Problems of Virology

Вопросы вирусологии

0507-40882411-2097

Central Research Institute for Epidemiology

12267

Articles

Статьи

Research Article

Molecular-genetic characterization of the Okhotskiy virus (OKHV) and Aniva virus (ANIV) (Orbivirus, Reoviridae) isolated from the ticks Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852 in High Latitudes of the Northern Eurasia

Молекулярно-генетическая характеристика вирусов Охотский (OKHV-Okhotskiy virus) и Анива (ANIV-Aniva virus) (Reoviridae, Orbivirus), изолированных в высоких широтах Северной Евразии из облигатных эктопаразитов чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820) - клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852

15042014

592

VOL 59, NO2 (2014)

ТОМ 59, №2 (2014)

222809062023

2014

Lvov D.K., Alkhovsky S.V., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Gitelman A.K., Samokhvalov E.I., Botikov A.G.

Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К., Самохвалов Е.И., Ботиков А.Г.

https://creativecommons.org/licenses/by/4.0

https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12267

Molecular-genetic characteristics of the Okhotskiy virus (OKHV) and Aniva virus (ANiV) were studied (iD GenBank KF981623-32). These viruses are distributed over the shelf and island areas in the high latitudes in the Okhotsk, Bering, and Barents seas and linked with nesting colonies of Alcidae seabirds and their obligatory parasites, the Ixodes uriae (Ixodidae) ticks. OKHV and ANiV are observed to be independent species within the limits of the Great island virus (GiV) group of the Orbivirus genus of the Reoviridae family. The majority of the genes of OKHV and ANiV have high homology (VP1 - 96%, Т2 - 99%, VP7 (T13) - 98%, NS1 - 94%, NS2 - 98%, NS3 - 72%, VP6 - 93%). Nevertheless, the envelope proteins containing the main specific antigenic determinants (VP2 and VP5) of OKHV and ANiV are sufficiently different (62% and 68% homology for amino acid sequences, respectively).

Изучены молекулярно-генетические характеристики вирусов Охотский (OKHV - Okhotskiy virus) (iD Gen Bank KF981623-32) и Анива (ANiV - Aniva virus), ареал распространения которых охватывает в высоких широтах шельфовые и островные территории бассейнов Охотского, Берингова и Баренцева морей. Вирусы экологически связаны с гнездовьями чистиковых (Alcidae) птиц и их облигатными паразитами клещами Ixodes uriae (Ixodidae). OKHV и ANiV являются самостоятельными видами в составе группы Грейт-Айленд (GiV - Great island virus) рода Orbivirus сем. Reoviridae. Большинство генов OKHV и ANiV имеют между собой высокий уровень гомологии (VP1 96%; Т2 99%; VP7 (T13) 98%; NS1 94%; NS2 98%; NS3 72%; VP6 93%). Но поверхностные белки, несущие основные видоспецифические антигенные детерминанты (VP2 и VP5), у OKHV и ANiV существенно различаются (62 и 68% гомологии по аминокислотным последовательностям соответственно).

ReoviridaeOrbivirusOKHVANIVKEMVGIVAlcidaeIxodidaeIxodes (Ceratixodes) uriaeReoviridaeOrbivirusOkhotskiy virus (OKHV)Aniva virus (ANIV)Kemerovo virus (KEMV)Great Island virus (GIV)high latitudescolonial seabirdsAlcidaeIxodidaeIxodes (Ceratixodes) uriaeOkhotsk seametagenomic analysis

вирус Охотскийвирус Анивавирус Кемерововирус Грейт-Айлендвысокие широтыколониальные морские птицыОхотское мореметагеномный анализ

Lvov D.K., Timofeeva A.A., Gromashevski V.L., Tsyrkin Y.M., Veselovskaya O.V., Gostinshchikova G.V et al. “Okhotskiy” virus, a new arbovirus of the Kemerovo group isolated from Ixodes (Ceratix-odes) putus Pick.-Camb. 1878 in the Far East. Arch. Ges. Virusforschung. 1973; 41 (3): 160-4.

Тимофеева А.А., Погребенко А.Г., Громашевский В.Л., Щербина Р.Д., Евсеева Т.И., Львов Д.К., Сазонов А.А. Очаговость природных инфекций на острове Ионы в Охотском море. Зоологический журнал. 1974; 53 (6): 306-11.

Okhotskiy virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 759-60.

Львов С.Д. Арбовирусы в высоких широтах. В кн.: Львов Д.К., Клименко С.М., Гайдамович С.Я., ред. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. М.: Медицина; 1989: 269-89.

Lvov S.D., Gromashevsky V.L., Andreev V.P. Natural foci of arboviruses in far northern latitudes of Eurasia. In: Calisher C.H., ed. Hemorrhagic fever with renal syndrome tick- and mosquito-borne viruses. Arch. Virol. 1991; Suppl. 1: 267-75.

Lvov S.D. Natural virus foci in high latitudes of Eurasia. In: Sov. Med. Rev. Sec. E: Virol. Rev. Harwood (USA): Ac. Publ. GmbH; 1993; vol. 3: 137-85.

Lvov D.K. Arboviral zoonoses of Northern Eurasia (Eastern Europe and the Commonwealth of Independent States). In: Beran G.W., ed. Handbook of zoonoses. Section B: Viral. Boca Raton, London, Tokyo: CRC Press; 1994: 237-60.

Львов Д.К. Природные очаги связанных с птицами арбовирусов СССР. В кн.: Львов Д.К., Ильичев В.Д. Миграции птиц и перенос возбудителей инфекции. М.: Наука; 1979: 37-101.

Lvov D.K., Gromashevski V.L., Skvortsova T.M., Berezina L.K., Gofman Y.P., Zhdanov V.M. et al. Arboviruses of high latitudes in the USSR. In: Kurstak E., ed. Arctic and tropical arboviruses. New York, San-Francisco. London: Harcourt Brace Jovanovich Publ.; 1979: 21-38.

10.

Lvov D.K., Timofeeva A.A., Smirnov V.A., Gromashevsky V.L., Sidorova G.A., Nikiforov L.P. et al. Ecology of tick-borne viruses in colonies of birds in the USSR. Med. Biol. 1975; 53 (5): 325-30.

11.

Львов Д.К. Экология вирусов. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и жтвотных. Москва: МИА; 2013: 66-86.

12.

Bauline virus. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 225-6.

13.

Cape-Wrath virus. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 305-6.

14.

Great Island virus. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 429-30.

15.

Mykines virus. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 721-2.

16.

Nugget virus. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 753-4.

17.

Tindholmur virus. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 1021-2.

18.

Yakina Head virus. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses and some other viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 1109-10.

19.

Attoui H., Mertens P.C., Becnel J., Belaganahalli S., Bergoin M., Brussaard C.P. et al. Family Reoviridae. In: King A.M.Q., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy. 9th report of the International committee on taxonomy of viruses. London, San Diego: Elsevier Science; 2012: 541-637.

20.

Thompson J. D., Higgins D. G.Gibson T. J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucl. Acids Res. 1994; 22 (22): 4673-80.

21.

Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28 (10): 2731-9.

22.

Zumpt F. The ticks of seabirds. Austr. Nat. Antarc. Res. Exped. Rep. 1952; 1 (1): 12-20.

23.

Roberts F.H.S. Australian ticks. Commonwealth Sci. Industr. Res. Organ. Melbourne (Australia): 1970.

24.

Белопольская М.М. Паразитофауна морских птиц. В кн.: Ученые записки Ленинградского государственного университета. Серия: Биология. 1952; 141 (28): 127-80.

25.

Arthur D.R. British ticks. London: Butterworths; 1963.

26.

Bequaert J.C. The ticks, or Ixodoidea, of the northeastern United States and eastern Canada. Entom. Am. 1946; 24: 73-120.

27.

Clifford C.M., Yunker C.E., Easton E.R., Keirans J.E. Ectoparasites and other arthropods from coastal Oregon. J. Med. Entomol. 1970; 7 (4): 438-45.

28.

Флинт В.Е., Костырко И.Н. О биологии клеща Ixodes putus Pick.-Camb. Зоологический журнал. 1967; 66 (8): 1253-6.

29.

Филиппова Н.А. Фауна СССР. Л.: Наука; 1977; 4 (4): Паукообразные. Иксодовые клещи подсем. Ixodinae.

30.

Artsob H., Spence L. Arboviruses in Canada. In: Kurstak E., ed. Arctic and tropical arboviruses. New York, San-Francisco, London: Harcourt Brace Jovanovich Publ.; 1979: 39-65.

31.

Львов Д.К., ред. Организация эколого-эпидемиологического мониторинга территории Российской Федерации с целью противоэпидемической защиты населения и войск. Методические рекомендации. М.: МЗ РФ, Федеральное Управление медикобиологических и экстремальных проблем, НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского рАМН; 1993.

32.

Львов Д.К., Дерябин П.Г., Аристова В.А., Бутенко А.М., Галкина И.В., Громашевский В.Л. и др. Атлас распространения возбудителей природно-очаговых вирусных инфекций на территории Российской Федерации. М.: МЗ РФ; 2001.

33.

Щелканов М.Ю., Громашевский В.Л., Львов Д.К. Роль экологовирусологического районирования в прогнозировании влияния климатических изменений на ареалы арбовирусов. Вестник РАМН. 2006; 2: 22-5.