Молекулярно-генетическая характеристика астровирусов, циркулирующих в Новосибирске
- Выпуск: Том 55, № 6 (2010)
- Страницы: 19-23
- Раздел: Статьи
- Дата подачи: 09.06.2023
- Дата публикации: 15.12.2010
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12048
- ID: 12048
Цитировать
Полный текст
Аннотация
1107 образцов фекалий детей раннего возраста, госпитализированных с диагнозом острой кишечной инфекции с января по декабрь 2007 г., исследовали на присутствие астровирусов. Астровирусы выявлены в 64 (5,8%) из 1107 образцов, причем лишь 50% из них встречались в виде моноинфекций. Астровирусы регистрировались в течение всего года, однако сезонности этой инфекции выявить не удалось. В основном случаи астровирусной инфекции отмечались у детей в возрасте до 1 года (90%). Астровирусы типировали с помощью секвенирования участка ORF2; в Новосибирске были обнаружены астровирусы только первого (HAstV-1) и второго (HAstV-2) генотипов.
Ключевые слова
Список литературы
- Боднев С. А., Тикунов А. Ю., Жираковская Е. В. и др. Распространенность норовирусов среди детей раннего возраста в г. Новосибирске в 2007 г. // Сиб. мед. журн. - 2008. - Т. 82, № 7. - С. 81-83.
- Жираковская Е. В., Тикунов А. Ю., Боднев С. А. и др. Оценка новой ПЦР тест-системы "АмплиСенс Rotavirus/Norovirus/Astrovirus-FEP" с гибридизационно-флуоресцентной детекцией по "конечной точке" // Биопрепараты. - 2008. - № 2. - С. 15-18.
- Жираковская Е. В., Малеев В. В., Боднев С. А. и др. Ротавирусы у детей раннего возраста в Новосибирске в 2005- 2007 гг.: выявление и генотипирование // Журн. микробиол. - 2008. - № 4. - С. 12-16.
- Подколзин А. Т., Мухина А. А., Шипулин Г. А. и др. Изучение этиологии острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционные отделения стационаров Москвы // Инфекц. бол. - 2004. - Т. 2, № 4. - С. 85-91.
- Bhattacharya R., Sahoo G. C., Nayak M. K. et al. Molecular epidemiology of human astrovirus infections in Kolkata, India // Infect., Genet., Evol. - 2006. - Vol. 6. - P. 425-435.
- Cubitt W. Human, small round structured viruses, caliciviruses and astroviruses // Baillieres Clin. Gastroenterol. - 1990. - Vol. 4. - P. 643-656.
- Guix S., Caballero S., Villena C. et al. Molecular epidemiology of astrovirus infection in Barcelona, Spain // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol. 40, N 1. - P. 133-139.
- Guix S.,. Bosch A., Pinto R. Human astrovirus diagnosis and typing: current and future prospects // Lett. Appl. Microbiol. - 2005. - Vol. 41, N 2. - P. 103-105.
- Lewis D., Lightfoot N., Cubitt W. et al. Outbreaks of astrovirus type 1 and rotavirus gastroenteritis in a geriatric in-patient population // J. Hosp. Infect. - 1989. - Vol. 14. - P. 9-14.
- Malasao R., Maneekarn N., Khamrin P. et al. Genetic diversity of norovirus, sapovirus, and astrovirus isolated from children hospitalized with acute gastroenteritis in Chiang Mai, Thailand // J. Med. Virol. - 2008. - Vol. 80, N 10. - P. 1749-1755.
- Mendez E., Arias C. Astroviruses // Fields virology / Eds D. M. Knipe et al. - 5-th ed. - Philadelphia, 2007. - Vol. 1. - P. 981-1000.
- Mendez-Toss M., Griffin D. D., Calva J. et al. Prevalence and genetic diversity of human astroviruses in Mexican children with symptomatic and asymptomatic infections // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol. 42, N 1. - P. 151-157.
- Noel J. S., Lee T. W., Kurtz J. B. et al. Typing of human astroviruses from clinical isolates by enzyme immunoassay and nucleotide sequencing // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33. - P. 797-801.
- Oh D., Schreier E. Molecular characterization of human astroviruses in Germany // Arch. Virol. - 2001. - Vol. 146, N 3. - P. 443-455.
- Silva P. A. et al. The circulation of human astrovirus genotypes in the Central West Region of Brazil // Mem.Inst. Oswaldo Cruz. - 2009. - Vol. 104, N 4. - P. 655-658.