Биологическая активность интерферонов при новой коронавирусной инфекции COVID-19
- Авторы: Оспельникова Т.П.1,2, Левицкая Д.С.1, Колодяжная Л.В.1,3, Шитова А.Д.1, Осипцов В.Н.4, Арифуллина Л.Р.1, Крюкова Н.О.5, Пахомов Д.В.1, Хромова Е.А.1, Баранова И.А.5, Чучалин А.Г.5, Костинов М.П.1, Свитич О.А.1
-
Учреждения:
- ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
- ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
- ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
- ФГКУЗ «Главный военный клинический госпиталь войск национальной гвардии Российской Федерации»
- ФГАОУ ВО Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова (РНИМУ) Минздрава России
- Выпуск: Том 67, № 2 (2022)
- Страницы: 142-152
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Дата подачи: 05.05.2022
- Дата принятия к публикации: 05.05.2022
- Дата публикации: 05.05.2022
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/612
- DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-99
- ID: 612
Цитировать
Аннотация
Введение. Иммунопатогенез новой коронавирусной инфекции COVID-19 принято связывать с развитием дисбаланса в иммунном ответе на её возбудитель – вирус SARS-CoV-2 (Coronaviridae: Coronavirinae: Betacoronavirus: Sarbecovirus). Это проявляется, в частности, дефицитом интерферонов (IFN) в начале заболевания с последующей гиперпродукцией провоспалительных цитокинов. Вирус вызывает снижение количества IFN I (α/β) и III типов (λ); менее изучены изменения, касающиеся IFN II типа (γ). В этой связи актуальным является определение функционального биологически активного IFN (интерферонового статуса) при COVID-19.
Цель исследования – оценка противовирусного потенциала организма посредством определения биологически активных IFN при новой коронавирусной инфекции.
Материал и методы. В работе использованы биологические образцы сыворотки крови пациентов с COVID-19, взятые в острую фазу (110 пациентов в 1–5 сутки болезни) и во время реабилитации (47 человек в период 1–3 мес. c момента начала заболевания). Оценка интерферонового статуса осуществлялась в соответствии с методикой, разработанной авторами и описанной ранее.
Результаты. В ходе эксперимента изучен IFN-статус пациентов с COVID-19 в остром периоде и в фазе постинфекционной реабилитации. Установлено, что SARS-CoV-2 вызывает выраженное угнетение биологической активности IFN I и II типов по сравнению с референтными значениями – более чем в 20 и 7 раз соответственно. На протяжении постковидного периода зарегистрировано неполное восстановление активности системы IFN, протекавшее весьма медленно. За время наблюдения не выявлено ни одного случая достижения физиологических показателей интерферонового статуса.
Заключение. Полученные данные по выявлению дефицита функционального биологически активного IFN подтверждают гипотезу о превалирующей роли нарушения процессов выработки IFN различных типов в иммунопатогенезе COVID-19.
Об авторах
Т. П. Оспельникова
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»); ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Автор, ответственный за переписку.
Email: ospelnikovat@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1580-6096
Оспельникова Татьяна Петровна – к.м.н., зав. лаб. интерферонов; старший научный сотрудник лаборатории цитокинов
Москва, Россия, 123098 ул. Гамалеи, д.18
РоссияД. С. Левицкая
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
Email: dyna-s@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-4316-1237
Левицкая Дина Сагитовна - к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории интерферонов
105064 г. Москва, М. Казенный пер., д. 5а
РоссияЛ. В. Колодяжная
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»); ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академикаН.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: 4583103@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6725-2219
Колодяжная Лариса Васильевна - лаборант-исследователь лаборатории интерферонов
105064 г. Москва, М. Казенный пер., д. 5а
РоссияА. Д. Шитова
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
Email: countess.iris@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0787-6251
Шитова Анна Денисовна - лаборант-исследователь лаборатории интерферонов
105064 г. Москва, М. Казенный пер., д. 5а
РоссияВ. Н. Осипцов
ФГКУЗ «Главный военный клинический госпиталь войск национальной гвардии Российской Федерации»
Email: valeraosiptsov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-1027-7620
Осипцов Валерий Николаевич - Старший врач терапевт
г. Балашиха, мкр. Никольско-Архангельский, Вешняковское шоссе, владение 101, 143915
РоссияЛ. Р. Арифуллина
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
Email: arifullinalidiya@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4787-324X
Арифуллина Лидия Руфановна - лаборант-исследователь лаборатории молекулярной иммунологии
105064 г. Москва, М. Казенный пер., д. 5а
РоссияН. О. Крюкова
ФГАОУ ВО Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова (РНИМУ) Минздрава России
Email: kryukovanadia@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-8167-0959
Крюкова Надежда Олеговна – ассистент, аспирант кафедры госпитальной терапии педиатрического факультета
РоссияД. В. Пахомов
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
Email: dm_pachomov@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4073-6085
Пахомов Дмитрий Владимирович - к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории вакцинопрофилактики и иммунотерапии аллергических заболеваний
105064 г. Москва, М. Казенный пер., д. 5а,
РоссияЕ. А. Хромова
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
Email: kate.khromova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4003-9976
Хромова Екатерина Александровна - к.м.н., научный сотрудник лаборатории вакцинопрофилактики и иммунотерапии аллергических заболеваний
105064 г. Москва, М. Казенный пер., д. 5а,
РоссияИ. А. Баранова
ФГАОУ ВО Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова (РНИМУ) Минздрава России
Email: iribaranova@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2469-7346
Баранова Ирина Александровна - д.м.н., профессор кафедры госпитальной терапии педиатрического факультета Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования
РоссияА. Г. Чучалин
ФГАОУ ВО Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова (РНИМУ) Минздрава России
Email: pulmomoskva@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6808-5528
Чучалин Александр Григорьевич – академик РАН, д.м.н., профессор кафедры госпитальной терапии педиатрического факультета Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования
РоссияМ. П. Костинов
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
Email: monolit.96@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1382-9403
Костинов Михаил Петрович – д.м.н., профессор, зав. лабораторией вакцинопрофилактики и иммунотерапии аллергических заболеваний
119991, г. Москва, ул. Трубецкая, 8, стр. 2,
Россия
О. А. Свитич
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова» («НИИВС»)
Email: svitichoa@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1757-8389
Свитич Оксана Анатольевна - Член-корр. РАН, д.м.н., профессор, Директор; Зав. Отдела иммунологии и аллергологии
105064 г. Москва, М. Казенный пер., д. 5а
Россия
Список литературы
- Постановление Правительства РФ № 66 «О внесении изменения в перечень заболеваний, представляющих опасность для окружающих». М.; 2020.
- Park A., Iwasaki A. Type I and type III interferons – induction, signaling, evasion, and application to combat COVID-19. Cell Host Microbe. 2020; 27(6): 870–8. https://doi.org/10.1016/j.chom.2020.05.008
- COVID-19 Data Repository by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University. Availible at: https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19 (accessed 2 April 2022)
- Coronavirus (COVID-19) confirmed cases, new cases, recoveries, and deaths in Russia as of March 23, 2022, by federal subject. Availible at: https://www.statista.com/statistics/1102935/coronavirus-casesby-region-in-russia/ (accessed 2 April 2022).
- Lei X., Dong X., Ma R., Wang W., Xiao X., Tian Z., et al. Activation and evasion of type I interferon responses by SARS-CoV-2. Nat. Commun. 2020; 11(1): 3810. https://doi.org/10.1038/s41467-020-17665-9
- Galani I.E., Rovina N., Lampropoulou V., Triantafyllia V., Manioudaki M., Pavlos E., et al. Untuned antiviral immunity in COVID-19 revealed by temporal type I/III interferon patterns and flu comparison. Nat. Immunol. 2021; 22(1): 32–40. https://doi.org/10.1038/s41590-020-00840-x
- Felgenhauer U., Schoen A., Gad H.H., Hartmann R., Schaubmar A.R., Failing K., et al. Inhibition of SARS-CoV-2 by type I and type III interferons. J. Biol. Chem. 2020; 295(41): 13958–64. https://doi.org/10.1074/jbc.AC120.013788
- Busnadiego I., Fernbach S., Pohl M.O., Karakus U., Huber M., Trkola A., et al. Antiviral activity of type I, II, and III interferons counterbalances ACE2 inducibility and restricts SARS-CoV-2. mBio. 2020; 11(5): e01928-20. https://doi.org/10.1128/mBio.01928-20
- Wei L., Ming S., Zou B., Wu Y., Hong Z., Li Z., et al. Viral Invasion and Type I Interferon Response Characterize the Immunophenotypes During Covid-19 Infection. SSRN Journal. 2020. https://dx.doi.org/10.2139/ssrn.3564998 Available at: https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=3564998 (accessed December 16, 2021).
- Мясников А.Л., Бернс С.А., Талызин П.А., Ершов Ф.И. Интерферон гамма в терапии пациентов с COVID-19 среднетяжелого течения. Вопросы вирусологии. 2021; 66(1) 47–54. https://doi.org/10.36233/0507-4088-24
- Ершов Ф.И., Оспельникова Т.П., Наровлянский А.Н. Интерфероновый статус как метод определения неспецифических биомаркеров иммунопатологии человека. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019; (3): 91–9. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2019-3-91-99
- Оспельникова Т.П., Морозова О.В., Андреева С.А., Исаева Е.И., Koлoдяжная Л.В., Колобухина Л.В., и др. Отличия спектров РНК интерферонов и интерферон-индуцируемого гена MX1 при гриппозной и аденовирусной инфекциях. Иммунология. 2018; 39(5-6): 290–3. http://dx.doi.org/10.18821/0206-4952-2018-39-5-6-290-293
- Оспельникова Т.П., Колодяжная Л.В., Табаков В.Ю., Ершов Ф.И. Способ определения продукции интерферонов как параметров врожденного иммунитета. Патент РФ №2657808; 2018. https://i.moscow/patents/RU2657808C1_20180615 (accessed December 16, 2021).
- Cai Y., Zhang J., Xiao T., Peng H., Sterling S.M., Walsh R.M. Jr., et al. Distinct conformational states of SARS-CoV-2 spike protein. Science. 2020; 369(6511): 1586–92. https://doi.org/10.1126/science.abd4251
- Thoms M., Buschauer R., Ameismeier M., Koepke L., Denk T., Hirschenberger M., et al. Structural basis for translational shutdown and immune evasion by the Nsp1 protein of SARS-CoV-2. Science. 2020; 369(6508): 1249–55. https://doi.org/10.1126/science.abc8665
- Ou X., Liu Y., Lei X., Li P., Mi D., Ren L., et al. Characterization of spike glycoprotein of SARS-CoV-2 on virus entry and its immune cross-reactivity with SARS-CoV. Nat. Commun. 2020; 11(1): 1620. https://doi.org/10.1038/s41467-020-15562-9
- Bullerdiek J. COVID-19 challenging cell biology. Protoplasma. 2020; 257(3): 619–20. https://doi.org/10.1007/s00709-020-01506-z
- Thevarajan I., Nguyen T.H.O., Koutsakos M., Druce J., Caly L., van de Sandt C.E., et al. Breadth of concomitant immune responses prior to patient recovery: a case report of non-severe COVID-19. Nat. Med. 2020; 26(4): 453–5. https://doi.org/10.1038/s41591-020-0819-2
- Министерство здравоохранения Российской Федерации. Временные методические рекомендации «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)». Версия 11 (07.05.2021). Available at: https://minzdrav.gov.ru/ministry/med_covid19
- Lapić I., Rogić D., Plebani M. Erythrocyte sedimentation rate is associated with severe coronavirus disease 2019 (COVID-19): a pooled analysis. Clin. Chem. Lab. Med. 2020; 58(7): 1146–8. https://doi.org/10.1515/cclm-2020-0620
- Vabret N., Britton G.J., Gruber C., Hegde S., Kim J., Kuksin M., et al. Immunology of COVID-19: current state of the science. Immunity. 2020; 52(6): 910–41. https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.05.002
- Симбирцев А.С. Иммунопатогенез и перспективы иммунотерапии коронавирусной инфекции. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессия. 2020; 12(4): 7–22. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2020-12-4-7-22
- Ершов Ф.И. Хронология пандемии COVID-19. М.: ГЭОТАР-Медиа; 2021.
- Adamczyk B., Morawiec N., Arendarczyk M., Baran M., Wierzbicki K., Sowa P., et al. Multiple sclerosis immunomodulatory therapies tested for effectiveness in COVID-19. Neurol. Neurochir. Pol. 2021; 55(4): 357–68. https://doi.org/10.5603/PJNNS.a2021.0051
- Ivashkiv L., Donlin L. Regulation of type I interferon responses. Nat. Rev. Immunol. 2014; 14(1): 36–49. https://doi.org/10.1038/nri3581
- Ye L., Schnepf D., Staeheli P. Interferon-λ orchestrates innate and adaptive mucosal immune responses. Nat. Rev. Immunol. 2019; 19(10): 614–25. https://doi.org/10.1038/s41577-019-0182-z
- Оспельникова Т.П., Исаева Е.И., Колодяжная Л.В., Козулина И.С., Андреева С.А., Полосков В.В., и др. Противовирусная активность препаратов интерферона бета-1а. Вопросы вирусологии. 2015; 60(6): 24–8.
- Zhou Q., Chen V., Shannon C.P., Wei X.S., Xiang X., Wang X., et al. Interferon-α2b Treatment for COVID-19. Front. Immunol. 2020; 11: 1061. https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.01061
- Pinto D., Park Y.J., Beltramello M., Walls A.C., Tortorici M.A., Bianchi S., et al. Cross-neutralization of SARS-CoV-2 by a human monoclonal SARS-CoV antibody. Nature. 2020; 583(7815): 290–5. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2349-y
- Neufeldt C.J., Cerikan B., Cortese M., Frankish J., Lee J.Y., Plociennikowska A., et al. SARS-CoV-2 infection induces a pro-inflammatory cytokine response through cGAS-STING and NF-κB. Commun. Biol. 2022; 5(1): 45. https://doi.org/10.1038/s42003-021-02983-5
- Lee J.S., Park S., Jeong H.W., Ahn J.Y., Choi S.J., Lee H., et al. Immunophenotyping of COVID-19 and influenza highlights the role of type I interferons in development of severe COVID-19. Sci. Immunol. 2020; 5(49): eabd1554. https://doi.org/10.1126/sciimmunol.abd1554
- Stertz S., Reichelt M., Spiegel M., Kuri T., Martínez-Sobrido L., García-Sastre A., et al. The intracellular sites of early replication and budding of SARS-coronavirus. Virology. 2007; 361(2): 304–15. https://doi.org/10.1016/j.virol.2006.11.027
- Chen Y., Cai H., Pan J., Xiang N., Tien P., Ahola T., et al. Functional screen reveals SARS coronavirus nonstructural protein nsp14 as a novel cap N7 methyltransferase. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009; 106: 3484–9. https://doi.org/10.1073/pnas.0808790106
- Menachery V.D., Yount B.L. Jr., Josset L., Gralinski L.E., Scobey T., Agnihothram S., et al. Attenuation and restoration of severe acute respiratory syndrome coronavirus mutant lacking 20-o-methyltransferase activity. J. Virol. 2014; 88(8): 4251–64. https://doi.org/10.1128/JVI.03571-13
- Lokugamage K.G., Hage A., Schindewolf C., Rajsbaum R., Menachery V.D. SARS-CoV-2 is sensitive to type I interferon pretreatment. bioRxiv. 2020. Preprint. https://doi.org/10.1101/2020.03.07.982264