Эффективность схем АРТ первой линии на основе TDF у ВИЧ-инфицированных пациентов с предсуществующей мутацией A62V в обратной транскриптазе
- Авторы: Ожмегова Е.Н.1, Кузнецова А.И.1, Лебедев А.В.1, Антонова А.А.1, Ким К.В.1, Мунчак Я.М.1, Туманов А.С.1, Казеннова Е.В.1
-
Учреждения:
- ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
- Выпуск: Том 69, № 3 (2024)
- Страницы: 231-240
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Дата подачи: 21.02.2024
- Дата публикации: 05.07.2024
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/16626
- DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-232
- EDN: https://elibrary.ru/lnmvih
- ID: 16626
Цитировать
Аннотация
Введение. A62V в обратной транскриптазе была идентифицирована как мутация, коррелирующая с вирусологической неудачей у пациентов, получавших терапию первой линии, включая тенофовир (TDF) или тенофовир алафенамид (TAF). A62V представляет собой типично полиморфную мутацию суб-субтипа А6 ВИЧ-1, который является наиболее распространенным вариантом вируса в России.
Материалы и методы. По результатам запроса к общеевропейской базе данных EuResist (EIDB) были сформированы две эквивалентные группы пациентов: 1-я группа ‒ пациенты с A62V на исходном уровне, получавшие TDF или TAF в терапии первой линии; 2-я группа ‒ пациенты без A62V на исходном уровне, получавшие TDF или TAF в терапии первой линии. В каждую группу входило по 23 пациента.
Результаты. Статистической разницы между двумя группами по вирусологической эффективности через 4, 12 и 24 нед после начала антиретровирусной терапии (АРТ) и по частоте вирусологических неудач не выявлено.
Заключение. Проведенное исследование имело некоторые ограничения, в связи с чем роль A62V в эффективности АРТ первой линии на основе TDF нуждается в уточнении и заслуживает дальнейшего изучения.
Ключевые слова
Полный текст
Введение
A62V в обратной траскриптазе (ОТ) является дополнительной мутацией, связанной с лекарственной устойчивостью (ЛУ) ВИЧ-1 [1, 2]. Она входит в состав мультирезистентных мутационных комплексов: комплекса Q151M (A62V, V75I, F77L, F116Y и Q151M) и инсерционного комплекса T69SSS (M41L, A62V, T69SSS, K70R и T215Y), которые влияют практически на все препараты нуклеозидных ингибиторов ОТ (НИОТ), включая широко используемые ламивудин (3TC), эмтрицитабин (FTC) и тенофовир (TDF) [3]. Также A62V часто встречается в сочетании с мутацией K65R, вызывающей ЛУ к TDF, абакавиру (ABC), ставудину (d4T), диданозину (ddI) и редко к 3TC [4]. Было показано, что A62V улучшает приспособленность устойчивых к лекарствам вирусов [3, 4]. A62V является неполиморфной мутацией для всех подтипов ВИЧ-1, за исключением подтипа А [3]. До сих пор неизвестно, может ли ранее существовавшая мутация A62V влиять на появление основных мутаций ЛУ ВИЧ-1 у пациентов, находящихся на первой линии терапии. Однако некоторые авторы определили A62V как одну из мутаций, коррелирующих с вирусологической неудачей у пациентов, получающих терапию первой линии, включая TDF, и подчеркнули необходимость дальнейшего изучения возможности влияния A62V на ЛУ к TAF [5]. В странах, где пациенты в основном инфицированы вариантами, отличными от А, A62V редко выявлялся исходно, до начала терапии [6, 7]. Кроме того, A62V в ОТ, как правило, представляет собой полиморфную мутацию подтипа А6, который является наиболее распространенным вариантом ВИЧ-1 в России [8, 9]. В период 2006–2022 гг. в России A62V был выявлен у 39,9% ранее не получавших лечения пациентов [9].
Целью данного исследования было сравнение эффективности схем антиретровирусной терапии (АРТ) первой линии с использованием TDF в двух группах: 1) в группе людей, живущих с ВИЧ (ЛЖВ), с мутацией A62V в ОТ ВИЧ-1 на исходном уровне и 2) в группе ЛЖВ без мутации A62V в ОТ ВИЧ-1 на исходном уровне.
Материалы и методы
Дизайн исследования и участники
Из интегрированной общеевропейской базы данных EuResist (EuResist Integrated DataBase, EIDB), одной из крупнейших доступных баз данных генотипов ВИЧ и клинических результатов действия АРТ, все доступные данные были загружены 21 марта 2023 г.1 Демографическая информация о пациентах являлась недоступной; все данные были полностью анонимными. Этическое одобрение в данном случае не требовалось.
Загруженный набор данных включал нуклеотидные последовательности и соответствующую им клиническую информацию о 151 109 пациентах. Были сформированы две группы.
Первая группа (A62V+) – группа ЛЖВ с мутацией A62V в ОТ ВИЧ-1 на исходном уровне – была сформирована по следующим критериям:
а) мутация A62V в ОТ ВИЧ-1 исходно до начала терапии первой линии;
б) отсутствие мутаций устойчивости к препаратам НИОТ на исходном уровне до начала терапии первой линии;
в) отсутствие мутаций ЛУ ВИЧ-1 к классам основных препаратов терапии первой линии (ненуклеозидных ингибиторов ОТ (ННИОТ), ингибиторов протеазы (ИП) или ингибиторов интегразы (ИИ)) на исходном уровне до начала терапии первой линии;
г) терапия первой линии на основе ННИОТ/ИП/ИИ с двумя НИОТ в качестве основы, одним из которых является TDF/TAF;
д) нахождение на терапии первой линии более 4 нед.
В итоге 23 пациента из EIDB соответствовали вышеперечисленным критериям.
Число пациентов во 2-й группе (A62V−) – группе ЛЖВ без мутации A62V в ОТ ВИЧ-1 на исходном уровне – было эквивалентно группе A62V+: 23 пациента. Группа A62V− была сформирована на основе случайной выборки по следующим критериям:
а) отсутствие мутации A62V в ОТ ВИЧ-1 исходно до начала лечения;
б) отсутствие мутаций устойчивости ВИЧ к НИОТ на исходном уровне до начала терапии первой линии;
в) отсутствие мутаций ЛУ ВИЧ-1 к классам основных препаратов (ННИОТ, ИП или ИИ) на исходном уровне до начала терапии первой линии;
г) терапия первой линии, основанная на ННИОТ/ИП/ИИ с двумя НИОТ в качестве основы, одним из которых является TDF/TAF;
д) нахождение на терапии первой линии более 4 нед.
Пациенты, включенные в исследование, наблюдались в разных европейских центрах, и ни один из пациентов не был из России.
Для каждого пациента загружали следующие данные: последовательность гена pol для протеазы и ОТ перед началом терапии первой линии и для интегразы, если пациент находился на терапии первой линии на основе ИИ; дата секвенирования образца, субтип ВИЧ, список мутаций (основные и дополнительные мутации к ИП, НИОТ, ННИОТ и ИИ в соответствии со Стэнфордской базой данных), данные АРТ (состав терапии первой линии, дата начала терапии и прекращения) и динамика вирусной нагрузки (ВН).
Эффективность АРТ первой линии сравнивали в двух группах согласно определениям вирусологического ответа в российских и европейских руководствах (табл. 1) [10, 11].
Таблица 1. Определение вирусологического ответа на АРТ в российских и европейских руководствах
Table 1. Virologic response definitions to ART in Russian and European guidelines
Руководство Guidelines | Вирусологическая эффективность Virologic efficacy | Вирусологический всплеск Virologic blip | Вирусологический неуспех Virologic failure | ||
через 4 нед in 4 weeks | через 12 нед in 12 weeks | через 24 нед in 24 weeks | |||
Российское руководство Russian guidelines | Снижение ВН на ≥ 1 lg VL decrease by ≥ 1 lg | ВН < 400 копий РНК/мл VL < 400 copies/mL | ВН < 50 копий РНК/мл VL < 50 copies/mL | После неопределяемой ВН (< 50 копий/мл) повышение ВН до уровня менее 200 копий РНК/мл After undetectable VL (< 50 copies/mL) an isolated rising of VL to a level of less than 200 copies/ml | Невозможность достижения ВН < 50 копий РНК/мл, или после вирусологической супрессии подтвержденный обнаруживаемый уровень ВН > 50 копий РНК/мл через 24 нед или более после начала АРТ The inability to achieve VL < 50 copies/ml or after virologic suppression confirmed detectable VL > 50 copies/ml in 24 weeks or more after ART starting |
Европейское руководство European guidelines | Н.д. N/a | Н.д. N/a | Н.д. N/a | После подтверждения неопределяемой ВН обнаруживаемый уровень ВН с последующим возвращением к неопределяемому уровню After confirmed undetectable VL an isolated detectable VL level followed by a return to an undetectable level | Невозможность достижения или поддержания ВН < 200 копий/мл The inability to achieve or maintain VL < 200 copies/ml |
Вирусологическую эффективность АРТ через 4, 12 и 24 нед оценивали на основании определения, приведенного в российских руководствах. Для определения случаев вирусологической неудачи критерии двух руководств были объединены. ВН < 50 копий РНК/мл использовали в качестве порогового или неопределяемого уровня ВН (вирусологическая супрессия).
Под вирусологическим всплеском «virologic blip» подразумевалось достижение уровня ВН < 50 копий РНК/мл с последующим кратковременным увеличением уровня ВН выше неопределяемого уровня с дальнейшим возвращением к уровню менее 50 копий РНК/мл.
Под вирусологической неудачей понимали невозможность достижения ВН < 50 копий/мл через 24 нед терапии или повторное выявление определяемого уровня ВН через 6 мес лечения и более у пациентов, достигших вирусологической супрессии. Также оценивали промежуточные результаты действия АРТ первой линии через 4, 12 и 24 нед после начала терапии в двух группах.
Статистический анализ проводили для сравнения частоты случаев вирусологической эффективности в двух группах в каждый момент времени.
Далее в каждой группе были выявлены случаи вирусологической неудачи. Статистический анализ проводили с целью определения разницы в частоте вирусологической неудачи в двух группах.
Статистический анализ и визуализация
Статистический анализ данных проводили с помощью программы Statistica v. 6.0 (StatSoft Inc., США). Представление количественных данных в настоящем исследовании осуществляли с использованием следующей описательной статистики: размера выборки (n), медианы и межквартильного интервала (IQR; в виде 25% и 75% процентилей). Статистическую значимость различий между наблюдаемыми параметрами оценивали с помощью двустороннего точного критерия Фишера. Уровень значимости (р), принятый в данной работе, составил 0,05 (или 5,0%). Визуализацию выполняли в программе GraphPad Prism v. 5.0 (GraphPad Software Inc., США).
Результаты
В каждую группу вошли 23 пациента (табл. 2).
Таблица 2. Характеристика пациентов, принявших участие в исследовании
Table 2. Characteristics of the patients who participated in the study
Схема первого ряда АРТ ART first-line regimen | A62V+ (n=23) | A62V− (n=23) | p |
3TC + TDF + DTG, n (%) | 1 (4,3) | – | 0,98 |
FTC + TAF + DRV, n (%) | 1 (4,3) | – | 0,98 |
3TC + TDF + EFV, N (%) | 1 (4,3) | – | 0,98 |
FTC + TDF + DRV/rtv, n (%) | 1 (4,3) | 2 (8,7) | 0,97 |
FTC + TDF + RPV, n (%) | 2 (8,7) | 1 (4,3) | 0,97 |
FTC + TDF + LPV/rtv, n (%) | 2 (8,7) | 1 (4,3) | 0,97 |
FTC + TDF + FPV/rtv, N (%) | 2 (8,7) | – | 0,5 |
FTC + TDF + EFV, n (%) | 7 (30,4) | 12 (52,2) | 0,48 |
FTC + TDF + DTG, n (%) | 3 (13,0) | – | 0,27 |
FTC + TAF + BIC, n (%) | 1 (4,3) | – | 0,98 |
FTC + TDF + ATV, n (%) | 1 (4,3) | 3 (13,0) | 0,66 |
FTC + TAF + DRV + cob, n (%) | 1 (4,3) | 2 (8,7) | 0,97 |
FTC + TDF + NVP, n (%) | – | 1 (4,3) | 0,97 |
FTC + TDF + RAL, n (%) | – | 1 (4,3) | 0,97 |
3TC + TDF + LPV/rtv, n (%) | – | 1 (4,3) | 0,97 |
Медиана [IQR] ВН на исходном уровне, log10 копий РНК/мл Median [IQR] VL at baseline, log10 RNA copies/ml | 0,99 | ||
Медиана [IQR] продолжительности терапии, нед Median [IQR] duration of therapy, weeks | 0,33 | ||
Субтип Subtype | |||
A6 | 20 (87,0) | 1 (4,3) | 0,001 |
B | – | 19 (82,6) | 0,003 |
G | 2 (8,7) | – | 0,5 |
CRF01_AE | 1 (4,3) | – | 0,98 |
CRF09_cpx | – | 1 (4,3) | 0,97 |
F | – | 1 (4,3) | 0,97 |
CRF02_AG | – | 1 (4,3) | 0,97 |
Примечание. TDF – тенофовира дизопроксила фумарат; TAF – тенофовира алафенамид; FTC – эмтрицитабин; 3TC – ламивудин; DRV – дарунавир; RPV – рилпивирин; LPV – лопинавир; FPV – фосампренавир; EFV – эфавиренц; DTG – долутегравир; BIC – биктегравир; АТV – атазанавир; NVP – невирапин; RAL – ралтегравир; RTV – ритонавир; cob – кобицистат; IQR – межквартильный размах; ВН – вирусная нагрузка.
Note. TDF – tenofovir disoproxil fumarate; TAF – tenofovir alafenamide; FTC – emtricitabine; 3TC – lamivudine; DRV – darunavir; RPV – rilpivirine; LPV – lopinavir; FPV – fosamprenavir; EFV – efavirenz; DTG – dolutegravir; BIC – bictegravir; ATV – atazanavir; NVP – nevirapine; RAL – raltegravir; rtv – ritonavir; cob – cobicistat; IQR – interquartile range; VL – viral load.
Большинство пациентов принимали FTC + TDF + EFV: 30,4% (7/23) в 1-й группе и 52,2% (12/23) во 2-й группе. ВН исходно была выше в 1-й группе (медиана 5,4 копий РНК/мл), чем во 2-й группе (4,6 копий РНК/мл). В 1-й группе больные ранее были инфицированы суб-субтипом А6 (87,0%), а во 2-й группе – субтипом В (82,6%). В среднем пациенты без A62V проходили более длительную терапию (168 нед).
Проанализированы результаты измерений ВН через 4 ± 2, 12 ± 4 и 24 ± 4 нед после начала АРТ. В табл. 3 представлены результаты измерения ВН у пациентов обеих групп. Значения ВН через 4 нед после начала АРТ были доступны у 36 пациентов (у 17 в 1-й группе у 19 во 2-й группе). У всех пациентов 1-й группы и у 18 из 19 пациентов 2-й группы наблюдалось снижение ВН более чем на 1 lg. Только у одного пациента (6а) во 2-й группе было зарегистрировано снижение ΔLg ВН менее чем на 1 lg, составившее 0,9. Статистической разницы между двумя группами не было найдено (р = 0,95).
Таблица 3. Результаты измерения вирусной нагрузки (ВН)
Table 3. Results of viral load (VL) measurement
Номер пациента Patient No. | ВН на исходном уровне, копий РНК/мл VL at baseline, RNA copies/ml | Срок наблюдения, мес Follow-up period, months | Срок наблюдения, нед Follow-up period, weeks | Число измерений ВН за период наблюдения Number of VL measurements during the observation period | ВН через 4 нед, копий РНК/мл VL in 4 weeks, RNA copies/ml | ВН через 4 нед (Δ Log10) VL decrease in 4 weeks (Δ Lg) | ВН через 12 нед, копий РНК/мл VL in 12 weeks, RNA copies/ml | ВН через 24 нед, копий РНК/мл VL in 24 weeks, RNA copies/ml |
A62V+ | ||||||||
1v | 4683 | 4 | 16 | 2 | – | – | 40 | – |
2v | 7852 | 6 | 24 | 2 | – | – | – | 69 200 |
3v | 726 | 5 | 20 | 2 | – | – | – | 40 |
4v | 6520 | 23 | 92 | 5 | 40 | 2,2 | 40 | – |
5v | 5817 | 45 | 180 | 12 | – | – | 5817 | 99 |
6v | 6660 | 80 | 320 | 19 | 0 | > 1 lg | 0 | 130 |
7v | 77 006 | 94 | 376 | 31 | 587 | 2,1 | 40 | 40 |
8v | 157 783 | 2 | 8 | 2 | – | – | 40 | – |
9v | 64 201 | 63 | 252 | 19 | 528 | 2,1 | 275 | 40 |
10v | 32 200 | 7 | 28 | 4 | 315 | 2,0 | 10 | 10 |
11v | 92 000 | 28 | 112 | 9 | 830 | 2,0 | 33 | 15 |
12v | 49 437 | 130 | 520 | 37 | 597 | 1,9 | – | 40 |
13v | 7286 | 15 | 60 | 5 | 1 | 3,8 | 130 120 | – |
14v | 16 200 | 5 | 20 | 3 | 0 | > 1 lg | 0 | – |
15v | 42 400 | 3 | 12 | 3 | 459 | 1,9 | 34 | – |
16v | 12 454 | 2 | 8 | 2 | – | – | 50 | – |
17v | 41 225 | 30 | 120 | 29 | 330 | 2,1 | – | 40 |
18v | 211 000 | 27 | 108 | 7 | 469 | 2,6 | 6 150 000 | – |
19v | 209 136 | 6 | 24 | 3 | 25 | 3,9 | – | 20 |
20v | 2 080 000 | 58 | 232 | 15 | 233 | 3,9 | 38 | 40 |
21v | 160 000 | 43 | 172 | 14 | 478 | 2,5 | 0 | 0 |
22v | 1 740 000 | 61 | 244 | 11 | 2180 | 2,9 | – | 0 |
23v | 155 707 | 45 | 180 | 20 | 1579 | 1,9 | 219 | 40 |
A62V− | ||||||||
1a | 78 000 | 28 | 112 | 5 | – | – | – | 25 |
2a | 69 000 | 51 | 204 | 10 | 390 | 2,2 | 50 | 25 |
3a | 134 896 | 22 | 88 | 7 | 1413 | 2,0 | 813 | 129 |
4a | 61 000 | 30 | 120 | 15 | 50 | 3,1 | 50 | 25 |
5a | 67 000 | 40 | 160 | 14 | 990 | 1,8 | 50 | 50 |
6a | 34 000 | 32 | 128 | 7 | 3900 | 0,9 | 50 | 50 |
7a | 230 000 | 35 | 140 | 16 | 57 | 3,6 | 50 | 50 |
8a | 910 000 | 23 | 92 | 4 | 3700 | 2,4 | – | 150 |
9a | 398 107 | 20 | 80 | 6 | 2754 | 2,1 | 282 | 63 |
10a | 360 000 | 49 | 196 | 10 | 850 | 2,6 | – | 25 |
11a | 490 000 | 56 | 224 | 14 | 850 | 2,7 | 50 | 50 |
12a | 425 187 | 7 | 28 | 2 | 1191 | 2,5 | – | 40 |
13a | 3000 | 31 | 124 | 6 | 50 | 1,8 | 50 | 25 |
14a | 9900 | 15 | 60 | 5 | 140 | 1,9 | 50 | 50 |
15a | 50 | 77 | 308 | 13 | – | – | – | – |
16a | 3000 | 50 | 200 | 11 | 50 | 1,8 | 50 | 50 |
17a | 6600 | 29 | 116 | 9 | 50 | 2,1 | 50 | 50 |
18a | 490 | 53 | 212 | 11 | – | – | 50 | 50 |
19a | 14 000 | 17 | 68 | 4 | – | – | 50 | 50 |
20a | 14 000 | 60 | 240 | 15 | 50 | 1,6 | 50 | 50 |
21a | 26 915 | 3 | 12 | 4 | 631 | 1,6 | 65 | – |
22a | 4100 | 33 | 132 | 8 | 50 | 1,9 | – | 25 |
23a | 17 000 | 45 | 180 | 9 | 56 | 2,5 | – | 25 |
Через 12 нед результаты измерений ВН были получены у 33 пациентов (у 17 в 1-й группе, у 16 во 2-й группе). В 1-й группе у 14 из 17 больных ВН была менее 400 копий/мл, во 2-й группе – у 15/16. Статистической разницы между двумя группами не было найдено (р = 0,6).
Через 24 нед результаты измерения ВН были получены у 36 пациентов (у 15 в 1-й группе, у 21 во 2-й группе). В 1-й группе у 12 из 15 пациентов ВН была менее 50 копий/мл, во 2-й группе – у 18/21. Статистической разницы между двумя группами не было найдено (p = 0,7).
Динамика ВН у пациентов двух групп за весь период наблюдения представлена на рисунке.
Рисунок. Динамика ВН в период наблюдения
Уровень ВН ниже 50 копий/мл определялся как пороговый. a–г (группа A62V+): а – пациенты 1v, 2v, 3v, 4v, 5v, 6v; б – пациенты 7v, 8v, 9v, 10v, 11v; в – пациенты 12v, 13v, 14v, 15v, 16v, 17v; г – пациенты 18v, 19v, 20v, 21v, 22v, 23v; д–з (группа А62V−): д – пациенты 1а, 2а, 3а, 4а, 5а, 6а; е – пациенты 7а, 8а, 9а, 10а, 11а; ж – пациенты 12а, 13а, 14а, 15а, 16а, 17а; з – пациенты 18а, 19а, 20а, 21а, 22а, 23а.
Figure. The dynamics of VLs during the follow-up period
The VL level below 50 copies/ml was defined as a cut-off. a–d (A62V+ group): a – patients 1v, 2v, 3v, 4v, 5v, 6v; b – patients 7v, 8v, 9v, 10v, 11v; c – patients 12v, 13v, 14v, 15v, 16v, 17v; d – patients 18v, 19v, 20v, 21v, 22v, 23v; e–h (A62V− group): e – patients 1a, 2a, 3a, 4a, 5a, 6a; f – patients 7a, 8a, 9a, 10a, 11a; g – patients 12a, 13a, 14a, 15a, 16a, 17a; h – patients 18a, 19a, 20a, 21a, 22a, 23a.
На основании динамики ВН в период наблюдения выявлены и проанализированы случаи вирусологической неудачи в обеих группах.
Так, в когорте A62V+ у 16 пациентов (1v, 3v, 4v, 6v, 7v, 8v, 10v, 11v, 13v, 14v, 15v, 16v, 19v, 20v, 21v, 22v) ВН достигла неопределяемого уровня (< 50 копий/мл). У 3 пациентов (5v, 9v, 12v) наблюдалась вирусологическая супрессия, за которой последовали всплески ВН. У 2 пациентов (17v, 23v) ВН достигла неопределяемого уровня с последующим подтвержденным вирусологическим неуспехом. У 2 пациентов (2v, 18v) ВН не достигла неопределяемого уровня. Следовательно, в когорте А62V+ вирусологическая неудача была выявлена у 4 (2v, 17v, 18v, 23v) из 23 пациентов.
В когорте A62V− у 19 пациентов (2а, 4а, 5а, 6а, 7а, 8а, 9а, 10а, 11а, 12а, 13а, 14а, 15а, 16а, 17а, 18а, 19а, 20а, 23а) была достигнута вирусологическая супрессия. У одного пациента (1а) ВН достигла неопределяемого уровня с последующим неподтвержденным всплеском ВН. У одного пациента (21а) ВН не достигла неопределяемого уровня. При этом через 12 нед ВН снизилась до 65 копий/мл, что соответствует вирусологической эффективности, а в последующий период наблюдения результаты измерения ВН не было доступны. Этот результат не был интерпретирован как вирусологическая неудача. У 2 пациентов (3а, 22а) ВН упала нижнего порогового уровня с последующим подтвержденным восстановлением. Следовательно, в когорте A62V− вирусологическая неудача была выявлена у 2 (3а, 22а) из 23 пациентов.
Многофакторный логистический регрессионный анализ в обеих группах не обнаружил связи между вирусологической неудачей и такими переменными, как состав АРТ, субтип ВИЧ-1 и продолжительность АРТ.
Статистической разницы в случаях вирусологической неудачи в двух группах не было найдено (p = 0,66; двусторонний критерий Фишера).
Обсуждение
Варианты ВИЧ-1, распространенные в России, отличаются от вариантов вируса, циркулирующих в Европе, Азии и Северной Америке [12]. Примечательно, что наиболее распространенным вариантом ВИЧ-1 в России является суб-субтип А6, выявляемый в 78,6% случаев [9]. Cуб-субтип А6 имеет ряд типичных полиморфных мутаций, связанных с ЛУ: E138A и A62V в ОТ, L74I в интегразе [8, 9, 13]. В одной из предыдущих работ мы изучали влияние ранее существовавшей мутации E138A в ОТ на эффективность схем АРТ первой линии [14]. Настоящее исследование сосредоточено на A62V в ОТ.
В более ранних исследованиях в России A62V в ОТ суб-субтипа А6 была обнаружена в 63% случаев у наивных пациентов и в 78% случаев у пациентов, имеющих опыт АРТ [15, 16]. Несмотря на то что в настоящее время наблюдается тенденция, указывающая на снижение частоты встречаемости A62V, ее распространенность остается относительно высокой. Так, в эпиднадзорном исследовании, проведенном в России на основе клинических образцов, собранных от ВИЧ-инфицированных пациентов до начала лечения в 2017–2019 гг., A62V была обнаружена в 37,1% случаев [17].
Недавнее исследование в России выявило потенциальную связь между A62V и вирусологическим прорывом «virological breakthrough» [18], что коррелирует с результатами предыдущего исследования [5]. Это первое исследование, в котором эффективность терапии первой линии, включающей TDF/TAF, сравнивали в двух группах: ЛЖВ с ранее существовавшей A62V в ОТ на исходном уровне до начала терапии первой линии и без нее.
В России генотипирование ВИЧ перед началом АРТ не является обязательным и, как правило, не проводится в плановом порядке [10]. В связи с этим для формирования двух групп пациентов мы обратились к общеевропейской интегрированной базе данных EIDB.
Результаты показали, что между двумя группами не было статистических различий по вирусологической эффективности через 4, 12 и 24 нед после начала АРТ, а также по частоте вирусологических неудач. Однако вирусологическая неудача наблюдалась у 4 пациентов в группе А62V+ и у 2 – в группе А62V−.
Основным ограничением настоящего исследования являлось отсутствие генотипов вируса в конце терапии первой линии у пациентов с вирусологической неудачей. Таким образом, не было возможности оценить, была ли вирусологическая неудача связана с появлением основных мутаций ЛУ ВИЧ, ассоциированных с A62V, или она была связана с другими мутациями ЛУ ВИЧ, а также недостаточной приверженностью пациентов. Кроме того, среди 4 пациентов с вирусологической неудачей в группе А62V+ один пациент (2v) принимал 3ТС + TDF + EFV и 3 пациента (17v, 18v, 23v) получали АРТ на основе ИП: FTC + TAF + DRV + cob, FTC + TDF + FPV/rtv и FTC + TDF + LPV/rtv соответственно. Два пациента с вирусологической неудачей в группе A62V− (3a, 22a) принимали FTC + TDF + EFV. При этом примерно у 50% пациентов EFV вызывает нейропсихиатрические побочные эффекты [19], что может повлиять на приверженность к лечению. Наиболее распространенным проявлением токсичности ИП является воздействие на желудочно-кишечный тракт, в частности диарея; более того, предпочтительный режим приема ИП – 2 раза в день, что может создать потенциальные проблемы для пациентов с точки зрения приверженности [20].
Еще одним ограничением настоящего исследования является то, что пациенты двух групп были инфицированы разными типами ВИЧ-1: в группе А62V+ – в 87,0% (20/23) случаев суб-субтипом А6, а в группе А62V− – в 82,6% (19/23) случаев субтипом В. В настоящее время имеются противоречивые данные о влиянии субтипа ВИЧ-1 на патогенез и развитие ЛУ. Результаты ряда исследований подтвердили гипотезу о том, что разные варианты ВИЧ-1 могут иметь разные клинические характеристики [21]. Кроме того, поскольку исследование носило ретроспективный характер, измерение ВН и последующее наблюдение за пациентами не были запланированы последовательно и на всех контрольных точках можно было наблюдать ограниченное число участников.
Заключение
Проведено первое пилотное исследование, направленное на оценку эффективности схем АРТ первой линии на основе TDF у ВИЧ-инфицированных пациентов с уже существующей мутацией A62V в ОТ. Результаты этого исследования позволяют приблизиться к пониманию риска вирусологической неудачи в присутствии A62V в ОТ. Показано, что A62V в ОТ на исходном уровне неочевидно снижает эффективность схем первой линии, содержащих TDF или TAF. Однако роль этой мутации заслуживает дальнейшего изучения.
1 The Euresist Integrated Database (EIDB). Available at: https://euresist.org/eidb
Финансирование. Исследование выполнено при финансовой поддержке Российского научного фонда, грант № 23–15-00027, https://rscf.ru/project/23-15-00027/, дата договора 15 мая 2023 г.
Благодарности. Авторы благодарят EuResist Network за предоставление данных из базы данных Euresist.
Конфликт интересов. Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов, связанных с публикацией настоящей статьи.
Funding. The research was funded by the Russian Science Foundation, grant number 23–15-00027, https://rscf.ru/project/23-15-00027/, date of agreement 15 May 2023.
Acknowledgement. The authors thank Euresist Network for providing the data from the Euresist database.
Conflict of interest. The authors declare no apparent or potential conflicts of interest related to the publication of this article.
Об авторах
Екатерина Никитична Ожмегова
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Автор, ответственный за переписку.
Email: ozhmegova.eka@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-3110-0843
канд. биол. наук, научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваАнна Игоревна Кузнецова
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: a-myznikova@list.ru
канд. биол. наук, заведующая лабораторией вирусов лейкозов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваАлексей Владимирович Лебедев
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: lebedevalesha236@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-6787-9345
канд. биол. наук, научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов подразделения Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваАнастасия Александровна Антонова
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: anastaseika95@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9180-9846
канд. биол. наук, научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваКристина Вячеславовна Ким
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: kimsya99@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4150-2280
младший научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваЯна Михайловна Мунчак
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: yanka.zabavnaya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4792-8928
младший научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваАлександр Сергеевич Туманов
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: desep@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6221-5678
научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваЕлена Валерьевна Казеннова
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: kazennova@rambler.ru
ORCID iD: 0000-0002-7912-4270
д-р биол. наук, ведущий научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского
Россия, МоскваСписок литературы
- Stanford University HIV Drug Resistance Database. Available at: http://hivdb.stanford.edu
- Wensing A.M., Calvez V., Ceccherini-Silberstein F., Charpentier C., Günthard H.F., Paredes R., et al. 2022 update of the drug resistance mutations in HIV-1. Top. Antivir. Med. 2022; 30(4): 559–74.
- Maldonado J.O., Mansky L.M. The HIV-1 reverse transcriptase A62V mutation influences replication fidelity and viral fitness in the context of multi-drug-resistant mutations. Viruses. 2018; 10(7): 376. DOI: https://doi.org/10.3390/v10070376
- Svarovskaia E.S., Feng J.Y., Margot N.A., Myrick F., Goodman D., Ly J.K., et al. The A62V and S68G mutations in HIV-1 reverse transcriptase partially restore the replication defect associated with the K65R mutation. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2008; 48(4): 428–36. DOI: https://doi.org/10.1097/QAI.0b013e31817bbe93
- Rhee S.Y., Varghese V., Holmes S.P., Van Zyl G.U., Steegen K., Boyd M.A., et al. Mutational correlates of virological failure in individuals receiving a WHO-recommended Tenofovir-containing first-line regimen: an international collaboration. EBioMedicine. 2017; 18: 225–35. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2017.03.024
- Wagner T., Zuckerman N.S., Halperin T., Chemtob D., Levy I., Elbirt D., et al. Epidemiology and transmitted HIV-1 drug resistance among treatment-naive individuals in Israel, 2010–2018. Viruses. 2021; 14(1): 71. DOI: https://doi.org/10.3390/v14010071
- Zhukova A., Dunn D., Gascuel O. Modeling drug resistance emergence and transmission in HIV-1 in the UK. Viruses. 2023; 15(6): 1244. DOI: https://doi.org/10.3390/v15061244
- Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012; 4(4): 44–51. EDN: https://elibrary.ru/pjowuj
- Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Шлыкова А.В., Лопатухин А.Э., Лаповок И.А., Салеева Д.В. и др. Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ в России (2013–2021 гг.). Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2021; 11(3): 53–62. DOI: https://doi.org/10.18565/epidem.2021.11.3.53-62 EDN: https://elibrary.ru/uqiuni
- Минздрав России. Клинические рекомендации «ВИЧ-инфекция у взрослых»; 2020. Available at: http://rushiv.ru/wp-content/uploads/2022/11/KR79.pdf
- Clinicalinfo. Guidelines for the Use of Antiretroviral Agents in Adults and Adolescents with HIV. Available at: https://clinicalinfo.hiv.gov/sites/default/files/guidelines/documents/adult-adolescent-arv/guidelines-adult-adolescent-arv.pdf
- Bbosa N., Kaleebu P., Ssemwanga D. HIV subtype diversity worldwide. Curr. Opin. HIV AIDS. 2019; 14(3): 153–60. DOI: https://doi.org/10.1097/coh.0000000000000534
- Kirichenko A., Lapovok I., Baryshev P., van de Vijver D., van Kampen J.J.A., Boucher C.A.B., et al. Genetic features of HIV-1 integrase sub-subtype A6 predominant in Russia and predicted susceptibility to INSTIs. Viruses. 2020; 12(8): 838. DOI: https://doi.org/10.3390/v12080838
- Kuznetsova A., Lebedev A., Gromov K., Kazennova E., Zazzi M., Incardona F., et al. Pre-existing singleton E138A mutations in the reverse transcriptase gene do not affect the efficacy of first-line ART regimens using rilpivirine in human immunodeficiency virus-infected patients. Clin. Case Rep. 2022; 10(2): e05373. DOI: https://doi.org/10.1002/ccr3.5373
- Суханова А.Л., Рудинский Н.И., Богословская Е.В., Круглова А.И., Башкирова Л.Ю., Цыганова Г.М. и др. Полиморфизм области генома, кодирующей протеазу и обратную транскриптазу, вариантов ВИЧ-1 подтипа А, распространенных на территории СНГ. Молекулярная биология. 2005; 39(6): 1063–71. EDN: https://elibrary.ru/hsjkol
- Kolomeets A.N., Varghese V., Lemey P., Bobkova M.R., Shafer R.W. A uniquely prevalent nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutation in Russian subtype A HIV-1 viruses. Aids. 2014; 28(17): F1–8. DOI: https://doi.org/10.1097/qad.0000000000000485
- Kirichenko A., Kireev D., Lopatukhin A., Murzakova A., Lapovok I., Saleeva D., et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS One. 2022; 17(1): e0257731. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0257731
- Щемелев А.Н., Останкова Ю.В., Валутите Д.Э., Серикова Е.Н., Зуева Е.Б., Семенов А.В. и др. Риск неэффективности терапии первой линии у пациентов с ВИЧ в Северо-Западном федеральном округе России. Инфекция и иммунитет. 2023; 13(2): 302–8. DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-RAO-2122 EDN: https://elibrary.ru/ciclmu
- Costa B., Vale N. Efavirenz: history, development and future. Biomolecules. 2022; 13(1): 88. DOI: https://doi.org/10.3390/biom13010088
- Lv Z., Chu Y., Wang Y. HIV protease inhibitors: a review of molecular selectivity and toxicity. HIV AIDS (Auckl.). 2015; 7: 95–104. DOI: https://doi.org/10.2147/hiv.S79956
- Salvaña E.M.T., Dungca N.T., Arevalo G., Li K., Francisco C., Penalosa C., et al. HIV-1 subtype shift in the Philippines is associated with high transmitted drug resistance, high viral loads, and fast immunologic decline. Int. J. Infect. Dis. 2022; 122: 936–43. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2022.06.048