Выявление и дифференциация штаммов вируса парагриппа-3 крупного рогатого скота с помощью полимеразной цепной реакции и секвенирования фрагмента

Показана возможность использования амплификации фрагмента гена HN в сочетании с нуклеотидным секвенированием кДНК для индикации и штаммовой дифференциации вируса парагриппа-3 крупного рогатого скота. Сравнительный анализ первичной структуры изучаемого фрагмента гена HN показал, что среди исследованных штаммов и изолятов вируса выделяются 2 генетические группы. Одну из них образуют североамериканские штаммы вируса и российские изоляты, первичная структура которых имеет высокий уровень гомологии с первичной структурой штамма SF-4/32, а другую - российские изоляты вируса, имеющие высокий уровень гомологии данного фрагмента с последовательностями японских штаммов. Наибольший уровень различий между исследованными штаммами и изолятами вируса составил около 8% при сравнении нуклеотидных последовательностей и около 4% при сравнении соответствующих им аминокислотных последовательностей.

вирус парагриппа-3 крупного рогатого скота, штаммы, геном, дифференциация, полимеразная цепная реакция, секвепирование