Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12279ArticlesСтатьиResearch ArticleGenetic characterization of the Batken virus (BKNV) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) isolated from the Ixodidae ticks Hyalomma marginatum Koch, 1844 and the mosquitoes Aedes caspius Pallas, 1771, as well as the Culex hortensis Ficalbi, 1889 in the Central AsiaГенетическая характеристика вируса Баткен (BKNV-Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии15042014592VOL 59, NO2 (2014)ТОМ 59, №2 (2014)333709062023Copyright ©; 2014, Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Lvov D.N., Lvov S.S., Samokhvalov E.I., Gitelman A.K., Botikov A.G., Krasnoslobodtsev K.G.Copyright ©; 2014, Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Львов Д.Н., Львов С.С., Самохвалов Е.И., Гительман А.К., Ботиков А.Г., Краснослободцев К.Г.2014Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Lvov D.N., Lvov S.S., Samokhvalov E.I., Gitelman A.K., Botikov A.G., Krasnoslobodtsev K.G.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Львов Д.Н., Львов С.С., Самохвалов Е.И., Гительман А.К., Ботиков А.Г., Краснослободцев К.Г.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12279

The prototype strain LEiV-K306 of the Batken virus (BKNV) was isolated from the ixodidae ticks Hyalomma marginatum Koch, 1844 collected from sheep near town Batken (Kirgizstan) in the April 1970. Later, the BKNV was isolated in Kirgizstan from the mixed pool of the Aedes caspius Pallas, 1771 and Culex hortensis Ficalbi, 1889 mosquitoes. From the very beginning, the BKNV was discussed to be very close to the Dhori virus (DHOV) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) isolated from the ixodidae ticks Hyalomma dromedarii Koch, 1844 in india. in this work, virtually complete genome sequence (Miseq, illumina) of the BKNV was determined (iD GenBank KJ396672-4). Structural and non-structural proteins of the BKNV have a high level of homology with DHOV - 98% (PB1) and 96% (PB2, PA, NP, M). Homology of HA protein between the BKNV and DHOV is 90%, which accounts for antigenic difference between these close relative viruses. Since the differences in the other structural and non-structural proteins are about 96-98%, the BKNV could be suggested as the topotypic DHOV strain for Central Asia, Transcaucasia, and Northern Caspian region. The evolution divergence of the BKNV and DHOV for HA could be explained by local ecologic peculiarities of the BKNV areal.

Методом полногеномного секвенирования (MiSeq, illumina) определена практически полная нуклеотидная последовательность генома вируса Баткен (BKNV - Batken virus) (iD GenBank KJ396672-4). Прототипный штамм LEiV-K306 BKNV изолирован от иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844, собранных с овец в окрестностях районного центра Баткен в Киргизии в апреле 1970 г. Впоследствии на территории Киргизии BKNV был изолирован из смешанного пула комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889. Ранее было установлено, что BKNV чрезвычайно близок к вирусу Дхори (DHOV - Dhori virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), впервые изолированному от иксодовых клещей Hyalomma dromedarii Koch, 1844 в Индии. В настоящей работе показано, что структурные и неструктурные белки BKNV обладают высоким уровнем гомологии с DHOV - 98% (PB1) и 96% (PB2, PA, NP, M). Уровень гомологии поверхностного гликопротеина HA у BKNV и DHOV составляет 90%, что объясняет антигенные различия между этими близкородственными вирусами. Поскольку гомология остальных структурных и неструктурных белков BKNV и DHOV составляет 96-98%, можно заключить, что BKNV является топотипным вариантом DHOV, характерным для Средней Азии, Закавказья и Северного Прикаспия. Эволюционное расхождение BKNV и DHOV по поверхностному гликопротеину, вероятно, связано с локальными экологическими особенностями ареала BkNv.

OrthomyxoviridaeThogotovirusDHOVIxodidaeCulicinaeOrthomyxoviridaeThogotovirusBatken virus (BKNV)Dhori virus (DHOV)ticksIxodidaemosquitoesCulicinaeharesbirdspasture biocenosisCentral AsiaTranscaucasiaNorthern Caspian regionmetag-enomic analysis complete genome sequencingвирус Баткен, BKNVвирус Дхориэнцефалитик-содовые клещикомарызайцыптицыпастбищные биоценозыСредняя АзияЗакавказьеСеверный Прикаспийметагеномный анализполногенемное секвени-рованиеLvov D.K., Karas F.R., Tsyrkin G.M., Vargina S.G., Timofeev E.M., Osipova N.Z. et al. Batken virus, a new arbovirus isolated from ticks and mosquitoes in Kirghis SSR. Arch. Ges. Virusforschung. 1974; 44 (1): 70-3.Batken (BKNV). In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): Am. Soc. Trop. Med. Hyg.; 1985: 223-4.Карась Ф.З. Арбовирусы Киргизии. В кн.: Гайдамович С.Я., ред. Арбовирусы. М.; 1978; вып. 3: 40-4.Frese M., Weeber M., Weeber F, Speth V, Haller O. MX1 sensitivity of Batken viruses - an Orthomyxovirus. J. Gen. Virol. 1997; 78 (10): 2453-8.Kawaoka Y., Cox N.J., Haller O., Hongo S., Kaverin N., Klenk H.D. et al. Family Orthomyxoviridae. In: Fauquet C.M., Mayo M.A., Ma-niloff J., Desselberger U., BallL.A., eds. Virus taxonomy. 8th Report of the International committee on taxonomy of viruses. Amsterdam: Elsevier Academic Press; 2005: 681-93.Anderson C.R. Recent advances in arthropod-borne virus research in India. Bull. Inst. Sci. India. 1963; 24: 205-16.Dhori (DHOV). In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): Am. Soc. Trop. Med. Hyg.; 1985: 371-2.McCauley J.W., Hongo S., Kaverin N.V, Kochs G., Lamb R.A., Matrosovich M.N. et al. Orthomyxoviridae. In: King A.M.Q., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., ed. Virus taxonomy. 9th ed. London: Elsevier Academic Press; 2012 : 749-61.Львов Д.Н., Львов С.С. Тоготовирусные энцефалиты. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 786-9.Львов Д.К. Экология вирусов. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 66-86.Jupp P.G. Arboviral zoonoses in Africa. In: Beran G.W., Steel J.H., eds. Handbook of zoonoses. Section B: Viral. Boca Raton: CRC Press; 1994: 262-73.Williams R.E., Hoogstraal H., Casals J., Kaiser M.N., Moussa M.I. Isolation on Wanowrie, Thogoto, and Dhori viruses from Hyalomma ticks infecting camels in Egypt. J. Med. Entomol. 1973; 10 (2): 143-6.Da Silva E.V., Da Rosa A.P., Nunes M.R., Diniz J.A., Tesh R.B., Cruz A.C. et al. Araguari virus, a new member of the family Orthomyxo-viridae: serologic, ultrastructural, and molecular characterization. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2005; 73 (6): 1050-8.Moore D.L., Causey O.R., Carey D.E., Reddy S., Cooke A.R., Akinkugbe F.M. et al. Arthropod-borne viral infections of man in Nigeria, 1964-1970. Ann. Trop. Med. Parasitol. 1975; 69 (1): 49-64.Бутенко А.М., Лещинская Е.В., Семашко И.В., Донец М.А.,Мартьянова Л.И. Вирус Дхори - возбудитель заболевания человека, пять случаев лабораторной инфекции. Вопросы вирусологии. 1987; 32 (6): 724-9.Львов Д.К.,Дерябин П.Г.,Аристова В.А.,Бутенко А.М., Галкина И.В., Громашевский В.Л. и др. Атлас распространения возбудителей природно-очаговых вирусных инфекций на территории Российской Федерации. М.: МЗ РФ; 2001.Щелканов М.Ю., Громашевский В.Л., Львов Д.К. Роль экологовирусологического районирования в прогнозировании влияния климатических изменений на ареалы арбовирусов. Вестник РАМН. 2006; 2: 22-5.Аристова В.А., Колобухина Л.В., Щелканов М.Ю., Львов Д.К. Экология вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки и особенности клиники на территории России и сопредельных стран. Вопросы вирусологии. 2001; 4 : 7-15.Lvov D.K. Arboviral zoonoses on Northern Eurasia (Easter Europe and the Commonwealth of Independent States). In: Beran G.W., Steel J.H., eds. Handbook of zoonoses. Section B: Viral. Boca Raton: CRC Press; 1994: 237-60.Смирнова С.Я., Скворцова Т.М., Седова А.Г., Зимина Ю.В.,Львов Д.К. О вновь выделенных штаммах вируса Баткен. Вопросы вирусологии. 1988; 33 (3): 360-2.Бутенко А.М., Чумаков М.П. Выделение нового для СССР арбо-вируса «Астра» из клещей H. plumbeum и комаров An. hyrcanus в Астраханской области. В кн.: Вопросы медицинской вирусологии. 1971; ч. 2 : 11-2.Львов Д.Н., Джаркенов А.Ф., Аристова В.А., Ковтунов А.И., Громашевский В.Л., Вышемирский О.И. и др. Изоляция вирусов Дхори (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) и Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Bunyaviridae, Nairovirus) от зайца (Lepus europaeus) и собранных с него клещей Hyalomma marginatus в средней зоне дельты Волги, Астраханская область, 2001 г. Вопросы вирусологии. 2002; 47 (4): 32-6.Яшкулов К.Б., Щелканов М.Ю., Львов С.С., Джамбинов С.Д., Галкина И.В., Федякина И.Т. и др. Изоляция вирусов гриппа А (Orthomyxoviridae, Influenza A virus), Дхори (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) и болезни Ньюкасла (Paramyxoviridae, Avulavirus) на о. Малый Жемчужный в северо-западной части акватории Каспийского моря. Вопросы вирусологии. 2008; 53 (3): 34-8.Львов Д.К., ред. Организация эколого-эпидемиологического мониторинга территории Российской Федерации с целью противоэпидемической защиты населения и войск. Методические рекомендации. М.: МЗ РФ, Федеральное Управление медикобиологических и экстремальных проблем, НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН; 1993.