Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12275ArticlesСтатьиResearch ArticleTaxonomic status of the Artashat virus (ARTSV) (Bunyaviridae, Nairovirus) isolated from the ticks Ornithodoros alactagalis Issaakjan, 1936 and O. verrucosus Olenev, Sassuchin et Fenuk, 1934 (Argasidae Koch, 1844) collected in TranscaucasiaTaxonomic status of the Artashat virus (ARTSV) (Bunyaviridae, Nairovirus) isolated from the ticks Ornithodoros alactagalis Issaakjan, 1936 and O. verrucosus Olenev, Sassuchin et Fenuk, 1934 (Argasidae Koch, 1844) collected in Transcaucasia15062014593VOL 59, NO3 (2014)ТОМ 59, №3 (2014)242809062023Copyright ©; 2014, Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Gitelman A.K., Botikov A.G., Samokhvalov E.I., Zakaryan V.A.Copyright ©; 2014, Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К., Ботиков А.Г., Самохвалов Е.И., Закарян В.А.2014Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Gitelman A.K., Botikov A.G., Samokhvalov E.I., Zakaryan V.A.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К., Ботиков А.Г., Самохвалов Е.И., Закарян В.А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12275

The Artashat virus (ARTSV) was originally isolated from the Ornithodoros alactagalis Issaakjan, 1936 (Argasidae Koch, 1844), which were collected in the burrow of small five-toed jerboa (Allactaga elater Lichtenstein, 1825) in Armenia in 1972. Later, the ARTSV was isolated from the O. verrucosus Olenev, Sassuchin et Fenuk, 1934 collected in the burrows of Persian gerbil (Meriones persicus Blanford, 1875) in Azerbaijan. Based on the virion morphology, the ARTSV was assigned to the Bunyaviridae viruses. In this work, the ARTSV genome was partially sequenced (GenBank ID: KF801650) and it was shown that the ARTSV is a new member of the Nairovirus genus. ARTSV has from 42% (Issyk-Kul virus) to 58% (Raza virus, Hughes group) similarity with the nairoviruses for nucleotide sequence of part of RNA-dependent RNA-polymerase (RdRp). The similarity on the amino acid level is 65-70%. Low level of homology and the equidistant position of the ARTSV on phylogenetic tree indicate that the ARTSV is a new prototype species of the Nairovirus genus (Bunyaviridae) forming a separate phylogenetic branch.

Вирус Арташат (ARTSV - Artashat virus) выделен от клещей Ornithodoros alactagalis issaakjan, 1936 (Argasidae Koch, 1844), собранных в норе малого тушканчика (Allactaga elater Lichtenstein, 1825) в Армении в 1972 г. Позднее ARTSV был изолирован от O. verrucosus Olenev, Sassuchin et Fenuk, 1934 из нор персидской песчанки (Meriones persicus Blanford, 1875) в Азербайджане. На основании морфологии вириона ARTSV отнесен к группе неклассифицированных буньявирусов сем. Bunyaviridae. В настоящей работе геном ARTSV (GenBank iD: KF801650) частично секвенирован. Уровень гомологии ARTSV с известными наи-ровирусами составляет от 42% (с вирусом Иссык-Куль) до 58% (с вирусом Раза, группа Хьюз) по нуклеотидной последовательности каталитического центра РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp). Гомология с наировирусами по аминокислотной последовательности ARTSV в среднем 65-70%. Низкий уровень гомологии ARTSV и его равноудаленное положение от остальных наировирусов позволяют классифицировать ARTSV как новый прототипный вид в составе рода Nairovirus, который образует самостоятельную антигенную и филогенетическую группу.

BunyaviridaeNairovirusArgasidaeOrnithodoros alactagalisOrnithodoros verrucosusBunyaviridaeNairovirusArtashat virus (ARTSV)burrow-shelter biocenosesArgasidaeOrnithodoros alactagalisOrnithodoros verrucosusjerboasandpiperTranscaucasiaArmeniaAzerbaijanmetag-enomic analysisвирус Арташат - ARTSVноровоубежищные биоценозытушканчикипесчанкиЗакавказьеАрменияАзербайджанметагеномный анализЛьвов Д.К., Альховский С.В., Щетинин А.М., Щелканов М.Ю. Буньявирусы (Bunyaviridae). В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 279-98.Львов Д.К., Тимофеева А.А., Громашевский В.Л. Новые арбови-русы, изолированные в СССР в 1969-1977 гг. В кн. : Материалы 18-й научной сессии Института полиомиелита и вирусных энцефалитов АМН СССР. М.; 1975: 322-4.Lvov D.K. Arboviral zoonoses of Northern Eurasia (Eastern Europe and the Commonwealth of Independent States). In: Beran G.W., ed. Handbook of zoonoses. Section B: Viral. Boca Raton, London, Tokyo: CRC Press; 1994 : 237-60.Lvov D.K. Arboviruses in the USSR. In: Vesenjak-Hirjan J., ed. Arboviruses in the Mediterranean Countries. Stuttgart, New York: Gustav Fischer Verlag.; Zbl. Bakt. 1980; (S 9): 35-48.Lvov D.K. Natural foci of arboviruses in the USSR. In: Sov. Med. Rev. Virol. UK: Harwood Ac. Publ. GmbH; 1987; vol. 1: 153-96.Львов Д.К. Арбовирусные инфекции в субтропиках и на юге умеренного пояса в СССР В кн.: Львов Д.К., Клименко С.М., Гайдамович С.Я., ред. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. М.: Медицина; 1989: 235-49.Lvov D.K. Ecological sounding of the USSR territory for natural foci of arboviruses. In: Sov. Med. Rev. Ser E: Virology Reviews. USA: Harwood Ac. Publ. GmbH; 1993; 5: 1-47.Шахназаров С.А., Оганесян А.С., Манукян Д.В., Алексанян Ю.Т., Иванидзе Э.А., Мачавариани Р.З., Бариабишвили М.О. Выделение арбовирусов на территории Республики Армения. В кн.: Львов Д.К., ред. Итоги науки и техники. Серия: Вирусология. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. М.: АН СССР; 1992; т. 27, ч. 1: 57-60.Львов Д.К. Природные очаги связанных с птицами арбовирусов СССР. В кн.: Львов Д.К., Ильичев В.Д., ред. Миграции птиц и перенос возбудителей инфекции. М.: Наука; 1979: 37-101.Львов Д.К., Дерябин П.Г., Аристова В.А., Бутенко А.М., Галкина И.В., Громашевский В.Л. и др. Атлас распространения возбудителей природно-очаговых вирусных инфекций на территории Российской Федерации. М.: МЗ РФ; 2001.Щелканов М.Ю., Громашевский В.Л., Львов Д.К. Роль экологовирусологического районирования в прогнозировании влияния климатических изменений на ареалы арбовирусов. Вестник РАМН. 2006; 2: 22-5.Львов Д.К., ред. Организация эколого-эпидемиологического мониторинга территории Российской Федерации с целью противоэпидемической защиты населения и войск: Методические рекомендации. М.: МЗ РФ, Федеральное Управление медикобиологических и экстремальных проблем, НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН; 1993.Филиппова Н.А. Аргасовые клещи (Argasidae). Фауна СССР. М., Л.: АН СССР; 1966: т. 4, вып. 3: Паукообразные.Plyusnin A., Beaty B. J., Elliot R.M., Goldbach R., Kormelink R., Lundkvist A. et al. Family Bunyaviridae. In: King A.M., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy: 9th Report of the International committee of taxonomy of viruses. London: Elsevier; 2012: 725-41.Dilcher M., Koch A., Hasib L., Dobler G., Hufert F.T., Weidmann M. Genetic characterization of Erve virus, a European Nairovirus distantly related to Crimean-Congo hemorrhagic fever virus. Virus Genes. 2012; 45 (3): 426-32.Honig J.E., Osborne J.C.Nichol S.T. The high genetic variation of viruses of the genus Nairovirus reflects the diversity of their predominant tick hosts. Virology. 2004; 318 (1): 10-6.Woessner R., Grauer M. T., Langenbach J., Dobler G., Kroeger J., Mielke H. G. et al. The Erve virus: possible mode of transmission and reservoir. Infection. 2000; 28 (3): 164-6.Chastel C., Main A. J., Richard P., Le Lay G., Legrand-Quillien M.C., Beaucournu J.C. Erve virus, a probable member of Bunyaviridae family isolated from shrews (Crocidura russula) in France. Acta Virol. 1989; 33 (3): 270-80.