Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12157ArticlesСтатьиResearch ArticleMolecular genetic characteristics of tick-borne encephalitis virus in the CrimeaМолекулярно-генетическая характеристика вируса клещевого энцефалита в Крыму15062012573VOL 57, NO3 (2012)ТОМ 57, №3 (2012)404409062023Copyright ©; 2012, Yurchenko O.A., Vinograd N.A., Dubina D.A.Copyright ©; 2012, Юрченко О.А., Виноград Н.А., Дубина Д.А.2012Yurchenko O.A., Vinograd N.A., Dubina D.A.Юрченко О.А., Виноград Н.А., Дубина Д.А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12157

The nucleotide sequences of the envelope (E) protein gene of three tick-borne encephalitis virus (TBEV) strains 80, 85, and 290 isolated from Ixodes ricinus ticks in the Crimea in 1989-1990 were determined. A comparative analysis of the genetic structure of the strains showed their identity. A phylogenetic analysis of these strains with 34 other TBEV strains could assign them to the European genotype and showed their maximum (97.24%) identity to the Pan strain that occupies a separate position among the sequenced TBEV strains. The findings indicate that the TBEV European genotype strains circulated together with the TBEV Far Eastern genotype ones in the Crimea in 1980-1990

Проведено определение нуклеотидных последовательностей гена белка оболочки Е трех штаммов ВКЭ 80, 85 и 290, изолированных из иксодовых клещей Ixodes ricinus в Крыму в 1989-1990 гг. Сравнительный анализ генетической структуры штаммов показал их идентичность. Филогенетический анализ этих штаммов с 34 другими штаммами ВКЭ позволил отнести их к европейскому генотипу вируса с максимальной идентичностью штамму Pan (97,24%), занимающему обособленное положение среди секвенированных штаммов ВКЭ. Полученные результаты указывают на то, что в 1980-1990 гг. в Крыму наряду с дальневосточным генотипом ВКЭ циркулировали штаммы европейского генотипа.

tick-borne encephalitis virusenvelope (E) protein genesequencingвирус клещевого энцефалитаген белка оболочки ЕсеквенированиеАдельшин Р. В., Злобин В. И., Беликов С. И. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита в европейской части России и некоторых странах Балтии, Восточной и Юго-Восточной Европы // Эпидемиол. и вакцинопрофилактика. - 2006. - № 2. - С. 27-34.Верхозина М. М., Злобин В. И., Козлова И. В. и др. Экологоэпидемиологический и молекулярно-генетический анализ популяции вируса клещевого энцефалита на территории Иркутской области // Эпидемиол. и вакцинопрофилактика. - 2008. - № 1. - С. 12-18.Виноград Н. А., Василишин З. П. Клинико-эпидемиологические особенности вирусного клещевого энцефалита на современном этапе // Сучаснi нфекцiï. -2010. - № 3. - С. 8-11.Вотяков В. И., Злобин В. И., Мишаева Н. П. Клещевые энцефалиты Евразии (вопросы экологии, молекулярной эпидемиологии, нозологии, эволюции). - Новосибирск: Наука, 2002.Гольдин Е. Б. Паразитофауна дикого кабана Sus scrofa Linnaeus, 1758: биоразнообразие и состояние изученности // Экосистемы Крыма, их оптимизация и охрана. - 2009. - Вып. 19. - С. 76-89.Громашевский В. Л. Методы изоляции арбовирусов // Арбовирусы (методы лабораторных и полевых исследований). - М., 1986. - С. 90-93.Демина Т. В., Джиоев Ю. П., Верхозина М. М. и др. Исследование генетической вариабельности и генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью дезоксиолигонуклеотидных зондов // Вопр. вирусол. - 2009. - № 3. - С. 33-42.Злобин В. И., Верхозина М. М., Демина Т. В. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 2007. - № 6. - С. 4-13.Карань Л. С., Маленко Г. В., Бочкова Н. Г. и др. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). - С. 34-40.Локтев В. Б., Терновой В. А., Нетесов С. В. Молекулярногенетическая характеристика вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 2007. - № 5. - С. 10-16.Погодина В. В., Карань Л. С., Колясникова Н. М. и др. Эволюция клещевого энцефалита и проблема эволюции возбудителя // Вопр. вирусол. - 2007. - № 5. - С. 16-21.Щучинова Л. Д. Эпидемиологический надзор и контроль инфекций, передающихся клещами, в Республике Алтай: Автореф. дис.. канд. мед. наук. - Омск, 2009.Ecker M., Allison S. L., Meixner T., Heinz F. X. Sequence analysis and genetic classification of tick-borne encephalitis viruses from Europe and Asia // J. Gen. Virol. - 1999. - Vol. 80. - P. 179-185.Gratz N. Трансмиссивные инфекционные заболевания в Европе. Их распространение и влияние на общественное здравоохранение. - Европейское региональное бюро ВОЗ, 2005.Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucl. Acids Symp. Ser. - 1999. - Vol. 41. - P. 95-98.Jaaskelainen A. E., Tikkakoski T., Uzcategui N. Y. et al. Siberian subtype tickborne encephalitis virus, Finland // Emerg. Infect. Dis. -2006. - Vol. 12, N 10. - P. 1568-1571.Lundkvist K., Vene S., Golovljova I. et al. Characterization of tick-borne encephalitis virus from Latvia: evidence for co-circulation of three distinct subtypes // J. Med. Virol. - 2001. - Vol. 65, N 4. - P. 730-735.Rey F. A., Heinz F. X., Mandl C. et al. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2 A resolution // Nature. - 1995. - Vol. 375. - P. 291-298.Ruzek D., Stastna H., Kopecky J. et al. Rapid subtyping of tick-borne encephalitis virus isolates using multiplex RT-PCR // J. Virol. Meth. - 2007. - Vol. 144, N 1-2. - P. 133-137.Thiel H. J., Collett M. S., Gould E. A. et al. / Fauquet C. M., Mayo M. A., Maniloff J., Desselberger U., Ball L. A., Eds. Virus taxonomy: Classification and nomenclature: Eighth report of the International committee on the taxonomy of viruses / Eds C. M. Fanquet et al. -New York; Oxford: Elsevier Academic Press, 2005. - P. 981-998.