Молекулярная эпидемиология парвовирусной инфекции в Республике Беларусь


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В работе представлен анализ NS1/VP1u-фрагмента генома (994 нуклеотида) 84 парвовирусов B19, выявленных в 2006 г. у больных инфекционной эритемой в Беларуси. Все вирусы принадлежали к генотипу 1, согласно классификации A. Servant и соавт., и формировали 2 кластера с четкой географической принадлежностью штаммов. Кластер 1A преимущественно включал вирусы от больных из Минска, где в 2006 г. была зарегистрирована вспышка парвовирусной инфекции. Кластер 1B составляли вирусы от спорадических случаев инфекционной эритемы из разных регионов страны. Вариабельность в пределах кластера 1B (1,1%) была почти вдвое выше вариабельности кластера 1A (0,6%). В сравнении с парвовирусами, представленными в Международном генетическом банке данных (NCBI, Bethesda, США), у белорусских штаммов выявлены 22 уникальные нуклеотидные замены, из которых 18 (81,8%) являлись значимыми. Подавляющее большинство образцов сывороток крови, содержавших IgM-антитела к парвовирусу, оказались позитивными и при исследовании в ПЦР (63 из 67; 94%), что свидетельствует о перспективности использования обоих методов для диагностики инфекции.

Список литературы

  1. Ермолович М. А., Самойлович Е. О., Семейко Г. В. // Здравоохранение. - 2006. - № 11. С. 25-28.
  2. Brown K. E. Variants of B 19 // PDA/EVEA European Virus Safety Forum: Dev. Biol. / Ed. J. Robertson. - Basel, 2004. - Vol. 118. - P. 71-77.
  3. Brown K. E. Detection and quantitation of parvovirus B19 // J. Clin. Virol. - 2004. - Vol. 31. P. 1-4.
  4. Candotti D., Etiz N., Parsyan A., Allain J. P. Identification and characterization of persistent human erythrovirus infection in blood donor samples // J. Virol. - 2004. - Vol. 78. - P. 12169-12178.
  5. Cohen B. J., Gandhi J., Clewley J. P. Genetic variants of palwovirus B19 identified in the United Kingdom: implications for diagnostic testing // J. Clin. Virol. - 2006. - Vol. 36. - P. 152-155.
  6. Dorsch S., Kaufmann B., Schaible U. et al. The VP1-unique region of parvovirus B19: amino acid variability and antigenic stability // J. Gen. Virol. - 2001. -Vol. 82. - P. 191-199.
  7. Enders M., Schalasta G., Baisch C. et al. Human parvovirus B19 infection during pregnancy-value of modern molecular and serological diagnostics // J. Clin. Virol. - 2006. - Vol. 35. - P. 400-406.
  8. Gallinella G., Venturoli S., Manaresi B19 virus genome diversity: epidemiological and clinical correlations // J. Clin. Virol. - 2003. - Vol. 28. - P. 1-13.
  9. Heegaard B. D., Brown K. E. Human parvovirus B19 // Clin. Microbiol. Rev. - 2002. - Vol. 15. - P. 485-505.
  10. Hemauer A., von Poblotzki A., Gigler A. et al. Sequence variability among different parvovirus B19 isolates // J. Gen. Virol. - 1996. - Vol. 77. - P. 1781-1785.
  11. Hokynar K., Soderlund-Venermo M., Pesonen M. et al. A new parvovirus genotype persistent in human skin // Virology. - 2002. - Vol. 302. - P. 224-228.
  12. Kumar S., Tamura K., Nei M. MEGA3: Integrated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment // Briefings in Bioinformatics -2004. - Vol. 5. - P. 150-163.
  13. Liefeldt L., Plentz A., Klempa B., et al. Recurrent high level parvovirus B19/genotype 2 viremia in a renal transplant repient analyzed by real-time PCR for simultaneous detection of genotypes ito 3 // J. Med. Virol. -2005. - Vol. 75. - P. 161-169.
  14. Nguyen Q. T., Wong S., Heegaard E. D., Brown K. E. Identification and characterization of a second novel human erythrovirus variant, A6 // Virology. - 2002. -Vol. 301. - P. 374- 380.
  15. Parsyan A., Szmaragd C., Allain J. P., Candotti D. Identification and genetic diversity of two human parvovirus B19 genotype 3 subtypes // J. Gen. Virol. - 2007. - Vol. 88. - P. 428-431.
  16. Sanabani S., Neto W. K., Pereira J., Sabino E. C. Sequence variability of human erythroviruses present in bone marrow of Brazilian patients with various parvovirus B19-related hematological symptoms // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44. - P. 604-606.
  17. Servant A., Laperche S., Lallemand F. et al. Genetic diversity within human erythroviruses: identification of three genotypes // J. Virol. -2002. - Vol. 76. - P. 9124-9134.
  18. Shackelton L. A., Holmes E. C. Phylogenetic evidence for the rapid evolution of human B19 erythrovirus // J. Virol. -2006. - Vol. 80. - P. 3666-3669.
  19. Toan N. L., Duechting A., Kremsner P. G. et al. Phylogenetic analysis of human parvovirus B 19, indicating two subgroups of genotype 1 in Vietnamese patients // J. Gen. Virol. - 2006. - Vol. 87. - P. 2941-2949.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Ермолович М.А., Семейко Г.В., Самойлович Е.О., Hübschen J.M., Muller C.P., Yermolovich M.A., Semeiko G.V., Samoilovich E.O., Hübschen J.M., Muller C.P., 2010

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах