Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12227ArticlesСтатьиResearch ArticleThe taxonomy of the Khasan Virus (KHAV), a new representative of Phlebovirus Genera (Bunyaviridae), isolated from the ticks Haemaphysalis longicornis (Neumann, 1901) in the Maritime territory (Russia)Таксономия вируса Хасан (Khasan, KHAV) - нового вируса рода Phlebovirus (сем. Bunyaviridae), изолированного из клещей Haemaphysalis longicornis (Neumann, 1901) в Приморском крае (Россия)15102013585VOL 58, NO5 (2013)ТОМ 58, №5 (2013)151809062023Copyright ©; 2013, Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Samokhvalov E.I., Gitelman A.K., Botikov A.G.Copyright ©; 2013, Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Самохвалов Е.И., Гительман А.К., Ботиков А.Г.2013Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Samokhvalov E.I., Gitelman A.K., Botikov A.G.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Самохвалов Е.И., Гительман А.К., Ботиков А.Г.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12227

The khasan virus (KHAV) was originally isolated in Khasansky District and maritime territory in 1971 from the ticks Haemophysalis longicornis Neumann, 1901) collected from the deers Cervus nippon (temmink, 1838). Based on the biological properties and virion morphology, KHAV was identified as an unclassified member of the Bunyaviridae family. in order to elucidate the KHAV taxonomy in more detail, viral genome was partially sequenced using the next-generation sequencing technology. according to the phylogenetic analysis conducted for partial sequences of the three genome segments, KHAV was attributed to the genus phlebovirus. KHAV is phylogenetically mostly related to the viruses of the Uukuniemi group and has up to 62% identity with them. the maximum identity level is observed for sequences of the mA-dependent-mA-polymerase (rdrp) gene. the KHAV homology level with the tick-borne Uukuniemi group viruses is 50 to 62%; however, for the mosquito-borne phleboviruses it does not exceed 30%.

Вирус Хасан (Khasan virus - KHAV) был изолирован в Хасанском районе Приморского края в 1971 г. из клещей Haemophysalis longicornis (Neumann, 1901), собранных с пятнистых оленей Cervus nippon Temmink, 1838. на основании биологических свойств и морфологии вириона KHAV был отнесен к неклассифицированным вирусам сем. Bunyaviridae. в настоящей работе для уточнения таксономического положения kHaV геном вируса был частично секвенирован с использованием технологии секвенирования следующего поколения (next-generation sequencing). на основании филогенетического анализа частичных последовательностей всех трех сегментов генома KHAV был отнесен нами к роду Phlebovirus. Филогенетически KHAV наиболее близко группируется с вирусами группы UUKV и обладает с ними на анализируемых участках генома до 62% идентичности. Максимальный уровень идентичности наблюдается для фрагментов последовательности РнК-зависимой РнК-полимеразы (RdRp). уровень гомологии KHAV с клещевыми вирусами группы UUKV составляет от 50 до 62%, тогда как с москитными флебовирусами это значение не превышает 30%.

Khasan virusbunyaviridaephlebovirusarboviruscomplete genome sequencingixodes ticksвирус Хасанбуньявирусыфлебовирусыарбовирусыполногеномное секвенированиеиксо-довые клещиLvov D. K., Leonova G. N., Gromashevsky V. L., Skvortsova T. M., Shestakov V. I., Belikova N. P. et al. Khasan virus, a new ungrouped bunyavirus isolated from Haemaphysalis longicornis ticks in the Primorie region. Acta Virol. 1978; 22 (3): 249-52.KHASAN. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses including certain other viruses of vertebrates. San Antonio, Texas: Am. Soc. Trop. Med. Hyg.; 1985: 567-8.Lvov D. K. Arboviruses in the USSR. In: Vasenjak-Hirjan J., Porterfield J.S., eds. Arboviruses in the mediterranean countries. 1st ed. New York: Gustav Fischer Verlag; 1980: 35-48.Plyusnin A., Beaty B. J., Elliot R. M., Goldbach R., Kormelink R., Lundkvist A. et al. Family Bunyaviridae. In: King A.M., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy: Ninth report of the international committee of taxonomy of viruses. 1st ed. London: Elsevier; 2012: 725-41.Альховский С. В., Львов Д. К., Щелканов М. Ю., Щетинин А. М., Краснослободцев К. Г., Дерябин П. Г. и др. Молекулярногенетическая характеристика вирусов Бханджа (BHAV) и Раздан (RAZV) (Bunyaviridae, Phlebovirus), изолированных от иксодовых клещей Rhipicephalus Bursa Canestrini & Fanzago, 1878, и Dermacentor Marginatus Sulzer, 1776, в Закавказье. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4): 14-9.Альховский С. В., Щетинин А. М., Львов Д. К., Щелканов М. Ю., Дерябин П. Г., Львов Д. Н. и др. Вирус Хурдун (KHURV): новый вирус рода Orthobunyavirus (Bunyaviridae). Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4): 10-3.Palacios G., Savji N., Travassos da Rosa A., Guzman H., Yu X., Desai A. et al. Characterization of the Uukuniemi virus group (Phlebovirus: Bunyaviridae): evidence for seven distinct species. J Virol. 2013; 87 (6): 3187-95.Matsuno K., Weisend C., Travassos da Rosa A. P., Anzick S. L., Dahlstrom E., Porcella S. F et al. Characterization of the Bhanja serogroup viruses (Bunyaviridae): a novel species of the genus Phlebovirus and its relationship with other emerging tick-borne phleboviruses. J. Virol. 2013; 87 (7): 3719-28.Щелканов М. Ю., Ананьев В. Ю., Львов Д. Н., Киреев Д. Е., Гурьев Е. Л., Аканина Д. С. и др. Комплексный экологовирусологический мониторинг на территории Приморского края в 2003-2006 гг. Вопросы вирусологии. 2007; 52 (5): 37-48.Lvov D. K. Natural foci of arboviruses in the USSR. In: Zhdanov V.M., ed. Sov. Med. Rev. Virol. UK: Harwood Academ. Pub. GmbH; 1987: 153-96.Lvov D. K., Shchelkanov M. Y., Prilipov A. G., Vlasov N. A., Fedyakina I. T., Deryabin P. G. et al. Evolution of highly pathogenic avian influenza H5N1 virus in natural ecosystems of northern Eurasia (2005-08). Avian Dis. 2010; 54 (1, Suppl.): 483-95.Thompson J. D., Higgins D. G., Gibson T. J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucl. Acids Res. 1994; 22 (22): 4673-80.Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M.Kumar S. MEGA 5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28 (10): 2731-9.Saikku P., von Bonsdorff C. H. Electron microscopy of the Uukuniemi virus, an ungrouped arbovirus. Virology. 1968; 34 (4): 804-6.Xu B., Liu L., Huang X., Ma H., Zhang Y., Du Y. et al. Metagenomic analysis of fever, thrombocytopenia and leukopenia syndrome (FTLS) in Henan Province, China: discovery of a new bunyavirus. PLoS Pathog. 2011; 7 (11): e1002369.McMullan L. K., Folk S. M., Kelly A. J., MacNeil A., Goldsmith C. S., Metcalfe M. G. et al. A new phlebovirus associated with severe febrile illness in Missouri. N. Engl. J. Med. 2012; 367 (9): 834-41.Zhang Y. Z., Zhou D. J., Qin X. C., Tian J. H., Xiong Y., Wang J. B. et al. The ecology, genetic diversity, and phylogeny of Huaiyangshan virus in China. J. Virol. 2012; 86 (5): 2864-8.Yu X. J., Liang M. F., Zhang S. Y., Liu Y., Li J. D., Sun Y. L. et al. Fever with thrombocytopenia associated with a novel bunyavirus in China. N. Engl. J. Med. 2011; 364 (16): 1523-32.