Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12224ArticlesСтатьиResearch ArticleThe taxonomy of the issyk-Kul virus (iSKV, Bunyaviridae, Nairovirus), the etiologic Agent of the issyk-Kul fever isolated from bats (Vespertilionidae) and ticks Argas (Carios) vespertilionis (Latreille, 1796)Таксономия вируса Иссык-Куль (Issyk-Kul virus, ISKV; Bunyaviridae, Nairovirus), возбудителя Иссык-Кульской лихорадки, изолированного от летучих мышей (Vespertilionidae) и клещей Argas (Carios) vespertilionis (Latreille, 1796)15102013585VOL 58, NO5 (2013)ТОМ 58, №5 (2013)111509062023Copyright ©; 2013, Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Samokhvalov E.I., Gitelman A.K., Botikov A.G.Copyright ©; 2013, Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Самохвалов Е.И., Гительман А.К., Ботиков А.Г.2013Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Samokhvalov E.I., Gitelman A.K., Botikov A.G.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Самохвалов Е.И., Гительман А.К., Ботиков А.Г.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12224

The issyk-Kul virus (etiological agent of the issyk-Kul fever) was originally isolated from bats (Nyctalus noctula Schreber, 1774 (Chiroptera: Vespertilionidae)) and their parasites ticks (Argas (Carios) vespertilionis Latreille, 1796 (Parasitiformes: Argasidae)) in Kirghizia. Sporadic cases and epidemics of the issyk-Kul fever are observed in Central Asia since 1979. The iSKV genome was de novo sequenced using the next-generation sequencing technology. According to the molecular-genetic and phylogenetic analysis, the iSKV is a member of a novel group in the genus Nairovirus (Bunyaviridae). Based on the data obtained, molecular-genetic methods can be used for iSKV detection (PCR) for the issyk-Kul fever monitoring and diagnosis in the endemic areas.

Вирус Иссык-Куль (issyk-Kul - iSKV) - этиологический агент Иссык-Кульской лихорадки (ИКЛ) впервые был выделен в Киргизии от летучих мышей Nyctalus noctula Schreber, 1774 (Chiroptera: Vespertilionidae) и их облигатных паразитов - клещей Argas (Carios) vespertilionis Latreille, 1796 (Parasitiformes: Argasidae). Спорадическую заболеваемость и эпидемические вспышки ИКЛ регистрируют в странах Средней Азии с 1979 г. В настоящей работе геном iSKV был секвенирован de novo с использованием технологии полногеномного секвенирования. На основании проведенного молекулярно-генетического и филогенетического анализа iSKV отнесен к новой группе рода Nairovirus (сем. Bunyaviridae). Полученные данные, помимо решения фундаментальных задач, связанных с описанием генетического разнообразия и таксономии вирусов, могут быть использованы для разработки молекулярно-генетических методов детекции iSKV (ПЦР) с целью мониторинга и диагностики ИКЛ на эндемичных территориях.

bunyavirusesnairovirusesarbovirusesIssyk-Kul virusIssyk-Kul fevernext generation sequencingbatsargasidae ticksбуньявирусынаировирусыарбовирусывирус Иссык-КульИссык-Кульская лихорадкаполногеномное секвенированиелетучие мышиаргасовы клещиLvov D. K., Karas F R., Timofeev E. M., Tsyrkin Y. M., Vargina S. G., Veselovskaya O. V et al. "Issyk-Kul" virus, a new arbovirus isolated from bats and Argas (Carios) vespertilionis (Latr., 1802) in the Kirghiz S.S.R. Brief report. Arch. Ges. Virusforsch. 1973; 42(2): 207-9.ISSYK-KUL. In: Karabatsos N., ed. International catalogue of arboviruses including certain other viruses of vertebrates. 3rd ed. San Antonio, Texas: Am. Soc. Trop. Med. Hyg.; 1985: 461.Львов Д. К., Костюков М. А., Пак Т. П., Громашевский В. Л. О выделении арбовируса, антигенно родственного вирусу Иссык-Куль, из крови больного человека. Вопросы вирусологии. 1980; (1): 61-2.Костюков М. А. Изучение экологии вируса Иссык-Куль. В кн.: Гайдамович С.Я., ред. Арбовирусы. М.; 1981: 78-82.Львов Д. К. Арбовирусные инфекции в субтропиках и на юге умеренного пояса СССР. В кн.: Львов Д.К., Клименко С.М., Гайдамович С.Я., ред. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. М.: Медицина; 1989: 235-49.Львов Д. К. Лихорадка Иссык-Куль. В кн.: Львов Д.К., ред. Медицинская вирусология. М.: МИА; 2008: 566-8.Lvov D. K. Issyk-Kul virus disease. In: Monath T.P., ed. The Arboviruses: ecology and epidemiology. Boca Raton, FL: CRS Press; 1988: 53-62.Plyusnin A., Beaty B. J., Elliot R. M., Goldbach R., Kormelink R., Lundkvist A. et al. Family Bunyaviridae. In: King A.M., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy: Ninth report of the international committee of taxonomy of viruses. London: Elsevier; 2012: 725-41.Thompson J. D., Higgins D. G., Gibson T. J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucl. Acids Res. 1994; 22 (22): 4673-80.Альховский С. В., Львов Д. К., Щелканов М. Ю., Щетинин А. М., Краснослободцев К. Г., Дерябин П. Г. и др. Молекулярногенетическая характеристика вирусов Бханджа (BHAV) и Раздан (RAZV) (Bunyaviridae, Phlebovirus), изолированных от иксодовых клещей Rhipicephalus Bursa Canestrini & Fanzago, 1878, и Dermacentor Marginatus Sulzer, 1776 в Закавказье. Вопросы вирусологии. 2013; 58(4): 14-9.Dilcher M., Koch A., Hasib L., Dobler G., Hufert F. T., Weidmann M. Genetic characterization of Erve virus, a European Nairovirus distantly related to Crimean-Congo hemorrhagic fever virus. Virus Genes. 2012; 45 (3): 426-32.Chastel C., Main A. J., Richard P., Le Lay G., Legrand-Quillien M. C.Beaucournu J. C. Erve virus, a probable member of Bunyaviridae family isolated from shrews (Crocidura russula) in France. Acta Virol. 1989; 33 (3): 270-80.Deyde V. M., Khristova M. L., Rollin P. E., Ksiazek T. G., Nichol S. T. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus genomics and global diversity. J. Virol. 2006; 80 (17): 8834-42.Crabtree M. B., Sang R., Miller B. R. Kupe virus, a new virus in the family bunyaviridae, genus nairovirus, Kenya. Emerg. Infect. Dis. 2009; 15 (2): 147-54.Honig J. E., Osborne J. C., Nichol S. T. The high genetic variation of viruses of the genus Nairovirus reflects the diversity of their predominant tick hosts. Virology. 2004; 318 (1): 10-6.Varma M. G., Converse J. D. Keterah virus infections in four species of Argas ticks (Ixodoidea: Argasidae). J. Med. Entomol. 1976; 13(1): 65-70.