Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12253ArticlesСтатьиResearch ArticleEvolution of Influenza A(H3N2) virus from 2007 to 2012Эволюционная изменчивость вируса гриппа A(H3N2) в период 20072012 гг15122013586VOL 58, NO6 (2013)ТОМ 58, №6 (2013)273109062023Copyright ©; 2013, Siluyanova E.V., Alkhovskiy S.V., Shevchenko E.S., Ivanova V.T., Oskerko T.A., Kolobukhina L.V., Merkulova L.N., Vartanyan R.V., Burtseva E.I.Copyright ©; 2013, Силуянова Э.В., Альховский С.В., Шевченко Е.С., Иванова В.Т., Оскерко Т.А., Колобухина Л.В., Меркулова Л.Н., Вартанян Р.В., Бурцева Е.И.2013Siluyanova E.V., Alkhovskiy S.V., Shevchenko E.S., Ivanova V.T., Oskerko T.A., Kolobukhina L.V., Merkulova L.N., Vartanyan R.V., Burtseva E.I.Силуянова Э.В., Альховский С.В., Шевченко Е.С., Иванова В.Т., Оскерко Т.А., Колобухина Л.В., Меркулова Л.Н., Вартанян Р.В., Бурцева Е.И.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12253

The results of the genetic studies of influenza viruses make it possible to understand their evolution and recommendations for vaccine strains content. In this work, the data of complete sequence of the На, NA, and M2-protein for 34 strains of influenza A(H3N2) virus circulating in russia during 2007-2012 are presented. the influenza strains were isolated in ivanovsky institute of Virology, Moscow, and some collaborating russian centers. the results of the phylogenetic analysis showed the differences among strains, which were observed during the analyzed period; the evolution had direction from A/Brisbane/10/2007 to A/Perth/16/2009 and А/ Victoria/208/2009. hemagglutinin of the influenza A(H3N2) virus strains had differences between strains of last two seasons and strains circulating before, in the antigenic sites A, B, D, and, to a lesser extent, c, and E. in the neuraminidase gene the mutations responsible for the resistance to oseltamivir (E119V, R292K, N294s) and zanamivir (Q136K) were not found. All isolates carry the s31N mutation in the M2 gene responsible for resistance to amantadine.

Результаты молекулярно-генетических исследований вирусов гриппа способствуют пониманию их эволюционной изменчивости, а также определяют выбор вакцинных штаммов. в статье представлена полная последовательность гемагглютинина (НА), нейраминидазы (NA) и M-белка 34 штаммов вируса гриппа A(H3N2), циркулировавших на территории РФ с 2007 по 2012 г. Штаммы были выделены в НИИ вирусологии им. Д.и. ивановского (Москва) и сотрудничающих с ним городах России. Данные филогенетического анализа выявили различия штаммов, которые произошли в анализируемый период: эволюция шла последовательно от А/Брисбен/10/2007 к А/перт/16/2009, а затем к А/виктория/208/2009. На штаммов вируса гриппа A(H3N2) последних двух эпидемических сезонов имел отличия от штаммов предыдущих сезонов в антигенных сайтах A, B, D и в меньшей степени в сайтах c и Е. в гене Па мутаций, отвечающих за устойчивость к озельтамивиру (Е1 19V, R292K, N294s) и занамивиру (Q136K), не обнаружено. в гене M2 все изоляты несли мутацию s31N, отвечающую за устойчивость к ремантадину.

Influenza virus A(H3N2)gene hemagglutiningene neuraminidasegene protein Mevolutionary dynamics of Influenza virusвирус гриппа A(H3N2)ген гемагглютининаген нейраминидазыген белка Mэволюционные динамики вируса гриппаБурцева Е.И., Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Прилипов А.Г., Альховский С.В., Львов Д.К. Анализ результатов надзора, лабораторной диагностики и выделения штаммов вирусов гриппа в базовых лабораториях ЦЭЭГ в период 2009-2011 гг. В кн.: Сборник статей и тезисов «Грипп: эпидемиология, профилактика и лечение», СПб.; 2011: 12-6.Киселев О.И. Грипп и гриппоподобные инфекции. Бюллетень пленарного заседания Проблемной комиссии РАМН. СПб., 2010.Киселев О.И. Геном пандемического вируса гриппа A/H1N1v-2009. М.: Димитрейд График Групп; 2011.Лукашов В.В. Молекулярная эволюция и филогенетический анализ. М.: Бином; Лаборатория знаний; 2009.Bhatt Samir, Holmes Edward C., Pybus Oliver G. The genomic rate of molecular adaptation of the human influenza a virus. Mol. Biol. Evol. J. 2011; 28(9): 2443-51.Bouvier N. M., Palese P. The biology of influenza viruses. Vaccine J. 2008; 26: 49-53.Byarugaba D. K., Ducatez M. F., Erima B., Mworozi E. A., Millard M., KibuukaH. et al. Molecular epidemiology of influenza A/H3N2 viruses circulating in Uganda. PLoS O 2011; 6(11): e 27803.Davies H.W., Appleyard G., Cunnighan P., Pereira M.S. The use of continuous cell line for the isolation of influenza virus. Bull. WHO. 1978; 56: 1991-3.Dapat I. C., Dapat C., Baranovich T., Suzuki Y., Kondo H., Shobugaw Y. et al. Genetic сharacterization of human Influenza viruses in the pandemic (2009-2010) and post-pandemic (2010-2011) periods in Japan. PLoS ONE J. 2012; 124: 15-22.Harper S., Klimov A., Uyeki T., Fukuda K. Influenza. Clin. Lab. Med. J. 2002; 885: 863-82.McCauley J., Daniels R., Lin Yi Pu., Zheng X., Gregory V., Whittaker L. et al. Report prepared for the WHO annual consultation on the composition of influenza vaccine for the Northern Hemisphere (14th-17th February 2011). London; 2011. vol. 70. URL: http://www.nimr.mrc. ac.uk/who-influenza-centre/annual-and-interim-reports/McCauley J., Daniels R., Lin Yi Pu, Zheng X., Gregory V., Whittaker L. et al. Report prepared for the WHO annual consultation on the composition of influenza vaccine for the Northern Hemisphere” (20th-22nd February 2012). London; 2012. vol. 70. URL: http://www.nimr.mrc. ac.uk/who-influenza-centre/annual-and-interim-reports/Nicholls H. Pandemic influenza: the inside story. PLoS Boil. J. 2006; 4: 0156-60.Nelson M. I., Holmes E. C. The evolution of epidemic influenza. Nat. Rev. genet. 2007; 8(3): 196-205.