Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology1684610.36233/0507-4088-365mygumwORIGINAL RESEARCHESОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯResearch ArticleGenetic characteristics of adenoviruses (Adenoviridae: Mastadenovirus) circulating among military personnel with respiratory infections during the 2023–2024 season in the Sverdlovsk RegionГенетическая характеристика аденовирусов (Adenoviridae: Mastadenovirus), циркулирующих среди больных респираторными инфекциями военнослужащих в эпидемиологический сезон 2023–2024 годов в Свердловской областиhttps://orcid.org/0000-0002-5074-7925KorotkovaInna A.КоротковаИнна Александровна
Russian Federation

Researcher, Lab. of Respiratory Viral Infections

научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций

korotkova_ia@niivirom.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6137-5437ChernyshevaAnna E.ЧернышеваАнна Евгеньевна
Russian Federation

Junior Researcher, Lab. of Respiratory Viral Infections

младший научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций

chernysheva_ae@niivirom.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2669-7144MukhachevIvan S.МухачевИван Семенович
Russian Federation

Candidate of Medical Sciences, Head

канд. мед. наук, начальник

faust.78@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0000-9506-5197MamontovOleg I.МамонтовОлег Игоревич
Russian Federation

Employee

сотрудник

faust.78@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0009-6986-488XKildyashovMaksim A.КильдяшовМаксим Александрович
Russian Federation

Employee

сотрудник

faust.78@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7286-6079MarkaryanAlexandr Y.МаркарянАлександр Юрьевич
Russian Federation

Candidate of Biological Sciences, Head of the Lab. of Respiratory Viral Infections

канд. биол. наук, и.о. заведующего лабораторией респираторных вирусных инфекций

markaryan_ay@niivirom.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3223-8219SemenovAlexandr V.СеменовАлександр Владимирович
Russian Federation

Doctor of Biological Sciences, Professor, Director

д-р биол. наук, профессор, директор

semenov_av@niivirom.ruFSRIVI "Virome" RospotrebnadzorФБУН «Федеральный научно-исследовательский институт вирусных инфекции «Виром» Роспотребнадзора1026 Center for State Sanitary and Epidemiological SurveillanceФГКУ «1026 Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора» Минобороны России0805202671217518123122025Copyright ©; 2026, Korotkova I.A., Chernysheva A.E., Mukhachev I.S., Mamontov O.I., Kildyashov M.A., Markaryan A.Y., Semenov A.V.Copyright ©; 2026, Короткова И.А., Чернышева А.Е., Мухачев И.С., Мамонтов О.И., Кильдяшов М.А., Маркарян А.Ю., Семенов А.В.2026Korotkova I.A., Chernysheva A.E., Mukhachev I.S., Mamontov O.I., Kildyashov M.A., Markaryan A.Y., Semenov A.V.Короткова И.А., Чернышева А.Е., Мухачев И.С., Мамонтов О.И., Кильдяшов М.А., Маркарян А.Ю., Семенов А.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/16846

The relevance of the conducted study is determined by the high epidemiological significance of adenovirus in the structure of acute respiratory viral infections (ARVI), particularly among military personnel. Previously, adenovirus was identified in 90% of cases of patients with community-acquired pneumonia hospitalised from organised military groups, leading to significant lung damage, various disabling complications, and possible fatal outcomes.

The aim of this study was to investigate the genetic diversity of adenoviruses detected in patients with respiratory infections among military personnel during the 2023–2024 influenza and ARVI epidemic season in the Sverdlovsk Region.

Materials and methods. Sanger sequencing was performed for 79 clinical samples (nasopharyngeal swabs) that tested positive for adenovirus. The samples were collected from military personnel exhibiting symptoms of ARVI who were receiving treatment in military medical institutions in the Sverdlovsk Region during the 2023–2024 influenza and ARVI epidemic season (October to February).

Results. Six genetic variants of adenovirus were identified: B3, B7, B14, B55, C2, and C5, with genotype B55 being predominant and associated with severe and moderately severe disease.

Conclusion. The study provides insight into the genetic diversity of adenoviruses circulating among military personnel in the Sverdlovsk Region during the 2023–2024 epidemic season. Genetic surveillance of circulating adenoviruses is essential for developing specific preventive measures, improving non-specific prevention methods, and identifying optimal drugs for aetiotropic therapy.

Актуальность проведенного исследования определяется высокой эпидемиологической значимостью аденовируса в структуре острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ), особенно среди военнослужащих. Установлено, что в 90% случаев у госпитализированных из организованных военных коллективов пациентов с внебольничной пневмонией идентифицировался аденовирус, вызывающий большой объем поражения легких, различные инвалидизирующие осложнения, возможные летальные исходы.

Цель исследования: изучение генетического разнообразия аденовирусов, обнаруженных у больных респираторными инфекциями военнослужащих в эпидемиологический сезон гриппа и ОРВИ 2023–2024 гг. в Свердловской области.

Материалы и методы. Проведено исследование 79 образцов клинического материала (назофарингеальные мазки), положительного на наличие аденовируса, с помощью метода фрагментного секвенирования по Сэнгеру. Материал был собран от военнослужащих с симптомами ОРВИ, находящихся на лечении в военно-медицинских организациях Свердловской области в период эпидсезона гриппа и ОРВИ 2023–2024 гг. (октябрь–февраль).

Результаты. Выявлено 6 геновариантов аденовируса: В3, В7, В14, В55, С2 и С5, при этом в большей степени определялся генотип В55, вызывающий тяжелое и средней степени тяжести течение болезни.

Заключение. Проведенное исследование дает представление о генетическом разнообразии аденовирусов, циркулирующих среди военнослужащих на территории Свердловской области в эпидсезоне 2023–2024 гг. Изучение генетических вариантов циркулирующих аденовирусов необходимо для разработки средств специфической профилактики заболевания, совершенствования методов неспецифической профилактики, поиска оптимальных препаратов для этиотропной терапии.

adenovirusmilitary personnelgenovariantspneumoniaВ55аденовирусвоеннослужащиегеновариантыпневмонияВ55Правительство Российской ФедерацииGovernment of the Russian Federation12104150044-2This study was not supported by any external sources of funding. The research was funded by the State budget as part of the federal project "Sanitary shield – health safety (prevention, detection, and response)", as well as as part of the research project "An integrated approach to studying the epidemiological and molecular-genetic characteristics of Influenza and ARVI in severe clinical forms during the period of mass vaccination" (No. 12104150044-2)Авторы заявляют об отсутствии внешнего финансирования при проведении исследования. Исследование выполнено за счет государственного бюджета в рамках федерального проекта «Санитарный щит – безопасность для здоровья (предупреждение, выявление, реагирование»), а также в рамках выполнения научно-исследовательской работы «Интегрированный подход к изучению эпидемиологических и молекулярно-генетических особенностей гриппа и ОРВИ при тяжелых клинических формах в период массовой вакцинопрофилактики» (рег. № 12104150044-2)Kharitonov M.A., Salukhov V.V., Kryukov E.V., Patsenko M.B., Rudakov Yu.V., Bogomolov A.B., et al. Viral pneumonia: a new look at an old problem (review). Meditsinskii sovet. 2021; (16): 60–77. https://doi.org/10.21518/2079-701X-2021-16-60-77 https://elibrary.ru/axladp (in Russian)Харитонов М.А., Салухов В.В., Крюков Е.В., Паценко М.Б., Рудаков Ю.В., Богомолов А.Б. и др. Вирусные пневмонии: новый взгляд на старую проблему (обзор литературы). Медицинский совет. 2021; (16): 60–77. https://doi.org/10.21518/2079-701X-2021-16-60-77 https://elibrary.ru/axladpPotter R.N., Cantrell J.A., Mallak C.T., Gaydos J.C. Adenovirus-associated deaths in US military during postvaccination period, 1999–2010. Emerg. Infect. Dis. 2012; 18(3): 507–9. https://doi.org/10.3201/eid1803.111238L’vov N.I. Adenovirus infection in military personnel: clinical presentation, diagnosis, and treatment: Diss. St. Petersburg; 2016. https://elibrary.ru/zqfulr (in Russian)Львов Н.И. Аденовирусная инфекция у военнослужащих: клиника, диагностика и лечение: Автореф. дисс. … д-ра мед. наук. СПб.; 2016. https://elibrary.ru/zqfulrAmosova I.V., Timoshicheva T.A., Egorova A.A., Musaeva T.D., Pisareva M.M., Eder V.A., et al. Genetic diversity of adenoviruses circulating among the military in the North-West region. Voprosy virusologii. 2017; 62(6): 283–7. https://doi.org/10.18821/0507-4088-2017-62-6-283-287 https://elibrary.ru/zuqevn (in Russian)Амосова И.В., Тимошичева Т.А., Егорова А.А., Мусаева Т.Д., Писарева М.М., Едер В.А. и др. Генетическое разнообразие аденовирусов, циркулирующих среди военнослужащих Северо-Западного региона. Вопросы вирусологии. 2017; 62(6): 283–7. https://doi.org/10.18821/0507-4088-2017-62-6-283-287 https://elibrary.ru/zuqevnKajon A.E., Lamson D.M., George K.S. Characterization of human adenoviruses of medical importance: isolation of infectious virus from clinical specimens and molecular typing. Curr. Protoc. 2023; 3(11): e916. https://doi.org/10.1002/cpz1.916Ukuli Q.A., Erima B., Mubiru A., Atim G., Tugume T., Kibuuka H., et al. Molecular characterisation of human adenoviruses associated with respiratory infections in Uganda. BMC Infect. Dis. 2023; 23(1): 435. https://doi.org/10.1186/s12879-023-08403-9Yatsyshina S.B., Ageeva M.R., Vorobieva N.S., Valdokhina A.V., Elkina M.A., Gorelov A.V., et al. Adenoviruses in the etiological structure of acute respiratory viral infection in Moscow in 2004–2014. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii. 2015; 92(5): 50–7. https://elibrary.ru/zqjyel (in Russian)Яцышина С.Б., Агеева М.Р., Воробьева Н.С., Валдохина А.В., Елькина М.А., Горелов А.В. и др. Аденовирусы в этиологической структуре острых респираторных вирусных инфекций в Москве в 2004–2014 гг. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015; 92(5): 50–7. https://elibrary.ru/zqjyelYu P., Ma C., Nawaz M., Han L., Zhang J., Du Q., et al. Outbreak of acute respiratory disease caused by human adenovirus type 7 in a military training camp in Shaanxi, China. Microbiol. Immunol. 2013; 57(8): 553–60. https://doi.org/10.1111/1348-0421.12074Potter R.N., Cantrell J.A., Mallak C.T., Gaydos J.C. Adenovirus-associated deaths in US military during postvaccination period, 1999–2010. Emerg. Infect. Dis. 2012; 18(3): 507–9. https://doi.org/10.3201/eid1803.111238Zhang Q., Seto D., Zhao S., Zhu L., Zhao W., Wan C. Genome sequence of the first human adenovirus type 14 isolated in China. J. Virol. 2012; 86(12): 7019–20. https://doi.org/10.1128/jvi.00814-12Dongliu Y., Guoliang Y., Haocheng X., Shuaijia Q., Li B., Yanglei J. Outbreak of acute febrile respiratory illness caused by human adenovirus B P14H11F14 in a military training camp in Shandong China. Arch. Virol. 2016; 161(9): 2481–9. https://doi.org/10.1007/s00705-016-2949-xKo J.H., Woo H.T., Oh H.S., Moon S.M., Choi J.Y., Lim J.U., et al. Ongoing outbreak of human adenovirus-associated acute respiratory illness in the Republic of Korea military, 2013 to 2018. Korean J. Intern. Med. 2021; 36(1): 205–13. https://doi.org/10.3904/kjim.2019.092Kim D., Lee E., Eom J., Kim Y., Kwon S.H., Oh H.S., et al. Prevalence and burden of human adenovirus-associated acute respiratory illness in the Republic of Korea military, 2013 to 2022. J. Korean Med. Sci. 2024; 39(4): e38. https://doi.org/10.3346/jkms.2024.39.e38Chen S.Y., Liu W., Xu Y., Qiu S., Chen Y., Tian X., et al. Epidemiology and genetic variabilities of human adenovirus type 55 reveal relative genome stability across time and geographic space in China. Front. Microbiol. 2020; 11: 606195. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.606195Lu G., Peng X., Li R., Liu Y., Wu Z., Wang X.., et al. An outbreak of acute respiratory infection at a training base in Beijing, China due to human adenovirus type B55. BMC Infect. Dis. 2020; 20(1): 537. https://doi.org/10.1186/s12879-020-05258-2Liu M.C., Xu Q., Li T.T., Wang T., Jiang B.G., Lv C.L., et al. Prevalence of human infection with respiratory adenovirus in China: A systematic review and meta-analysis. PLoS Negl. Trop. Dis. 2023; 17(2): e0011151. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011151Wu X., Zhang J., Lan W., Quan L., Ou J., Zhao W., et al. Molecular typing and rapid identification of human adenoviruses associated with respiratory diseases using universal PCR and sequencing primers for the three major capsid genes: penton base, hexon, and fiber. Front. Microbiol. 2022; 13: 911694. https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.911694Cheng Z., Yan Y., Jing S., Li W.G., Chen W.W., Zhang J., et al. Comparative genomic analysis of re-emergent human adenovirus type 55 pathogens associated with adult severe community-acquired pneumonia reveals conserved genomes and capsid proteins. Front. Microbiol. 2018; 9: 1180. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01180Zhang J., Ma K., Wang X., Jiang Y., Zhao S., Ou J., et al. Desmoglein 2 (DSG2) is a receptor of human adenovirus type 55 causing adult severe community-acquired pneumonia. Virol. Sin. 2021; 36(6): 1400–10. https://doi.org/10.1007/s12250-021-00414-7Hierholzer J.C., Pumarola A., Rodriguez-Torres A., Beltran M. Occurrence of respiratory illness due to an atypical strain of adenovirus type 11 during a large outbreak in Spanish military recruits. Am. J. Epidemiol. 1974; 99(6): 434–42. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.aje.a121632Heo J.Y., Noh J.Y., Jeong H.W., Choe K.W., Song J.Y., Kim W.J., et al. Molecular epidemiology of human adenovirus-associated febrile respiratory illness in soldiers, South Korea 1. Emerg. Infect. Dis. 2018; 24(7): 1221–7. https://doi.org/10.3201/eid2407.171222Yunkerov V.I., Grigor’ev S.G., Rezvantsev M.V. Mathematical and Statistical Processing of Medical Research Data [Matematiko-statisticheskaya obrabotka dannykh meditsinskikh issledovanii]. St. Petersburg: VMedA; 2011. https://elibrary.ru/xryzwx (in Russian)Юнкеров В.И., Григорьев С.Г., Резванцев М.В. Математико-статистическая обработка данных медицинских исследований. СПб.: ВМедА; 2011. https://elibrary.ru/xryzwxLiu T., Zhou Z., Tian X., Liu W., Xu D., Fan Y., et al. A recombinant trivalent vaccine candidate against human adenovirus types 3, 7, and 55. Vaccine. 2018; 36(16): 2199–206. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2018.02.050Tian X., Jiang Z., Fan Y., Qiu S., Zhang L., Li X., et al. A tetravalent vaccine comprising hexon-chimeric adenoviruses elicits balanced protective immunity against human adenovirus types 3, 7, 14 and 55. Antiviral Res. 2018; 154: 17–25. https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2018.04.001