Молекулярно-генетические варианты вируса ECHO 9, идентифицированные у больных серозным менингитом в России в 2007-2009 гг.


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В 2009 г. вирус ECHO 9 стал причиной сезонного подъема заболеваемости и нескольких вспышек энтеровирусной инфекции (ЭВИ) в ряде регионов России. В результате анализа фрагмента области VP1 генома варианты вируса ECHO 9, выявленные у больных серозным менингитом и ЭВИ в 2007-2009 гг. - дифференцировались на 4 филогенетические линии. Наибольшее распространение в 2009 г. получил один вариант вируса ECHO 9. Вирусы ECHO 9, идентифицированные на разных территориях, при высокой гомологии нуклеотидных последовательностей фрагмента VP1 генома (98,2-100%) характеризовались вариабельностью аминокислотных последовательностей в области В-С-петли.

Список литературы

  1. Лукашев А. Н., Иванова О. Е., Еремеева Т. П. и др. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 30 на территории России и стран СНГ // Вопр. вирусол. - 2005. - № 3. - С. 12-16.
  2. Лукашев А. Н., Резник В. И., Иванова О. Е. и др. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 6 - возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. // Вопр. вирусол. - 2008. - № 1. - С. 16-21.
  3. Онищенко Г. Г., Новикова Н. А., Ефимов Е. И. и др. Сезон энтеровирусного серозного менингита в Н. Новгороде в 2007 году: молекулярно-эпидемиологические аспекты // Журн. микробиол. - 2009. - № 2. - С. 24-30.
  4. Bingjun Т., Yoshida Н., Yan W. et.al. Molecular typing and epidemiology of non-polio enteroviruses isolated from Yunnan Province, the People's Republic of China // J. Med. Virol. - 2008. - Vol. 80. - P. 670-679.
  5. Hara K., Kashiwagi Т., Ohtsu Y. Molecular evolution of human echovirus 9 isolated from patients with aseptic meningiris in Nothern Kyushu during the Summer of 1997 // Microbiol. Immunol. - 2001. - Vol. 45. - P. 717-720.
  6. Jacques J., Moret H., Minette D. et.al. Epidemiological, molecular, and clinical features of enterovirus respiratory infections in French children between 1999 and 2005 // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol. 46, № 1. - P. 206-213.
  7. Khetsuriani N., LaMonte-Fowlkes A., Oberste M. S., Pallanch M. A. Enterovirus surveillance United States, 1970-2005 // MMWR. - 2006. Vol. 55. - P. 1-20.
  8. Kyungah В., Park K., Jung E. et.al. Molecular and epidemiological characterization of enterovirus isolated in chungnam, Korea from 2005 to 2006 // J. Microbiol. Biotechnol. - 2009. - Vol. 19. - P. 1055-1064.
  9. Leitch E. C., Harvala H., Robertson I. et al. Direct identification of human enterovirus serotypes in cerebrospinal fluid by amplification and sequencing of the VP 1 region // J. Clin. Virol. - 2009. - Vol. 44. - P. 119-124.
  10. Mirand A., Henquell C., Archimbaud C. et al. Prospective identification of enteroviruses involved in meningitis in 2006 through direct genotyping in cerebrospinal fluid // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol. 46. - P. 87-96.
  11. Mistchenko A. S., Viegas M., Eatta M. P., Barrero P. R. Molecular and epidemiologic analysis of enterovirus В neurological infection in Argentine children // J. Clin. Virol. - 2006. - Vol. 37. - P. 293-299.
  12. Nix W. A., Oberste M. S., Pallansch M. A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44. - P. 2698-2704.
  13. Oberste M. S., Maher K., Williams A. J. et al. Species-specific RT-PCR amplification of human enteroviruses: a tool for rapid species identification of uncharacterized enteroviruses // J. Gen. Virol. - 2006. - Vol. 87. - P. 119-128.
  14. Paananen A., Ylipaasto P., Rieder E. et al. Molecular and biological analysis of echovirus 9 strain isolated from a diabetic child // J. Med. Virol. - 2003. - Vol. 69. - P. 529-537.
  15. Rotbart H. A., Brennan P. J., Fife K. H. et.al. Enterovirus meningitis in adults // Clin. Infect. Dis. - 1998. - Vol. 27. - P. 896-898.
  16. Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0 // Mol. Biol. Evol. - 2007. - Vol. 24. - P. 1596-1599.
  17. Thoelen I., Moes E., Lemey P. et al. Analysis of the serotype and genotype correlation of VP1 and the 5' noncoding region in an epidemiological survey of the human enterovirus В species // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol. 42. - P. 963-971.
  18. Trallero G., Casas I., Tenorio A. et al. Enteroviruses in Spain: virological and epidemiological studies over 10 years (1988-1997) // Epidemiol. Infect. - 2000. - Vol. 124. - P. 497-506.
  19. Trallero G., Avellon A., Otero A. et al. Enteroviruses in Spain over the decade 1998-2007: virological and epidemiological studies // J. Clin. Virol. - 2010. - Vol. 47. - P. 170-176.
  20. Tsao K. C., Huang C. G., Huang Y. L. et al. Epidemiologic features and virus isolation of enteroviruses in Nothern Taiwan during 2000-2008 // J. Virol. Meth. - 2010. - Vol. 165. - P. 330-332.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Голицына Л.Н., Фомина С.Г., Новикова Н.А., Епифанова Н.В., Парфенова О.В., Луковникова Л.Б., Зверев В.В., Пономарева Н.В., Мазепа В.Н., Григорьева Г.И., Ефимов Е.И., Golitsyna L.N., Fomina S.G., Novikova N.A., Epifanova N.V., Parfenova O.V., Lukovnikova L.B., Zverev V.V., Ponomareva N.V., Mazepa V.N., Grigoryeva G.I., Efimov E.I., 2011

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах