Вариабельность регуляторного гена nef ВИЧ-1, связаннаяс различными стадиями ВИЧ-инфекции
- Выпуск: Том 49, № 6 (2004)
- Страницы: 16-20
- Раздел: Статьи
- Дата подачи: 09.06.2023
- Дата публикации: 15.12.2004
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11874
- ID: 11874
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Изучены биологические свойства лабораторных штаммов и изолятов ВИЧ-1 в сопоставлении с результатами
исследования методами электрофореза и секвенирования фрагмента гена nef, полученного из их
противовирусной ДНК и РНК, а также РНК и ДНК ВИЧ-1, изолированных непосредственно из крови больных
на разных стадиях ВИЧ-инфекции. Характер электрофоретической картины и результаты определения
нуклеотидной последовательности показали, что ген nef РНК ВИЧ-1 лабораторных штаммов типа rapid/high,
ВИЧ-изопятов и РНК, полученных от больных на поздних стадиях инфекции, имеет внутреннюю делецию
размером 135 нуклеотидов. Установленный феномен может служить доказательством того, что нарушение
структуры гена nef приводит к увеличению (по характеру лабораторных маркеров) вирулентности
вируса и его усиленному размножению на поздних стадиях ВИЧ-инфекции, инициируя по крайней мере
в ряде случаев ее прогрессирование.
исследования методами электрофореза и секвенирования фрагмента гена nef, полученного из их
противовирусной ДНК и РНК, а также РНК и ДНК ВИЧ-1, изолированных непосредственно из крови больных
на разных стадиях ВИЧ-инфекции. Характер электрофоретической картины и результаты определения
нуклеотидной последовательности показали, что ген nef РНК ВИЧ-1 лабораторных штаммов типа rapid/high,
ВИЧ-изопятов и РНК, полученных от больных на поздних стадиях инфекции, имеет внутреннюю делецию
размером 135 нуклеотидов. Установленный феномен может служить доказательством того, что нарушение
структуры гена nef приводит к увеличению (по характеру лабораторных маркеров) вирулентности
вируса и его усиленному размножению на поздних стадиях ВИЧ-инфекции, инициируя по крайней мере
в ряде случаев ее прогрессирование.
Ключевые слова
Список литературы
- Маренникова С. С. и др. О штаммовых особенностях циркулирующего в СССР ВИЧ-1 по данным изучения его свойств в клеточных культурах // Вопр. вирусол. - 1991. - № 5. - С. 356-361.
- Покровский В. И. || ВИЧ-инфекция или СПИД? // Тер. арх. - 1989. - № И. - С. 3-6.
- Радюк С. Л., Мацевич Г. Р., Анджапаридзе О. Г. // Неизотопный метод количественного ПЦР-анализа в диагностике ВИЧ-инфекции // Вопр. вирусол. - 1994. - № 6. - С. 242-245.
- Шкарин В. В., Соринсон С. Н. // ВИЧ/СПИД-инфекция. -Н. Новгород, 1999. - С. 17-18.
- Gombert F. О. et al. Antigenic epitopes of NEF protein from different HIV-1 strains as recognized by sera from patients with manifest and latent HIV infection // Virology. - 1990. - Vol. 176. - P. 458-466.
- Kawano Y. et al. Mutational analysis of human immunodeficiency virus type I (HIV-1) accessory genes: requirement of a site in the nef gene for HIV-1 replication in vitro and in vivo // J. Virol. - 1997. - Vol. 71. - P. 8456-8466.
- Kirchoff F. et al. Sequence variations in human immunodeficiency virus type 1 nef gene are associated with different stages of disease // J. Virol. - 1999. - Vol. 73. - P. 5497-5508.
- Maniatis T. et al. Molecular Cloning. - New York, 1989. - P. E3-E4.
- Maniatis T. et al. Molecular Cloning. - New York, 1989. - P. E10-E11.
- Maniatis T. et al. Molecular Cloning. - New York, 1989. - P. 6.3-6.13.
- Miller M. D. et al. Intravirion generation of the C-terminal core domain of HIV-1 nef by the protease is insufficient to enhance viral infectivity // Virology. - 1997. - Vol. 234, N 2. - P. 215-225.
- Nelson L. et al. Functional characterization of human immunodeficiency virus type 1 nef genes in patients with divergent rates of disease progression // J. Virol. - 1995. - Vol. 69. - P. 6758-6769.
- Nikolaev A. I. et al. Analysis of transcripts specific for B-cell non-Hodgkin lymphomas in patients infected with the human immunodeficiency virus type 1 // Mol. Biol. - 1999. - Vol. 33. - P. 215.
- Ou C.-Y. et al. DNA amplification for direct detection of human immunodeficiency virus (HIV-1) in DNA of peripheral mononuclear cells // Science. - 1988. - Vol. 239. - P. 295-297.
- Saiki R. et al. Analysis of enzymatically amplified beta-globin and HLA-DQ alpha DNA with allele specific oligonucleotide probes // Nature. - 1986. - Vol. 324. - P. 163-166.
- Sanger F. et al. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1977. - Vol. 74. - P. 5463-5467.