Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12199ArticlesСтатьиResearch ArticleRevision of map signs for some arboviruses as the result of new data of their taxonomyРевизия картографических знаков некоторых арбовирусов в связи с новыми данными по их таксономии20122013581SNO1S (2013)№1S (2013)546309062023Copyright ©; 2013, Shchelkanov M.Y., Lvov D.K., Alkhovsky S.V., Shchetinin A.M., Chumakov V.M., Deryabin P.G.Copyright ©; 2013, Щелканов М.Ю., Львов Д.К., Альховский С.В., Щетинин А.М., Чумаков В.М., Дерябин П.Г.2013Shchelkanov M.Y., Lvov D.K., Alkhovsky S.V., Shchetinin A.M., Chumakov V.M., Deryabin P.G.Щелканов М.Ю., Львов Д.К., Альховский С.В., Щетинин А.М., Чумаков В.М., Дерябин П.Г.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12199

New map signs are introduced and some previously introduced ones are improved for arboviruses, which taxonomy positions were recently specified as the result of implementation of full genome sequencing and metagenomic analysis into laboratory practice.

В работе представлены новые и усовершенствованы некоторые ранее введённые картографические знаки арбовирусов, таксономическое положение которых было уточнено в последнее время в связи с внедрением в лабораторную практику полногеномного секвенирования и метагеномного анализа.

map signmappingIssyk-Kul virusISKVSakhalin virusSAKVParamushir virusPRMSVRukutama virusRUKVArtashat virusARTSVTamdy virusTAMVKhurdun virusKHURVBhanja virusBHAVRazdan virusRAZVGissar virusGSSRVZaliv Terpeniya virusZTVKomandory virusKOMVKhasan virusKHAVAlma-Arasan virusAARVSokuluk virusSOKVTyuleniy virusTYUVKama virusKAMVBatken virusBKNVTyulek virusTLKVSikhote-Alin virusSAVSyr-Darya Valley fever virusSDVFVOkhotskiy virusOKHVAniva virusANIVBaku virusBAKVWad-Medany virusWMDVKyzylagach virusKYZVкартографический знаккартографированиевирус Иссык-Кульвирус Сахалинвирус Парамуширвирус Рукутамавирус Арташатвирус Тамдывирус Хурдунвирус Бханджавирус Разданвирус Гиссарвирус Залив Терпениявирус Командорывирус Хасанвирус Алма-Арасанвирус Сокулуквирус Тюленийвирус Камавирус Баткенвирус Тюлёквирус Сихотэ-Алиньвирус лихорадки долины Сырдарьивирус Охотскийвирус Анивавирус Бакувирус Вад-Меданивирус КызылагачЛьвов Д.К. Экология вирусов. В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 66-86.Львов Д.К. Организация эколого-эпидемиологического мониторинга территорий Российской Федерации с целью противоэпидемической защиты населения и войск. (Методические рекомендации). МЗ РФ, Федеральное управление медико-биологических и экстремальных проблем, НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН, Москва, 1993.Львов Д.К. Выявление циркуляции арбовирусов. В кн.: Итоги науки и техники. Серия Вирусология. М.: АН СССР, 1991; 116.Львов Д.К. Экология вирусов. В кн.: Д.К. Львов (ред.). Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА, 2013 : 66-86.Львов Д.К., Дерябин П.Г., Аристова В.А., Бутенко А.М., Галкина И.В., и др. Атлас распространения возбудителей природно-очаговых вирусных инфекций на территории Российской Федерации. М.: МЗ РФ. 2001.Щелканов М.Ю., Громашевский В.Л., Львов Д.К. Роль эколого-вирусологического районирования в прогнозировании влияния климатических изменений на ареалы арбовирусов. Вестник РАМН. 2006; (2): 22-25.Львов Д.К. Природные очаги связанных с птицами арбовирусов СССР. В кн.: Львов Д.К., Ильичёв В.Д. Миграции птиц и перенос возбудителей инфекции. М.: Наука; 1979; Глава 2: 37-101.Lvov D.K., Gromashevski V.L., Skvortsova T.M., Berezina L.K., Gofman Y.P., et al. Arboviruses of high latitudes in the USSR. In: KurstakE. (Ed.) Arctic and tropical arboviruses. NY-San-Francisco-London: Harcourt Brace Jovanovich Publ.; 1979; Ch. 3: 21-38.Lvov D.K., Timopheeva A.A., Smirnov V.A., Gromashevsky V.L., Sidorova G.A., et al. Ecology of tick-borne viruses in colonies of birds in the USSR. Med. Biol. 1975; 53 (5): 325-330.Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Prilipov A.G., Vlasov N.A., Fedyakina I.T., et al. Evolution of HPAI H5N1 virus in Natural ecosystems of Northern Eurasia (2005-2008) // Avian Dis. - 2010. - V. 54. - P. 483-495.Берлянт А.М. Образ пространства: карта и информация. М.: Мысль, 1986.Малхазова С.М. Медико-географический анализ территорий: картографирование, оценка, прогноз. М.: Научный мир, 2001.Тикунов В.С. Моделирование в картографии. М.: Изд-во МГУ, 1997.Петренко М.С., Щелканов М.Ю., Юдин А.Н., Бурунова В.В., Славский А.А., Стариков Н.С. Системная интеграция вирусологических, экологических и картографических исследований на основе современных информационных технологий. В сб.: III Всероссийская конференция с международным участием «Фундаментальные науки и прогресс клинической медицины» (Москва, Россия; 20-24 января 2004 г.). М.: Научно-издательский Центр ММА им. И.М. Сеченова, 2004. 159.Щелканов М.Ю., Яшкулов К.Б., Львов Д.Н., Бушкиева Б.Ц., Ананьев В.Ю. и др. Информационно-картографическое обеспечение мониторинга природных очагов арбовирусных инфекций. В сб.: Информационные технологии в медицине и здравоохранении. Труды Международного Симпозиума (Карловы Вары, Чехия; 22-29 мая 2004 г.). М., 2004; 36-38.Львов Д.К., Альховский С.В., Щетинин А.М., Щелканов М.Ю. Буньявирусы (Bunyaviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 279-298.Львов Д.К., Дерябин П.Г., Альховский С.В. Флавирусы (Flaviviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 340-347.Каверин Н.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю. Ортомиксовирусы (Orthomyxoviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 307-314.Львов Д.К., Щелканов М.Ю. Пикорнавирусы (Picornaviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 232-249.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю. Поксвирусы (Poxviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 179-185.Львов Д.К., Альховский С.В., Урываев Л.В., Щелканов М.Ю. Реовирусы (Reoviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 315-324.Львов Д.К., Альховский С.В., Урываев Л.В. Тогавирусы (Togaviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 334-340.Альховский С.В. Метагеномный подход - полногеномное секвенирование. В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Ред.: академик РАН Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 476-479.Альховский С.В., Щетинин А.М., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г. и др. Вирус Хурдун (KHURV): новый вирус рода Orthobunyaviridae (Bunyaviridae). Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4) : 10-13.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Краснослободцев К.Г. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вирусов Бханджа (BHAV) и Раздан (RAZV) (Bunyaviridae, Phlebovirus), изолированных от иксодовых клещей Rhipicephalus bursa Canestrini et Fanzago, 1878 и Dermacentor marginatus Sulzer, 1776 в Закавказье. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4) : 14-19.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Таксономия вируса Иссык-Куль (Issyk-Kul virus, ISKV), возбудителя Иссык-Кульской лихорадки, изолированного от летучих мышей (Vespertilionidae) и клещей Argas (Carios) vespertilionis (Latreille, 1896). Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4) : 11-15.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Таксономия вируса Хасан (Khasan, KHAV) - нового вируса рода Phlebovirus (сем. Bunyaviridae), изолированного из клещей Haemaphysalis longicornis (Neumann, 1901) в Приморском крае (Россия). Вопросы вирусологии. 2013; 58 (5) : 15-18.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Генетическая характеристика нового вируса Командоры (Komandory virus, KOMV; Bunyaviridae, Phlebovirus), изолированного из клещей Ixodes uriae (Acari: Ixodidae), собранных в гнездовьях кайр Uria aalge на Командорских островах в Беринговом море. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (6) : 18-22.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Таксономия вируса Баку (Baku virus, BAKV; Reoviridae, Orbivirus), изолированного из облигатных паразитов птиц - аргасовых клещей (Acari: Argasidae) в Азербайджане, Туркменистане и Узбекистане. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (6) : 22-26.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г., Богданова В.С. и др. Применение современных молекулярно-биологических технологий для обеспечения биологической безопасности. Вопросы вирусологии. 2013; Приложение 1: 34-53.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Генетическая характеристика штаммов вируса Залив Терпения (ZTV - Zaliv Terpeniya virus) (Bunyaviridae, Phlebovirus, антигенный комплекс Укуниеми), изолированного в высоких широтах Северной Евразии из облигатных эктопаразитов чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820) - клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852 и от комаров Culex modestus Ficalbi, 1889 в субтропиках Закавказья. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (1) : В печати.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Генетическая характеристика вируса Каспий (CASV - Caspiy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от чайковых (Laridae Vigors, 1825) и крачковых (Sternidae Bonaparte, 1838) птиц и аргасовых клещей Ornithodoros capensis Neumann, 1901 (Argasidae Koch, 1844) на западном и восточном побережьях Каспийского моря. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (1) : В печати.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Таксономия вируса Сокулук (SOKV - Sokuluk virus) (Flaviviridae, Flavivirus, антигенный комплекс летучих мышей Энтеббе), изолированного в Киргизии от летучих мышей нетопырей-карликов (Vespertilio pipistrellus Schreber, 1774), аргасовых клещей (Argasidae Koch, 1844) и птиц. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (1) : В печати.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Генетическая характеристика вирусов из антигенного комплекса Тюлений (Flaviviridae, Flavivirus): Тюлений (TYUV - Tyuleniy virus), изолированного из облигатных эктопаразитов колониальных птиц - клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, собранных в высоких широтах Северной Евразии, - и Кама (KAMV - Kama virus), изолированного из клещей Ixodes lividus Roch, 1844, собранных в норовых колониях птиц в средней части Русской равнины. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (1) : В печати.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Гительман А.К., Дерябин П.Г. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вирусов Охотский (OKHV - Okhotskiy virus) и Анива (ANIV - Aniva virus) (Reoviridae, Orbivirus), изолированных в высоких широтах Северной Евразии из облигатных эктопаразитов чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820) -клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (2) : В печати.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Генетическая характеристика вируса Баткен (BKNV - Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (2) : В печати.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Аристова В.А. и др. Таксономия ранее негруппированного вируса Тамды (TAMV - Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schülce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) в Средней Азии и Закавказье. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (2) : В печати.Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Таксономический статус вируса Тюлёк (Tyulek - TLKV) (Orthomyxoviridae, Quaranjavirus, группа Кваранфил), изолированного в Киргизии из клещей Argas vulgaris Filippova, 1961 (Argasidae) из норовых биотопов с гнёздами птиц. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (2) : В печати.Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г. и др. Таксономия вируса Арташат (ARTSV - Artashat virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного из клещей Ornithodoros alactagalis Issaakjan, 1936 и O. verrucosus Olenev, Sassuchin et Fenuk, 1934 (Argasidae Koch, 1844), собранных в Закавказье. Вопросы вирусологии. 2014; 59 (3) : В печати.