Дифференциация генетических вариантов вирусов Крымской-Конго геморрагической лихорадки


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Описан простой, быстрый, не требующий секвенирования на первом этапе метод скрининга образцов, потенциально содержащих вирус Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ), с использованием рестрикционного анализа ампликонов для дифференциации генотипов вируса ККГЛ, характерных для Европы, от нехарактерных для данной территории биовариантов вируса. Для этого предложено использовать ПЦР-фрагмент L-сегмента генома вируса, включающий вариабельный район, и эндонуклеазы рестрикции AluI и HaeIII.
Предложенная схема скрининга образцов, потенциально содержащих вирус ККГЛ, может помочь исследователям в проведении мониторинга с целью выявления нехарактерных генотипических вариантов вируса на территории Российской Федерации и других европейских стран.

Список литературы

  1. Аристова В. А., Колобухина Л. В., Щелканов М. Ю., Львов Д. К. Экология вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки и особенности ее клиники на территории России и сопредельных стран // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 7-14.
  2. Колобухина Л. В., Евченко Ю. М., Вышемирский О. И. и др. Изоляция трех штаммов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки от больных в Ставропольском крае во время эпидемической вспышки в 2000 г. // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 15-18.
  3. Онищенко Г. Г., Сандахчиев Л. С., Нетесов С. В., Мартынюк Р. А. Биотерроризм: национальная и глобальная угроза // Вестн. РАН. - 2003. - Т. 73, № 3. - С. 195-204.
  4. Петрова И. Д., Серегин С. В., Петров В. С. и др. Генетическая характеристика S-сегмента РНК двух штаммов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, изолированных на юге России и в Узбекистане // Вопр. вирусол. - 2003. - № 2. - С. 8-11.
  5. Туманова И. Ю., Серегин С. В., Вышемирский О. И. и др. Генетический мониторинг вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки в Казахстане и Таджикистане в период 2001-2003 гг. // Молекул. генетика. - 2006. - № 2. - С. 36-41.
  6. Яшина Л. Н., Петров В. С., Вышемирский О. И. и др. Характеристика вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, циркулирующего в России и республиках Средней Азии // Вопр. вирусол. - 2002. - № 3. - С. 11- 15.
  7. Benjiang M. A., Changshou H., Papa A. et al. Sequencing and comparative analysis of the complete glycoprotein gene of three Crimean-Congo hemorrhagic fever virus Chinese isolates // Chin. J. Exp. Clin. Virol. - 2001. - Vol. 15. - P. 105-111.
  8. Casals J. Antigenic similarity between the virus causing Crimean hemorrhagic fever and Congo virus // Pros. Soc. Exp. Biol. Med. - 1969. - Vol. 131. - P. 233-236.
  9. Deyde V. M., Khristova M. L., Rollin P. E. et al. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus genomics and global diversity // J. Virol. - 2006. - Vol. 80. - P. 8834-8842.
  10. Hewson R., Gmyl A., Gmyl L. et al. Evidence of segment reassortment in Crimean-Congo hemorrhagic fever virus // J. Gen. Virol. - 2004. - Vol. 85. - P. 3059-3070.
  11. Honig J. E., Osborne J. C., Nichol S. T. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus genome L RNA segment and encoded protein // Virology. - 2004. - Vol. 321. - P. 29-35.
  12. Hoogstraal H. The epidemiology of tick-borne Crimean-Congo hemorrhagic fever in Asia, Europe and Africa // J. Med. Entomol. - 1979. - Vol. 15. - P. 307-417.
  13. Kinsella E., Martin S. G., Grolla A. et al. Sequence determination of the Crimean-Congo hemorrhagic fever virus L segment // Virology. - 2004. - Vol. 321. - P. 23-28.
  14. Meissner J. D., Seregin S. S., Seregin S. V. et al. A vriable region in the Crimean-Congo hemorrhagic fever virus L segment distinguishes between strains isolated from different geographic regions // J. Med. Virol. - 2006. - Vol. 78. - P. 223-228.
  15. Papa A., Benjiang M. A., Kouidou S. et al. Genetic characterization of M RNA segment of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus strains, China // Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 8. - P. 50-53.
  16. Rodriguez L. L., Maupin G. O., Ksiazek T. G. et al. Molecular investigation of a multisource outbreak of Crimean-Congo hemorrhagic fever in the United Arab Emirates // Am. J. Trop. Med. Hyg. - 1997. - Vol. 57. - P. 512-518.
  17. Seregin V. S., Samokhvalov E. I., Petrova I. D. et al. Genetic characterization of the M RNA segment of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus strains isolated in Russia and Tajikistan // Virus Genes. - 2004. - Vol. 28. - P. 189-195.
  18. Whitehouse C. A. Crimean-Congo hemorrhagic fever // Antiviral Res. - 2004. - Vol. 64. - P. 145-160.
  19. Yashina L., Petrova I., Seregin S. et al. Genetic variability of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in Russia and Central Asia // J. Gen. Virol. - 2003. - Vol. 84. - P. 1199-1206.
  20. Yashina L., Vyshemirskii O., Seregin S. V. et al. Genetic analysis of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in Russia // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41. - P. 860-862.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Серегин С.В., Серегин С.С., Петров В.С., Тюнников Г.И., Якименко Н.В., Сергеев А.Н., Seregin S.V., Seregin S.S., Petrov V.S., Tyunnikov G.I., Yakimenko N.V., Sergeev A.N., 2011

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах