Специфическое определение флавивирусов методом молекулярной гибридизации с синтетическими дезоксиопигонуклеотидными зондами


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Сконструированы молекулярные зонды для специфического определения флавивирусов, переносимых клещами (клещевого энцефалита - КЭ, Омской геморрагической лихорадки) и комарами (японского энцефалита, Западного Нила, энцефалита долины Мюррея, энцефалита Сан-Луи, денге 1-4, желтой лихорадки). Зонды представляют собой синтетические дезоксиолигонуклеотиды длиной 18-20 оснований, комплементарные определенным, установленным с помощью компьютерного анализа участкам вирусных РНК. Получены зонды, специфически гибридизующиеся с наборами штаммов вируса КЭ либо вируса Омской геморрагической лихорадки и не взаимодействующие с другими вирусами комплекса КЭ. Для индикации и идентификации флавивирусов, переносимых комарами, предложены группоспецифические зонды к вирусам комплексов японского энцефалита и денге, а также виру специфические зонды, способные выявлять каждый из этих вирусов и не дающие перекрестных реакций.

Список литературы

  1. Злобин В. И., Кветкова Э. А., Наволокин О. В. и др. Сравнение трех экспресс-методов индикации вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 1990. - № 1. - С. 57-59.
  2. Злобин В. И., Демина Т. В., Беликов С. И. и др. Анализ генетической вариабельности штаммов вируса клещевого энцефалита по первичной структуре фрагмента гена белка оболочки Е // Там же. - 2001. - № 1. - С. 13-16.
  3. Калишер Ч. X. (Calisher С. Н.) Антигенная классификация и таксономия флавивирусов (семейство Flaviviridae). Создание универсальной системы для таксономии вирусов, вызывающих клещевой энцефалит // Acta Virol. - 1988. - Т. 32. - С. 464-473.
  4. Плетнев А. Г., Ямщиков В. Ф., Блинов В. М. Нуклеотидная последовательность генома и полная аминокислотная последовательность полипротеина вируса клещевого энцефалита // Биоорган, химия. - 1989. - Т. 15, № 11. - С. 1504-1521.
  5. Шаманин В. А., Злобин В. И., Плетнев А. Г. Фрагмент нуклеиновой кислоты - зонд для выявления и идентификации флавивирусов. - Пат. № 1678835. -Роспатент. - 1993.
  6. Шаманин В. А., Злобин В. И., Плетнев А. Г. Фрагмент нуклеиновой кислоты - зонд для выявления и идентификации флавивирусов, переносимых комарами. Пат. № 1678837. - Роспатент. - 1993.
  7. Brinton M. A., Dispoto J. H. Sequence and secondary structure analysis of 5-terminal region of flavivirus genome RNA // Virology. - 1988. - Vol. 153. - P. 290-299.
  8. Felsenstein J. PHYLIP (Philogeny Interference Package) version 3.5 с Distributed by author. - Washington, 1993.
  9. Gritsun T. S., Frolova T. V., Pogodina V. V. et al. Nucleotide and deduced amino-acid sequence of the envelope glycoprotein of Omsk hemorragic fever virus comparison with other flaviviruses // J. Gen. Virol. - 1993. - Vol. 74. - P. 287-291.
  10. Hahn C. S., Galler R., Hunkapiller T. et al. Nucleotide sequence of Dengue 2 RNA and comparison of the encoded proteins with those of other flavivirus // Virology. - 1988. - Vol. 162. - P. 167-180.
  11. Lobigs M., Marshall I. D., Weir R. C., Dalgamo L. Murrey Valley encephalitis virus field strains Australia and Papua New Guinea studies on the sequence of the major envelope protein gene and virulence for mice // Ibid. - Vol. 165. - P. 245-255.
  12. Mandl С. W., Heinz F. X., Kunz Ch. Sequence of the structural proteins of tick-borne encephalitis virus (western subtype) and comparative analysis with other flaviviruses // Ibid. - Vol. 166. - P. 197-205.
  13. Mandl С. W., Iacono-Connoris L., Waller G. et al. Sequence of the genes encoding the structural proteins of the low-virulence tick-borne flaviviruses Langat TP21 and Yelantsev // Ibid. - 1991. - Vol. 185. - P. 891-895.
  14. Mandl С. W., Holzmann H., Kunz C., Heinz F. Complete genomic sequence of Powassan virus evaluation of genetic elements in tick-borne versus mosquito-borne flaviviruses // Ibid. - 1993. - Vol. 194. - P. 173-184.
  15. Rice С. M., Lenches E. M., Eddy S. R. et al. Nucleotide sequence of yellow fever virus: Implication for flavivirus gene expression and evolution // Science. - 1985. - Vol. 229, N 4715. - P. 726-733.
  16. Shamanin V. A., Pletnev A. G., Rubin S. G., Zlobin V. I. Differentiation of strfains of tick-borne encephalitis virus by means of RNA-DNA hybridization // J. Gen. Virol. - 1990. - Vol. 71. - P. 1505-1515.
  17. Shiu S. Y. W., Aires M. D., Gould F. A. Genomic sequence of the structural proteins of Louping ill virus: comparative analysis with tick-borne encephalitis virus // Virology. - 1991. - Vol. 180.- P. 411-415.
  18. Sumiyoshi H., Mori C., Fuke I. et al. Complete nucleotide sequence of the Japanese encephalitis virus genome // Ibid. - 1987. - Vol. 161. - P. 497-510.
  19. Venugopal K., Buckley A., Reid H. W., Gould F. A. Nucleotide sequence of the envelope glycoprotein of Negishi virus shows very close homology to Louping ill virus // Ibid. - 1992. - Vol. 190. - P. 515-521.
  20. Venugopal K., Gritsun Т., Lashkevich V. A., Could F. A. Analysis of the structural proteins gene seqeunce shows Kyasanur-forest disease virus as a distinct member of the tick-borne encephalitis virus complex // J. Gen. Virol. - 1994. - Vol. 75. - P. 227-232.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Злобин В.И., Погодина В.В., Дрокин Д.А., Газо М.X., Бочкова Н.Г., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Беликов С.И., Козлова И.В., Верхозина М.М., 2003

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах