Генетическая изменчивость области, кодирующей протеазу,у изолятов ВИЧ-1 подтипа А и рекомбинантов CRF03_ABна территории СНГ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Проведен анализ нуклеотидных последовательностей, кодирующих протеазу, 27 вариантов вируса
иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1), выделенных в России и других странах СНГот серопозитивных лиц,
практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов. Все лица никогда не принимали антиретровирусных препаратов.
Показано, что все нуклеотидные последовательности относятся к подтипу А и характеризуются
высокой генетической гомогенностью (0,00-3,23; среднее значение 1,38 ±0,79). Ни один из изученных
изолятов не содержал первичных мутаций устойчивости к ингибиторам протеазы.
Однако более половины всех изолятов несли замену V77I, являющуюся, по данным литературы, вторичной
мутацией устойчивости, определяющей повышенный уровень резистентности к нельфинавиру.
Более того, эта замена была ассоциирована с двумя синонимичными мутациями в положениях 31 и 78,
что указывает на единое происхождение всех \/771-вариантов.

Список литературы

  1. Бобков А. Ф., Казеннова Е. В., Бобкова М. Р. и др. Молекулярно-генетическая характеристика ВИЧ-1 на территории России // Вестн. РАМН. - 2002. - № 8. - С. 40-42.
  2. ВИЧ-инфекция: клиника, диагностика и лечение / Покровский В. В., Ермак Т. Н., Беляева В. В., Юрин О. Г. - М., 2003. - С. 418-426.
  3. Ammaranond P., Cunningham P., Oelrichs R. et al. Rates of transmission of antiretroviral drug resistant strains of HIV-1 //J. Clin. Virol. -2003. - Vol. 26. - P. 153-161.
  4. Bobkov A., Kazennova E., Selimova L. et al. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: Identification of the subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants // AIDS Res. Hum. Retrovirus. - 1998. - Vol. 14. - P. 669-676.
  5. Brenner B. G., Wainberg M. A. The role of antiretrovirals and drug resistance in vertical transmission of HIV-1 infection //Ann. N. Y. Acad. Sci. - 2000. - Vol. 918. - P. 9-15.
  6. Carrillo A., Stewart K. D., Norbeck D. W. et al. In vitro selection and characterization of human immunodeficiency virus type 1 variants with increased resistance to ABT-378, a novel protease inhibitor // J. Virol. - 1998. - Vol. 72. - P. 7532-7541.
  7. Delwart E. L., Shpaer E. G., Louwagie J. et al. Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay // Science. - 1993. - Vol. 262. - P. 1257-1261.
  8. Duwe S., Brunn M., Altmann D. et al. Frequency of genotypic and phenotypic drugresistant HIV-1 among therapynaTve patients of the German seroconverter study // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2001. - Vol. 26. - P. 266-273.
  9. Eelsenstein J. PHYLIP - phylogenetic interference package (version 3.2) // Cladistics. - 1989. - Vol. 5. - P. 164-166.
  10. Fonjungo P. N., Mpoudi E. N., Torimoro J. N. et al. Human immunodeficiency virus types 1 group M protease in Cameroon: genetic diversity and protease inhibitor mutational features // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol. 40. - P. 837-845.
  11. Heyndickx L., Janssens W., Zekeng L. et al. Simplified strategy for detection of recombinant" human immunodeficiency virus type 1 group M isolates by gag/env heteroduplex mobility assay// J. Virol. - 2000. - Vol. 74. - P. 363-370.
  12. Liitsola K., Holm K., Bobkov A. An AB recombinant and its parental HIV type 1 strains in the area of the former Soviet Union: low requirements for sequence identity in recombination. UNAIDS Virus Isolation Network // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 2000. - Vol. 16. - P. 1047-1053.
  13. Patick A. K., Duran M., Cao Y. et al. Genotypic and phenotypic characterization of human immunodeficiency virus type 1 variants isolated from patients treated with the protease inhibitor Nelfinavir // Antimicrob. Agents Chemother. - 1998. - Vol. 42. - P. 2637-2644.
  14. Resch W., Hermann R., Parkin N. et al. Nelfinavir-resistant, Amprenavir-hypersusceptible strains of human immunodeficiency virus type 1 carrying an N88S mutation in protease have reduced infectivity, reduced replication capacity, and reduced fitness and process the gag polyprotein precursor aberrantly //J. Virol. - 2002. - Vol. 76. - P. 8659-8666.
  15. Servais J., Lambert C., Fontaine E. et al. Variant human immunodeficiency virus type 1 proteases and response to combination therapy including a protease inhibitor // Antimicrob. Agents Chemother. - 2001. - Vol. 45. - P. 893-900.
  16. Vazquez de Parga E., Thomson M. M., Rakhmanova A. et al. Sequence analysis of HIV-1 reverse transcriptase and protease genes and V3 region in a cohort of patients from the former Soviet Union // 14-th International AIDS Conference. - Barcelona, 2002. - Abstr. TuPeC4807.
  17. Walsh J. C., Pozniak A. L., Nelson M. R. et al. Virologic rebound on HAART in the context of low treatment adherence with a low prevalence of antiretroviral drug resistance // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2002. - Vol. 30. - P. 278-287.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Суханова А.Л., Казеннова Е.В., Рудинский Н.И., Михайлович В.М., Грядунов Д.А., Будилов А.В., Булавкина М.А., Weber J.N., Покровский В.В., Бобков А.Ф., 2004

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах