Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology1680010.36233/0507-4088-346tmrweoORIGINAL RESEARCHESОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯResearch ArticleDifferentiation of vaccine strains and field isolates of bovine herpesvirus type 1 (Orthoherpesviridae: Varicellovirus)Дифференциация вакцинных штаммов и полевых изолятов герпесвируса крупного рогатого скота 1-го типа (Orthoherpesviridae: Varicellovirus)https://orcid.org/0000-0002-9712-3079PchelnikovAlexander V.ПчельниковАлександр Владимирович
Russian Federation

Doctor of Veterinary Sciences, Associate Professor, Associate Professor of the Department of Epizootology and Organization of Veterinary Medicine

д-р вет. наук, доцент, доцент кафедры эпизоотологии и организации ветеринарного дела

vetdr-mom@list.ruhttps://orcid.org/0000-0002-0426-9678YuzhakovAnton G.ЮжаковАнтон Геннадиевич
Russian Federation

Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher at the Interdepartmental Research Laboratory

канд. биол. наук, старший научный сотрудник научно-исследовательской межкафедральной лаборатории

anton_oskol@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0008-1851-8963MakhovaIrina A.МаховаИрина Александровна
Russian Federation

Laboratory assistant at the Interdepartmental Research Laboratory

лаборант научно-исследовательской межкафедральной лаборатории

makhovairinafvm@yandex.ruMoscow State Academy of Veterinary Medicine and Biotechnology – MVA named after K.I. SkryabinФГБОУ ВО «Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии – МВА имени К.И. Скрябина»3012202570655155804092025Copyright ©; 2025, Pchelnikov A.V., Yuzhakov A.G., Makhova I.A.Copyright ©; 2025, Пчельников А.В., Южаков А.Г., Махова И.А.2025Pchelnikov A.V., Yuzhakov A.G., Makhova I.A.Пчельников А.В., Южаков А.Г., Махова И.А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/16800

Introduction. Differentiation of vaccine strains and field isolates of bovine type 1 herpesvirus Varicellovirus bovinealpha1 is an urgent task to improve the quality of diagnosis of infectious bovine rhinotracheitis (IBR). There are several approaches to solve this problem. The most successful methods are those proposed by R.W. Fulton and S.K. Chothe in 2013 and 2018, respectively.

The aim of the study is to test the methods proposed by R.W. Fulton and S.K. Chothe to study the possibility of their optimization and implementation in routine laboratory diagnostics of IBR in Russia.

Materials and methods. 4 vaccine strains and 6 field isolates of the IBR virus were studied using PCR-based algorithms by R.W. Fulton and S.K. Chothe to determine the presence of single nucleotide substitutions at 11 control points of the virus genome in comparison with the nucleotide sequence of the reference strain Cooper JX898220.

Results. Both methods confirmed that the domestic strains of the IBR virus used for the production of inactivated vaccines originate from field isolates of the virus. Both the reference and modern epizootic isolates obtained by us and our colleagues at different times in Russia are epizootic strains that have no direct connection with the large-scale use of foreign vaccines, including live ones, both among our own indigenous livestock and among animals imported from abroad. None of the methods we tested allows us to distinguish between Varicellovirus bovinealpha1 and Varicellovirus bovinealpha5.

Conclusion. The methods proposed by R.W. Fulton (2013) and S.K. Chothe (2018) can be used to differentiate vaccine strains and field isolates of IBR virus only after our recommended preliminary differentiation of BoHV of types 1 and 5.

Введение. Дифференциация вакцинных штаммов и полевых изолятов герпесвируса крупного рогатого скота 1-го типа – Varicellovirus bovinealpha1 – актуальная задача для повышения качества диагностики инфекционного ринотрахеита крупного рогатого скота (ИРТ КРС). Имеется несколько подходов для решения этой задачи. Наиболее удачными являются методики, предложенные R.W. Fulton и S.K. Chothe в 2013 и 2018 гг. соответственно.

Цель исследования – отработка методик, предложенных R.W. Fulton и S.K. Chothe, для изучения возможности их оптимизации и внедрения в рутинную лабораторную диагностику ИРТ КРС в России.

Материалы и методы. Исследовали 4 вакцинных штамма и 6 полевых изолятов вируса ИРТ КРС с помощью молекулярно-генетических методов по алгоритмам R.W. Fulton и S.K. Chothe для выяснения наличия однонуклеотидных замен в 11 контрольных точках генома вируса в сравнении с нуклеотидной последовательностью референтного штамма Cooper JX898220.

Результаты. Применение обоих методов подтвердило, что отечественные штаммы вируса ИРТ КРС, используемые для производства инактивированных вакцин, имеют происхождение от полевых изолятов вируса. Как референтные, так и современные эпизоотические изоляты, полученные нами и нашими коллегами в разное время в России, являются эпизоотическими штаммами, которые не имеют прямой связи с масштабным применением зарубежных вакцин, в том числе живых, как среди собственного коренного скота, так и среди животных, ввезенных из-за границы. Ни один из опробованных нами методов не позволяет различить Varicellovirus bovinealpha1 и Varicellovirus bovinealpha5.

Заключение. Методики, предложенные R.W. Fulton (2013) и S.K. Chothe (2018), можно применять для дифференциации вакцинных штаммов и полевых изолятов вируса ИРТ КРС только после рекомендованной нами предварительной дифференциации герпесвирусов КРС 1-го и 5-го типов.

bovine herpes virusPCRdifferentiationvaccine strainfield isolateBoHV-1вирус герпеса крупного рогатого скотаПЦРдифференциациявакцинный штаммполевой изолятBoHV-1Russian Science FoundationРоссийский научный фонд25-26-00337Mayfield J.E., Good P.J., VanOort H.J., Campbell A.R., Reed D.E. Cloning and cleavage site mapping of DNA from bovine herpesvirus 1 (Cooper strain). J. Virol. 1983; 47(1): 259–64. https://doi.org/10.1128/JVI.47.1.259-264.1983Baumeister J., Klupp B.G., Mettenleiter T.C. Pseudorabies virus and equine herpesvirus 1 share a nonessential gene which is absent in other herpesviruses and located adjacent to a highly conserved gene cluster. J. Virol. 1995; 69(9): 5560–7. https://doi.org/10.1128/JVI.69.9.5560-5567.1995Henderson G., Zhang Y., Inman M., Jones D., Jones C. Infected cell protein 0 encoded by bovine herpesvirus 1 can activate caspase 3 when overexpressed in transfected cells. J. Gen. Virol. 2004; 85(Pt. 12): 3511–6. https://doi.org/10.1099/vir.0.80371-0Inman M., Zhou J., Webb H., Jones C. Identification of a novel bovine herpesvirus 1 transcript containing a small open reading frame that is expressed in trigeminal ganglia of latently infected cattle. J. Virol. 2004; 78(10): 5438–47. https://doi.org/10.1128/jvi.78.10.5438-5447.2004Lipińska A.D., Koppers-Lalic D., Rychłowski M., Admiraal P., Rijsewijk F.A., Bieńkowska-Szewczyk K., et al. Bovine herpesvirus 1 UL49.5 protein inhibits the transporter associated with antigen processing despite complex formation with glycoprotein M. J. Virol. 2006; 80(12): 5822–32. https://doi.org/10.1128/JVI.02707-05Winkler M.T., Doster A., Jones C. Persistence and reactivation of bovine herpesvirus 1 in the tonsils of latently infected calves. J. Virol. 2000; 74(11): 5337–46. https://doi.org/10.1128/jvi.74.11.5337-5346.2000Fulton R.W., d’Offay J.M., Eberle R. Bovine herpesvirus-1: comparison and differentiation of vaccine and field strains based on genomic sequence variation. Vaccine. 2013; 31(11): 1471–9. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2013.01.013Fulton R.W., d’Offay J.M., Dubovi E.J., Eberle R. Bovine herpesvirus-1: Genetic diversity of field strains from cattle with respiratory disease, genital, fetal disease and systemic neonatal disease and their relationship to vaccine strains. Virus Res. 2016; 223: 115–21. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2016.06.017Fulton R.W., d’Offay J.M., Eberle R., Moeller R.B., Campen H.V., O’Toole D., et al. Bovine herpesvirus-1: evaluation of genetic diversity of subtypes derived from field strains of varied clinical syndromes and their relationship to vaccine strains. Vaccine. 2015; 33(4): 549–58. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2014.11.033Fulton R.W., d’Offay J.M., Landis C., Miles D.G., Smith R.A., Saliki J.T., et al. Detection and characterization of viruses as field and vaccine strains in feedlot cattle with bovine respiratory disease. Vaccine. 2016; 34(30): 3478–92. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2016.04.020Chase C.C.L., Fulton R.W., O’Toole D., Gillette B., Daly R.F., Perry G., et al. Bovine herpesvirus 1 modified live virus vaccines for cattle reproduction: Balancing protection with undesired effects. Vet. Microbiol. 2017; 206: 69–77. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2017.03.016Chothe S.K., Sebastian A., Thomas A., Nissly R.H., Wolfgang D., Byukusenge M., et al. Whole-genome sequence analysis reveals unique SNP profiles to distinguish vaccine and wild-type strains of bovine herpesvirus-1 (BoHV-1). Virology. 2018; 522: 27–36. https://doi.org/10.1016/j.virol.2018.06.015Pchelnikov, A.V. Improvement and development of methods for the diagnosis and prevention of herpesvirus diseases in cattle: specialty 4.2.3. Infectious diseases and animal immunology: abstract of the dissertation for the degree of Doctor of Veterinary Sciences / Pchelnikov Alexander Vladimirovich. – Moscow, 2025. – 34 p.Пчельников, А.В. Совершенствование и разработка методов диагностики и профилактики герпесвирусных болезней крупного рогатого скота: специальность 4.2.3. Инфекционные болезни и иммунология животных: автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора ветеринарных наук / Пчельников Александр Владимирович. – Москва, 2025. – 34 с.