Отправить статью по E-mail Генотипирование вирусов варицелла-зостер, выделенных на территории Монголии
- Выпуск: Том 55, № 5 (2010)
- Страницы: 40-43
- Раздел: Статьи
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12056
- ID: 12056
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Проведено генотипирование 50 образцов ВЗВ, выделенных от больных с ВЗВ-инфекцией, проходивших лечение в Центре инфекционных заболеваний (Улан-Батор, Монголия). Использовали метод, основанный на амплификации специфических фрагментов ДНК генов ORF21, ORF22 и ORF50 с последующим секвенированием и определением в этих фрагментах статуса характеристических точечных мутаций. Результаты показали, что собранные образцы принадлежали к генотипам J (62%), Ml (18%), E1(12%), Е2 (4%) и М2 (4%). Кроме этого, проведен анализ полиморфных участков генов ORF62, затрагивающих сайты рестрикции SmaI и MspI, а также ORF38 и ORF54, затрагивающих сайты рестрикции PstI и Bgl соответственно. Все образцы имели генотип Sma- Msp-. Все образцы с генотипом Е были Pst+ Bgl-, все образцы с генотипами M1 и М2 - Pst+ Bgl+. Из 31 образца с генотипом J 29 имели маркеры Pst+ Bgl+, а 2 были Pst- Bgl+. Генотипирование позволило определить спектр генотипов ВЗВ, циркулирующих на территории Монголии, а также документировать отсутствие у них мутаций, характерных для вакцинного штамма.
Ключевые слова
Список литературы
- Arvin A. M. Varicella-zoster virus: overview and clinical manifestations // Semin. Dermatol. 1996. - Vol. 15, N 2. - Suppl. - P. 4-7.
- LaRussa P. et al. Viral strain identification in varicella vaccinees with disseminated rashes // Pediatr. Infect. Dis. J. - 2000. - Vol. 19, N 11. - P. 1037-1039.
- LaRussa P. S., Gershon A. A. Biologic and geographic differences between vaccine and clinical varicella-zoster virus isolates // Arch. Virol. - 2001. - Vol. 17. - Suppl. - P. 41-48.
- Liu J. et al. Genotyping of clinical varicella-zoster virus isolates collected in China // J. Clin. Microbiol. - 2009. - Vol. 47, N 5. - P. 1418-1423.
- Loparev V. N. et al. Improved identification and differentiation of varicella-zoster virus (VZV) wild-type strains and an attenuated varicella vaccine strain using a VZV open reading frame 62-based PCR // J. Clin. Microbiol. - 2000. - Vol. 38, N 9. - P. 3156-3160.
- Loparev V. N. et al. Global identification of three major genotypes of varicella-zoster virus: longitudinal clustering and strategies for genotyping // J. Virol. 2004. - Vol. 78, N 15. - P. 8349-8358.
- Loparev. V. N. et al. Identification of five major and two minor genotypes of varicella-zoster virus strains: a practical two-amplicon approach used to genotype clinical isolates in Australia and New Zealand // J. Virol. - 2007. - Vol. 81, N 23. - P. 12758-12765.
- Loparev V. N. et al. Distribution of varicella-zoster virus (VZV) wild-type genotypes in northern and southern Europe: evidence for high conservation of circulating genotypes // Virology. - 2009. - Vol. 383, N 2. - P. 216-225.
- Norberg P. et al. Complete-genome phylogenetic approach to varicella-zoster virus evolution: genetic divergence and evidence for recombination // J. Virol. - 2006. - Vol. 80, N 19. - P. 9569-9576.
- Peters G. A. et al. A full-genome phylogenetic analysis of varicella-zoster virus reveals a novel origin of replication-based genotyping scheme and evidence of recombination between major circulating clades // J. Virol. - 2006. - Vol. 80, N 19. - P. 9850-9860.
- Sergeev N. et al. New mosaic subgenotype of varicella-zoster virus in the USA: VZV detection and genotyping by oligonucleotide-microarray // J. Virol. Meth. - 2006. - Vol. 136, N 1- 2. - Р. 8-16.
Дополнительные файлы
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).