Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12248ArticlesСтатьиResearch ArticleThe taxonomy of the Baku virus (BAKV; Reoviridae, Orbivirus) isolated from the birds obligate parasites Argasidae ticks in Azerbaijan, Turkmenistan, and UzbekistanТаксономия вируса Баку (BAKV–Baku virus; Reoviridae, Orbivirus), изолированного из облигатных паразитов птиц –аграсовых клещей (Acari: Argasidae) в Азербайджане, Туркменистане и Узбекистане15122013586VOL 58, NO6 (2013)ТОМ 58, №6 (2013)222609062023Copyright ©; 2013, Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Gitelman A.K., Botikov A.G., Samokhvalov E.I.Copyright ©; 2013, Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К., Ботиков А.Г., Самохвалов Е.И.2013Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Gitelman A.K., Botikov A.G., Samokhvalov E.I.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К., Ботиков А.Г., Самохвалов Е.И.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12248

The Baku virus (BAKV) was originally isolated from the ticks Ornithodoros capensis Neumann, 1901 (Acari: Argasidae) collected from the seagull (Larus argentatus) seating nests on the islands of the Baku archipelago, the Caspian sea. BAKV was assigned to Kemerovo group (KEMV) (Orbivirus, Reoviridae). The BAKV was frequently isolated from the ticks O. coniceps Canestrini, 1980, collected from L. argentatus and tern (Sterna hirundo) nests in Turkmenia and pigeon (Columba livia neglecta) nests in Uzbekistan. in this work, the genome of the BaKv was sequenced using the next-generation sequencing technology. The BAKV Pol protein has 48.6% identity level with the viruses of the Great island Virus group and at average 41% with non-tick orbiviruses. The BAKV T2 protein level identity with the orbiviruses ranges from 23.7% to 64.8%. The maximum identity level of the T2 protein (64.8%) is observed for the tick-borne viruses of the GiV (KEMV) group. According to the conducted molecular-genetic and phylogenetic analysis, the BAKV is a novel species of the genus Orbivirus. it forms a phylogenetic group distinctly related to the GiV group.

Вирус Баку (BAKV - Baku virus) был выделен из клещей Ornithodoros capensis Neumann, 1901 (Acari: Argasidae), собранных весной и летом 1970 г. в гнездовье серебристых чаек Larus argentatus на островах Бакинского архипелага в Каспийском море, и отнесен к комплексу вируса Кемерово (KEMV), род Orbivirus сем. Reoviridae. Позднее BAKV многократно изолировали из клещей O. coniceps Canestrini, І980, собранных в гнездовьях чаек L. argentatus и крачек Sterna hirundo в Туркмении и норовых гнездовьях голубей Columba livia neglecta в предгорьях Чаткальского хребта Западного Тянь-Шаня (Ташкентский район, Узбекистан). В настоящей работе геном прототипного штамма BAKV LEiV-Azn46 был секвенирован de novo с использованием технологии полногеномного секвенирования (next-generation sequencing). Установлено, что белок Pol BAKV имеет 48,6% идентичности с вирусами группы GiV и в среднем 41% с неклещевыми орбивирусами. Идентичность белка Т2 BAKV с орбивирусами составляет от 23,7 до 64,8%. Наибольший уровень (64,8%) идентичности по белку Т2 BAKV имеет с клещевыми вирусами группы GiV (KEMV). На основании проведенного молекулярно-генетического и филогенетического анализа показано, что BAKV является новым видом орбивирусов, который формирует отдельную филогенетическую группу, близкую к группе GiV.

orbivirusesKemerovo grouparbovirusesixodes ticksnext-generation sequencingGreat Island virusорбивирусыгруппа Кемеровоарбовирусыиксодоидные клещиполногеномное секвенированиевирус Грейт АйлендЛьвов Д. К., Громашевский В. Л., Сидорова Г. А., Тучкин Ю. М. Выделение нового арбовируса Баку группы Кемерово из аргасовых клещей Oraithodoros capensis в Азербайджане. Вопросы вирусологии. 1971; 4: 434-7.Baku. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses including certain other viruses of vertebrates. San Antonio, Texas: Am. Soc. Trop. Med. Hyg.; 1985: 203.Gromashevsky V.L., Lvov D. K., Sidorova G. A., Tsirkin Y. M., Fomina K. B., Aristova V. A. et al. A complex natural focus of arboviruses on Glinyanyi Island, Baku Archipelago, Azerbaidzhan S.S.R. Acta Virol. 1973; 17 (2): 155-8.Мирзоева Н. М. Итоги изучения арбовирусных инфекций в Азербайджане (1967-1976 гг.). Арбовирусы. 1978; 3: 27-31.Lvov D. K., Timopheeva A. A., Smirnov V. A., Gromashevsky V. L., Sidorova G. A., Nikiforov L. P. et al. Ecology of tick-borne viruses in colonies of birds in the USSR. Med. Biol. 1975; 53 (5): 325-30.Сидорова Г. А., Жмаева З. М., Громашевский В. Л. Изоляция вируса Баку от клещей Ornithodoros coniceps, собранных в гнездовьях голубей в Ташкентской области. Экология вирусов. 1974; 2: 102-5.Сидорова В.П., Андреев В. П. Некоторые черты экологии новых арбовирусов, выделенных в Узбекистане и Туркмении. Экология вирусов. 1980; 108-14.Андреев В. Л., Громашевский В. Л., Веселовская О. В. Изоляция вируса Баку в Западной части Туркменской ССР. Экология вирусов. 1973; 96-103.Саркисян Б. Г., Новохатский А. С., Львов Д. К. Орбивирусы. Успехи современной биотехнологии АН СССР. 1979; 5: 210-25.Lvov D. K. Arboviruses in the USSR. In: Vasenjak-Hirjan J., Porterfield J.S., eds. Arboviruses in the mediterranean countries. 1st ed. New York: Gustav Fischer Verlag; 1980: 35-48.Lvov D. K. Ecological soundings of the former USSR territory for natural foci of arboviruses. eds. Sov. Med. Rev. Virol. UK: Harwood Academ. Pub. GmbH; 1993: 1-47.Lvov D. K. Natural foci of arboviruses in the USSR. In: Zhdanov V.M., eds. Sov. Med. Rev. Virol. UK: Harwood Academ. Pub. GmbH; 1987: 153-96.Attoui H., Mertens P. P. C., Becnel J., Belaganahalli S., Bergoin M., BrussaardC. P. et al. Family Reoviridae. In: King A.M., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy: Ninth report of the international committee of taxonomy of viruses. 1st ed. London: Elsevier; 2012: 541-637.Урываев Л. В., Львов Д. К. Реовирусы. В кн.: Львов Д.К., ред. Медицинская вирусология. М.: МИА; 2008: 202-6.Dilcher M., Hasib L., Lechner M., Wieseke N., Middendorf M., Marz M. et al. Genetic characterization of Tribec virus and Kemerovo virus, two tick-transmitted human-pathogenic Orbiviruses. Virology. 2012; 423 (1): 68-76.Belhouchet M., Mohd Jaafar F., Tesh R., Grimes J., Maan S., Mertens P. P. et al. Complete sequence of Great Island virus and comparison with the T2 and outer-capsid proteins of Kemerovo, Lipovnik and Tribec viruses (genus Orbivirus, family Reoviridae). J. Gen. Virol. 2010; 91 (12): 2985-93.