Типирование вируса лейкоза крупного рогатого скота, циркулирующего в Украине


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Вирус лейкоза крупного рогатого скота (ВЛ КРС), циркулирующий на территории Украины, охарактеризован посредством определения подвидовой принадлежности. Провирусная ДНК ВЛ КРС выделена из лимфоцитов периферической крови животных черно-пестрой породы из неблагополучных в отношении лейкоза хозяйств Харьковской области, природно инфицированных ВЛ КРС. Фрагмент env-гена провирусной ДНК амплифицирован, секвенирован и проанализирован после обработки ампликона тремя ферментами рестрикции - BamHI, Bell, Pvull. Проведенный анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов показал, что украинский изолят ВЛ КРС может быть классифицирован и отнесен к австралийскому подвиду, одному из 3 известных подвидов. Множественное выравнивание и филогенетический анализ фрагмента env-гена изолятов ВЛ КРС из базы данных EMBL продемонстрировали, что эволюционно украинский изолят расположен отдаленно от кластеров изолятов как бельгийского, японского, так и австралийского подвидов, а также имеет наибольшее количество (4) несовпадающих нуклеотидов для проанализированного высококонсервативного локуса env-гена ВЛ КРС длиной 444 пары нуклеотидов

Список литературы

  1. Бродский Л. К., Драчев А. Л., Татузов Р. Л., Чумаков К. М. Пакет прикладных программ для анализа последовательностей биополимеров: GeneBee // Биополимеры и клетка. - 1991.-Т. 7. -С. 10-14.
  2. Елов А. А., Козлова А. В. Диагностика и мониторинг ВИЧинфекции на генетическом уровне // Успехи соврем, биол. - 1996. -Т. 116. -С. 48-59.
  3. Лимфоциты. Методы / Под ред. Дж. Клауса. - М., 1990.
  4. Beier D., Blankenstein P., Marquardt O., Kuzmak J. Identification of different BLV provirus isolates by PCR, RELPA and DNA sequencing // Berl. Munch. Tierarztl. Wschr. - 2001. - Bd 114. -S. 252-256.
  5. Coulston J., Naif H., Brandon R. et al. Molecular cloning and sequencing of an Australian isolate of proviral bovine leukaemia DNA: comparison with other isolates // J. Gen. Virol. - 1990. -Vol.71. -P. 1737-1747.
  6. Dequiedt F., Kettmann R., Burny A., Willems L. Mutations in the p53 tumor-suppressor gene are frequently associated with bovine leukemia virus-induced leukemogenesis in cattle but not in sheep // Virology. - 1995. - Vol. 209. - P. 676-683.
  7. Dube S., Bachman S., Spicer T. et al. Degenerate and specific PCR assays for the detection of bovine leukaemia virus and primate T-cell leukaemia/lymphoma virus pol DNA and RNA: phylogenetic comparisons of amplified sequences from cattle and primates from around the world // J. Gen. Virol. - 1997. -Vol. 78.-P. 1389-1398.
  8. Hayasaka D., Suzuki Y., Kariwa H. et al. Phylogenetic and virulence analysis of tick-borne encephalitis viruses from Japan and far-eastern Russia // Ibid. - 1999. - Vol. 80. - P. 3127- 3135.
  9. Hayasaka D., Ivanov L., Leonova G. et al. Distribution and characterization of tick-borne encephalitis viruses from Siberia and far-eastern Asia // Ibid. - 2001. - Vol. 82. - P. 1319- 1328.
  10. Limansky A., Limanskaya O. Comparison of primer sets for detection of bovine leukemia virus by polymerase chain reaction // Bull. Vet. Inst, in Pulawy. - 2002. - Vol. 46. - P. 27-36.
  11. Rychlik W., Spencer W. J., Rhoads R. E. Optimization of the annealing temperature for DNA amplification in vitro // Nucl. Acids Res. - 1990. - Vol. 18. - P. 6409-6417.
  12. Willems L., Thienpont E., Kerkhops P. Bovine leukemia virus, an animal model for the study of intrastrain variability // J. Virol. - 1993. - Vol. 67. - P. 1086-1089.
  13. Willems L., Kerkhofs P., Dequiedt F. Attenuation of bovine leukemia virus by deletion of R3 and G4 open reading frames // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1994. - Vol. 91. P. 11532-11536.
  14. Zaghawa A., Beier D., Abd El-Rahim H. et al. An outbreak of enzootic bovine leukosis in Upper Egypt: clinical, laboratory and molecular-epidemiological studies // J. Vet. Med. - 2002. - Vol. B49. - P. 123-129.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Лиманский А.П., Geue L., Лиманская О.Ю., Beier D., 2004

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах