Картирование точечных мутаций, приводящих к утрате сродства вируса ECHO11 к рецептору DAF (CD55)


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Для картирования мутаций, обусловливающих утрату вирусом ECHO11 сродства к рецептору DAF (CD55), проведено секвенирование структурной части генома исходного daf+-клона и двух выделенных из него мутантных daf-клонов (101 и 103). Нуклеотидные последовательности депонированы в GenBank: EU167520, EU167521, EU167522. Обнаружены точечные мутации, приводившие к замене аминокислотных остатков, контактирующих с DAF-, в белке VP2: S145 → N у клона 101 и G162 → E у клона 103 соответственно.

Список литературы

  1. Bergelson J. M., Chan M., Solomon K. R. et al. / Decayaccelerating factor (CD55), a glycosylphosphatidylinositol-anchored complement regulatory protein, is a receptor for several echoviruses // Proc. Natl. Acad. Sci USA. - 1994. - Vol. 91. - P. 6245.
  2. Bhella D., Goodfellow I. G., Roversi P. et al. The structure of echovirus type 12 bound to a two-domain fragment of its cellular attachment protein decay-accelerating factor (CD55) // J. Biol. Chem. - 2004. - Vol. 279, N 9. - P. 8325-8332.
  3. He Y., Lin F., Chipman P. R. et al. Structure of decay- accelerating factor bound to echovirus 7: a virus-receptor complex // Proc. Natl. Acad. Sci USA. - 2002. - Vol. 99, N 16. - P. 10325-10329.
  4. Kumar S., Tamura K., Nei M. MEGA3: Intergated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment // Briefings in Bioinformatics. - 2004. - Vol. 79. - P. 1707-1713.
  5. Novoselov A. V., Lozhnikov A. B., Chereshnev V. A. et al. Mathematical modelling of mutant accumulation kinetics in a cloned viral population // Rus. J. Numer. Anal. Math. Modelling-2004. - Vol. 19, N 4. - P. 293-304.
  6. Pettigrew D. M., Williams D. T., Kerrigan D. et al. Structural and functional insights into the interaction of echoviruses and decay-accelerating factor // J. Biol. Chem. - 2006. - Vol. 281, N 8. - P. 5169-5177.
  7. Powell R. M., Schmitt V., Ward T. et al. Characterization of echoviruses that bind decay accelerating factor (CD55): evidence that some haemagglutinating strains use than one cellular receptor // J. Gen. Virol. - 1998. - Vol. 79. - P. 177-1713.
  8. Sergeev A. G., Novoselov A. V., Bubenschikov A. V., Kondrashova Z. N. Genetic analysis of echovirus 11 variability in adsorption to human erythrocytes // Arch. Virol. - 1994. - Vol. 134, N 1. - P. 129-139.
  9. Stuart A. D., McKee T. A., Williams P. A. et al. Determination of the structure of a decay accelerating factor-binding clinical isolate of echovirus 11 allows mapping of mutants with altered receptor requirements for infection // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, N 15. - P. 7694-7704.
  10. Stuart A. D., Eustace H. E., McKee T. A., Brown T. D. K. A novel cell entry pathway for a DAF-using human enterovirus is dependent on lipid rafts // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, N 18. - P. 9307-9322.
  11. Ward T. Pipkin P. A., Clarkson N. A. et al. Decay accelerating factor (CD55) identified as the receptor for echovirus 7 using CELICS, a rapid immuno-focal cloning method // EMBO J. - 1994. - Vol. 13, N 21. - P. 5070-5074.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Резайкин А.В., Новоселов А.В., Фадеев Ф.А., Сергеев А.Г., Лебедев С.В., Rezaikin A.V., Novoselov A.V., Fadeyev F.A., Sergeyev A.G., Lebedev S.V., 2009

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС77-77676 от 29.01.2020.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах