Отправить статью по E-mail Роль стабилизирующего и расщепляющего отбора в эволюции вирусов семейств Parvoviridae и Astroviridae
- Выпуск: Том 49, № 1 (2004)
- Страницы: 7-17
- Раздел: Статьи
- URL: https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11817
- ID: 11817
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Ранее с помощью филогенетических методов собрана и проанализирована вся генетическая информация для семейств Parvoviridae и Astroviridae. Это позволило определить эволюционные отношения между вирусами, выявить и охарактеризовать ряд событий в эволюционной истории этих семейств. В данной работе исследована роль стабилизирующего и расщепляющего отбора в эволюции вирусов семейств Parvoviridae и Astroviridae. Проведен анализ числа синонимичных и несинонимичных нуклеотидных замен в кодирующих участках геномов вирусов. Показана роль стабилизирующего отбора как одного из ключевых факторов в эволюции парвовирусов и астровирусов.
Ключевые слова
Список литературы
- Berns К. I. Parvoviridae: the viruses and their replication // ields Virology / Eds B. N. Fields et al. - Philadelphia, 1996. P. 2173-2197.
- Horiuchi М., Yamaguchi Y., Gojobori T. et al. Differences in the evolutionary pattern of feline panleukopenia virus and canine parvovirus // Virology. - 1998. - Vol. 249. - P. 440-452.
- Jonassen C. M., Jonassen T. O., Saif Y. M. et al. Comparison of capsid sequences from human and animal astroviruses // J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82. - P. 1061-1067.
- Kumar S., Tamura K., Nei M. Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA). - University Park, 1993.
- Kumar S., Hedges S. B. A molecular time scale for vertebrate evolution // Nature. - 1998. - Vol. 392. - P. 917-920.
- Li W.-H., Wu C.-L, Luo C.-C. A new method for estimating synonymous and nonsynonymous rates of nucleotide substitution considering the relative likelihood of nucleotide and codon changes // Mol. Biol. Evol. - 1985. - Vol. 2. - P. 150-174.
- Lukashov V. V., Goudsmit J. Evolutionary relationships among parvoviruses: virus-host coevolution among autonomous primate parvoviruses and links between adeno-associated and avian parvoviruses // J. Virol. - 2001. - Vol. 75. - P. 2729-2740.
- Lukashov V. V., Goudsmit J. Evolutionary relationships among Astroviridae // J. Gen. Virol. - 2002. - Vol. 83. - P. 1397- 1405.
- Matsui S. M., Greenberg H. B. Astroviruses // Fields Virology / Eds B. N. Fields et al. - Philadelphia, 1996. - P. 811-824.
- Thompson J. D., Higgins D. G., Gibson T. J., Clustal W. Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice // Nucl. Acids Res. - '1994. - Vol. 22. - P. 4673-4680.
- Van Regenmortel M. H. V., Fauquet С. M., Bishop D. H. L. et al. Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses // Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. - San Diego, 2000.
- Wang Q. H., Kakizawa J., Wen L. Y. et al. Genetic analysis of the capsid region of astroviruses // J. Med. Virol. - 2001. - Vol. 64. - P. 245-255.
Дополнительные файлы
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).