГ НИЦЭМ. В структуре вируса гриппа А большую активность проявил A(H3N2), долевое участие которого составило 95,0%. Штаммы вируса гриппа В выявляли только в 5,0% случаев, при этом в отдельных городах его активность была выше по сравнению с другими городами Европейской части РФ: в гг. Москве (10,3%), Липецке (15,3%), Владимире (7,5%), Ярославле (5,5%) и Владивостоке (8,7%).

 

Рис. 2. Долевое участие вирусов гриппа в период эпидемического сезона 2023–2024 гг. в разных регионах РФ (по данным Центров гигиены и эпидемиологии городов, областей, республик).

Fig. 2. The share of influenza viruses during the epidemic season 2023–2024 in different regions of the Russian Federation (according to the Centers of Hygiene and Epidemiology of cities, regions, republics).

 

Результаты антигенной характеристики эпидемических штаммов представлены в табл. 2. Исследования проводили в отношении вирусов гриппа, вошедших в состав вакцин в сезоне 2023–2024 гг. для стран Северного полушария³.

 

Таблица 2. Антигенные свойства эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В, выделенных в эпидемическом сезоне 2023–2024 гг.

Table 2. Antigenic properties of epidemic strains of influenza A and B viruses isolated in the epidemic season 2023–2024

Тип/подтип вируса гриппа Type/subtype of the influenza virus	Штаммы вирусов гриппа, вошедшие в состав гриппозных вакцин в сезоне 2023–2024 гг. (отношение к гомологичному титру) Influenza virus strains included in influenza vaccines in the 2023–2024 season (relation to homologous titer)	Число штаммов, близкородственных эталонной сыворотке/число изученных The number of strains closely related to the reference serum/the number of studied	Общее число изученных штаммов The total number of strains studied
А(H1N1)pdm09	А/Виктория/4897/22 A/Victoria/4897/22 (1–1/2 : 1/4)	2 (100%) : 0	2
	Дрейф-вариант Drift variant (< 1/4)	0
А(H3N2)	А/Дарвин/9/21 A/Darwin/9/21 (1–1/2 : 1/4)	52 (27,8%) : 103 (55,1,0%)	187
	Дрейф-вариант Drift variant (< 1/4)	32 (17,1%)
В	Линия Виктория-подобных Victoria-like lineage В/Австрия/135941/21(D3) (1–1/2) B/Austria/135941/21	0 : 6 (46,2%)	13
	Линия Виктория-подобных Victoria-like lineage Дрейф-вариант Drift variant (< 1/4)	7 (53,8%)

 

В рассматриваемый период со спектром специфических референс-сывороток были изучены антигенные свойства 202 гемагглютинирующих изолятов, выделенных в гг. Москве, Великом Новгороде, Ярославле, Томске, Оренбурге, Биробиджане и Владивостоке: 187 изолятов проявили родство к вирусу гриппа A(H3N2), причем 17,1% из них представляли собой дрейф-варианты и взаимодействовали с сывороткой к вакцинному вирусу A/Дарвин/9/21(H3N2) до 1/8 и ниже гомологичного титра; два изолята проявили близкое родство с вирусом гриппа A(H1N1)pdm09; 13 изолятов, имели родство к вирусу гриппа В и взаимодействовали с сывороткой к вакцинному вирусу В/Австрия/1359417/21 от 1/16 до 1/4 гомологичного титра.

Изучена чувствительность эпидемических штаммов вирусов гриппа, выделенных в разных городах РФ, к препаратам с антинейраминидазной активностью. Данные представлены в табл. 3.

 

Таблица 3. Чувствительность эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В, выделенных в сезоне 2023–2024 гг., к препаратам с антинейраминидазной активностью

Table 3. The susceptibility of influenza epidemic strains A and B, isolated in season 2023–2024 to inhibitors of neuraminidase

ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии» Роспотребнадзора Center for Hygiene and Epidemiology of Rospotrebnadzor	Число штаммов Number of strains	Штаммы вируса гриппа Influenza virus strains	IC50 (nM) к антинейраминидазным препаратам (интервалы среднего значения) IC50 (nM) to antineuraminidase drugs (mean value intervals)
			осельтамивиру oseltamivir	занамивиру zanamivir
ЦЭЭГ, НИЦЭМ, Москва NRCEM CEEI, Moscow	2	A(H1N1)pdm09	0,5–0,7	0,4–0,9
	56	A(H3N2)	0,3–5,0	0,9–8,3
	3	B	35,6–38,9	4,5–5,1
Новгородской области / Novgorod region	2	A(H3N2)	0,9–3,1	1,9–4,3
Ярославской области / Yaroslavl region	2	A(H3N2)	0,5–0,6	0,5–1,6
Оренбургской области / Orenburg region	10	A(H3N2)	0,3–0,9	0,6–4,2
Томской области / Tomsk region	5	A(H3N2)	0,4–0,6	0,9–1,2
Приморского края / Primorsky Krai	10	A(H3N2)	0,4–0,7	0,8–2,0
	4	B	22,0–42,7	2,0–7,3
Еврейской АО / Jewish Autonomous District	4	A(H3N2)	0,4–1,0	0,8–4,1
ИТОГО TOTAL	2	A(H1N1)pdm09	0,5–0,7	0,4–0,9
	89	A(H3N2)	0,3–5,0	0,5–8,3
	7	В	22,0–42,7	2,0–7,3

 

Все из протестированных штаммов проявили нормальную чувствительность к осельтамивиру и занамивиру, за исключением 2 штаммов вируса гриппа A(H3N2) – А/Москва/26/2023 и А/Москва/3/2024 (H3N2), в отношении которых обнаружена сниженная чувствительность к осельтамивиру и занамивиру.

Методом высокопроизводительного секвенирования получены полногеномные последовательности для 62 штаммов вирусов гриппа А, в том числе 58 штаммов A(H3N2) и 4 штаммов A(H1N1)pdm09, выделенных в разных регионах РФ.

Вирусы гриппа A(H3N2) были отнесены к клайду 3C.2a1b.2a.2a.3a.1 (2a.3a.1), представленному вирусом A/Таиланд/8/2022. В отношении 72,0% популяции выявлены общие замены N122D, K276E, характерные для субклайда J.2 (референс-штамм A/Сидней/878/2023); кроме того, были выявлено 12 штаммов, которые так же несли дополнительные мутации в HA, как I25V, V347M, что больше характерно для субклайда J.1 (референс-штамм A/Сидней/856/2023); на Дальнем Востоке были выявлены оригинальные штаммы (13), несущие дополнительные замены F79L, P239S в HA по отношению к клайду J.2: (EPI_ISL_18807375, EPI_ISL_18808360, EPI_ISL_18808361, EPI_ISL_18808362, EPI_ISL_18808363, EPI_ISL_18808364, EPI_ISL_18808365, EPI_ISL_18808371, EPI_ISL_19072582, EPI_ISL_19072580, EPI_ISL_19072579, EPI_ISL_19072578, EPI_ISL_19072577, EPI_ISL_19072576, EPI_ISL_19072575, EPI_ISL_19072574, EPI_ISL_19072573, EPI_ISL_19072572, EPI_ISL_19072571, EPI_ISL_19072570, EPI_ISL_19072569, EPI_ISL_19072524, EPI_ISL_19072523, EPI_ISL_19072522, EPI_ISL_19072521, EPI_ISL_19072520, EPI_ISL_19072519, EPI_ISL_19072518, EPI_ISL_19072517, EPI_ISL_19072516, EPI_ISL_19072515, EPI_ISL_19072514, EPI_ISL_19072513, EPI_ISL_19072512, EPI_ISL_19072511, EPI_ISL_19072510, EPI_ISL_19072509, EPI_ISL_19072508, EPI_ISL_19072507, EPI_ISL_19072506, EPI_ISL_19072505, EPI_ISL_19072504, EPI_ISL_19072503, EPI_ISL_19072502, EPI_ISL_19072501, EPI_ISL_19072500, EPI_ISL_19072499, EPI_ISL_19072498, EPI_ISL_19072497, EPI_ISL_19072496, EPI_ISL_19072495, EPI_ISL_19072494, EPI_ISL_19072493, EPI_ISL_19072492, EPI_ISL_19072491, EPI_ISL_19072490, EPI_ISL_19072489, EPI_ISL_19072488).

Штаммы вируса гриппа A(H1N1)pdm09 (4) были близкородственны вакцинному вирусу А/Виктория/2570/19, представленному клайдом 6B.1A.5a.2a (EPI_ISL_18809332, EPI_ISL_18809333, EPI_ISL_18809334, EPI_ISL_18809335).

Среди изученных штаммов генетических маркеров, ответственных за снижение чувствительности к ингибиторам нейраминидазы (осельтамивира, занамивира) и полимеразного комплекса (балоксавира марбоксила), не выявлено.

Обсуждение

Ранний рост активности вирусов гриппа на фоне относительно низкой активности и продолжающейся эволюционной изменчивости SARS-CoV-2 был отмечен в рассматриваемый период в большинстве стран Северного полушария⁴,⁵,⁶.

По данным ВОЗ, с 1 октября 2023 г. по 30 июня 2024 г. во всех странах мира было проведено исследование более 10 млн образцов клинических материалов, из которых 12,3% оказались положительными на вирусы гриппа. Увеличение показателя выявления положительных проб на вирусы гриппа было отмечено с начала октября 2023 г., с превышением 10% порогового значения в период 47-й недели 2023 г. (11,0%); максимальные показатели были зарегистрированы в период последней недели 2023 г. (33,0%); уменьшение этого показателя началось с 14-й недели 2024 г.; к концу сезона (39-я неделя 2024 г.) он составил 4,0%, что было выше по сравнению с предыдущим сезоном (1,4%). За анализируемый период долевое участие вирусов гриппа распределилось следующим образом: грипп типа А – 78,0% и грипп типа В – 22,0%; 25,0% среди субтипированных вирусов гриппа А были отнесены к A(H1N1)pdm09 и 75,0% – к A(H3N2); все из субтипированных вирусов гриппа В были отнесены к линии В/Виктория-подобных. Прослежены, как и в предыдущие сезоны, различия по долевому участию вирусов гриппа в странах, температурных зонах и регионах ВОЗ.

В странах Европейского региона ВОЗ рост показателей числа положительных проб на респираторные патогены был связан с вирусом гриппа A(H3N2) с максимальными значениями на 5-й неделе 2024 г. (26,1%); снижением в период 9-й недели 2024 г. (9,8%)⁵. Вирус гриппа В детектировали с 13-й недели 2024 г., в основном в спорадических случаях. За анализируемый период долевое участие распределилось следующим образом: грипп типа А – 43741 (93,4%) и грипп типа В – 3066 (6,4%); 10,4% среди субтипированных вирусов гриппа А пришлось на A(H1N1)pdm09 и 89,6% – на A(H3N2); все из субтипированных вирусов гриппа В (159) были отнесены к линии В/Виктория-подобных.

В странах Американского региона ВОЗ длительность эпидемии гриппа составила 15 нед (с 49-й недели 2023 г.) с максимальными показателями активности в конце декабря 2023 г. (18,1%), при этом были отмечены различия по доминирующему типу вируса: в странах Северной Америки доминировал вирус гриппа типа A(H1N1)pdm09 (76,5% из числа типированных штаммов вируса гриппа А)⁶; в Центральной Америке и на Карибских островах доминировал A(H3N2) с частотой положительных проб до 81,0%.

В странах Юго-Восточного региона ВОЗ регистрировали относительно низкую активность вирусов гриппа (до 10,0% положительных проб из числа тестируемых), причем детектировали практически равнозначную активность всех 3 вирусов гриппа.

В странах Западного Тихоокеанского региона ВОЗ прослежена большая активность A(H3N2) с пиковыми показателями числа положительных проб на 49-й неделе (34,1%); с 10-й недели 2024 г. регистрировали рост активности вируса гриппа A(H1N1)pdm09 с максимальными показателями в период 13-й недели 2024 г.

В странах Африканского региона ВОЗ с 40-й недели 2023 г. регистрировали со-циркуляцию вирусов гриппа А, причем большую активность A(H1N1)pdm09 отмечали в период некоторых недель сезона, при этом вирус гриппа В выявляли только в спорадических случаях. Показатели, превышающие пороговый уровень (10,0%), регистрировали в период с 40-й недели 2023 г. до 3-й недели 2024 г. и с 18-й до 26-й недели 2024 г. (до 250 положительных проб в неделю). В странах центральной Африки долевое участие вирусов гриппа составило: для гриппа А – 62,0% с равнозначным участием обеих подтипов; гриппа В – 38,0%. В странах восточной Африки долевое участие вирусов гриппа составило: для гриппа А – 87,0%, в том числе гриппа A(H3N2) – 72,0%; гриппа В – 13,0%.

В странах Восточного Средиземноморского региона ВОЗ начало сезона было отмечено относительно высокими показателями числа положительных проб на вирусы гриппа (22,7% в период 40-й недели 2023 г.) с максимальными показателями к 43-й неделе 2023 г. (29,1%). В этот период в ряде стран была отмечена большая активность вирусов гриппа A(H1N1)pdm09 и В – в Бахрейне, Египте и Ливане; социркуляцию A(H3N2) и В регистрировали в Афганистане; A(H1N1)pdm09 и A(H3N2) – в Тунисе.

Изучение генетических свойств популяции циркулировавших штаммов выявило неполное соответствие штаммам, входившим в состав гриппозных вакцин в сезоне 2023–2024 гг., для стран Северного полушария.

Популяция циркулировавших штаммов вируса гриппа A(H1N1)pdm09 была представлена вариантами клайда 5a.2a (субклайдов – С.1, С.7, С.1.7.2, С.8. С.1.9) и клайда 5а.2а.1 (субклайдов С.1.1, D, D.1, D.2, D.3, D.4), включающих эталоны – А/Виктория/2570/2017 (вакцинный), А/Сидней/5/2021, А/Висконсин/67/2022. Наибольшая активность была отмечена в отношении субклайда С.1.9, который доминировал в большинстве регионов, за исключением стран Северной Америки, Центральной и Южной Америки, где доминировали штаммы субклайда D.

Штаммы вируса гриппа A(H3N2) были отнесены к клайду 3C.2a1b.2a.2a.3a.1 (субклайды J.1–J.4; А/Таиланд/18/2022) с доминированием субклайда J.2., представители которого имели специфические замены в гемагглютинине (HA) – N122D и R276E. Штаммы субклайда J.1 (I25V, V347M) социркулировали с небольшой частотой во многих странах, за исключением стран Азии и Африки, где было отмечено их доминирование. В ряде стран западной Африки выявляли циркуляцию субклайдов G.1.3.1 (2a.3a) и J.4 (2a.3a.1).

Вирусы гриппа В были менее активны, и все из типированных вирусов принадлежали к линии В/Виктория-подобных, клайду V1A.3а.2 (В/Австрия/1359417/2021); представители линии В/Ямагата-подобных детектированы не были.

Учитывая особенности свойств циркулировавших штаммов, эксперты ВОЗ провели замену состава гриппозных вакцин компонента вируса гриппа A(H3N2): А/Дарвин/9/2021 (клайд 2а) на A/Таиланд/8/2022 (клайд 2а.3а.1, субклайд J). Необходимо отметить, что в период февраля–сентября 2024 г. в популяции штаммов вирусов гриппа продолжали регистрировать гетерогенность популяций и в большей степени это коснулось вируса гриппа A(H3N2) (доминирующего в России и странах Европы), что стало причиной его замены в составе гриппозных вакцин для стран Южного полушария на более актуальный (A/Таиланд/8/2022, клайд 2а.3а.1, субклайд J на А/Хорватия/10136RV/2023, клайд).

Согласно данным, полученным ВОЗ в период сезона 2023–2024 гг., была протестирована чувствительность более 15 000 штаммов вирусов гриппа А и В к препаратам с антинейраминидазной активностью и около 10 000 – к балоксавирусу марбоксилу. Результаты показали хороший профиль чувствительности ко всем препаратам; в целом пониженная чувствительность к препаратам с антинейраминидазной активностью была определена среди штаммов A(H1N1)pdm09 в 1,6%, A(H3N2) в 0,01% и гриппа В в 0,2%; к балоксавиру марбоксилу в 0,1, 0,3 и 0% соответственно.

Второй респираторный патоген, в отношении которого страны проводят международный мониторинг, – новый коронавирус SARS-CoV-2¹. В рассматриваемом эпидемическом сезоне его активность была значительно ниже по сравнению с предыдущими сезонами (в основном частота положительных проб не превышала 10,0%, за исключением летних месяцев, в период которых регистрировали максимальные показатели ‒ до 13,0%), при этом его наибольшая активность была отмечена в странах Европейского региона ВОЗ. Суммарно к 15 сентября 2024 г. в мире было зарегистрировано 776 301 484 случая инфицирования SARS-CoV-2, 7 066 329 (0,9%) из которых – с летальным исходом. Тройку лидеров по числу инфицированных составили страны Европы (36,0%), Тихоокеанского региона (27,0%) и Америки (25,0%). В то же время тройку лидеров по частоте летальных исходов составили страны Европы (32,0%), Америки (43,0%) и Юго-Восточной Азии (11,0%). Прослежена зависимость активности SARS-CoV-2 от активности вирусов гриппа; складывается впечатление, что в отличие от предыдущих лет на фоне высокой активности вирусов гриппа снижается активность SARS-CoV-2. Можно предположить, что SARS-CoV-2 «занял свою нишу» в структуре классических ОРВИ.

Кроме того, в популяции этого вируса также были отмечены новые варианты с доминированием в определенные периоды. В начале сезона (октябрь 2023 г.) наиболее часто детектировали варианты XBB 1,5+F456 (64,5%), BA.2 (20,0%) и BA.2.75 (8,0%). В последующие месяцы был отмечен рост варианта BA.2.86 (c ноября 2023 г.), и уже к январю 2024 г. его долевое участие составило 92,0%. Далее в циркуляцию вошли новые варианты по линии BA.2.86, в частности JN.1, изменчивость которого регистрировали в последующие месяцы. JN.1 стал «родоначальником» популяции штаммов, получившей название FLiRT. В период сентября 2024 г. среди наиболее распространенных субклайдов FLiRT в Европейском регионе стали такие представители, как KP.3.1.1 (45%), XEC (13%), KP.3.1 (11%), JN.1 (9%), JN.1.11 (3%), JN.1.16 (3%), JN.1.9 (3%), KP.2 (3%)⁵.

А.А. Соминина и соавт. сообщили об изменениях в этиологической структуры средней и тяжелой форм ОРВИ в период пандемии COVID-19, в частности, значительном снижении частоты детекции вирусов гриппа и HRsV (2020–2021 гг.), росте числа случаев HMPV- и HRV-инфекций; росте удельного веса HRsV-инфекции у детей на фоне достоверного снижения частоты COVID-19 (2022–2023 гг.) [3]. В отделениях реанимации и интенсивной терапии у детей в постпандемический период чаще всего выявляли HRsV-инфекцию, у взрослых – SARS-CoV-2. Полученные в рамках настоящей работы данные в определенной степени подтверждают выявленные ранее тенденции.

Особую обеспокоенность продолжает вызывать способность вирусов гриппа птиц и свиней инфицировать людей, что нередко приводит к тяжелым случаям заболевания⁷ [10]. Среди наиболее патогенных – вирусы гриппа А с подтипом гемагглютинина H5, H7 и H9.

В период сентября 2023 г. – августа 2024 г. в некоторых странах мира инфицирование вирусом гриппа птиц A(H5N1) было подтверждено в 23 случаях (Камбоджа – 14, США – 6, по 1 случаю в Китае, Австралии и Вьетнаме), A(H5N6) – 5 случаев (Китай), A(H9N2) – 14 случаев (Китай – 11, по 1 случаю в Гане, Индии и Вьетнаме), A(H10N3) – 1 случай (Китай), A(H10N5) – 1 случай (Китай); инфицирование вирусами гриппа свиней A(H1N1)v – 5 случаев (США, Вьетнам, Бразилия, Испания, Швейцария, A(H1N2 v – 5 случаев (США – 4, Великобритания – 1), A(H3N2)v – 1 случай (Канада)⁸.

С 2024 г. в США регистрируют случаи инфицирования фермеров вирусом гриппа птиц A(H5N1) от коров (клайд 2.3.4.4.b, генотип B3.13) и от птиц на птицефабриках (генотипа D1.1)⁶. При этом случаев передачи от человека к человеку не регистрировали с 2007 г. Возможно, это коррелирует с данными в опытах на хорьках, где было показано, что вирус клайда 2.3.4.4.b, включая генотип B3.13, достаточно хорошо передавался при прямом контакте и крайне ограниченно – при воздушно-капельном [11]. Современные вирусологические и эпидемиологические данные показывают, что несмотря на способность вирусов гриппа птиц инфицировать людей, по своим свойствам они остаются птичьими без «признаков» адаптации к млекопитающим, хотя события 2024 г. в США утверждают обратное: вирус гриппа птиц A(H5N1) смог инфицировать коров, а от коров произошло инфицирование людей. Все вышесказанное определяет необходимость дальнейших исследований и контроля.

Заключение

Эпидемический сезон 2023–2024 гг. имел свои особенности и, в частности, на фоне относительно низкой активности SARS-CoV-2 и его новых вариантов характеризовался более ранним началом, наибольшей активностью вируса гриппа А, причем страны мира различались по доминирующему подтипу (A(H1N)pdm09 или A(H3N2)), а также долевому участию вируса гриппа В линии В/Виктория-подобных; вирус гриппа линии В/Ямагата-подобных не проявлял свою активность с марта 2020 г. В зависимости от активности типа/подтипа вируса гриппа в определенные периоды сезона отмечены различия по показателям заболеваемости, вовлеченности возрастных групп, летальности. По антигенным и молекулярно-генетическим свойствам популяция эпидемических штаммов вирусов гриппа была близка вирусам, входившим в состав гриппозных вакцин, рекомендованных экспертами ВОЗ в сезоне 2022–2023 гг., что предполагает их высокую эффективность; сохранен благоприятный профиль чувствительности к препаратам с антинейраминидазной активностью, а также ингибитору фермента, синтезирующего матричную РНК вируса гриппа. Тройку «лидеров» в структуре сезонных ОРВИ представляли HRV (5,9%), HRsV (2,4%) и HCoV (2,1%). В странах мира продолжают регистрировать случаи инфицирования людей вирусами гриппа птиц и свиней. Все вышесказанное указывает на актуальность исследований и полученных данных в рамках проводимого надзора за циркуляцией вирусов гриппа.

 

¹ COVID-19 epidemiological update – 9 October 2024. Edition 172. Доступно по: https://www.who.int/publications/m/item/covid-19-epidemiological-update-edition-172

² Risk assessments and summaries of influenza at the human-animal interface. Доступно по: https://www.who.int/teams/global-influen-za-programme/avian-influenza/monthly-risk-assessment-summary

³ Опубликованы рекомендации по штаммовому составу вакцин против сезонного гриппа на 2024–2025 гг. для Северного полушария; 2024. Доступно по: https://www.who.int/ru/news/item/23-02-2024-recommendations-announced-for-influenza-vaccine-composition-for-the-2024-2025-northern-hemisphere-influenza-season

⁴ Global influenza programme. Influenza updates. Доступно по: https://www.who.int/teams/global-influenza-programme/surveillance-and-monitoring/influenza-updates

⁵ Seasonal influenza – Annual Epidemiological Report for 2023/2024. Доступно по: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/seasonal-influenza-annual-epidemiological-report-20232024

⁶ Seasonal influenza – Annual Epidemiological Report for 2023/2024. Доступно по: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/seasonal-influenza-annual-epidemiological-report-20232024

⁷ Опубликованы рекомендации по штаммовому составу вакцин против гриппа на эпидемический сезон 2025 г. в Южном полушарии; 2024. Доступно по: https://www.who.int/ru/news/item/27-09-2024-recommendations-announced-for-influenza-vaccine-composition-for-the-2025-southern-hemisphere-influenza-season

⁸ Influenza (avian and other zoonotic). Доступно по: https://www.who.int/health-topics/influenza-avian-and-other-zoonotic#tab=tab_1

Об авторах

Елена Ивановна Бурцева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2518-6801

д-р мед. наук, заведующая лабораторией этиологии и эпидемиологии гриппа

Россия, 123098, г. Москва

Наталья Владимировна Бреслав

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: n.belyakova1983@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6946-5119

канд. биол. наук, старший научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Евгения Андреевна Мукашева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: mukasheva_evgeniya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5688-5309

научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Кирилл Геннадьевич Краснослободцев

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: kkg_87@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-1745-9128

научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Елена Сергеевна Кириллова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: esshevchenko@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7977-7530

канд. мед. наук, ведущий научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Светлана Викторовна Трушакова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: s.trushakova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9610-3041

канд. биол. наук, старший научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Ирина Александровна Комарова

ФГБОУ ВО «Тихоокеанский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: mikhaira@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0483-7433

ассистент кафедры инфекционных болезней

Россия, 690002, г. Владивосток

Елена Леонидовна Феодоритова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: flulab@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1472-1357

научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Анна Дмитриевна Панова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: ainushgnomello@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9322-6273

младший научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Лидия Борисовна Кистенева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: lborisovna2007@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7336-409X

руководитель лаборатории

Россия, 123098, г. Москва

Ирина Николаевна Хлопова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: khlopova.ira@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7419-590X

канд. мед. наук, ведущий научный сотрудник Института вирусологии им. Д.И. Ивановского

Россия, 123098, г. Москва

Ирина Сергеевна Кружкова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: irina-kru@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1983-481X

младший научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Анастасия Сергеевна Крепкая

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: nastya18-96@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7272-4011

младший научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Екатерина Олеговна Морозова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: eo-morozova@inbox.ru
ORCID iD: 0009-0001-3367-6168

канд. биол. наук, старший научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Анна Викторовна Игнатьева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: valgella@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6206-2299

канд. биол. наук, старший научный сотрудник

Россия, 123098, г. Москва

Андрей Борисович Комиссаров

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: andrey.komissarov@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0003-1733-1255

заведующий лабораторией молекулярной вирусологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Игорь Николаевич Тюрин

ГБУЗ «Инфекционная клиническая больница № 1» Департамента здравоохранения города Москвы

Email: tyurin.dti@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5696-1586

канд. мед. наук, главный врач

Россия, 125310, г. Москва

Алексей Александрович Самков

ГБУЗ «Инфекционная клиническая больница № 1» Департамента здравоохранения города Москвы

Email: a.a.samkov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-0365-3096

заместитель главного врача по медицинской части

Россия, 125310, г. Москва

Наталья Александровна Антипят

ГБУЗ «Инфекционная клиническая больница № 1» Департамента здравоохранения города Москвы

Email: natadoc70@bk.ru
ORCID iD: 0000-0001-8578-2838

заместитель главного врача по медицинской части

Россия, 125310, г. Москва

Список литературы

Дополнительные файлы