МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ВЫДЕЛЕННЫХ В СУБЪЕКТАХ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА
- Авторы: Котова В.О.1, Троценко О.Е.1, Балахонцева Л.А.1, Базыкина Е.А.1
-
Учреждения:
- ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
- Выпуск: Том 64, № 2 (2019)
- Страницы: 79-89
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Дата подачи: 20.01.2020
- Дата публикации: 20.04.2019
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/237
- DOI: https://doi.org/10.18821/0507-4088-2019-64-2-79-89
- ID: 237
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Введение. Молекулярно-генетический мониторинг, включающий слежение за циркуляцией резистентных форм вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) и анализ территориальной специфики распространения различных геновариантов вируса, является важной частью системы эпидемиологического надзора за распространением ВИЧ-инфекции. Цель исследования - проанализировать распространённость вариантов ВИЧ-1 среди ВИЧ-инфицированных пациентов, проживающих на территориях Дальневосточного федерального округа (ДФО). Материал и методы. Молекулярно-генетическим анализом фрагмента области гена pol, кодирующей протеазу и часть обратной транскриптазы, охвачено 206 образцов плазмы крови от ВИЧ-инфицированных пациентов, проживающих на территории Сахалинской, Магаданской, Амурской, Еврейской автономной областей, Хабаровского края, Республики Саха (Якутия) и Чукотского автономного округа, входящих в ДФО. Результаты. Установлено, что в большинстве регионов доминирует ВИЧ-1 суб-субтипа А6, на долю которого пришлось 72,1 ± 3,1%. В 14 (6,8 ± 1,8%) случаях был выявлен субтип В и у 4 (1,9±1,0%) пациентов субтип С. На отдельных территориях обнаружены рекомбинантные формы ВИЧ-1 и определён их спектр. Выявлено 5 типов циркулирующих рекомбинантных форм ВИЧ-1: CRF03_AB - 2 (0,9 ± 0,7%), CRF02_AG - 8 (3,9 ± 1,3%), CRF63_02A1 - 27 (13,1 ± 2,4%), CRF11_cpx - 1 (0,5 ± 0,5%), CRF01_AE - 3 (1,5 ±0,8 %). Высокая гетерогенность вируса отмечена в Еврейской автономной области. Обсуждение. Проведённые исследования выявили генетические различия в пейзаже циркулирующих субтипов ВИЧ-1 и частоте распространения рекомбинантных форм ВИЧ-1. Вероятно, это объясняется увеличением миграционных потоков, которые могут способствовать трансграничному завозу и дальнейшему распространению различных генетических вариантов ВИЧ-1 среди населения ДФО. Заключение. Проведенные исследования показали, что молекулярно-генетический мониторинг циркуляции геновариантов ВИЧ-1 должен охватывать не только неблагополучные по ВИЧ-инфекции территории РФ, но и регионы с низкими показателями заболеваемости и поражённости населения.
Ключевые слова
Об авторах
В. О. Котова
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Автор, ответственный за переписку.
Email: kotova.valeriya@mail.ru; dvaids@mail.ru
Россия
О. Е. Троценко
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Л. А. Балахонцева
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Е. А. Базыкина
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Email: noemail@neicon.ru
Россия