Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12211ArticlesСтатьиResearch ArticlePrevalence, Features of Circulation, and Diversity of Human Parechoviruses in Nizhny NovgorodОбнаружение, особенности циркуляции и разнообразие парэховирусов человека в Нижнем Новгороде15042013582VOL 58, NO2 (2013)ТОМ 58, №2 (2013)293309062023Copyright ©; 2013, Golitsyna L.N., Zverev V.V., Novikova N.A., Fomina S.G., Parfenova O.V., Epifanova N.V., Lukovnikova L.B., Morozova O.V., Ponomareva N.V.Copyright ©; 2013, Голицына Л.Н., Зверев В.В., Новикова Н.А., Фомина С.Г., Парфенова О.В., Епифанова Н.В., Луковникова Л.Б., Морозова О.В., Пономарева Н.В.2013Golitsyna L.N., Zverev V.V., Novikova N.A., Fomina S.G., Parfenova O.V., Epifanova N.V., Lukovnikova L.B., Morozova O.V., Ponomareva N.V.Голицына Л.Н., Зверев В.В., Новикова Н.А., Фомина С.Г., Парфенова О.В., Епифанова Н.В., Луковникова Л.Б., Морозова О.В., Пономарева Н.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12211

A total of 5230 specimens from children with gastroenteritis collected in Nizhny Novgorod in 2006-2010 were screened for human parechoviruses (HPeV). HPeV were observed every year with mean frequency of 6.16%. The majority of HpeV (65.83%) was detected in children younger than 3 years. The typing of 71 detected HPeV with the use of partial sequencing of the VP3-VP1 region revealed the presence of HPeV1 (91.55%), HpeV6 (5.63%), HPeV3 (3.08%), HPeV4 (1.54%). HPeV1B was predominant among HPeV1, HPeV1A was identified rarely. Six stains of HPEV1 formed separate phylogenetic cluster, had sequence gomology with HPEV1A or HPeV1B not more than 88% and could be characterized as members of a separate genotype HPeV1.

Проведено исследование 5230 проб копроматериала от детей в возрасте до 17 лет с диагнозом острой кишечной инфекции (ОКИ), госпитализированных в Нижнем Новгороде в 2006-2010 гг. Парэховирусы человека (ПЭВ) выявляли на протяжении всего периода исследований, в среднем с частотой 6,16%, преимущественно (65,83%) в группе детей до 3 лет. Тип вируса методом секвенирования VP3-VP1 области генома идентифицирован в 71 случае: ПЭВ1 (91,55%), ПЭВ6 (5,63%), ПЭВ3 (3,08%) и ПЭВ4 (1,54%). Большинство ПЭВ1 принадлежали к генотипу В, ПЭВ1 генотипа А идентифицированы в единичных случаях. Шесть штаммов ПЭВ1, последовательности которых образовали самостоятельную филогенетическую группу и имели не более 88% гомологии с известными последовательностями ПЭВ генотипов 1А и 1В, могут быть охарактеризованы как представители отдельного генотипа ПЭв1.

human parechovirusesprevalencegenotype of human parechovirusesпарэховирусы человекаобнаружениегенотипы парэховирусов человекаГолицына Л.Н., Зверев В.В., Новикова Н.А. и др. Обнаружение парэховирусов у детей с гастроэнтеритом. В кн.: Материалы IX съезда Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов, 26-27 апреля 2007 г., Москва. М.: Санэпидемиа; 2007: 224-5.Abed Y., Boivin G. Human parechovirus infection in Canada. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12 (6): 969-75.Baumgarte S., de Souza Luna L.K., Grywna K. et al. Prevalence, types, and RNA concentrations of human parechoviruses, including a six parechovirus type, in stool sampales from patients with acute enteritis. J. Clin. Microbiol. 2008; 46 (1): 242-8.Benshop K., Thomas X., Serpenti C. et al. High prevalence of human Parechovirus (HPeV) genotypes in the Amsterdam region and identification of specific HPeV variants by direct genotyping of stool samples. J. Clin. Microbiol. 2008; 46 (12): 3965-70.Calvert J., Chieochansin T., Benschop K.S. et.al. Recombination dynamics of human parechoviruses: investigation of type-specific differences in frequency and epidemiological correlates. J. Gen. Virol. 2010; 91: 1299-38.Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Nonpolio enterovirus and human parechovirus surveillance -- United States, 2006-2008. MMWR. 2010; 59: 1577-80.Chieochansin T., Vichiwattana P., Korkong S. et al. Molecular epidemiology, genome characterization, and recombination event of human parechovirus. Virology. 2011; 421: 159-66.Ehrnst A., Eriksson M. Epidemiological features of type 22 echovirus infection. Scand. J. Infect. Dis. 1993; 25: 275-81.Han T.H., Kim C.H., Park S.H. et.al. Detection of human parecho-viruses in children with gastroenteritis in South Korea. Arch. Virol. 2011; 156: 1471-5.Harvala H., Robertson I., McWilliam Leitch E.C. et al. Epidemiology and clinical associations of human parechovirus respiratory infections. J. Clin. Microbiol. 2008; 46 (10): 3446-53.Ito M., Yamashita T., Tsuzuki H. et al. Isolation and identification of a novel human parechovirus. J. Gen. Virol. 2004; 85: 391-8.Ito M., Yamashita T., Tsuzuki H. et al. Detection of human parechoviruses from clinical stool samples in Aichi, Japan. J. Clin. Microbiol. 2010; 48 (8): 2683-8.Khetsuriani N., Lamonte-Fowlkes A., Oberst S., Pallansch M.A. Enterovirus surveillance-United States, 1970-2005. MMWR. 2006; 55: 1-20.Oberste M.S., Maher K., Pallansch M.A. Specific detection of echo-viruses 22 and 23 in cell culture supernatants by RT-PCR. J. Med. Virol. 1999; 58: 178-81.Pham N.T.H., Takanashi S., Tran D.N. et al. Huma parechoviruses infection in children hospitalized with acute gastroenteritis in Sri Lanka. J. Clin. Microbiol. 2011; 49: 364-6.Sanden S., Bruin E., Vennema H. et al. Prevalence of Human parecho-virus in Netherlands in 2000 to 2007. J. Clin. Microbiol. 2008; 46 (9): 2884-9.Stanway G., Hyypia T. Parechoviruses. J. Virol. 1999; 73: 5249-54.Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., and Kumar S. MEGA 5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28: 2731-9.Zhang D.L., Jin Y., Li D.D. Cheng W.X. et al. Prevalence of human parechovirus in Chinese children hospitalized for acute gastroenteritis. Clin. Microbiol. Infect. 2011; 11: 1156-9.