<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Problems of Virology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Problems of Virology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Вопросы вирусологии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0507-4088</issn><issn publication-format="electronic">2411-2097</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Central Research Institute for Epidemiology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">356</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL RESEARCHES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Features of the tick-borne encephalitis virus infection of Ixodes persulcatus Shulze и Ixodes pavlovskyi Pomerantsev 1946 during period of growth and transformation of species structure of the ixodids community</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Особенности инфекции вирусом клещевого энцефалита Ixodes persulcatus Shulze и Ixodes pavlovskyi Pomerantsev в период роста численности и трансформации видовой структуры сообщества иксодид</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Chicherina</surname><given-names>G. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Чичерина</surname><given-names>Г. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Novosibirsk</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>630091, г. Новосибирск</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Моrozova</surname><given-names>О. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Морозова</surname><given-names>О. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Moscow</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>123098, г. Москва</p><p>119435, г. Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Panov</surname><given-names>V. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Панов</surname><given-names>В. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Novosibirsk</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>630091, г. Новосибирск</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff6"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Romanenko</surname><given-names>V. N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Романенко</surname><given-names>В. Н.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Tomsk</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>643050, г. Томск</p></bio></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bakhvalov</surname><given-names>S. А.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бахвалов</surname><given-names>С. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Novosibirsk</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>630091, г. Новосибирск</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff6"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bakhvalova</surname><given-names>V. N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бахвалова</surname><given-names>В. Н.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Valentina Bakhvalova, candidate of biological sciences</p><p>Novosibirsk</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Бахвалова Валентина Николаевна, канд. биол. наук, ст. науч. сотр.</p><p>630091, г. Новосибирск</p></bio><email>bvntbe@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff6"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Systematics and Ecology of Animals</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУН «Институт систематики и экологии животных» СО РАН</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">D.I. Ivanovsky Institute of Virology «Federal Research Centre for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician N.F. Gamaleya»</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт вирусологии им. Д. И. Ивановского ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУН «НИИ физико- химической медицины» ФМБА России</institution></aff><aff><institution xml:lang="en">Institute of Systematics and Ecology of Animals</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff4"><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУН «Институт систематики и экологии животных» СО РАН</institution></aff><aff><institution xml:lang="en">Тomsk State University</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff5"><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВПО «Национальный исследовательский Томский государственный университет»</institution></aff><aff><institution xml:lang="en">Institute of Systematics and Ecology of Animals</institution></aff></aff-alternatives><aff id="aff6"><institution>ФГБУН «Институт систематики и экологии животных» СО РАН</institution></aff><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2015-10-28" publication-format="electronic"><day>28</day><month>10</month><year>2015</year></pub-date><volume>60</volume><issue>5</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>42</fpage><lpage>46</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2020-07-11"><day>11</day><month>07</month><year>2020</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2020-07-11"><day>11</day><month>07</month><year>2020</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2015, Chicherina G.S., Моrozova О.V., Panov V.V., Romanenko V.N., Bakhvalov S.А., Bakhvalova V.N.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2015, Чичерина Г.С., Морозова О.В., Панов В.В., Романенко В.Н., Бахвалов С.А., Бахвалова В.Н.</copyright-statement><copyright-year>2015</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Chicherina G.S., Моrozova О.V., Panov V.V., Romanenko V.N., Bakhvalov S.А., Bakhvalova V.N.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Чичерина Г.С., Морозова О.В., Панов В.В., Романенко В.Н., Бахвалов С.А., Бахвалова В.Н.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/356">https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/356</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>ELISA for antigen detection, reverse transcription with quantitative real-time PCR with the subtype-specific fluorescent probes, phylogenetic analysis of the E and NS 1 gene nucleotide sequences, bioassays with suckling mice, hemagglutination and neuroinvasiveness tests were used to compare the tick-borne encephalitis virus (TBEV) infection of the ixodid ticks Ixodes persulcatus P. Schulze and Ixodes pavlovsky Pomerantsev 1946 in sympatria area of their natural habitats in Novosibirsk region during growth period of their populations with the replacement of prevailing species of the monodominant type of ixodid population structure. Ratio of the two tick species did not depend on biotopes of pine or birch forest, but rather on the distance from Novosibirsk Scientific Center: the lower anthropogenic pressure, the smaller I. pavlovsky proportion. The TBEV rate (including both pathogenic and apathogenic viruses for laboratory mice), spectra of the 3 main genetic types of TBEV, neurovirulence and hemagglutination activity were similar for both I. persulcatus and I. pavlovsky. However, proportion of pathogenic for laboratory mice virus and the TBEV Far Eastern subtype, as well as viral loads of Siberian and European types for the TBEV from I. pavlovsky, were significantly higher than those from I. persulcatus.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>С использованием методов иммуноферментного анализа на антиген, обратной транскрипции с последующей количественной полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с генотипспецифичными флуоресцентными зондами в реальном времени, филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей генов Е и NS1, биопробы на мышах, реакции гемагглютинации, а также определения нейроинвазивности проведено сравнение инфекции вирусом клещевого энцефалита (ВКЭ) иксодовых клещей Ixodes persulcatus P.Schulze и Ixodes pavlovskyi Pomerantsev 1946 в зоне симпатрии их ареалов на территории Новосибирской области в период роста численности иксодовых клещей со сменой доминирующего вида. Соотношение двух видов клещей зависело не от биотопов соснового или березового леса, а от удаленности от лесопарковой зоны Новосибирского научного центра: при уменьшении антропогенной нагрузки относительная доля клеща Павловского уменьшалась. Вирусофорность (с учетом патогенного и апатогенного для лабораторных мышей ВКЭ), спектры 3 основных генетических типов ВКЭ, нейровирулентность и гемагглютинирующая активность ВКЭ у клещей таежного и Павловского были сходными. Различия состояли в том, что доли патогенного для лабораторных мышей вируса и дальневосточного генетического типа ВКЭ, а также вирусные нагрузки сибирского и европейского типов ВКЭ у клеща Павловского существенно превышали таковые у таежного клеща.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>anthropurgic endemic region of tick-borne encephalitis</kwd><kwd>ixodid tick Ixodes pavlovsky Pomerantsev 1946</kwd><kwd>taiga tick Ixodes persulcatus P. Schulze</kwd><kwd>tick-borne encephalitis virus (TBEV)</kwd><kwd>viral infection rate</kwd><kwd>viral load</kwd><kwd>TBEV genetic types</kwd><kwd>TBEV neurovirulence</kwd><kwd>hemagglutination activity</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>антропургический очаг клещевого энцефалита</kwd><kwd>клещ Павловского Ixodes pavlovskyi Pomerantsev 1946</kwd><kwd>таежный клещ Ixodes persulcatus P. Schulze</kwd><kwd>вирус клещевого энцефалита</kwd><kwd>вирусофорность</kwd><kwd>вирусная нагрузка</kwd><kwd>генетические типы</kwd><kwd>нейровирулентность</kwd><kwd>гемагглютинирующая активность</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="en">Our research was supported by grants №83, 135, 141 of the Integration Program of Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences and by the Federal Fundamental Scientific Research Programme for 2013-2020 (VI.51.1.5).</funding-statement><funding-statement xml:lang="ru">Исследования выполнены при финансовой поддержке грантов №83, 135, 141 Интеграционных программ Сибирского отделения Российской академии наук и Федеральных программ фундаментальных научных исследований 2013-2020 (VI.51.1.5).</funding-statement></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Labuda M., Randolph S.E. Survival strategy of tick-borne encephalitis virus: cellular basis and environmental determinants. Zentralbl. Bakteriol. 1999; 289 (5–7): 513–24.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Korenberg E.I. Seasonal population dynamics of ixodes ticks and tick-borne encephalitis virus. Exp. Appl. Acarol. 2000; 24 (9): 665– 81.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Nuttall P.A., Labuda M. Dynamics of infection in tick vectors and at the tick-host interface. Adv. Virus Res. 2003; 60: 233–72.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Богданов И.И. Иксодовые клещи Западной Сибири. Сообщение VII. Типы населения иксодовых клещей. Вестник Омского государственного педагогического университета. Естественные науки и экология. 2006. Available at: www.omsk.edu</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Романенко В.Н. Мониторинг видового состава и численности иксодовых клещей (Parasitiformes, Ixodidae) в антропургических биотопах. Вестник Томского государственного университета. 2009; 324: 376–9.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Bakhvalova V.N., Panov V.V., Morozova O.V.Tick-borne encephalitis virus quasispecies rearrangements in ticks and mammals. In: Daniel R@uz@ek, ed. Flavivirus encephalitis. ISBN: 978-953-307-669-0, “InTech”. 2011: 213–234. Available at: http://www.intechopen.com/articles/show/title/tick-borne-encephalitis-virus-quasispecies-rearrangements-in-ticks-and-mammals</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Филиппова Н.А., ред. Таежный клещ Ixodes persulcatus Schulze (Acarina, Ixodidae): морфология, систематика, экология, медицинское значение. Ленинград: Наука; 1985.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Иванова Н.В. Роль мелких млекопитающих в очагах природных инфекций на антропогенно трансформированной территории юго-востока Западной Сибири: Автореф. дисс. ... канд. биол. наук. Томск; 2009.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Романенко В.Н., Кондратьева Л.М. Зараженность иксодовых клещей, снятых с людей, вирусом клещевого энцефалита на территории г. Томска и его окрестностей. Паразитология. 2011; 45 (1): 3–10.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Добротворский А.К., Бахвалова В.Н., Харитонова Н.Н., Сапегина В.Ф. Динамика параметров паразитарной системы клещевого энцефалита в условиях северной лесостепи Приобья. Сибирский экологический журнал. 1994; 1 (4): 369–75.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. Беклемишев В.Н. К изучению зараженности клещей переносчиков энцефалита методом биопробы. Вопросы вирусологии. 1962; 2: 240–2.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12. Морозова О.В., Бахвалова В.Н., Панов В.В. Сравнение методов детекции вируса клещевого энцефалита. В кн.: Фундаментальные науки – медицине. Сборник трудов научной конференции. Новосибирск: АРТА; 2008: 171–7.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13. Bakhvalova V.N., Dobrotvorskiy A.K., Panov V.V., Matveeva V.A., Tkachev S.E., Morozova O.V. Natural tick-borne encephalitis virus infection among wild small mammals in the southeastern part of western Siberia, Russia. Vector Borne Zoonotic Dis. 2006; 6 (1): 32–41.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>14. Морозова О.В., Гришечкин А.Е., Бахвалова В.Н., Исаева Е.И., Подчерняева Р.Я. Динамика репродукции вируса клещевого энцефалита в культурах клеток. Вопросы вирусологии. 2012; 2: 40–3.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>15. Дерябин П.Г., Лебедева Г.А., Логинова Н.В. Реакция нейтрализации тогавирусов на мышах и культурах клеток. В кн.: Гайдамович С.Я., ред. Арбовирусы (методы лабораторных и полевых исследований). М.: Наука; 1986: 120–6.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>16. Clarke D.H., Casals J. Techniques for hemagglutination and hemagglutination-inhibition with arthropod-borne viruses. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1958; 7 (5): 561–73.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>17. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28: 2731–9.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>18. Ашмарин И.П., Воробьев А.А. Статистические методы в микробиологических исследованиях. Ленинград: Медгиз; 1962.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>19. Лакин Г.Ф. Биометрия. М.: Высшая школа; 1980.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>20. Цыбулин С.Н., Жимулев И.Ф., Панов В.В., Вартапетов Л.Г., Жуков В.С., Богомолова И.Н. и др. Животный мир. Позвоночные. (Динамика численности и пространственная неоднородность сообществ). В кн.: Жимулев И.Ф., ред. Динамика экосистем Новосибирского Академгородка. Новосибирск: Издательство СО РАН; 2013: 56–80.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>21. Чичерина Г.С., Романенко В.Н., Панов В.В., Морозова О.В., Бахвалова В.Н. Антропогенная трансформация сообщества иксодовых клещей в западносибирском природном очаге клещевого энцефалита. В кн.: «Научные чтения памяти Н.Ф. Реймерса и Ф.Р. Штильмарка. Антропогенная трансформация природной среды», г. Пермь, 6–9.12.2011. Пермь: Пермский государственный национальный исследовательский университет; 2011: 135–41.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>22. Карань Л.С., Маленко Г.В., Бочкова Н. Г., Левина Л.С., Колясникова Н.М., Гамова Е.Г. и др. Применение молекулярногенетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита. Бюллетень Сибирского отделения РАМН. 2007; 4: 34–40.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>23. Погодина В.В., Карань Л.С., Колясникова Н.М., Левина Л.С., Маленко Г.В., Гамова Е.Г. и др. Эволюция клещевого энцефалита и проблема эволюции возбудителя. Вопросы вирусологии. 2007; 5: 16–21.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
