Молекулярно-генетическая характеристика астровирусов, циркулирующих в Новосибирске


Цитировать

Полный текст

Аннотация

1107 образцов фекалий детей раннего возраста, госпитализированных с диагнозом острой кишечной инфекции с января по декабрь 2007 г., исследовали на присутствие астровирусов. Астровирусы выявлены в 64 (5,8%) из 1107 образцов, причем лишь 50% из них встречались в виде моноинфекций. Астровирусы регистрировались в течение всего года, однако сезонности этой инфекции выявить не удалось. В основном случаи астровирусной инфекции отмечались у детей в возрасте до 1 года (90%). Астровирусы типировали с помощью секвенирования участка ORF2; в Новосибирске были обнаружены астровирусы только первого (HAstV-1) и второго (HAstV-2) генотипов.

Список литературы

  1. Боднев С. А., Тикунов А. Ю., Жираковская Е. В. и др. Распространенность норовирусов среди детей раннего возраста в г. Новосибирске в 2007 г. // Сиб. мед. журн. - 2008. - Т. 82, № 7. - С. 81-83.
  2. Жираковская Е. В., Тикунов А. Ю., Боднев С. А. и др. Оценка новой ПЦР тест-системы "АмплиСенс Rotavirus/Norovirus/Astrovirus-FEP" с гибридизационно-флуоресцентной детекцией по "конечной точке" // Биопрепараты. - 2008. - № 2. - С. 15-18.
  3. Жираковская Е. В., Малеев В. В., Боднев С. А. и др. Ротавирусы у детей раннего возраста в Новосибирске в 2005- 2007 гг.: выявление и генотипирование // Журн. микробиол. - 2008. - № 4. - С. 12-16.
  4. Подколзин А. Т., Мухина А. А., Шипулин Г. А. и др. Изучение этиологии острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционные отделения стационаров Москвы // Инфекц. бол. - 2004. - Т. 2, № 4. - С. 85-91.
  5. Bhattacharya R., Sahoo G. C., Nayak M. K. et al. Molecular epidemiology of human astrovirus infections in Kolkata, India // Infect., Genet., Evol. - 2006. - Vol. 6. - P. 425-435.
  6. Cubitt W. Human, small round structured viruses, caliciviruses and astroviruses // Baillieres Clin. Gastroenterol. - 1990. - Vol. 4. - P. 643-656.
  7. Guix S., Caballero S., Villena C. et al. Molecular epidemiology of astrovirus infection in Barcelona, Spain // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol. 40, N 1. - P. 133-139.
  8. Guix S.,. Bosch A., Pinto R. Human astrovirus diagnosis and typing: current and future prospects // Lett. Appl. Microbiol. - 2005. - Vol. 41, N 2. - P. 103-105.
  9. Lewis D., Lightfoot N., Cubitt W. et al. Outbreaks of astrovirus type 1 and rotavirus gastroenteritis in a geriatric in-patient population // J. Hosp. Infect. - 1989. - Vol. 14. - P. 9-14.
  10. Malasao R., Maneekarn N., Khamrin P. et al. Genetic diversity of norovirus, sapovirus, and astrovirus isolated from children hospitalized with acute gastroenteritis in Chiang Mai, Thailand // J. Med. Virol. - 2008. - Vol. 80, N 10. - P. 1749-1755.
  11. Mendez E., Arias C. Astroviruses // Fields virology / Eds D. M. Knipe et al. - 5-th ed. - Philadelphia, 2007. - Vol. 1. - P. 981-1000.
  12. Mendez-Toss M., Griffin D. D., Calva J. et al. Prevalence and genetic diversity of human astroviruses in Mexican children with symptomatic and asymptomatic infections // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol. 42, N 1. - P. 151-157.
  13. Noel J. S., Lee T. W., Kurtz J. B. et al. Typing of human astroviruses from clinical isolates by enzyme immunoassay and nucleotide sequencing // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33. - P. 797-801.
  14. Oh D., Schreier E. Molecular characterization of human astroviruses in Germany // Arch. Virol. - 2001. - Vol. 146, N 3. - P. 443-455.
  15. Silva P. A. et al. The circulation of human astrovirus genotypes in the Central West Region of Brazil // Mem.Inst. Oswaldo Cruz. - 2009. - Vol. 104, N 4. - P. 655-658.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Тикунов А.Ю., Жираковская Е.В., Юн Т.Э., Боднев С.В., Нетесов С.В., Тикунова Н.В., Tikunov A.Y., Zhirakovskaya E.V., Yun T.E., Bodnev S.A., Netesov S.V., Tikunova N.V., 2010

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах