Генетическая характеристика S-сегмента РНК двух штаммов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, изолированных на юге России и в Узбекистане


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Определена нуклеотидная последовательность S-сегмента геномных РНК двух штаммов вируса ККГЛ: LEIV 10145 Уз, выделенного из клещей в 1985 г. в Узбекистане, и LEIV 29223 Ств, выделенного от больного в 2000 г. в Ставропольском крае. Установлено, что длина S-сегмента составляет 1672 и 1674 нуклеотида соответственно, инициирующий кодон (метиониновый) находится в позициях 56-58, протяженность рамок трансляции для нуклеокапсидного белка составляет 482 аминокислотных остатка. Различия в длинах S-сегмента по сравнению с другими штаммами касаются 5'- и З'-некодирующих областей. Сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей S-сегментов генома этих штаммов с опубликованными ранее данными показало, что штамм вируса ККГЛ из Узбекистана наиболее близок штаммам из Китая, а штамм из Ставропольского края образует отдельную ветвь на филогенетическом дереве вместе со штаммом Дроздов (Астраханская область).

Список литературы

  1. Аристова В. А., Колобухша Л. В., Щелканов М. Ю., Львов Д. К. Экология вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки и особенности ее клиники на территории России и сопредельных стран // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 7-14.
  2. Бутенко А. М., Чумаков М. П., Башкирцев В. Н. и др. Изоляция и исследование Астраханского штамма (Дроздов) вируса Крымской геморрагической лихорадки и результаты серодиагностики этой инфекции // Материалы 15-й науч. конф. ИПВЭ АМН СССР. - М., 1968.-Т. 3.-С. 8890.
  3. Казаков С. В., Каримов С. К., Дерновой А. Г. и др. Методические подходы к изучению эпидемического процесса Крымской геморрагической лихорадки в Мойынкумском природном очаге Жамбылской области // Гиг., эпидемиол. и иммунол. (Алматы). - 2001. - № 1-2. - С. 75-85.
  4. Колобухина Л. В., Евченко Ю. М., Вышемирский О. И. и др. Изоляция трех штаммов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки от больных в Ставропольском крае во время эпидемической вспышки в 2000 г. // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 15-18.
  5. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование: Пер. с англ. - М., 1984.
  6. Benjiang M. A., Changshou H., Papa A. et al. Sequencing and comparative analysis of the complete glycoprotein gene of three Crimean-Congo hemorrhagic fever virus Chinese isolates // Chinese J. Exp. Clin. Virol.-2001-Vol. 15.-P. 105-111.
  7. Casals J. Antigenic similarity between the virus causing Crimean hemorrhagic fever and Congo virus // Proc. Soc. Exp. Biol. (N. Y.). - 1969. - Vol. 131. - P. 233-236.
  8. Farrell R. E. RNA Methodologies. - New York, 1998. - P. 80-83.
  9. Hoogstraal H. The epidemiology of tick-borne Crimean-Congo hemorrhagic fever in Asia, Europe and Africa // J. Med. Entomol. - 1979. - Vol. 15. - P. 307-417.
  10. Kumar S., Tamura K., Nei M. MEGA: Molecular Evolutionary Genetics Analysis. Version 102 (computer program). - Harrisburg, 1993.
  11. Mariott A. C., Nuttall P. A. Comparison of the S RN A segments and nucleoprotein sequences of Crimean-Congo hemorrhagic fever, Hazara and Dugbe viruses // Virology. - 1992. - Vol. 109. - P. 795-799.
  12. Papa A., Benjiang M. A., Kouidou S. et al. Genetic characterization of M RNA segment of Crimean Congo hemorrhagic fever virus strain, China // Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 8, N 1. - P. 50-53.
  13. Rodriguez L. L., Maupin G. O., Ksiazek T. G. et al. Molecular investigation of a multisource outbreak of Crimean-Congo hemorrhagic fever in the United Arab Emirates // Am. J. Trap. Med. Hyg. - 1997. - Vol. 57. - P. 512-518.
  14. Rychlik W., Rhoads R. E. A computer program for choosing optimal oligonucleotides for filter hybridization, sequencing and in vitro amplification of DNA // Nucl. Acids Res. - 1989. - Vol. 17. - P. 8543.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Петрова И.Д., Серегин С.В., Петров В.С., Вышемирский О.И., Кузина И.И., Львов Д.К., Самохвалов Е.И., Тюнников Г.И., Гуторов В.В., Яшина Л.Н., Нетесов С.В., 2003

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах